BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-253H24
Chromosome11 (Build37)
Map Location 64,414,519 - 64,415,637
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100041690, LOC654442, LOC668297, Hs3st3b1, Cox10, 2810001G20Rik, EG544785, Hs3st3a1
Downstream geneLOC626959, Elac2, AU040829, 1700086D15Rik, LOC100041790, Myocd
LinkOpen Mouse BAC browser

no map image available.



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-253H24.bB6Ng01-253H24.g
ACCGA060214GA060215
length1,115343
definitionB6Ng01-253H24.b B6Ng01-253H24.g
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattcacttcatccccagtagatgctcagcaagcatgcgtggatatgac
cactggccttggaaatcagctcaactccagcagtgccagtctcttggtga
ctaataaaccatcctgcactcttgaattgtcccctatttcatgaagaacc
agggtgttctgacaccagacacacttcatttgtcaaagcttcagttatga
gctcatgatgtcagtagaagcaatgcattcatacgcaatgttgcttgccc
aggctccatctgtgccgaaggtgctctactctcttgagattaatctcaat
gcacagaacagatcacttttcgttttgaggattcctactatcactcatct
ctattccttcctctcacctccatgatgaggctactagaatcttcacctct
agattaaaaggcttctgttctttctcacttatagaaggaacatctcctca
aaagttaccatagccaagtgctacatgtataacagctcacttgatatgtt
tttaaaaaattatctgttcactagcctatgtcactatcacaaatggaaaa
cccaggaatgctgttatctatggtgacctgactgtcccagataccgagtg
taatggccagtttaatgtcaacttgacacaggctagagtcatcagagagg
agggagcctcaagtgagaacatttctttttaagatctggatatagagatg
cctgtggtctatttgcctagttagtgattgatatgtgagttctcagccca
ttttgggaccatgcttgggctgatggttctgaattctaaaagaaagaaac
tgagcaggccatgaggagcaagccagtaagcagcacccctccatggcctc
tgcttaaattcctgcctctgggttcctgccctgtttaagttcctgtcctg
acttcctagggtgatgatcagtgatatgggaagggtgagccaataactct
ttcctccccaattttctttggtcatagtgtttcatcacagcaatagttac
ccttaggaggataccaggagtctcagttttgttagttgagtttgaacaaa
catttaaatcttctaatttctgtttcacctcatgcccaaggctggattag
ttgtctctgctatat
cacagtaagaccaacagagtcaactaacctggacccttgggactctcaga
gtctaaactaccaaccaaagaacacacacgagggctggacctagggttcc
cagctcatacgtagcagatgtgcagcttggccttcatgtgggtcctgaac
aatttgaacaagggctaccccaaaagctattgcctgcaaagtgggatatg
ttcttggagctgggctgccttgtctggcctcagtgagaaaggaggtgctt
agcctcacagagacttgaagtgccggggtgaggggactcctagggggtcc
cacttgctcagaaaaaaagaggatgggggaggggtatggggga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_64414519_64415637
seq2: B6Ng01-253H24.b_44_1158

seq1  GAATTCACTTCATCCCCAGTAGATGCTCAGCAAGCATGCGTGGATATGAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTTCATCCCCAGTAGATGCTCAGCAAGCATGCGTGGATATGAC  50

seq1  CACTGGCCTTGGAAATCAGCTCAACTCCAGCAGTGCCAGTCTCTTGGTGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGGCCTTGGAAATCAGCTCAACTCCAGCAGTGCCAGTCTCTTGGTGA  100

seq1  CTAATAAACCATCCTGCACTCTTGAATTGTCCCCTATTTCATGAAGAACC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATAAACCATCCTGCACTCTTGAATTGTCCCCTATTTCATGAAGAACC  150

seq1  AGGGTGTTCTGACACCAGACACACTTCATTTGTCAAAGCTTCAGTTATGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTGTTCTGACACCAGACACACTTCATTTGTCAAAGCTTCAGTTATGA  200

seq1  GCTCATGATGTCAGTAGAAGCAATGCATTCATACGCAATGTTGCTTGCCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCATGATGTCAGTAGAAGCAATGCATTCATACGCAATGTTGCTTGCCC  250

seq1  AGGCTCCATCTGTGCCGAAGGTGCTCTACTCTCTTGAGATTAATCTCAAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTCCATCTGTGCCGAAGGTGCTCTACTCTCTTGAGATTAATCTCAAT  300

seq1  GCACAGAACAGATCACTTTTCGTTTTGAGGATTCCTACTATCACTCATCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACAGAACAGATCACTTTTCGTTTTGAGGATTCCTACTATCACTCATCT  350

seq1  CTATTCCTTCCTCTCACCTCCATGATGAGGCTACTAGAATCTTCACCTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTCCTTCCTCTCACCTCCATGATGAGGCTACTAGAATCTTCACCTCT  400

seq1  AGATTAAAAGGCTTCTGTTCTTTCTCACTTATAGAAGGAACATCTCCTCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTAAAAGGCTTCTGTTCTTTCTCACTTATAGAAGGAACATCTCCTCA  450

seq1  AAAGTTACCATAGCCAAGTGCTACATGTATAACAGCTCACTTGATATGTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTTACCATAGCCAAGTGCTACATGTATAACAGCTCACTTGATATGTT  500

seq1  TTTAAAAAATTATCTGTTCACTAGCCTATGTCACTATCACAAATGGAAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAAAAATTATCTGTTCACTAGCCTATGTCACTATCACAAATGGAAAA  550

seq1  CCCAGGAATGCTGTTATCTATGGTGACCTGACTGTCCCAGATACCGAGTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGGAATGCTGTTATCTATGGTGACCTGACTGTCCCAGATACCGAGTG  600

seq1  TAATGGCCAGTTTAATGTCAACTTGACACAGGCTAGAGTCATCAGAGAGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGGCCAGTTTAATGTCAACTTGACACAGGCTAGAGTCATCAGAGAGG  650

seq1  AGGGAGCCTCAAGTGAGAACATTTCTTTTTAAGATCTGGATATAGAGATG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAGCCTCAAGTGAGAACATTTCTTTTTAAGATCTGGATATAGAGATG  700

seq1  CCTGTGGTCTATTTGCCTAGTTAGTGATTGATATGTGAGTTCTCAGCCCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTGGTCTATTTGCCTAGTTAGTGATTGATATGTGAGTTCTCAGCCCA  750

seq1  TTTTGGGACCATGCTTGGGCTGATGGTTCTGAATTCTAAAAGAAAGAAAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGGGACCATGCTTGGGCTGATGGTTCTGAATTCTAAAAGAAAGAAAC  800

seq1  TGAGCAGGCCATGAGGAGCAAGCCAGTAAGCAGCACCCCTCCATGGCCTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCAGGCCATGAGGAGCAAGCCAGTAAGCAGCACCCCTCCATGGCCTC  850

seq1  TGCTTAAATTCCTGCCTCTGGGTTCCTGCCCTGTTTAAGTTCCTGTCCTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTAAATTCCTGCCTCTGGGTTCCTGCCCTGTTTAAGTTCCTGTCCTG  900

seq1  ACTTCCTAGGGTGATGATCAGTGATAT-GGAAGGGTGAGCCAAATAAACT  949
      ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||
seq2  ACTTCCTAGGGTGATGATCAGTGATATGGGAAGGGTGAGCCAA--TAACT  948

seq1  CTTTCCTCCCCAATTTTCTTTGGTCATAGTGTTTCATCACAGCAATAGTT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCCTCCCCAATTTTCTTTGGTCATAGTGTTTCATCACAGCAATAGTT  998

seq1  ACCCTTAGGAGGATACCAGGAGTTCTCAAGTTTTGTTAGTTTGAG-TTGA  1048
      |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||
seq2  ACCCTTAGGAGGATACCAGGAG-TCTC-AGTTTTGTTAG-TTGAGTTTGA  1045

seq1  ACAAACAATTTAAATC-TCTAATTTCTG-TTCA-CTCATTGCCCAAGGGC  1095
      |||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||| |||
seq2  ACAAAC-ATTTAAATCTTCTAATTTCTGTTTCACCTCA-TGCCCAA-GGC  1092

seq1  TGGATAATTTGTCTCCTGCTATAT  1119
      ||||| | |||||| |||||||||
seq2  TGGATTAGTTGTCT-CTGCTATAT  1115