BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-242O07
Chromosome11 (Build37)
Map Location 91,825,699 - 91,996,283
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneEG664976, Kif2b
Downstream geneLOC382545, LOC100039286, Car10
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-242O07.bB6Ng01-242O07.g
ACCGA052419GA052420
length988488
definitionB6Ng01-242O07.b B6Ng01-242O07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(91,825,699 - 91,826,660)(91,995,793 - 91,996,283)
sequence
gaattcagttcttgagaaggggagaaaggaaaccctaaggagttccccct
gctttacaaggtattcaaaacactactgggtaatttttggatcattgtgg
tgggtacctaaatgagccaccattgtgatgggtacctaggtgagacacta
ttgtgatggatacttaggggatccacttaatatagtaaccacaaatttca
cacttgtcaaattagtcctatctatgcttaaaatgataacagtccttttc
atctcaatgtgatatcttgtttatggcatctttttttttttaagtcctca
ctgaatttttgttcctattgaggtttgacttgcaagcactgattgacaag
acaaaatgatgtttgatagtgataagaacaaatattactgatactttctc
tgtttcctcatgtttctctccttactagatggtcccataaatgaagcatc
tttatagacctaagatttttttcattgttggtgggattgcaagctggtac
aaccactatgtaaatcagtctgccagttcctcagaaaattggacatagta
ttacctgaggaccagctataccactcctgggcataaacccaaaagatgtt
ccaacatataaaaaggacacatgctccactatgttcatagcagccttatt
tataatagccaggagctggaaagaacccagatgtccttcaacaaatgagt
ggatacagaaaatgtggtacaattacacaatggagtactactcagccatt
aaaaacaatgacttcatgaaattcttagggtaatggatggaactagaaaa
tatcatcctgagtgtggtaccccaataacaaaagaacactcatggtatgc
tgtaattgataagtggatattagccccaaaactcgggaatacccaagata
caattcagagaccacatgaagctcaagaagaggaataccaaagtgtggat
actttcatgccttgttagaaggaaataaatactcatgg

agctgaggtaatttcgtgaagccgtttttcaaaacgcaaaattgaaagag
ggcttggggtataatcctgttgtagagcattttcctaagatgaacagctc
tttacattcaggctctctgaagttgttaagcaaaaacactaggacctatg
gagatggcaaaatcaggaaagtgcctcccatataaacatgagactgagtt
ttgtgtcagatccttaggaagcaatataaaactcaaaaaatggggcttac
atttgcaactaagagctcaccaactggttatactggctacccagtgtttt
ctggactcagtgttgcaaataataatataatggaaaatagtataggacac
ctattggcatactctggcctccatatacatagccacactatgtattcact
gcccccctgcctccctgcctccctgccctgctgcccccctgccccctacc
ccctgccccatgctccctgcctccctgactgtctccct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_91825699_91826660
seq2: B6Ng01-242O07.b_46_1008

seq1  GAATTCAGTTCTTGAGAAGGGGAGAAAGGAAACCCTAAGGAGTTCCCCCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTTCTTGAGAAGGGGAGAAAGGAAACCCTAAGGAGTTCCCCCT  50

seq1  GCTTTACAAGGTATTCAAAACACTACTGGGTAATTTTTGGATCATTGTGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTACAAGGTATTCAAAACACTACTGGGTAATTTTTGGATCATTGTGG  100

seq1  TGGGTACCTAAATGAGCCACCATTGTGATGGGTACCTAGGTGAGACACTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTACCTAAATGAGCCACCATTGTGATGGGTACCTAGGTGAGACACTA  150

seq1  TTGTGATGGATACTTAGGGGATCCACTTAATATAGTAACCACAAATTTCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGATGGATACTTAGGGGATCCACTTAATATAGTAACCACAAATTTCA  200

seq1  CACTTGTCAAATTAGTCCTATCTATGCTTAAAATGATAACAGTCCTTTTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTGTCAAATTAGTCCTATCTATGCTTAAAATGATAACAGTCCTTTTC  250

seq1  ATCTCAATGTGATATCTTGTTTATGGCATCTTTTTTTTTTTAAGTCCTCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCAATGTGATATCTTGTTTATGGCATCTTTTTTTTTTTAAGTCCTCA  300

seq1  CTGAATTTTTGTTCCTATTGAGGTTTGACTTGCAAGCACTGATTGACAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAATTTTTGTTCCTATTGAGGTTTGACTTGCAAGCACTGATTGACAAG  350

seq1  ACAAAATGATGTTTGATAGTGATAAGAACAAATATTACTGATACTTTCTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAATGATGTTTGATAGTGATAAGAACAAATATTACTGATACTTTCTC  400

seq1  TGTTTCCTCATGTTTCTCTCCTTACTAGATGGTCCCATAAATGAAGCATC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTCCTCATGTTTCTCTCCTTACTAGATGGTCCCATAAATGAAGCATC  450

seq1  TTTATAGACCTAAGATTTTTTTCATTGTTGGTGGGATTGCAAGCTGGTAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATAGACCTAAGATTTTTTTCATTGTTGGTGGGATTGCAAGCTGGTAC  500

seq1  AACCACTATGTAAATCAGTCTGCCAGTTCCTCAGAAAATTGGACATAGTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCACTATGTAAATCAGTCTGCCAGTTCCTCAGAAAATTGGACATAGTA  550

seq1  TTACCTGAGGACCAGCTATACCACTCCTGGGCATAAACCCAAAAGATGTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACCTGAGGACCAGCTATACCACTCCTGGGCATAAACCCAAAAGATGTT  600

seq1  CCAACATATAAAAAGGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACATATAAAAAGGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATT  650

seq1  TATAATAGCCAGGAGCTGGAAAGAACCCAGATGTCCTTCAACAAATGAGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAATAGCCAGGAGCTGGAAAGAACCCAGATGTCCTTCAACAAATGAGT  700

seq1  GGATACAGAAAATGTGGTACAATTACACAATGGAGTACTACTCAGCCATT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATACAGAAAATGTGGTACAATTACACAATGGAGTACTACTCAGCCATT  750

seq1  AAAAACAATGACTTCATGAAATTCTTAGGGTAATGGATGGAACTAGAAAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAACAATGACTTCATGAAATTCTTAGGGTAATGGATGGAACTAGAAAA  800

seq1  TATCATCCTGAGTGTGGTACCCCAATAACAAAAGAACACTCATGGTATGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCATCCTGAGTGTGGTACCCCAATAACAAAAGAACACTCATGGTATGC  850

seq1  TGTAATTGATAAGTGGATATTAGCCCCAAAACTC-GGAATACCCAAGATA  899
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  TGTAATTGATAAGTGGATATTAGCCCCAAAACTCGGGAATACCCAAGATA  900

seq1  CAATTCAGAGACCACATGAAGCTCAAGAAGAAGGAATACCAAAGTGTGGA  949
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  CAATTCAGAGACCACATGAAGCTCAAGAAG-AGGAATACCAAAGTGTGGA  949

seq1  TAC-TTCATGCCTT  962
      ||| ||||||||||
seq2  TACTTTCATGCCTT  963


seq1: chr11_91995793_91996283
seq2: B6Ng01-242O07.g_70_563 (reverse)

seq1  AGGG----AGGCAGGGAGGCAGGGAGGCAGGGAGGCAGGGAGGCAGGGAG  46
      ||||    || |||||||||||||| ||| || ||||||| || |||| |
seq2  AGGGAGACAGTCAGGGAGGCAGGGA-GCATGG-GGCAGGG-GGTAGGG-G  46

seq1  GCAGGGAG---GCAGGGCAGGGAGGCAGGGAGGCAGGGGGGCAGTGAATA  93
      |||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGGGGGCAGCAGGGCAGGGAGGCAGGGAGGCAGGGGGGCAGTGAATA  96

seq1  CATAGTGTGGCTATGTATATGGAGGCCAGAGTATGCCAATAGGTGTCCTA  143
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGTGTGGCTATGTATATGGAGGCCAGAGTATGCCAATAGGTGTCCTA  146

seq1  TACTATTTTCCATTATATTATTATTTGCAACACTGAGTCCAGAAAACACT  193
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTATTTTCCATTATATTATTATTTGCAACACTGAGTCCAGAAAACACT  196

seq1  GGGTAGCCAGTATAACCAGTTGGTGAGCTCTTAGTTGCAAATGTAAGCCC  243
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTAGCCAGTATAACCAGTTGGTGAGCTCTTAGTTGCAAATGTAAGCCC  246

seq1  CATTTTTTGAGTTTTATATTGCTTCCTAAGGATCTGACACAAAACTCAGT  293
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTTTTGAGTTTTATATTGCTTCCTAAGGATCTGACACAAAACTCAGT  296

seq1  CTCATGTTTATATGGGAGGCACTTTCCTGATTTTGCCATCTCCATAGGTC  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATGTTTATATGGGAGGCACTTTCCTGATTTTGCCATCTCCATAGGTC  346

seq1  CTAGTGTTTTTGCTTAACAACTTCAGAGAGCCTGAATGTAAAGAGCTGTT  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGTGTTTTTGCTTAACAACTTCAGAGAGCCTGAATGTAAAGAGCTGTT  396

seq1  CATCTTAGGAAAATGCTCTACAACAGGATTATACCCCAAGCCCTCTTTCA  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTTAGGAAAATGCTCTACAACAGGATTATACCCCAAGCCCTCTTTCA  446

seq1  ATTTTGCGTTTTGAAAAACGGCTTCACGAAATTACCTCAGCTGAATTC  491
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTGCGTTTTGAAAAACGGCTTCACGAAATTACCTCAGCTGAATTC  494


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |