BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-259O15
Chromosome11 (Build37)
Map Location 59,109,320 - 59,259,245
singlet/doubletdoublet
Overlap geneWnt9a, Gm249, 1110031B06Rik
Upstream geneZfp692, Zfp672, 1700047K16Rik, Sh3bp5l, 2210415F13Rik, LOC624814, 1810065E05Rik, OTTMUSG00000005737, 4930504O13Rik, Olfr30, Olfr333-ps1, Olfr332, Olfr331, Olfr330, Olfr329, Olfr328, Olfr327-ps1, Olfr325, Olfr324, 2210407C18Rik, Olfr323, Trim58, Olfr216, OTTMUSG00000005755, Olfr320, LOC668058, Olfr319, Olfr318, Olfr317, Olfr316, Olfr315, Olfr314, 3100002J23Rik, Olfr313, Olfr312, GA_x5J8B7W3UM0-1747565-1747342, Olfr311, 2810021J22Rik, Zfp39, Butr1, Rnf187, LOC676691, Hist3h2ba, Hist3h2bb, Hist3h2a, LOC382523, Trim17, Trim11, Obscn, A230051G13Rik, 4930543L23Rik, Gja12, Guk1, Mrpl55, 2310033P09Rik, Arf1, Wnt3a
Downstream geneJmjd4, BC050078, LOC432565, Zkscan17, Nlrp3, Olfr222, LOC668157, Olfr223, GA_x5J8B7W3UM0-970645-971221, Olfr225, AA536749, 4933433K01Rik, Flcn, Cops3, Nt5m, Med9, Rasd1, Pemt, Rai1, Srebf1, Tom1l2, LOC667892, Lrrc48, Atpaf2, 4933439F18Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-259O15.bB6Ng01-259O15.g
ACCGA064974GA064975
length7141,151
definitionB6Ng01-259O15.b B6Ng01-259O15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(59,258,532 - 59,259,245)(59,109,320 - 59,110,467)
sequence
gaattcactctgtagaccagaggtacccctgtctctgctttccaagtgct
agaatcaaaggtgtttgctactgtgcctggtttaactagatttatagtag
gcttgtaaactgacgaagttcttaaggggaatttctggtaagtagtctct
tattaaaactataatgacatggagaggttggaaagcctttggcttctatt
gacttaacagaccaccagcttctaccaaacccaaagctaggaatgccatc
gggtaacaccgaggcctagagaacagcattttccatttgctgtagccgca
atagactcttacaagtccactgacacatttttatctttgccttgacttat
aaaactccatgaaacggcttccactttggaacatggaatttggggtaacc
taaatctgtgttgttggaccctggtcactcaaaatggctccagaagaaac
atctgttaattatatttaaggtgagagataaaagtaaatgggattgacta
caacccatagcccatgtccagttgctagtatattgtagatgaagctcctt
ggcacagccacacccctcagttatgtgttaatctgtgttgtcagtgacag
tgactaaggttcatggctcctaagcctaaagcacttgcatggccctcggg
ccaggttcataggcctggtacaaagaagaacgaagtcagtgatgctgggg
gtggggtggggtgg
gaattctaggatttaagacatgtaccactgaacctggctaatttcttcaa
cacctgtagtttcccacagaccaaaaccagtatctacagacagatatgtg
caccatctttgcttttaatggtaggaacagcctccaagcccagcctcaca
agatctgtgagaggcctttacaaccatctgcactaaaatgaagcatactt
gtatctaacagtctcctcagacagcaggggacattctccaccacacttgg
agctttctggcgaggtgcaccctgggatgccttggcacacactattgaga
aagacaacacaaatgtaagcaagtgggactgtgccctaggtggttgtgtg
gggctgacaggaaggaaagaagtgattcagccacatctgctcctggggct
gtccttgaagagtgaacttccttgaccttgacctctggtctcctacttgg
tcctaccctcctccttagtcacttagcagttgtctctgttagacacagct
gtctgtgtagattgttccgtcctgttgatggtgtgttcctttcttcatag
ccggtgagcttcctgctcatctgggactgcttttcctcttgcaccttcat
cccacaactgtgtttctccccccaccccccgccccccacaacttctccag
aaccaacaacattaccacatccacagctgtgcctctggccatcattgata
tggagtgcctttgcagggcctttgcaagcaaggcttccaactcaagatga
tccagctctgagagtcacctcattttgccttctgtgcaaggatgcttgta
tggtctatgtttagtctatattccatcccagcacgcattgtggttgctcc
cagcctatgcagggctttattcagactggaccctttgctttctgtctggg
cttgtgctgggcaggtccagccctagcagctggtccatttgtggtttctg
ttgtacaccccgctgtctggatgtctgcttcttcaactgcaccccttgct
tcagcatctttgtcttgctgacttttcttggtctgtatctgtttattcag
attgtttattttcttaccttgggatccacctcttttcttcctcctctctt
ccttctttgcctgcttcttcttcattcttttcttgtatttgagaagcagc
a
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_59258532_59259245
seq2: B6Ng01-259O15.b_51_764 (reverse)

seq1  CCACCCCACCCCACCCCCAGCATCACTGACTTCGTTCTTCTTTGTACCAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCCCACCCCACCCCCAGCATCACTGACTTCGTTCTTCTTTGTACCAG  50

seq1  GCCTATGAACCTGGCCCGAGGGCCATGCAAGTGCTTTAGGCTTAGGAGCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTATGAACCTGGCCCGAGGGCCATGCAAGTGCTTTAGGCTTAGGAGCC  100

seq1  ATGAACCTTAGTCACTGTCACTGACAACACAGATTAACACATAACTGAGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAACCTTAGTCACTGTCACTGACAACACAGATTAACACATAACTGAGG  150

seq1  GGTGTGGCTGTGCCAAGGAGCTTCATCTACAATATACTAGCAACTGGACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTGGCTGTGCCAAGGAGCTTCATCTACAATATACTAGCAACTGGACA  200

seq1  TGGGCTATGGGTTGTAGTCAATCCCATTTACTTTTATCTCTCACCTTAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCTATGGGTTGTAGTCAATCCCATTTACTTTTATCTCTCACCTTAAA  250

seq1  TATAATTAACAGATGTTTCTTCTGGAGCCATTTTGAGTGACCAGGGTCCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAATTAACAGATGTTTCTTCTGGAGCCATTTTGAGTGACCAGGGTCCA  300

seq1  ACAACACAGATTTAGGTTACCCCAAATTCCATGTTCCAAAGTGGAAGCCG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACACAGATTTAGGTTACCCCAAATTCCATGTTCCAAAGTGGAAGCCG  350

seq1  TTTCATGGAGTTTTATAAGTCAAGGCAAAGATAAAAATGTGTCAGTGGAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCATGGAGTTTTATAAGTCAAGGCAAAGATAAAAATGTGTCAGTGGAC  400

seq1  TTGTAAGAGTCTATTGCGGCTACAGCAAATGGAAAATGCTGTTCTCTAGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTAAGAGTCTATTGCGGCTACAGCAAATGGAAAATGCTGTTCTCTAGG  450

seq1  CCTCGGTGTTACCCGATGGCATTCCTAGCTTTGGGTTTGGTAGAAGCTGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCGGTGTTACCCGATGGCATTCCTAGCTTTGGGTTTGGTAGAAGCTGG  500

seq1  TGGTCTGTTAAGTCAATAGAAGCCAAAGGCTTTCCAACCTCTCCATGTCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCTGTTAAGTCAATAGAAGCCAAAGGCTTTCCAACCTCTCCATGTCA  550

seq1  TTATAGTTTTAATAAGAGACTACTTACCAGAAATTCCCCTTAAGAACTTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAGTTTTAATAAGAGACTACTTACCAGAAATTCCCCTTAAGAACTTC  600

seq1  GTCAGTTTACAAGCCTACTATAAATCTAGTTAAACCAGGCACAGTAGCAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGTTTACAAGCCTACTATAAATCTAGTTAAACCAGGCACAGTAGCAA  650

seq1  ACACCTTTGATTCTAGCACTTGGAAAGCAGAGACAGGGGTACCTCTGGTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCTTTGATTCTAGCACTTGGAAAGCAGAGACAGGGGTACCTCTGGTC  700

seq1  TACAGAGTGAATTC  714
      ||||||||||||||
seq2  TACAGAGTGAATTC  714

seq1: chr11_59109320_59110467
seq2: B6Ng01-259O15.g_68_1218

seq1  GAATTCTAGGATTTAAGACATGTACCACTGAACCTGGCTAATTTCTTCAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTAGGATTTAAGACATGTACCACTGAACCTGGCTAATTTCTTCAA  50

seq1  CACCTGTAGTTTCCCACAGACCAAAACCAGTATCTACAGACAGATATGTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTGTAGTTTCCCACAGACCAAAACCAGTATCTACAGACAGATATGTG  100

seq1  CACCATCTTTGCTTTTAATGGTAGGAACAGCCTCCAAGCCCAGCCTCACA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCATCTTTGCTTTTAATGGTAGGAACAGCCTCCAAGCCCAGCCTCACA  150

seq1  AGATCTGTGAGAGGCCTTTACAACCATCTGCACTAAAATGAAGCATACTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCTGTGAGAGGCCTTTACAACCATCTGCACTAAAATGAAGCATACTT  200

seq1  GTATCTAACAGTCTCCTCAGACAGCAGGGGACATTCTCCACCACACTTGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATCTAACAGTCTCCTCAGACAGCAGGGGACATTCTCCACCACACTTGG  250

seq1  AGCTTTCTGGCGAGGTGCACCCTGGGATGCCTTGGCACACACTATTGAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTTCTGGCGAGGTGCACCCTGGGATGCCTTGGCACACACTATTGAGA  300

seq1  AAGACAACACAAATGTAAGCAAGTGGGACTGTGCCCTAGGTGGTTGTGTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACAACACAAATGTAAGCAAGTGGGACTGTGCCCTAGGTGGTTGTGTG  350

seq1  GGGCTGACAGGAAGGAAAGAAGTGATTCAGCCACATCTGCTCCTGGGGCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTGACAGGAAGGAAAGAAGTGATTCAGCCACATCTGCTCCTGGGGCT  400

seq1  GTCCTTGAAGAGTGAACTTCCTTGACCTTGACCTCTGGTCTCCTACTTGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTTGAAGAGTGAACTTCCTTGACCTTGACCTCTGGTCTCCTACTTGG  450

seq1  TCCTACCCTCCTCCTTAGTCACTTAGCAGTTGTCTCTGTTAGACACAGCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTACCCTCCTCCTTAGTCACTTAGCAGTTGTCTCTGTTAGACACAGCT  500

seq1  GTCTGTGTAGATTGTTCCGTCCTGTTGATGGTGTGTTCCTTTCTTCATAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGTGTAGATTGTTCCGTCCTGTTGATGGTGTGTTCCTTTCTTCATAG  550

seq1  CCGGTGAGCTTCCTGCTCATCTGGGACTGCTTTTCCTCTTGCACCTTCAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGGTGAGCTTCCTGCTCATCTGGGACTGCTTTTCCTCTTGCACCTTCAT  600

seq1  CCCACAACTGTGTTTCTCCCCCCACCCCCCGCCCCCCACAACTTCTCCAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACAACTGTGTTTCTCCCCCCACCCCCCGCCCCCCACAACTTCTCCAG  650

seq1  AACCAACAACATTACCACATCCACAGCTGTGCCTCTGGCCATCATTGATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCAACAACATTACCACATCCACAGCTGTGCCTCTGGCCATCATTGATA  700

seq1  TGGAGTGCCTTTGCAGGGCCTTTGCAAGCAAGGCTTCCAACTCAAGATGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGTGCCTTTGCAGGGCCTTTGCAAGCAAGGCTTCCAACTCAAGATGA  750

seq1  TCCAGCTCTGAGAGTCACCTCATTTTGCCTTCTGTGCAAGGATGCTTGTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGCTCTGAGAGTCACCTCATTTTGCCTTCTGTGCAAGGATGCTTGTA  800

seq1  TGGTCTATGTTTAGTCTATATTCCATCCCAGCACGCATTGTGGTTGCTCC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCTATGTTTAGTCTATATTCCATCCCAGCACGCATTGTGGTTGCTCC  850

seq1  CAGCCTATGCAGGGCTTTATTCAGACTGGACCC-TTGCTTTCTGTCTGGC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| 
seq2  CAGCCTATGCAGGGCTTTATTCAGACTGGACCCTTTGCTTTCTGTCTGGG  900

seq1  CTTGTGCTGGGCAGGTCCAGCCCTAGCAGCTGGTCCATTTGTGG-TTCTG  948
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  CTTGTGCTGGGCAGGTCCAGCCCTAGCAGCTGGTCCATTTGTGGTTTCTG  950

seq1  -TGTACA-CCCGCTGTCTGGATGTCTGCTTCCTCAACTGCACCCCTTGCT  996
       |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TTGTACACCCCGCTGTCTGGATGTCTGCTTCTTCAACTGCACCCCTTGCT  1000

seq1  TCAGCATC-TTGTCTTGCTGACTTTTCTTGGTCTGTATCTGTT--ATCAG  1043
      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
seq2  TCAGCATCTTTGTCTTGCTGACTTTTCTTGGTCTGTATCTGTTTATTCAG  1050

seq1  ATTGTTTA-TTTCTTACCTTGGG-TCCACCCTCTTTCCTCCCTCCCTCTC  1091
      |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| || ||| ||||||
seq2  ATTGTTTATTTTCTTACCTTGGGATCCA-CCTCTTTTCTTCCT-CCTCTC  1098

seq1  TTCCTTCCTTGCCTGCTTCCTTCCTTCCATTC-TTTCTTGTTATTTGAGA  1140
      ||||||| |||||||||| ||||  | ||||| ||||||| |||||||||
seq2  TTCCTTCTTTGCCTGCTT-CTTC--TTCATTCTTTTCTTG-TATTTGAGA  1144

seq1  TAGCAGCA  1148
       |||||||
seq2  -AGCAGCA  1151