BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-184P08
Chromosome11 (Build37)
Map Location 83,737,784 - 83,876,718
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDdx52, Ap1gbp1, Dusp14
Upstream geneUnc45b, Slfn5, Set8-ps, Slfn9, Slfn8, LOC668706, Slfn10, Slfn2, Slfn1, Slfn4, Slfn3, LOC100043636, LOC435271, Slfn14, Pex12, Ap2b1, Rasl10b, OTTMUSG00000000934, 1700020L24Rik, Mmp28, Taf15, OTTMUSG00000000990, Ccl5, Ccl9, Ccl6, LOC194905, Ccl3, Ccl4, OTTMUSG00000000971, Expi, 1100001G20Rik, 2700008B19Rik, LOC676191, Tcf2
Downstream geneTada2l, OTTMUSG00000000997, Acaca, LOC100043671, Aatf, Lhx1, Mrm1, BC022224, Ggnbp2, Pigw, Znhit3, Car4, Usp32
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-184P08.bB6Ng01-184P08.g
ACCGA010200GA010201
length912955
definitionB6Ng01-184P08.b B6Ng01-184P08.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(83,737,784 - 83,738,693)(83,875,766 - 83,876,718)
sequence
gaattcagttaggcaggagctcagggactgctctctgcgtgcctgtgtgt
ctgtgatggagagcacaggacagaagacccatgttcacagccaggctgac
atgtctctttatatgtccatctctccatgtgctccagagtcagcttgcag
tctctatgaaatcatgggcactctattttattaagccacacaagcagcta
gaaagttctctcagatggagacctcatcttgtccgacctatgggacatct
cttcatgccccactaagtataagcttcccagtaacattaatgatggccgg
tcctcacggttacctacgcacctgggccagttttaggttcttggttctta
tcacataaaggcctgctctaaggagcttggtttatatgaagctcagacaa
aaccctagaaaggactgctagtcttgggtgtcttattaaagaggaatgga
gattatgtcttgggacagaaggttcatagagcttataaggcaagacaatt
ggtattccctgtgccacaagtttaccacattgggctctaacataatagtg
actcagcatgtatttgaagtatgttctaactttacatgtacctattcctc
ttgatccacgaaacaacccatttaaaaaaaaatgagagaaccaacgggta
tttgaaaaattaaagcactattctgaggccatggggctagtagctcaggc
tcctttcagctcagaggctgaactggtagccacgccaagcctgcacaagt
tttaaaaatcagtctactttacctttagtgatctagcttccaagtcaaaa
aagatcgatacccccacctggtatatagtgctgtagcattctcagggcat
tcagttgacatatggaggtgatgctgatggtggtagtgactggatggaat
gaggggagtgca
gaattcaatgcccctaacagctgagccatctttccagcccccactaattt
tttttttttttttttttgcttgtaaaattttttttgtttgtttcagatct
ggctttcaggaaaagatagccctgagaataggattaaaaagtattgtcag
aagagagagcccattggtgtgttttgataacctcttgacttggcagctgc
tgccagccacttgtcagtgacttgttagtgaggctggctcagctcatctg
ggtgcgtcagtggtgactgaccagagagcacttcctgccctgtttgtcag
ctgttaactcctccttccatcctgtagtctctggaggagaaggcactttt
gaaatccatgcctagtcaagtcccagatggatggcctatggcggttgttg
ttttttgagattatatcattgaagctttttatttttttttattttttttt
tatgaagagttcagtcagctgtggaggcccgctcctgtatttctggcact
tggatggcagaggatggaggattaaaagttcctctgctaaacagcaaatg
taaggccagccagggatcaggagaccctgttccagaaaacaaaaagctct
ataaagtattcatcctttactgaaatgtttctgccaacctatttatttac
ttatttatttttccaacctatttattttatttactgtttgcgatactgtg
tgtgtgttctcacagcagtctgtaacccaagttccaggtaatatgatgcc
ctcttctggcctcctcacataccaggtatatacataccagacacatgcac
aaaggtgtaaggcaacccccccccccccaacataaaacaatttctaaacc
taagacagaaaaatgggaattaattttgtcagcactctttttttttttta
gatttatttatttaatttatgtacatgagtacacctgtagctgtcttcag
cacca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_83737784_83738693
seq2: B6Ng01-184P08.b_44_955

seq1  GAATTCAGTTAGGCAGGAGCTCAGGGACTGCTCTCTGCGTGCCTGTGTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTTAGGCAGGAGCTCAGGGACTGCTCTCTGCGTGCCTGTGTGT  50

seq1  CTGTGATGGAGAGCACAGGACAGAAGACCCATGTTCACAGCCAGGCTGAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGATGGAGAGCACAGGACAGAAGACCCATGTTCACAGCCAGGCTGAC  100

seq1  ATGTCTCTTTATATGTCCATCTCTCCATGTGCTCCAGAGTCAGCTTGCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCTCTTTATATGTCCATCTCTCCATGTGCTCCAGAGTCAGCTTGCAG  150

seq1  TCTCTATGAAATCATGGGCACTCTATTTTATTAAGCCACACAAGCAGCTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTATGAAATCATGGGCACTCTATTTTATTAAGCCACACAAGCAGCTA  200

seq1  GAAAGTTCTCTCAGATGGAGACCTCATCTTGTCCGACCTATGGGACATCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGTTCTCTCAGATGGAGACCTCATCTTGTCCGACCTATGGGACATCT  250

seq1  CTTCATGCCCCACTAAGTATAAGCTTCCCAGTAACATTAATGATGGCCGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCATGCCCCACTAAGTATAAGCTTCCCAGTAACATTAATGATGGCCGG  300

seq1  TCCTCACGGTTACCTACGCACCTGGGCCAGTTTTAGGTTCTTGGTTCTTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCACGGTTACCTACGCACCTGGGCCAGTTTTAGGTTCTTGGTTCTTA  350

seq1  TCACATAAAGGCCTGCTCTAAGGAGCTTGGTTTATATGAAGCTCAGACAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACATAAAGGCCTGCTCTAAGGAGCTTGGTTTATATGAAGCTCAGACAA  400

seq1  AACCCTAGAAAGGACTGCTAGTCTTGGGTGTCTTATTAAAGAGGAATGGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCTAGAAAGGACTGCTAGTCTTGGGTGTCTTATTAAAGAGGAATGGA  450

seq1  GATTATGTCTTGGGACAGAAGGTTCATAGAGCTTATAAGGCAAGACAATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTATGTCTTGGGACAGAAGGTTCATAGAGCTTATAAGGCAAGACAATT  500

seq1  GGTATTCCCTGTGCCACAAGTTTACCACATTGGGCTCTAACATAATAGTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTATTCCCTGTGCCACAAGTTTACCACATTGGGCTCTAACATAATAGTG  550

seq1  ACTCAGCATGTATTTGAAGTATGTTCTAACTTTACATGTACCTATTCCTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAGCATGTATTTGAAGTATGTTCTAACTTTACATGTACCTATTCCTC  600

seq1  TTGATCCACGAAACAACCCATTTAAAAAAAAATGAGAGAACCAACGGGTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATCCACGAAACAACCCATTTAAAAAAAAATGAGAGAACCAACGGGTA  650

seq1  TTTGAAAAATTAAAGCACTATTCTGAGGCCATGGGGCTAGTAGCTCAGGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAAAAATTAAAGCACTATTCTGAGGCCATGGGGCTAGTAGCTCAGGC  700

seq1  TCC-TTCAGCTCAGAGGCTGAACTGGTAGCCACGCCAAGCCTGCACAAGT  749
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTTCAGCTCAGAGGCTGAACTGGTAGCCACGCCAAGCCTGCACAAGT  750

seq1  TTTAAAAATCAGTCTACTTTACCTTTAGTGATCTAGCTTCCAAGTCAAAA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAAAATCAGTCTACTTTACCTTTAGTGATCTAGCTTCCAAGTCAAAA  800

seq1  AAGATCGATACCCCCACCTGGTATATAGTGCTGTAGCATTCTCAGGGCAT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATCGATACCCCCACCTGGTATATAGTGCTGTAGCATTCTCAGGGCAT  850

seq1  TCAGTTGACATATGGAGGTGATGCTGATGGTGGTAGTGACTGGATGG-AT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TCAGTTGACATATGGAGGTGATGCTGATGGTGGTAGTGACTGGATGGAAT  900

seq1  GAGGGGAGTGGA  910
      |||||||||| |
seq2  GAGGGGAGTGCA  912

seq1: chr11_83875766_83876718
seq2: B6Ng01-184P08.g_72_1026 (reverse)

seq1  TGGTGTGTCTGAAGACAGCTACA-GTGTACTCATGTACATAAAATAAATA  49
      |||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TGGTG---CTGAAGACAGCTACAGGTGTACTCATGTACATAAATTAAATA  47

seq1  AATAAATCT-AAAAAAAAAAAGAGTGCTGACAAAA-TAATTTCCATTTTT  97
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
seq2  AATAAATCTAAAAAAAAAAAAGAGTGCTGACAAAATTAATTCCCATTTTT  97

seq1  CTGTCTTAAGTTTTAGAAATTGTTTTATGTT-GGGGGGGGGGGGTTGCC-  145
      ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| 
seq2  CTGTCTT-AGGTTTAGAAATTGTTTTATGTTGGGGGGGGGGGGGTTGCCT  146

seq1  TACACCTTTGTGCATGTGTCTGGTATGTATATACCTGGTATGTGAGGAGG  195
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACCTTTGTGCATGTGTCTGGTATGTATATACCTGGTATGTGAGGAGG  196

seq1  CCAGAAGAGGGCATCATATTACCTGGAACTTGGGTTACAGACTGCTGTGA  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAAGAGGGCATCATATTACCTGGAACTTGGGTTACAGACTGCTGTGA  246

seq1  GAACACACACACAGTATCGCAAACAGT-AATAAAATAAATAGGTTGGAAA  294
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  GAACACACACACAGTATCGCAAACAGTAAATAAAATAAATAGGTTGGAAA  296

seq1  AATAAATAAGTAAATAAATAGGTTGGCAGAAACATTTCAGTAAAGGATGA  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAATAAGTAAATAAATAGGTTGGCAGAAACATTTCAGTAAAGGATGA  346

seq1  ATACTTTATAGAGCTTTTTGTTTTCTGGAACAGGGTCTCCTGATCCCTGG  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTTTATAGAGCTTTTTGTTTTCTGGAACAGGGTCTCCTGATCCCTGG  396

seq1  CTGGCCTTACATTTGCTGTTTAGCAGAGGAACTTTTAATCCTCCATCCTC  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCCTTACATTTGCTGTTTAGCAGAGGAACTTTTAATCCTCCATCCTC  446

seq1  TGCCATCCAAGTGCCAGAAATACAGGAGCGGGCCTCCACAGCTGACTGAA  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCATCCAAGTGCCAGAAATACAGGAGCGGGCCTCCACAGCTGACTGAA  496

seq1  CTCTTCATAAAAAAAAAATAAAAAAAAATAAAAAGCTTCAATGATATAAT  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTCATAAAAAAAAAATAAAAAAAAATAAAAAGCTTCAATGATATAAT  546

seq1  CTCAAAAAACAACAACCGCCATAGGCCATCCATCTGGGACTTGACTAGGC  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAAAAACAACAACCGCCATAGGCCATCCATCTGGGACTTGACTAGGC  596

seq1  ATGGATTTCAAAAGTGCCTTCTCCTCCAGAGACTACAGGATGGAAGGAGG  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGATTTCAAAAGTGCCTTCTCCTCCAGAGACTACAGGATGGAAGGAGG  646

seq1  AGTTAACAGCTGACAAACAGGGCAGGAAGTGCTCTCTGGTCAGTCACCAC  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTAACAGCTGACAAACAGGGCAGGAAGTGCTCTCTGGTCAGTCACCAC  696

seq1  TGACGCACCCAGATGAGCTGAGCCAGCCTCACTAACAAGTCACTGACAAG  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACGCACCCAGATGAGCTGAGCCAGCCTCACTAACAAGTCACTGACAAG  746

seq1  TGGCTGGCAGCAGCTGCCAAGTCAAGAGGTTATCAAAACACACCAATGGG  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTGGCAGCAGCTGCCAAGTCAAGAGGTTATCAAAACACACCAATGGG  796

seq1  CTCTCTCTTCTGACAATACTTTTTAATCCTATTCTCAGGGCTATCTTTTC  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTCTTCTGACAATACTTTTTAATCCTATTCTCAGGGCTATCTTTTC  846

seq1  CTGAAAGCCAGATCTGAAACAAACAAAAAAAATTTTACAAGCAAAAAAAA  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAAGCCAGATCTGAAACAAACAAAAAAAATTTTACAAGCAAAAAAAA  896

seq1  AAAAAAAAAAAATTAGTGGGGGCTGGAAAGATGGCTCAGCTGTTAGGGGC  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAAAAAATTAGTGGGGGCTGGAAAGATGGCTCAGCTGTTAGGGGC  946

seq1  ATTGAATTC  953
      |||||||||
seq2  ATTGAATTC  955