BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-203H16
Chromosome11 (Build37)
Map Location 72,123,933 - 72,284,550
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC628100, Tekt1, D130058I21Rik, Ggt6, Mybbp1a
Upstream gene9230020A06Rik, Wscd1, Aipl1, 6720460F02Rik, Pitpnm3, 4933427D14Rik, Txnl5, Med31, 4930563E22Rik, Slc13a5, Fbxo39
Downstream gene9830002I17Rik, LOC432577, Ube2g1, Ankfy1, Cyb5d2, Zzef1, LOC627119, Atp2a3, P2rx1, LOC100043309, Camkk1, 1200014J11Rik, Itgae, Gsg2, P2rx5, Tmem93, Tax1bp3, Ctns, Carkl, Trpv1, Trpv3, Aspa, Spata22, Olfr20, Olfr376, Olfr377-ps1, Olfr1, Olfr75-ps1, Olfr378, Olfr379-ps1, Olfr380
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-203H16.bB6Ng01-203H16.g
ACCGA023679GA023680
length990991
definitionB6Ng01-203H16.b B6Ng01-203H16.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(72,283,567 - 72,284,550)(72,123,933 - 72,124,919)
sequence
gaattcaaggatagcctgagctaaagtgagactctgtctcaaaaacatga
gtaaactagacccagtttaagagaaaataaattagaagatgagtctgaag
gagtcagcgtcaatgcaacactgagaaggggcagtgtgttgttgtttgtg
atattacctggtctttgtgacctgtgattggtcagctgtgaccttcccta
tggggagaatggaggaagtggaggcagaagaatcaggaagacatttttgt
gaaaggcttgaaggctcaagttcctgggcttttgtcttagatcgatcgat
agggcagcagagaaggcttgagagcagggcgtgaccatgtggttgtatgc
atcagtgttcacactgttgcccagtgcaggaacggatggcagaggaggct
ggaggctactcagggcttgagtttgtggggccacaggaaatgccaggatg
gggtagggatggaggaagagctggctcagagtgaaaccagacagtgtctt
caggccttgttcttctcaaccttgatgagtccaggaacatgctctgcttc
acagaccaaggttccatgggtacaactaggcagccccacagccaccctcc
caggagaccccaaaagccacctatggctggagacaccagcacaggctttc
tgtccaaagcagagcatagacagagcaatagtgctgttcttcctgcctga
gggctgagtgtggacagaccccagatgccactagtggagctatgtatgtt
tcgtgtcttccccatcagttggagtggcctgggttggacttgggatggca
gaggctacccacgtctgtctgagcatcctccctgcccacaggatgtggag
ggtgggtgtgtcttctcaaataacagcccagctgggagtctgactttggg
aaacaaaccctggttcagccatgaccaggcaagggcaggaggtaggcttc
atgtcacagtgggccttctttacacctaccttgccgtctc
gaattcaaggccaactaagttaaagtaagaccctgtgtcaaaaattaagt
aaacaaagaaacaaacaaacaaacaaatcaatggagaagggaagactagg
taaatggttaggtggtaaagcatttgtccttcatgcatgcagatggcctt
aggttcagtcttcagcatcacacacgcacacaagctgattctcccctctt
actcttctccagtcacatccctgaggaagcaatttcagcagcctgtgggt
tctcaacgggaaccctatcagcaaacacagggctgaatagtctacggccc
acatgttatcttagaatattcattactctgctgtttgcctcccccacccc
cagaggtgcagtccttcaaaaacaggagatctcaatagtttttttttaat
ttctttatgcatttatgttttataagaatgacctaatttcaccctgagtc
gggtgcttccgcacttttctccatctttgtcagacttagcaaggagaagt
acaatatgccccaaccaaacttgaatttcaaagaaatggggaccattttt
taatctcagtatgtctgcagacattgtaagagatctgccattatggtcca
ttttcagtatgaaaatgtgtttcagtgtgaaagtacatctagaagtacct
actgagtcccaagtaagcaggggacactgcccttgtctgcctctgcccgg
atgcttcttagtttatgtcagggttgaaaacattgcacaactgagcccct
gcactaggatagagaaggctctcaaaccaccacccaccaccaccaccact
tggggagcctatggtgggcagaagtttttcacacttgagaactataaaaa
ccacttgtaccaaatggggagcgctaaccatttttgcccttttctgtaga
gactgtacaaggttgtaagtcacttcaactgcttgcttctgtttcgctac
tctgagtctcccaattcttattatgagggggggtggggggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_72283567_72284550
seq2: B6Ng01-203H16.b_45_1034 (reverse)

seq1  GAGACGGCAAGGTAGGTGCTAAGAAG--CCACTGTGGCCATGAAGCCTAC  48
      ||||||||||||||||||  ||||||  ||||||| | ||||||||||||
seq2  GAGACGGCAAGGTAGGTGTAAAGAAGGCCCACTGT-GACATGAAGCCTAC  49

seq1  CTCCTGCCCTTGCCTGGTC-TGGCTGAACCAGGG-TTGTTTCCCAAGTTC  96
      ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||
seq2  CTCCTGCCCTTGCCTGGTCATGGCTGAACCAGGGTTTGTTTCCCAAAGTC  99

seq1  AGACT-CCAGCT-GGCTGCTATTTTGAGAAGACACA-CCACCCTCCACAT  143
      ||||| |||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||
seq2  AGACTCCCAGCTGGGCTGTTA-TTTGAGAAGACACACCCACCCTCCACAT  148

seq1  CCTGTGGGCAGGGAGGATGCTCAGACAGACGTGGGTAGCCTCTGCCAT-C  192
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  CCTGTGGGCAGGGAGGATGCTCAGACAGACGTGGGTAGCCTCTGCCATCC  198

seq1  CAAGTCCAACCCAGGCCACTCCAACTGATGGGGAAGACACGAAACATACA  242
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTCCAACCCAGGCCACTCCAACTGATGGGGAAGACACGAAACATACA  248

seq1  TAGCTCCACTAGTGGCATCTGGGGTCTGTCCACACTCAGCCCTCAGGCAG  292
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTCCACTAGTGGCATCTGGGGTCTGTCCACACTCAGCCCTCAGGCAG  298

seq1  GAAGAACAGCACTATTGCTCTGTCTATGCTCTGCTTTGGACAGAAAGCCT  342
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAACAGCACTATTGCTCTGTCTATGCTCTGCTTTGGACAGAAAGCCT  348

seq1  GTGCTGGTGTCTCCAGCCATAGGTGGCTTTTGGGGTCTCCTGGGAGGGTG  392
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTGGTGTCTCCAGCCATAGGTGGCTTTTGGGGTCTCCTGGGAGGGTG  398

seq1  GCTGTGGGGCTGCCTAGTTGTACCCATGGAACCTTGGTCTGTGAAGCAGA  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTGGGGCTGCCTAGTTGTACCCATGGAACCTTGGTCTGTGAAGCAGA  448

seq1  GCATGTTCCTGGACTCATCAAGGTTGAGAAGAACAAGGCCTGAAGACACT  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGTTCCTGGACTCATCAAGGTTGAGAAGAACAAGGCCTGAAGACACT  498

seq1  GTCTGGTTTCACTCTGAGCCAGCTCTTCCTCCATCCCTACCCCATCCTGG  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGGTTTCACTCTGAGCCAGCTCTTCCTCCATCCCTACCCCATCCTGG  548

seq1  CATTTCCTGTGGCCCCACAAACTCAAGCCCTGAGTAGCCTCCAGCCTCCT  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTCCTGTGGCCCCACAAACTCAAGCCCTGAGTAGCCTCCAGCCTCCT  598

seq1  CTGCCATCCGTTCCTGCACTGGGCAACAGTGTGAACACTGATGCATACAA  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCATCCGTTCCTGCACTGGGCAACAGTGTGAACACTGATGCATACAA  648

seq1  CCACATGGTCACGCCCTGCTCTCAAGCCTTCTCTGCTGCCCTATCGATCG  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACATGGTCACGCCCTGCTCTCAAGCCTTCTCTGCTGCCCTATCGATCG  698

seq1  ATCTAAGACAAAAGCCCAGGAACTTGAGCCTTCAAGCCTTTCACAAAAAT  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTAAGACAAAAGCCCAGGAACTTGAGCCTTCAAGCCTTTCACAAAAAT  748

seq1  GTCTTCCTGATTCTTCTGCCTCCACTTCCTCCATTCTCCCCATAGGGAAG  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTCCTGATTCTTCTGCCTCCACTTCCTCCATTCTCCCCATAGGGAAG  798

seq1  GTCACAGCTGACCAATCACAGGTCACAAAGACCAGGTAATATCACAAACA  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACAGCTGACCAATCACAGGTCACAAAGACCAGGTAATATCACAAACA  848

seq1  ACAACACACTGCCCCTTCTCAGTGTTGCATTGACGCTGACTCCTTCAGAC  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACACACTGCCCCTTCTCAGTGTTGCATTGACGCTGACTCCTTCAGAC  898

seq1  TCATCTTCTAATTTATTTTCTCTTAAACTGGGTCTAGTTTACTCATGTTT  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCTTCTAATTTATTTTCTCTTAAACTGGGTCTAGTTTACTCATGTTT  948

seq1  TTGAGACAGAGTCTCACTTTAGCTCAGGCTATCCTTGAATTC  984
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGACAGAGTCTCACTTTAGCTCAGGCTATCCTTGAATTC  990

seq1: chr11_72123933_72124919
seq2: B6Ng01-203H16.g_66_1056

seq1  GAATTCAAGGCCAACTAAGTTAAAGTAAGACCCTGTGTCAAAAATTAAGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGGCCAACTAAGTTAAAGTAAGACCCTGTGTCAAAAATTAAGT  50

seq1  AAACAAAGAAACAAACAAACAAACAAATCAATGGAGAAGGGAAGACTAGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAAAGAAACAAACAAACAAACAAATCAATGGAGAAGGGAAGACTAGG  100

seq1  TAAATGGTTAGGTGGTAAAGCATTTGTCCTTCATGCATGCAGATGGCCTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATGGTTAGGTGGTAAAGCATTTGTCCTTCATGCATGCAGATGGCCTT  150

seq1  AGGTTCAGTCTTCAGCATCACACACGCACACAAGCTGATTCTCCCCTCTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTCAGTCTTCAGCATCACACACGCACACAAGCTGATTCTCCCCTCTT  200

seq1  ACTCTTCTCCAGTCACATCCCTGAGGAAGCAATTTCAGCAGCCTGTGGGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTTCTCCAGTCACATCCCTGAGGAAGCAATTTCAGCAGCCTGTGGGT  250

seq1  TCTCAACGGGAACCCTATCAGCAAACACAGGGCTGAATAGTCTACGGCCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAACGGGAACCCTATCAGCAAACACAGGGCTGAATAGTCTACGGCCC  300

seq1  ACATGTTATCTTAGAATATTCATTACTCTGCTGTTTGCCTCCCCCACCCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGTTATCTTAGAATATTCATTACTCTGCTGTTTGCCTCCCCCACCCC  350

seq1  CAGAGGTGCAGTCCTTCAAAAACAGGAGATCTCAATAGTTTTTTTTTAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGGTGCAGTCCTTCAAAAACAGGAGATCTCAATAGTTTTTTTTTAAT  400

seq1  TTCTTTATGCATTTATGTTTTATAAGAATGACCTAATTTCACCCTGAGTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTATGCATTTATGTTTTATAAGAATGACCTAATTTCACCCTGAGTC  450

seq1  GGGTGCTTCCGCACTTTTCTCCATCTTTGTCAGACTTAGCAAGGAGAAGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTGCTTCCGCACTTTTCTCCATCTTTGTCAGACTTAGCAAGGAGAAGT  500

seq1  ACAATATGCCCCAACCAAACTTGAATTTCAAAGAAATGGGGACCATTTTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATATGCCCCAACCAAACTTGAATTTCAAAGAAATGGGGACCATTTTT  550

seq1  TAATCTCAGTATGTCTGCAGACATTGTAAGAGATCTGCCATTATGGTCCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATCTCAGTATGTCTGCAGACATTGTAAGAGATCTGCCATTATGGTCCA  600

seq1  TTTTCAGTATGAAAATGTGTTTCAGTGTGAAAGTACATCTAGAAGTACCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCAGTATGAAAATGTGTTTCAGTGTGAAAGTACATCTAGAAGTACCT  650

seq1  ACTGAGTCCCAAGTAAGCAGGGGACACTGCCCTTGTCTGCCTCTGCCCGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAGTCCCAAGTAAGCAGGGGACACTGCCCTTGTCTGCCTCTGCCCGG  700

seq1  ATGCTTCTTAGTTTATGTCAGGGTTGAAAACATTGCACAACTGAGCCCCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTTCTTAGTTTATGTCAGGGTTGAAAACATTGCACAACTGAGCCCCT  750

seq1  GCACTAGGATAGAGAAGGCTCTCAAACCACCACCCACCACCACCACCACT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTAGGATAGAGAAGGCTCTCAAACCACCACCCACCACCACCACCACT  800

seq1  TGGGGAGCCTATGGTGGGCAGAAGTTTTTCACACTTGAGAACTATAAAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGAGCCTATGGTGGGCAGAAGTTTTTCACACTTGAGAACTATAAAAA  850

seq1  CCACTTGTACCAAAT-GGGAGCGCTAACCATTTTTGCCC-TTTCTGTAGA  898
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  CCACTTGTACCAAATGGGGAGCGCTAACCATTTTTGCCCTTTTCTGTAGA  900

seq1  GACTGTACAAGGTTGTAAGTCACTTCAACTGCTTGCTTCTGTTTCGCTAC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGTACAAGGTTGTAAGTCACTTCAACTGCTTGCTTCTGTTTCGCTAC  950

seq1  TCTGAGTCTCCCAATTCTTATTATGA--GGGGGTGGGGGGG  987
      ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||
seq2  TCTGAGTCTCCCAATTCTTATTATGAGGGGGGGTGGGGGGG  991