BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-257I21
Chromosome11 (Build37)
Map Location 67,030,112 - 67,155,203
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMyh1, Myh4, Myh8, Myh13
Upstream geneGm879, LOC668323, A530088H08Rik, 9130409J20Rik, A730055C05Rik, 2310004I24Rik, Sco1, Myh3, Myh2
Downstream geneGas7, Rcvrn, Glp2r, LOC544792, Dhrs7c, LOC100041899, Usp43, Wdr16, Stx8, Ntn1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-257I21.bB6Ng01-257I21.g
ACCGA063223GA063224
length1,1361,144
definitionB6Ng01-257I21.b B6Ng01-257I21.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(67,154,067 - 67,155,203)(67,030,112 - 67,031,271)
sequence
gaattcagctgtctgaaagggagagggattagagatgcccatctatgagc
atctatgagcagagaagaggcagagaagaatgtgagggtaccaaccacgg
aggaagcaacccctaccttctcaatgagctcgatgcaggccgccaggtcc
atcccgaagtcaatgaactcccactcgatgccttccttcttgtactcctc
ctgctccagcacgaacatgtggtggttgaaaaactgttgcagtttctcat
tggtgaagttgatgcacagctgctccaggctgttgaactgggtgcaaata
tgaaagagtttaagtctgagaaatctatgggaatgaatttgggaccagag
ctaagcagacagaaaaagccagtcatttgcccaaacagctcacatcaaag
atctcaaagccagcgatgtccaagaccccgatgaagtactgccggggctg
cttggtgtccagctgctggttgatgcgggtgaccatccataggaacatct
tctcatagacagccttggccagggcacccactgagttggtcaccttgaga
aaggaccatccacttaatgttcacattaaatcattagtccacactcatta
gttttgttaagttgaagcatcaaattgacatcatgatggtcaaaagtaat
tgagtgttgccaatttcacatcatgcggtatcttattaactatttttaaa
acatctgtcttccttgtgatattattctttctctgataacaattccacta
aaaacatagtttcttaacagccatggccatagcacatgactccaggcatt
gtcaagttccaatcagaggagaagccttgatgtagattggatgaattagt
atccccttataggatttgaaattggaattaaaagctgctgatctgaatct
cagttgagagtagaaatatggaagtgttaatttgagaaatctgaggaggt
ctcagcaggaggggcaaagaaactttatttagcaaagacaccattagagg
agagagatatagcatttgtagctgcaaaggagtcagaagaggaggcctgc
ttccgccttcatttcctatgcctgccccctagcaggagtgtgccacgcat
gcatttgcaatctctggtccccctggagaatctaag
gaattcctcttaatgacttgaccaactttctactaaagtcatgttgctcc
tcctgtgacactcaaagactgtattattattgttaaggtgggcaggacat
tcagagtaaaacaaacactattctcaagttaggatactcccccaaatttc
tcctcttcagcacacgttttcttactcctatcagtggcatgatcttaaaa
gactaaacattaaacatgtggtttctaataaatttcaaaacaggtaagac
tagtaacgaattttcacagggggtactgccacaaggcttgtattttctga
atatgttacctcaagagtggaagacaaacttatgcaccgtttggtttggg
agctgtttacaatttagaaccaactcattctgggatcagaaagacaattg
cttgcttccctaacatggacagacctctctcaaagtgtctactgagcatc
agttctgcatatgaggtctactatttgagagtcccatttcccaccaaaaa
aatgttacaggtggccaacacagtaactggatagccagaaagcatctgag
tgcgttgactgctctcttgtacattgtttttttcatatgtttgcttacct
cttgcaatgcaatcatatcatcttaaatatctcccaaaaccttggttgat
cataaagagtctggctcaaaattccctatattctcattgtacaaagattt
gctcgtcagcattgcagtggatgatggacatatgatataacctccatctg
tcaccaagctttagacttggtacctcctttgttccagtttttattttcaa
attttaatgtctaacatcaggctgagttttctggaccttgggtatttttt
gcaggtgaatactcacgccagctagacgaaaaggattcattagtttccca
gctctccaggggcaaacaggcattcactcaacagattgaggagctgagag
gcagcttgagaggagataaggtgactggcttcttgttgtggcatgatatc
atggtctgcagttgttatacttacactggtgtatggtgtgggttccctgc
cccctttgctgggtggggatctagagcttagagaataaatacccattaat
gaaatcaacctcctaacttaatttttagccaggagtgccttagc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_67154067_67155203
seq2: B6Ng01-257I21.b_46_1181 (reverse)

seq1  CTTAGA-TCTCAGGGGGGACCCAAGGAATGCAAATGCATGCGT-GCACAC  48
      |||||| ||||  |||||| |||  || ||||||||||||||| ||||||
seq2  CTTAGATTCTCCAGGGGGA-CCAGAGATTGCAAATGCATGCGTGGCACAC  49

seq1  TCCTGCTAGGGGGGCAGGCAACCAGGAAATGAAGGC-GAAGCAG----CC  93
      |||||||| |||||||||||   ||||||||||||| |||||||    ||
seq2  TCCTGCTA-GGGGGCAGGCA--TAGGAAATGAAGGCGGAAGCAGGCCTCC  96

seq1  TCTCTCTGACTCCTTTGCAGCTACAAATGCTATTATCTCTCTCCTCTAAT  143
      ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TCT-TCTGACTCCTTTGCAGCTACAAATGCTA-TATCTCTCTCCTCTAAT  144

seq1  -GTGTCTTTGCTAAATAAAGTTTCTTTGCCCCTCCTGCCTGAGACCTCCC  192
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||
seq2  GGTGTCTTTGCTAAATAAAGTTTCTTTGCCCCTCCTG-CTGAGACCT-CC  192

seq1  TCAGATTTCTCAAATTAACACTTCCATATTTCTACTCTCAACCTGAGATT  242
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  TCAGATTTCTCAAATTAACACTTCCATATTTCTACTCTCAA-CTGAGATT  241

seq1  CAGATCAGCAGCTTTTAATTCCAATTTCAAATCCTATAAGGGGATACTAA  292
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATCAGCAGCTTTTAATTCCAATTTCAAATCCTATAAGGGGATACTAA  291

seq1  TTCATCCAATCTACATCAAGGCTTCTCCTCTGATTGGAACTTGACAATGC  342
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATCCAATCTACATCAAGGCTTCTCCTCTGATTGGAACTTGACAATGC  341

seq1  CTGGAGTCATGTGCTATGGCCATGGCTGTTAAGAAACTATGTTTTTAGTG  392
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAGTCATGTGCTATGGCCATGGCTGTTAAGAAACTATGTTTTTAGTG  391

seq1  GAATTGTTATCAGAGAAAGAATAATATCACAAGGAAGACAGATGTTTTAA  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTGTTATCAGAGAAAGAATAATATCACAAGGAAGACAGATGTTTTAA  441

seq1  AAATAGTTAATAAGATACCGCATGATGTGAAATTGGCAACACTCAATTAC  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAGTTAATAAGATACCGCATGATGTGAAATTGGCAACACTCAATTAC  491

seq1  TTTTGACCATCATGATGTCAATTTGATGCTTCAACTTAACAAAACTAATG  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGACCATCATGATGTCAATTTGATGCTTCAACTTAACAAAACTAATG  541

seq1  AGTGTGGACTAATGATTTAATGTGAACATTAAGTGGATGGTCCTTTCTCA  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTGGACTAATGATTTAATGTGAACATTAAGTGGATGGTCCTTTCTCA  591

seq1  AGGTGACCAACTCAGTGGGTGCCCTGGCCAAGGCTGTCTATGAGAAGATG  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGACCAACTCAGTGGGTGCCCTGGCCAAGGCTGTCTATGAGAAGATG  641

seq1  TTCCTATGGATGGTCACCCGCATCAACCAGCAGCTGGACACCAAGCAGCC  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTATGGATGGTCACCCGCATCAACCAGCAGCTGGACACCAAGCAGCC  691

seq1  CCGGCAGTACTTCATCGGGGTCTTGGACATCGCTGGCTTTGAGATCTTTG  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGGCAGTACTTCATCGGGGTCTTGGACATCGCTGGCTTTGAGATCTTTG  741

seq1  ATGTGAGCTGTTTGGGCAAATGACTGGCTTTTTCTGTCTGCTTAGCTCTG  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGAGCTGTTTGGGCAAATGACTGGCTTTTTCTGTCTGCTTAGCTCTG  791

seq1  GTCCCAAATTCATTCCCATAGATTTCTCAGACTTAAACTCTTTCATATTT  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCAAATTCATTCCCATAGATTTCTCAGACTTAAACTCTTTCATATTT  841

seq1  GCACCCAGTTCAACAGCCTGGAGCAGCTGTGCATCAACTTCACCAATGAG  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCCAGTTCAACAGCCTGGAGCAGCTGTGCATCAACTTCACCAATGAG  891

seq1  AAACTGCAACAGTTTTTCAACCACCACATGTTCGTGCTGGAGCAGGAGGA  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTGCAACAGTTTTTCAACCACCACATGTTCGTGCTGGAGCAGGAGGA  941

seq1  GTACAAGAAGGAAGGCATCGAGTGGGAGTTCATTGACTTCGGGATGGACC  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACAAGAAGGAAGGCATCGAGTGGGAGTTCATTGACTTCGGGATGGACC  991

seq1  TGGCGGCCTGCATCGAGCTCATTGAGAAGGTAGGGGTTGCTTCCTCCGTG  1042
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCGGCCTGCATCGAGCTCATTGAGAAGGTAGGGGTTGCTTCCTCCGTG  1041

seq1  GTTGGTACCCTCACATTCTTCTCTGCCTCTTCTCTGCTCATAGATGCTCA  1092
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGGTACCCTCACATTCTTCTCTGCCTCTTCTCTGCTCATAGATGCTCA  1091

seq1  TAGATGGGCATCTCTAATCCCTCTCCCTTTCAGACAGCTGAATTC  1137
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATGGGCATCTCTAATCCCTCTCCCTTTCAGACAGCTGAATTC  1136

seq1: chr11_67030112_67031271
seq2: B6Ng01-257I21.g_64_1207

seq1  GAATTCCTCTTAATGACTTGACCAACTTTCTACTAAAGTCATGTTGCTCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTCTTAATGACTTGACCAACTTTCTACTAAAGTCATGTTGCTCC  50

seq1  TCCTGTGACACTCAAAGACTGTATTATTATTGTTAAGGTGGGCAGGACAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGTGACACTCAAAGACTGTATTATTATTGTTAAGGTGGGCAGGACAT  100

seq1  TCAGAGTAAAACAAACACTATTCTCAAGTTAGGATACTCCCCCAAATTTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAGTAAAACAAACACTATTCTCAAGTTAGGATACTCCCCCAAATTTC  150

seq1  TCCTCTTCAGCACACGTTTTCTTACTCCTATCAGTGGCATGATCTTAAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCTTCAGCACACGTTTTCTTACTCCTATCAGTGGCATGATCTTAAAA  200

seq1  GACTAAACATTAAACATGTGGTTTCTAATAAATTTCAAAACAGGTAAGAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTAAACATTAAACATGTGGTTTCTAATAAATTTCAAAACAGGTAAGAC  250

seq1  TAGTAACGAATTTTCACAGGGGGTACTGCCACAAGGCTTGTATTTTCTGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTAACGAATTTTCACAGGGGGTACTGCCACAAGGCTTGTATTTTCTGA  300

seq1  ATATGTTACCTCAAGAGTGGAAGACAAACTTATGCACCGTTTGGTTTGGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGTTACCTCAAGAGTGGAAGACAAACTTATGCACCGTTTGGTTTGGG  350

seq1  AGCTGTTTACAATTTAGAACCAACTCATTCTGGGATCAGAAAGACAATTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGTTTACAATTTAGAACCAACTCATTCTGGGATCAGAAAGACAATTG  400

seq1  CTTGCTTCCCTAACATGGACAGACCTCTCTCAAAGTGTCTACTGAGCATC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCTTCCCTAACATGGACAGACCTCTCTCAAAGTGTCTACTGAGCATC  450

seq1  AGTTCTGCATATGAGGTCTACTATTTGAGAGTCCCATTTCCCACCAAAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCTGCATATGAGGTCTACTATTTGAGAGTCCCATTTCCCACCAAAAA  500

seq1  AATGTTACAGGTGGCCAACACAGTAACTGGATAGCCAGAAAGCATCTGAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTTACAGGTGGCCAACACAGTAACTGGATAGCCAGAAAGCATCTGAG  550

seq1  TGCGTTGACTGCTCTCTTGTACATTGTTTTTTTCATATGTTTGCTTACCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCGTTGACTGCTCTCTTGTACATTGTTTTTTTCATATGTTTGCTTACCT  600

seq1  CTTGCAATGCAATCATATCATCTTAAATATCTCCCAAAACCTTGGTTGAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCAATGCAATCATATCATCTTAAATATCTCCCAAAACCTTGGTTGAT  650

seq1  CATAAAGAGTCTGGCTCAAAATTCCCTATATTCTCATTGTACAAAGATTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAAGAGTCTGGCTCAAAATTCCCTATATTCTCATTGTACAAAGATTT  700

seq1  GCTCGTCAGCATTGCAGTGGATGATGGACATATGATATAACCTCCATCTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCGTCAGCATTGCAGTGGATGATGGACATATGATATAACCTCCATCTG  750

seq1  TCACCAAGCTTTAGACTTGGTACCTCCTTTGTTCCAGTTTTTATTTTCAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCAAGCTTTAGACTTGGTACCTCCTTTGTTCCAGTTTTTATTTTCAA  800

seq1  ATTTTAATGTCTAACATCAGGCTGAGTTTTCTGGACCTTGGGTATTTTTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTAATGTCTAACATCAGGCTGAGTTTTCTGGACCTTGGGTATTTTTT  850

seq1  GCAGGTGAATACTCACGCCAGCTAGACGAAAAGGATTCATTAGTTTCCCA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGTGAATACTCACGCCAGCTAGACGAAAAGGATTCATTAGTTTCCCA  900

seq1  GCTCTCCAGGGGCAAACAGGCATTCACTCAACAGATTGAGGAGCTGAAGA  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  GCTCTCCAGGGGCAAACAGGCATTCACTCAACAGATTGAGGAGCTG-AGA  949

seq1  GGCAGCTTGAAGAGGAGATAAAGGTGAACTGGCTTCTTGTTGTTGGCATG  1000
      ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||
seq2  GGCAGCTTG-AGAGGAGAT-AAGGTG-ACTGGCTTCTTGTTG-TGGCATG  995

seq1  ATTATCATTGGTCTTGCAGTTGTTTATACTTACACT-GTGTAT-GTGTGG  1048
      | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||
seq2  A-TATCA-TGGTC-TGCAGTTG-TTATACTTACACTGGTGTATGGTGTGG  1041

seq1  GTTCCCTGCCCCCCTTTGCTGG--TGGGATCTAAGAGCTTAGAGAATAAA  1096
      |||||||| |||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||
seq2  GTTCCCTG-CCCCCTTTGCTGGGTGGGGATCT-AGAGCTTAGAGAATAAA  1089

seq1  TACCAATTTAAATGAAAAATTCAACCTCTAAACTCTTATTTTTTTAGGCC  1146
      |||| |||  |||||||   ||||||||  ||  |||| |||||   |||
seq2  TACCCATT--AATGAAA---TCAACCTCCTAA--CTTAATTTTT--AGCC  1130

seq1  AAGAGTGCCTTAGC  1160
      | ||||||||||||
seq2  AGGAGTGCCTTAGC  1144