BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-179K19
Chromosome11 (Build37)
Map Location 67,266,682 - 67,454,714
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGas7
Upstream geneGm879, LOC668323, A530088H08Rik, 9130409J20Rik, A730055C05Rik, 2310004I24Rik, Sco1, Myh3, Myh2, Myh1, Myh4, Myh8, Myh13
Downstream geneRcvrn, Glp2r, LOC544792, Dhrs7c, LOC100041899, Usp43, Wdr16, Stx8, Ntn1, Pik3r5, BB220380, BC024997, Ccdc42
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-179K19.bB6Ng01-179K19.g
ACCGA006327GA006328
length910842
definitionB6Ng01-179K19.b B6Ng01-179K19.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(67,453,817 - 67,454,714)(67,266,682 - 67,267,513)
sequence
gaattctaatccagccagggctgtagagtgagtctccatctcaagaaagc
aaagcaaaaataaaaataaaaaacataaaaagagctggggatgtggctcg
gtgggagaatgtctctagcatattcaagggtttcagttcactccttagaa
gcactcatgcacacacacatacaccacaacacaaacacataccacacaca
tatcacacataccacaccacatataacacacatcacacacatcactcatg
ctcccccactcatacacatacacacataccacatacacacatcacacaca
tagaatattcaccaaacacacatcatacataccatatccatataccacac
acacatacacacacacaccacacaccagacatactatatacacacacaca
acacatacacccacataccacatataccacacacactctacgtactacac
acacaaacagacacacataagcacacccataccacacacacacacacaca
cacacacacacactacagacacgcttacacacacacatcacacaaacaca
taaacacacacacacatagacacacaaacacaccactcaccttacaaaca
tatgagacttttaaatttcacactcctctagaatgtgtgtttcttggtgc
atactcacatccccacttgcgtgctgctaagactccttttccagggctag
gggaagccccactgcaacgcttttccattgccgatgctcaacacacttgt
cacagccagtttcaagcctcagtctagcttcctactcttgacctcatggg
gatcacactttgagactcacactctttcccagattccgtaagtttggggg
aagctatttctcctctctgtctccctctctactcttcccccccacccccg
tgttgtgtgt
gaattctcttaagatgtggttggtccattggtatttttaggaagcttttg
ttgttgtaattttgtctcctgtttttttttttctttttgagacagaccca
aaccctacaacacacactggcctggacctcactatatcactcaggcagac
cttgaactttctggtggttttcctgcctcagcctcctgaatgctgggatt
agaagacgtcatcctccagtttaacagctgttttctattatctcttaaca
gcagctgggctgaaggaagcttgtccacaattcctggacaagcactagct
gtaagtgcacttgtcaggttgcccaggattctccttaggtgagatggctt
ctgtgtagactggggcccaggcaatgctctcaaagctgaggtgggcccag
ctgaatggctttgaaaagctacagggattgttctaatgtcctgccaagac
cacagtgctaaaggaacttgattcaaagctcagacaaattatgcaagaat
ttaaggctttttgtacctaatactgaactgactttgtctcagcctaaaac
gctgagaggtttgtgcccagctgaatagccataggaagccatacaagctt
actgagcaaggggcataaggagttggtcagtactataagctgtgtacccc
ttatcggaaaaacttggcaggaaacagaagtaggcatatctctgtgagtt
aagaggtaaagcctggttttacatagttttcaggtaagcccagagctaca
tagtaacatttcccttgtttaagaatgggggaaatggggaagtatagaaa
cagaaatgggaccgaaaatgttgaggatttttgtaattgttt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_67453817_67454714
seq2: B6Ng01-179K19.b_36_945 (reverse)

seq1  ACACACACACAC-GGGGTGGGGGG--AGAGTAGAGAGGGAGACAGAGAGG  47
      ||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACA-ACACGGGGGTGGGGGGGAAGAGTAGAGAGGGAGACAGAGAGG  49

seq1  AGAAATAGCTTCCCC--AACTTACGG-ATCTGGGAAAGAGTGTGAGTCTC  94
      |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAATAGCTTCCCCCAAACTTACGGAATCTGGGAAAGAGTGTGAGTCTC  99

seq1  -AAGTGTGAT-CCCATGAGGTCAAGAGTAGGAAGCTAGACTGAGGCTTGA  142
       ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTGTGATCCCCATGAGGTCAAGAGTAGGAAGCTAGACTGAGGCTTGA  149

seq1  AACTGGCTGTGACAAGTGTGTTGAGCATCGGCAATGG-AAAGCGTTGCAG  191
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  AACTGGCTGTGACAAGTGTGTTGAGCATCGGCAATGGAAAAGCGTTGCAG  199

seq1  TGGGGCTTCCCCTAGCCCTGG-AAAGGAGTCTTAGCAGCACGC-AGTGGG  239
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TGGGGCTTCCCCTAGCCCTGGAAAAGGAGTCTTAGCAGCACGCAAGTGGG  249

seq1  GATGTGAGTATGCACCAAGAAACACACATTCTAGAGGAGTGTGAA--TTT  287
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || 
seq2  GATGTGAGTATGCACCAAGAAACACACATTCTAGAGGAGTGTGAAATTTA  299

seq1  AAAGTCTCATATGTTTGTAAGGTGAGTGGTGTGTTTGTGTGTCTATGTGT  337
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTCTCATATGTTTGTAAGGTGAGTGGTGTGTTTGTGTGTCTATGTGT  349

seq1  GTGTGTGTTTATGTGTTTGTGTGATGTGTGTGTGTAAGCGTGTCTGTAGT  387
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTTTATGTGTTTGTGTGATGTGTGTGTGTAAGCGTGTCTGTAGT  399

seq1  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGTATGGGTGTGCTTATGTGTG  437
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGTATGGGTGTGCTTATGTGTG  449

seq1  TCTGTTTGTGTGTGTAGTACGTAGAGTGTGTGTGGTATATGTGGTATGTG  487
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTTTGTGTGTGTAGTACGTAGAGTGTGTGTGGTATATGTGGTATGTG  499

seq1  GGTGTATGTGTTGTGTGTGTGTATATAGTATGTCTGGTGTGTGGTGTGTG  537
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTATGTGTTGTGTGTGTGTATATAGTATGTCTGGTGTGTGGTGTGTG  549

seq1  TGTGTATGTGTGTGTGGTATATGGATATGGTATGTATGATGTGTGTTTGG  587
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTATGTGTGTGTGGTATATGGATATGGTATGTATGATGTGTGTTTGG  599

seq1  TGAATATTCTATGTGTGTGATGTGTGTATGTGGTATGTGTGTATGTGTAT  637
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATATTCTATGTGTGTGATGTGTGTATGTGGTATGTGTGTATGTGTAT  649

seq1  GAGTGGGGGAGCATGAGTGATGTGTGTGATGTGTGTTATATGTGGTGTGG  687
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGGGGGAGCATGAGTGATGTGTGTGATGTGTGTTATATGTGGTGTGG  699

seq1  TATGTGTGATATGTGTGTGGTATGTGTTTGTGTTGTGGTGTATGTGTGTG  737
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTGTGATATGTGTGTGGTATGTGTTTGTGTTGTGGTGTATGTGTGTG  749

seq1  TGCATGAGTGCTTCTAAGGAGTGAACTGAAACCCTTGAATATGCTAGAGA  787
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATGAGTGCTTCTAAGGAGTGAACTGAAACCCTTGAATATGCTAGAGA  799

seq1  CATTCTCCCACCGAGCCACATCCCCAGCTCTTTTTATGTTTTTTATTTTT  837
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCTCCCACCGAGCCACATCCCCAGCTCTTTTTATGTTTTTTATTTTT  849

seq1  ATTTTTGCTTTGCTTTCTTGAGATAGAGACTCACTCTACAGCCCTGGCTG  887
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTTGCTTTGCTTTCTTGAGATGGAGACTCACTCTACAGCCCTGGCTG  899

seq1  GATTAGAATTC  898
      |||||||||||
seq2  GATTAGAATTC  910

seq1: chr11_67266682_67267513
seq2: B6Ng01-179K19.g_66_907

seq1  GAATTCTCTTAAGATGTGGTTGGTCCATTGGTATTTTTAGGAAGCTTTTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTTAAGATGTGGTTGGTCCATTGGTATTTTTAGGAAGCTTTTG  50

seq1  TTGTTGTAATTTTGTCTCCTGTTTTTTTTTTTCTTTTTGAGACAGACCCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTGTAATTTTGTCTCCTGTTTTTTTTTTTCTTTTTGAGACAGACCCA  100

seq1  AACCCTACAACACACACTGGCCTGGACCTCACTATATCACTCAGGCAGAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCTACAACACACACTGGCCTGGACCTCACTATATCACTCAGGCAGAC  150

seq1  CTTGAACTTTCTGGTGGTTTTCCTGCCTCAGCCTCCTGAATGCTGGGATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGAACTTTCTGGTGGTTTTCCTGCCTCAGCCTCCTGAATGCTGGGATT  200

seq1  AGAAGACGTCATCCTCCAGTTTAACAGCTGTTTTCTATTATCTCTTAACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGACGTCATCCTCCAGTTTAACAGCTGTTTTCTATTATCTCTTAACA  250

seq1  GCAGCTGGGCTGAAGGAAGCTTGTCCACAATTCCTGGACAAGCACTAGCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCTGGGCTGAAGGAAGCTTGTCCACAATTCCTGGACAAGCACTAGCT  300

seq1  GTAAGTGCACTTGTCAGGTTGCCCAGGATTCTCCTTAGGTGAGATGGCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAGTGCACTTGTCAGGTTGCCCAGGATTCTCCTTAGGTGAGATGGCTT  350

seq1  CTGTGTAGACTGGGGCCCAGGCAATGCTCTCAAAGCTGAGGTGGGCCCAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGTAGACTGGGGCCCAGGCAATGCTCTCAAAGCTGAGGTGGGCCCAG  400

seq1  CTGAATGGCTTTGAAAAGCTACAGGGATTGTTCTAATGTCCTGCCAAGAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAATGGCTTTGAAAAGCTACAGGGATTGTTCTAATGTCCTGCCAAGAC  450

seq1  CACAGTGCTAAAGGAACTTGATTCAAAGCTCAGACAAA-TATGCAAGAAT  499
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  CACAGTGCTAAAGGAACTTGATTCAAAGCTCAGACAAATTATGCAAGAAT  500

seq1  TTAAGGCTTTTTGTACCTAATACTGAACTGACTTTGTCTCAGCCTAAAAC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGGCTTTTTGTACCTAATACTGAACTGACTTTGTCTCAGCCTAAAAC  550

seq1  GCTGAGAGGTTTGTGCCCAGCTGAATAGCCATAGGAAGCCATACAAGCTT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAGAGGTTTGTGCCCAGCTGAATAGCCATAGGAAGCCATACAAGCTT  600

seq1  ACTGAGCAAGGGGCATAAGGAGTTGGTCAGTACTATAAGCTGTGTACCCC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAGCAAGGGGCATAAGGAGTTGGTCAGTACTATAAGCTGTGTACCCC  650

seq1  TTATCGGAAAAACTTGGCAGGAAACAGAAGTAGGCAGATCTCTGTGAGTT  699
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TTATCGGAAAAACTTGGCAGGAAACAGAAGTAGGCATATCTCTGTGAGTT  700

seq1  AAGAGGT-AAGCCTGG-TTTACATAG-TTTCAGGTAAG-CCAGAGCTACA  745
      ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||
seq2  AAGAGGTAAAGCCTGGTTTTACATAGTTTTCAGGTAAGCCCAGAGCTACA  750

seq1  TAGTAACA-TTCCCTTGTTTAAGAAT-GGGGAAAT-GGGAAGTAAAGAAA  792
      |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||
seq2  TAGTAACATTTCCCTTGTTTAAGAATGGGGGAAATGGGGAAGTATAGAAA  800

seq1  CAGAAATGGGACCGAAAATGTTGAGGA-TTTTGTAA-TGTTT  832
      ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||
seq2  CAGAAATGGGACCGAAAATGTTGAGGATTTTTGTAATTGTTT  842