BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-170B18
Chromosome11 (Build37)
Map Location 7,287,330 - 7,447,221
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneZmiz2, Ppia, H2afv, LOC665277, LOC665283, LOC626342, Purb, Myo1g, LOC100041286, Ccm2, LOC665327, AB182283, Tbrg4, Wap, LOC100041311, Ramp3, LOC665314, LOC626419, LOC665339, LOC665343, LOC100041332, Adcy1, LOC100041347, Igfbp1, Igfbp3
Downstream geneLOC665380, Tns3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-170B18.bB6Ng01-170B18.g
ACCDH960907DH960908
length1,1281,224
definitionDH960907|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-170B18, 5' end.DH960908|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-170B18, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(7,287,330 - 7,288,451)(7,446,001 - 7,447,221)
sequence
gaattctttaaattgaaaggaaaaacaaccaaagacctaatgttcaaaca
atgagacaattacatagccaaaatagacgcaaatacaatataaatacatt
tggttaaaattcaattagatttggcaaactccctacatcatgttttcatg
attggtaaaagcattataatgttaactactgtggtgcccatagatgaaga
gatacatttgcagtcatcccagctccaagtaggagcaacacctcagagca
ccatggatgggaaaagatgtacatagggagtctgaaggtgaacacttctg
caagtctggactttataaactgatattgagggcagtttgatagatgttgg
ccagcacccagtggtcaagtaagaattcatgtcacagggtaaaaacaaaa
taagcaattagagattttattgaattttagcttacactataaacatctac
catcaaaacagcagatggccaggaaattgaggaaaagtggttagctatag
gatacaagccattatggccaatttatggttatatagtccatttagagctg
accagagaattacagacaggtgggactactagttccctatcttccaaagc
tggaaatgctgtctgcttataggccattactccaggcttgaagagtttca
ggcagtctgctctatgacgtggctcatatcagaagaggacaaactttgaa
gtcccaggatatatctgtgttaagggttttcatactgaaccaacaagatg
ggggatttgggaataggaaaacaccagtgactttcatctcaaattataca
gagccatacatgagttcatattgatgcctctaattctaatctgttactgt
gagggtcatttcagccctctgccctcaattgtctgtggattctcttcgag
cagtggaaaccctgtttccgaccacctgccaaacacttacctaattgttc
cattgacctgctatgtagagcaattacagaggtgttaaattttttaatct
accttattctttttcagtctgagtcacatgaaagtttttgtggctgtcct
cttacttcttttgttaggtctcatggccagggtttatttctgatagggtg
tccttctggcatggggaccattgcagga
gaattcagagctctgatcatcagagatgctttgtctagggagtctaagca
gtatatctacatcctcctgaagatggccttttacagtgttatgctacact
gtggtaagctcactaaacagctaacaaactagcaaaatgcaagttatacc
taggagatgaaacagctgcccctgtcctgcagcagagtagtccagtagtt
cagtaggacctgtggtggtttgaatgagaatggaccccacaggctcatag
atttgaatgcttggtcaccagagagtggcactatttgaaagcattaggaa
gtgtagccaatgggtactgtggtttcaaaagtccagggttagcccagtgg
ctccctctcttcctgttgcctatagatctagatgtagaacccttggctac
ctctccagcatcatgtctgcctttgctgccattttccccaccgtgataat
aatgtgcactgtaagaaaaaacccaattaaatactttctttgtataaagg
ttgtcatggtcatggtgtctcttcacagcagtagaacactaactgaaacg
ctatcatacttctgattgggccacatttccctgtctatgaagagaaaaga
tacacccatcttacaatgaccaatatccattccaggatgtgcaaggatga
tgatattgtcccgaatcctttgctgctctgcccatgctcagaatttttct
caacagagcattccatctggggcgactgactacatgctaggcactgttct
aggcctttacacaaatagacttggctcatttttaagagcacgccccagtt
tacatgtggaaattgaacagagaaacatttaaatattacataggaaagcc
aggaagctgcgattcacccagaaataccagtgtactctcctggcatctgt
gagacccttcagtaccccatggagctgttcctgagggacacagtcatgac
tagctctgtacactgcaattcagtagctgagcaacgttgcaggatggagg
caagctttgtttgggttagtgaggctgagaaaccttctcttctggggaca
aaaatctaactggatatctctttgtcagagagggggttctcctccctttc
tatactgaagagagagagtacttaacctgctccaatggggttattgaatg
tcactcctttaaagaatagtcgcatctgagaggagttaagaccagacctt
tcaggaattaaccgagtttgtggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_7287330_7288451
seq2: B6Ng01-170B18.b_44_1171

seq1  GAATTCTTTAAATTGAAAGGAAAAACAACCAAAGACCTAATGTTCAAACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTAAATTGAAAGGAAAAACAACCAAAGACCTAATGTTCAAACA  50

seq1  ATGAGACAATTACATAGCCAAAATAGACGCAAATACAATATAAATACATT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGACAATTACATAGCCAAAATAGACGCAAATACAATATAAATACATT  100

seq1  TGGTTAAAATTCAATTAGATTTGGCAAACTCCCTACATCATGTTTTCATG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTAAAATTCAATTAGATTTGGCAAACTCCCTACATCATGTTTTCATG  150

seq1  ATTGGTAAAAGCATTATAATGTTAACTACTGTGGTGCCCATAGATGAAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGTAAAAGCATTATAATGTTAACTACTGTGGTGCCCATAGATGAAGA  200

seq1  GATACATTTGCAGTCATCCCAGCTCCAAGTAGGAGCAACACCTCAGAGCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATACATTTGCAGTCATCCCAGCTCCAAGTAGGAGCAACACCTCAGAGCA  250

seq1  CCATGGATGGGAAAAGATGTACATAGGGAGTCTGAAGGTGAACACTTCTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGGATGGGAAAAGATGTACATAGGGAGTCTGAAGGTGAACACTTCTG  300

seq1  CAAGTCTGGACTTTATAAACTGATATTGAGGGCAGTTTGATAGATGTTGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTCTGGACTTTATAAACTGATATTGAGGGCAGTTTGATAGATGTTGG  350

seq1  CCAGCACCCAGTGGTCAAGTAAGAATTCATGTCACAGGGTAAAAACAAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCACCCAGTGGTCAAGTAAGAATTCATGTCACAGGGTAAAAACAAAA  400

seq1  TAAGCAATTAGAGATTTTATTGAATTTTAGCTTACACTATAAACATCTAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGCAATTAGAGATTTTATTGAATTTTAGCTTACACTATAAACATCTAC  450

seq1  CATCAAAACAGCAGATGGCCAGGAAATTGAGGAAAAGTGGTTAGCTATAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCAAAACAGCAGATGGCCAGGAAATTGAGGAAAAGTGGTTAGCTATAG  500

seq1  GATACAAGCCATTATGGCCAATTTATGGTTATATAGTCCATTTAGAGCTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATACAAGCCATTATGGCCAATTTATGGTTATATAGTCCATTTAGAGCTG  550

seq1  ACCAGAGAATTACAGACAGGTGGGACTACTAGTTCCCTATCTTCCAAAGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGAGAATTACAGACAGGTGGGACTACTAGTTCCCTATCTTCCAAAGC  600

seq1  TGGAAATGCTGTCTGCTTATAGGCCATTACTCCAGGCTTGAAGAGTTTCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAATGCTGTCTGCTTATAGGCCATTACTCCAGGCTTGAAGAGTTTCA  650

seq1  GGCAGTCTGCTCTATGACGTGGCTCATATCAGAAGAGGACAAACTTTGAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGTCTGCTCTATGACGTGGCTCATATCAGAAGAGGACAAACTTTGAA  700

seq1  GTCCCAGGATATATCTGTGTTAAGGGTTTTCATACTGAACCAACAAGATG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCAGGATATATCTGTGTTAAGGGTTTTCATACTGAACCAACAAGATG  750

seq1  GGGGATTTGGGAATAGGAAAACACCAGTGACTTTCATCTCAAATTATACA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGATTTGGGAATAGGAAAACACCAGTGACTTTCATCTCAAATTATACA  800

seq1  GAGCCATACATGAGTTCATATTGATGCCTCTAATTCTAATCTGTTACTGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCATACATGAGTTCATATTGATGCCTCTAATTCTAATCTGTTACTGT  850

seq1  GAGGGTCATTTCAGCCCTCTGCCCTCAATTGTCTGTGGATTCTCTTCGAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGTCATTTCAGCCCTCTGCCCTCAATTGTCTGTGGATTCTCTTCGAG  900

seq1  CAGTGGAAACCCTGTTTCCGACCACCTGCCAAACACTTACCTAATTGTTC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGGAAACCCTGTTTCCGACCACCTGCCAAACACTTACCTAATTGTTC  950

seq1  CATTGACCTGCATATGTAGAGCAATTACAGAGTTGTTAAATTTTTTAATC  1000
      ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  CATTGACCTGC-TATGTAGAGCAATTACAGAGGTGTTAAATTTTTTAATC  999

seq1  TACC-TATTC-TTTTCAGTCTGAGTCACATGAAAGTTTTTGTGGCTGTCC  1048
      |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTTATTCTTTTTCAGTCTGAGTCACATGAAAGTTTTTGTGGCTGTCC  1049

seq1  TC-TACTTC-TTTGTAAGTTCTCATGGTCAGGGTTTATATCTGAT-GGGT  1095
      || |||||| ||||| || |||||||| |||||||||| |||||| ||||
seq2  TCTTACTTCTTTTGTTAGGTCTCATGGCCAGGGTTTATTTCTGATAGGGT  1099

seq1  G-CCTTCTGCCAT-GGGACCATTGCAGGA  1122
      | ||||||| ||| |||||||||||||||
seq2  GTCCTTCTGGCATGGGGACCATTGCAGGA  1128

seq1: chr11_7446001_7447221
seq2: B6Ng01-170B18.g_68_1291 (reverse)

seq1  CCCA-AAACTTGGTTCAATTCCTGAAAAAGCTGCTGCTTATACCTCTCAT  49
      |||| ||||| |||| |||||||||||   ||| |  | |  ||||||| 
seq2  CCCACAAACTCGGTT-AATTCCTGAAAGGTCTGGTCTTAACTCCTCTCA-  48

seq1  GAT--GGCAATCTTTTAAAGAGGGTGACATTCAAATGACACATTGTAGCA  97
      |||  | | ||  ||||||| | |||||||||||    | ||||| ||||
seq2  GATGCGACTATTCTTTAAAG-GAGTGACATTCAATAACCCCATTGGAGCA  97

seq1  -GTTAAGAAATCTCTCT-TACAGT-TAGAAAGGAAGAGGAACCCCCT-GC  143
       |||||| | ||||||| | |||| |||||||| ||  |||||||||  |
seq2  GGTTAAGTACTCTCTCTCTTCAGTATAGAAAGGGAGGAGAACCCCCTCTC  147

seq1  TGGCTAAGAGGGTAT-CAG-TAGATATTTGTGCCCATGAAGAG-AGGTTT  190
      || | |||| | ||| ||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||||
seq2  TGACAAAGA-GATATCCAGTTAGATTTTTGTCCCCA-GAAGAGAAGGTTT  195

seq1  CTCAGCTTCACTAACCCAACAAAAGCATGCCTCCATCCTTGCAAACGTTG  240
      |||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||| |||||||
seq2  CTCAGCCTCACTAACCCAAACAAAGCTTGCCTCCATCC-TGC-AACGTTG  243

seq1  CTCAGCTACTGAATTGCAGTGTACAGAGCTAGTCATGACTGTGTCCCTCA  290
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGCTACTGAATTGCAGTGTACAGAGCTAGTCATGACTGTGTCCCTCA  293

seq1  GGAACAGCTCCATGGGGTACTGAAGGGTCTCACAGATGCCAGGAGAGTAC  340
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACAGCTCCATGGGGTACTGAAGGGTCTCACAGATGCCAGGAGAGTAC  343

seq1  ACTGGTATTTCTGGGTGAATCGCAGCTTCCTGGCTTTCCTATGTAATATT  390
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGTATTTCTGGGTGAATCGCAGCTTCCTGGCTTTCCTATGTAATATT  393

seq1  TAAATGTTTCTCTGTTCAATTTCCACATGTAAACTGGGGCGTGCTCTTAA  440
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATGTTTCTCTGTTCAATTTCCACATGTAAACTGGGGCGTGCTCTTAA  443

seq1  AAATGAGCCAAGTCTATTTGTGTAAAGGCCTAGAACAGTGCCTAGCATGT  490
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGAGCCAAGTCTATTTGTGTAAAGGCCTAGAACAGTGCCTAGCATGT  493

seq1  AGTCAGTCGCCCCAGATGGAATGCTCTGTTGAGAAAAATTCTGAGCATGG  540
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCAGTCGCCCCAGATGGAATGCTCTGTTGAGAAAAATTCTGAGCATGG  543

seq1  GCAGAGCAGCAAAGGATTCGGGACAATATCATCATCCTTGCACATCCTGG  590
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAGCAGCAAAGGATTCGGGACAATATCATCATCCTTGCACATCCTGG  593

seq1  AATGGATATTGGTCATTGTAAGATGGGTGTATCTTTTCTCTTCATAGACA  640
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGATATTGGTCATTGTAAGATGGGTGTATCTTTTCTCTTCATAGACA  643

seq1  GGGAAATGTGGCCCAATCAGAAGTATGATAGCGTTTCAGTTAGTGTTCTA  690
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAAATGTGGCCCAATCAGAAGTATGATAGCGTTTCAGTTAGTGTTCTA  693

seq1  CTGCTGTGAAGAGACACCATGACCATGACAACCTTTATACAAAGAAAGTA  740
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTGTGAAGAGACACCATGACCATGACAACCTTTATACAAAGAAAGTA  743

seq1  TTTAATTGGGTTTTTTCTTACAGTGCACATTATTATCACGGTGGGGAAAA  790
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAATTGGGTTTTTTCTTACAGTGCACATTATTATCACGGTGGGGAAAA  793

seq1  TGGCAGCAAAGGCAGACATGATGCTGGAGAGGTAGCCAAGGGTTCTACAT  840
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAGCAAAGGCAGACATGATGCTGGAGAGGTAGCCAAGGGTTCTACAT  843

seq1  CTAGATCTATAGGCAACAGGAAGAGAGGGAGCCACTGGGCTAACCCTGGA  890
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGATCTATAGGCAACAGGAAGAGAGGGAGCCACTGGGCTAACCCTGGA  893

seq1  CTTTTGAAACCACAGTACCCATTGGCTACACTTCCTAATGCTTTCAAATA  940
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTGAAACCACAGTACCCATTGGCTACACTTCCTAATGCTTTCAAATA  943

seq1  GTGCCACTCTCTGGTGACCAAGCATTCAAATCTATGAGCCTGTGGGGTCC  990
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCACTCTCTGGTGACCAAGCATTCAAATCTATGAGCCTGTGGGGTCC  993

seq1  ATTCTCATTCAAACCACCACAGGTCCTACTGAACTACTGGACTACTCTGC  1040
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTCATTCAAACCACCACAGGTCCTACTGAACTACTGGACTACTCTGC  1043

seq1  TGCAGGACAGGGGCAGCTGTTTCATCTCCTAGGTATAACTTGCATTTTGC  1090
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGGACAGGGGCAGCTGTTTCATCTCCTAGGTATAACTTGCATTTTGC  1093

seq1  TAGTTTGTTAGCTGTTTAGTGAGCTTACCACAGTGTAGCATAACACTGTA  1140
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTTGTTAGCTGTTTAGTGAGCTTACCACAGTGTAGCATAACACTGTA  1143

seq1  AAAGGCCATCTTCAGGAGGATGTAGATATACTGCTTAGACTCCCTAGACA  1190
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGCCATCTTCAGGAGGATGTAGATATACTGCTTAGACTCCCTAGACA  1193

seq1  AAGCATCTCTGATGATCAGAGCTCTGAATTC  1221
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCATCTCTGATGATCAGAGCTCTGAATTC  1224