seq1: chr11_3792809_3793917
seq2: B6Ng01-166E22.b_46_1144
seq1 GAATTCAGGACCTCCGGAAGAGCAGTCAGTGCTCTTACCTGCTGAGCCAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAATTCAGGACCTCCGGAAGAGCAGTCAGTGCTCTTACCTGCTGAGCCAT 50
seq1 CTCTCCAGCTCCTGGGTTCTCATTTTTTGATAATTTAGTTATATTATGAA 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTCTCCAGCTCCTGGGTTCTCATTTTTTGATAATTTAGTTATATTATGAA 100
seq1 GTGTTTTTCAATGGTTTTTCCCATTTAAAAAAACAATTGTTCATACATTC 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTGTTTTTCAATGGTTTTTCCCATTTAAAAAAACAATTGTTCATACATTC 150
seq1 TAAAACTTGGAAGCCAAGTGGATCATTGTGTTAAGTCAGTTGATATAATA 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TAAAACTTGGAAGCCAAGTGGATCATTGTGTTAAGTCAGTTGATATAATA 200
seq1 CATATAATCAAGAATAAATATCTTGGTATAATAACTAGATAGAGAAAAAA 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CATATAATCAAGAATAAATATCTTGGTATAATAACTAGATAGAGAAAAAA 250
seq1 GTTGTGGCCACTGCAACTAAACAGTGGCTACTGTTTACTAAAGAGTGAAT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTTGTGGCCACTGCAACTAAACAGTGGCTACTGTTTACTAAAGAGTGAAT 300
seq1 TTTTGTGTTGTGCTTTTTAAAAATACAACACACATATACTTAGATATGGA 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTTTGTGTTGTGCTTTTTAAAAATACAACACACATATACTTAGATATGGA 350
seq1 TTATCTTAGCCTGTCAATTGCTGTAATAAAATACTGACCAAAAACAACTT 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTATCTTAGCCTGTCAATTGCTGTAATAAAATACTGACCAAAAACAACTT 400
seq1 GAAGAGAGTGCTTACTTCAGTTTACAGGTTGCAGTTGCTCATCAAATAAG 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAAGAGAGTGCTTACTTCAGTTTACAGGTTGCAGTTGCTCATCAAATAAG 450
seq1 GCTGAGGCAGAGCTAAGGGCAGGAACCTGAAGTCAGGAACTAAAGCAGAG 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GCTGAGGCAGAGCTAAGGGCAGGAACCTGAAGTCAGGAACTAAAGCAGAG 500
seq1 ACCACAGTGGAAGGCTGCTTACTGGCTTGCTCTTCATGACTTACTCAACT 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACCACAGTGGAAGGCTGCTTACTGGCTTGCTCTTCATGACTTACTCAACT 550
seq1 GGCCTTCTTATACAACCCAACCACCCGCGCAGGTGTGACACTGTCCACAG 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGCCTTCTTATACAACCCAACCACCCGCGCAGGTGTGACACTGTCCACAG 600
seq1 TGCCCTACATCCTCCCACACCAGTCATTAGGAAACTGCTCCCCAGACACG 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGCCCTACATCCTCCCACACCAGTCATTAGGAAACTGCTCCCCAGACACG 650
seq1 CCCACAGGCCATCAGCTGTAGACAATTCCCCAAAAGATGTTCCTTCATCC 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCCACAGGCCATCAGCTGTAGACAATTCCCCAAAAGATGTTCCTTCATCC 700
seq1 CAGGTAAAACTAGTAGTTTTAAATTGACAAAAACTAGCCAGCACAGTGAT 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAGGTAAAACTAGTAGTTTTAAATTGACAAAAACTAGCCAGCACAGTGAT 750
seq1 TGGTTTGCTGCTCCGACTTCTGTTTGGTTTGTTGTTGTTGATGTTGCTTA 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGGTTTGCTGCTCCGACTTCTGTTTGGTTTGTTGTTGTTGATGTTGCTTA 800
seq1 GTTTATTTTACTTTTGAAATGATTGGCAAACCACTCTAAAGGAAACCAGG 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTTTATTTTACTTTTGAAATGATTGGCAAACCACTCTAAAGGAAACCAGG 850
seq1 GAAATGACATACGTGCTGGTGAAGTATTTCTGAATACAGATTCCCAAACA 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAAATGACATACGTGCTGGTGAAGTATTTCTGAATACAGATTCCCAAACA 900
seq1 AACAATAGCAAAAAGGGAAGAACCACACATGAATTGACTGAAACAGAAAT 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AACAATAGCAAAAAGGGAAGAACCACACATGAATTGACTGAAACAGAAAT 950
seq1 GGCTGTCTGATACACACAGGAACAGAAGGAATACAAATAACAACTTATAC 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2 GGCTGTCTGATACACACAGGAACAGAAGGAATACAAATA--CACTTATAC 998
seq1 TAAACTCAGTCTCTATTGGTTAGCACATCAGAATAAGATCATCATAAAAT 1050
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2 TAAACTCAGTCTCTATTGGTTAGCACATCAGA--TAGATCATCATAAAAT 1046
seq1 ACATTCATAGTCAGACAA-AACAAAAACAAAACAAAAACAAAAAAACAGA 1099
|||||||||||| ||||| || | ||||||||| ||||||| ||
seq2 ACATTCATAGTCCGACAACAAAACAAACAAAAC-------AAAAAACGGA 1089
seq1 AAACACCACC 1109
||||||||||
seq2 AAACACCACC 1099
| seq1: chr11_3948914_3949138
seq2: B6Ng01-166E22.g_72_296 (reverse)
seq1 CCTCCTTCTCCTTCTCCTGTTTTTCCTTTCCCTCTCTCCTGTTGGGAGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCTCCTTCTCCTTCTCCTGTTTTTCCTTTCCCTCTCTCCTGTTGGGAGCC 50
seq1 GCGCCCACATTCGCCGTTACAAGATGGCGCTGACAGCTGTGTTCTAAGTG 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GCGCCCACATTCGCCGTTACAAGATGGCGCTGACAGCTGTGTTCTAAGTG 100
seq1 GTAAACAAATAATCTGCGCATGTGCCAAGGGTATCTTATGACTACTTGTG 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTAAACAAATAATCTGCGCATGTGCCAAGGGTATCTTATGACTACTTGTG 150
seq1 CTCTGCCTTCCCCGTGACGTCAACTCGGCCGATGGGCTGCAGCCAATCAG 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTCTGCCTTCCCCGTGACGTCAACTCGGCCGATGGGCTGCAGCCAATCAG 200
seq1 GGAGTGACACGTCCGAGGCGAAGGA 225
|||||||||||||||||||||||||
seq2 GGAGTGACACGTCCGAGGCGAAGGA 225
|