BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-264P13
Chromosome11 (Build37)
Map Location 117,412,863 - 117,509,644
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneUbe2o, Aanat, Rhbdf2, Cygb, OTTMUSG00000003947, 1810032O08Rik, St6galnac2, LOC634720, BC018473, St6galnac1, Mxra7, Jmjd6, 1110005A03Rik, LOC100043293, Sfrs2, Mfsd11, Mgat5b, LOC100042036, Sec14l1, Sept9, EG667423
Downstream geneTnrc6c, Tmc6, Tmc8, 6030468B19Rik, Syngr2, Tk1, Afmid, Birc5, LOC546519, Tha1, Socs3, Pgs1, Dnahc17, Pscd1, Usp36, Timp2, Ddc8, Lgals3bp, Cant1, C1qtnf1, D230014K01Rik, D11Bwg0517e
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-264P13.bB6Ng01-264P13.g
ACCGA068742GA068743
length1,0851,090
definitionB6Ng01-264P13.b B6Ng01-264P13.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(117,412,863 - 117,413,938)(117,508,554 - 117,509,644)
sequence
gaattcccaatgtgttcttggccagctgtgtgcactagtcacaagagatt
ccctgggagtgacagtagagaggtcttataggataacagagactaggcca
cccttgatgcttcatcaatgcacggggcctcacacgatctgtgaagaata
cctgttcccacccatcagagagcacacctgcaggggctctcgtgagctca
ggtgtgatcagagtctgttgctgcagcctgagcccgttagtccaggaaag
ccactcccaacctgtcaacacatgtactgtagagtcctacatcgagcagg
tttctgctgattggggtgggggtggcaggttctgggaacagtggggatgc
ccaagagccaggccagacgctatggacatgatttctgaggctcagtgagg
caggaagagggcaacagaaaggaagcctgagtaagggagttgcagagaag
actgaactgggtggcaccaccatttcctcctggctggaccccagggtctg
aagtgcccagggcagccagagcaggccatctcctgcctcccaccaatggt
ttccaggaaaggctcagttgtcatggcaacatccatccaattactccact
tttgcagaaatcacctaccagccaagttggctggaactcaccccttctaa
agaacaaagtcctccgcttgaagtttggcctcgctgtggccaagcgtgtg
aagcgagaagtggagaggcgggttgggcacatgggccacaagagagatgg
tcacagaggcagaggctataaccaagggacaatggctagccttcacaaac
cagagacaggcggagagctggatcctgccaaggtgctaaaggataggcaa
gttaggaaagggattctatgtgaaatagctttgctgaggacagggcttgg
tcactgagaaggctgaggttcccgttgaagtctttcctaggaggggtgcg
agtccagaagggagtggctggccaattgggtcattactgaagtaacaagt
ggagaatggcctgtattgtgatataacacataggaagggttggccagccc
aacccatggagggcggtgtgcctctggcagaggtg
gaattcagattcatcctcagctacacagtgagggcttggccagcctgtgg
gcgatgcgtaaaattgtctcagtaaactaaacacagcgctggacagatgg
ctcagcagttaacagcactagctgctcttccaaaagacccaggactgatc
ccagcatccacatgatggttcacagccatctgtaacttcagctacaaatc
ccatgccttcttctggtctccataggtaccaggacatatgtagtgcacaa
atttccaggcaaaactcgacacacatcatgtaatgaaaggtaaacaaaac
agagtcaaacagagctgctggaagtgaaggggtatgtgtcaggcagcagg
gcaggagcggggtactgggctccgcagggatggcagttcgggtgacaagc
agatttctgaagccgtttgcagaatgagacctgtttgacctcaaacactc
agagcttcagctcttcctggaagcaataggatggctaatgagaggaataa
ggctagaaacctcactggcttgttgcagctgcccaggccctaccttcaag
cagttgatggtctgggaatttggagcaggttaaccaagagcccgtcatca
cactgtgtgccagtcttctgagtgtgtgtgccgcattaccaccaccaggg
acaggtcttgcccttagaccacctatgttcctccctagaatgcagtctta
gggttttactgctgtgaacagacaccatgaccaaggcaactcttataagg
atgataattggggctggcttgcatgtttggaggttcattccattatcatt
aaggcaggaacataatggcctccaggtaggcatggtacaggaggagctga
gagttctacatcttcatctgaaggctgctagcagactactgccttccagg
cagctagaatgagggtcttaaagcccacgcccacagtgacacacccactc
caacaaggccacacctctatagtgccattccccgttgctgagcacataac
aaaccatcacactgcagttcttttgtttttggaccattactgagatctgc
cctgcaggacaggcctcagtgcagttatcccttttgagaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_117412863_117413938
seq2: B6Ng01-264P13.b_47_1131

seq1  GAATTCCCAATGTGTTCTTGGCCAGCTGTGTGCACTAGTCACAAGAGATT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCAATGTGTTCTTGGCCAGCTGTGTGCACTAGTCACAAGAGATT  50

seq1  CCCTGGGAGTGACAGTAGAGAGGTCTTATAGGATAACAGAGACTAGGCCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGGGAGTGACAGTAGAGAGGTCTTATAGGATAACAGAGACTAGGCCA  100

seq1  CCCTTGATGCTTCATCAATGCACGGGGCCTCACACGATCTGTGAAGAATA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTGATGCTTCATCAATGCACGGGGCCTCACACGATCTGTGAAGAATA  150

seq1  CCTGTTCCCACCCATCAGAGAGCACACCTGCAGGGGCTCTCGTGAGCTCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTTCCCACCCATCAGAGAGCACACCTGCAGGGGCTCTCGTGAGCTCA  200

seq1  GGTGTGATCAGAGTCTGTTGCTGCAGCCTGAGCCCGTTAGTCCAGGAAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTGATCAGAGTCTGTTGCTGCAGCCTGAGCCCGTTAGTCCAGGAAAG  250

seq1  CCACTCCCAACCTGTCAACACATGTACTGTAGAGTCCTACATCGAGCAGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTCCCAACCTGTCAACACATGTACTGTAGAGTCCTACATCGAGCAGG  300

seq1  TTTCTGCTGATTGGGGTGGGGGTGGCAGGTTCTGGGAACAGTGGGGATGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTGCTGATTGGGGTGGGGGTGGCAGGTTCTGGGAACAGTGGGGATGC  350

seq1  CCAAGAGCCAGGCCAGACGCTATGGACATGATTTCTGAGGCTCAGTGAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGAGCCAGGCCAGACGCTATGGACATGATTTCTGAGGCTCAGTGAGG  400

seq1  CAGGAAGAGGGCAACAGAAAGGAAGCCTGAGTAAGGGAGTTGCAGAGAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAAGAGGGCAACAGAAAGGAAGCCTGAGTAAGGGAGTTGCAGAGAAG  450

seq1  ACTGAACTGGGTGGCACCACCATTTCCTCCTGGCTGGACCCCAGGGTCTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAACTGGGTGGCACCACCATTTCCTCCTGGCTGGACCCCAGGGTCTG  500

seq1  AAGTGCCCAGGGCAGCCAGAGCAGGCCATCTCCTGCCTCCCACCAATGGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGCCCAGGGCAGCCAGAGCAGGCCATCTCCTGCCTCCCACCAATGGT  550

seq1  TTCCAGGAAAGGCTCAGTTGTCATGGCAACATCCATCCAATTACTCCACT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGGAAAGGCTCAGTTGTCATGGCAACATCCATCCAATTACTCCACT  600

seq1  TTTGCAGAAATCACCTACCAGCCAAGTTGGCTGGAACTCACCCCTTCTAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCAGAAATCACCTACCAGCCAAGTTGGCTGGAACTCACCCCTTCTAA  650

seq1  AGAAC-AAGTCCTCCGCTTGAAGTTTGGCCTCGCTGTGGCCAAGCGTGTG  699
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACAAAGTCCTCCGCTTGAAGTTTGGCCTCGCTGTGGCCAAGCGTGTG  700

seq1  AAGCGAGAAGTGGAGAGGCGGGTTGGGCACATGGGCCACAAGAGAGATGG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCGAGAAGTGGAGAGGCGGGTTGGGCACATGGGCCACAAGAGAGATGG  750

seq1  TCACAGAGGCAGAGGCTATAACCAAGGGACAATGGCTAGCCTTCACAAAC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACAGAGGCAGAGGCTATAACCAAGGGACAATGGCTAGCCTTCACAAAC  800

seq1  CAGAGACAGGCGGAGAGCTGGATCCTGCCAAGGTGCTAAAGGATAGGCAA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGACAGGCGGAGAGCTGGATCCTGCCAAGGTGCTAAAGGATAGGCAA  850

seq1  GTTAGGAAAGGGATTCTATGTGAAATAGCTTTGCTGAGGACAGGGC-TGG  898
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  GTTAGGAAAGGGATTCTATGTGAAATAGCTTTGCTGAGGACAGGGCTTGG  900

seq1  TCACTGAGAAGGCTGAGGTGCCCG-TGAAGTC-TTCCTAG--AGGGTGCG  944
      ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||   |||||| 
seq2  TCACTGAGAAGGCTGAGGTTCCCGTTGAAGTCTTTCCTAGGAGGGGTGC-  949

seq1  GAGTCCAGAAGGAAGTGGCTGGCCAATT-GGTCATTTACTGAAAGTAACA  993
      |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| 
seq2  GAGTCCAGAAGGGAGTGGCTGGCCAATTGGGTCA-TTACTG-AAGTAAC-  996

seq1  AAAGTGGAGAATGG-CTGTATTGTGATAT-ACACATAGGA--GGTTGGCA  1039
       ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||| 
seq2  -AAGTGGAGAATGGCCTGTATTGTGATATAACACATAGGAAGGGTTGGCC  1045

seq1  AGCC--AACCAAGGAGGGCGG-GTG-CTCTGGGCAGAGGTG  1076
      ||||  | ||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||
seq2  AGCCCAACCCATGGAGGGCGGTGTGCCTCT-GGCAGAGGTG  1085

seq1: chr11_117508554_117509644
seq2: B6Ng01-264P13.g_68_1157 (reverse)

seq1  TTCTCAAAA-GGATACTGGCACTTGAGGCCTGGTTCCTGCAGGGCAGATC  49
      ||||||||| |||||   |||| |||||||||  ||||||||||||||||
seq2  TTCTCAAAAGGGATAACTGCAC-TGAGGCCTG--TCCTGCAGGGCAGATC  47

seq1  TCAGTAATGGTTCCAAAACAAA--GACTGCAGTTGTGATGGTTTG-TATG  96
      ||||||||||| | ||||||||   ||||||| |||||||||||| ||||
seq2  TCAGTAATGGTCCAAAAACAAAAGAACTGCAG-TGTGATGGTTTGTTATG  96

seq1  TGCTCAGC-ACGGGGAATGGCACTATTAGGAGGTGTGGCCTTGTTGGAGT  145
      |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCAGCAACGGGGAATGGCACTAT--AGAGGTGTGGCCTTGTTGGAGT  144

seq1  GGGTGTGTCACTGTGGGCGTGGGCTTTAAGACCCTCATTCTAGCTGCCTG  195
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTGTGTCACTGTGGGCGTGGGCTTTAAGACCCTCATTCTAGCTGCCTG  194

seq1  GAAGGCAGTAGTCTGCTAGCAGCCTTCAGATGAAGATGTAGAACTCTCAG  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGCAGTAGTCTGCTAGCAGCCTTCAGATGAAGATGTAGAACTCTCAG  244

seq1  CTCCTCCTGTACCATGCCTACCTGGAGGCCATTATGTTCCTGCCTTAATG  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTCCTGTACCATGCCTACCTGGAGGCCATTATGTTCCTGCCTTAATG  294

seq1  ATAATGGAATGAACCTCCAAACCTGCAAGCCAGCCCCAATTATCATCCTT  345
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATGGAATGAACCTCCAAACATGCAAGCCAGCCCCAATTATCATCCTT  344

seq1  ATAAGAGTTGCCTTGGTCATGGTGTCTGTTCACAGCAGTAAAACCCTAAG  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGAGTTGCCTTGGTCATGGTGTCTGTTCACAGCAGTAAAACCCTAAG  394

seq1  ACTGCATTCTAGGGAGGAACATAGGTGGTCTAAGGGCAAGACCTGTCCCT  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCATTCTAGGGAGGAACATAGGTGGTCTAAGGGCAAGACCTGTCCCT  444

seq1  GGTGGTGGTAATGCGGCACACACACTCAGAAGACTGGCACACAGTGTGAT  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGTGGTAATGCGGCACACACACTCAGAAGACTGGCACACAGTGTGAT  494

seq1  GACGGGCTCTTGGTTAACCTGCTCCAAATTCCCAGACCATCAACTGCTTG  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACGGGCTCTTGGTTAACCTGCTCCAAATTCCCAGACCATCAACTGCTTG  544

seq1  AAGGTAGGGCCTGGGCAGCTGCAACAAGCCAGTGAGGTTTCTAGCCTTAT  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTAGGGCCTGGGCAGCTGCAACAAGCCAGTGAGGTTTCTAGCCTTAT  594

seq1  TCCTCTCATTAGCCATCCTATTGCTTCCAGGAAGAGCTGAAGCTCTGAGT  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCTCATTAGCCATCCTATTGCTTCCAGGAAGAGCTGAAGCTCTGAGT  644

seq1  GTTTGAGGTCAAACAGGTCTCATTCTGCAAACGGCTTCAGAAATCTGCTT  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGAGGTCAAACAGGTCTCATTCTGCAAACGGCTTCAGAAATCTGCTT  694

seq1  GTCACCCGAACTGCCATCCCTGCGGAGCCCAGTACCCCGCTCCTGCCCTG  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACCCGAACTGCCATCCCTGCGGAGCCCAGTACCCCGCTCCTGCCCTG  744

seq1  CTGCCTGACACATACCCCTTCACTTCCAGCAGCTCTGTTTGACTCTGTTT  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCTGACACATACCCCTTCACTTCCAGCAGCTCTGTTTGACTCTGTTT  794

seq1  TGTTTACCTTTCATTACATGATGTGTGTCGAGTTTTGCCTGGAAATTTGT  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTACCTTTCATTACATGATGTGTGTCGAGTTTTGCCTGGAAATTTGT  844

seq1  GCACTACATATGTCCTGGTACCTATGGAGACCAGAAGAAGGCATGGGATT  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTACATATGTCCTGGTACCTATGGAGACCAGAAGAAGGCATGGGATT  894

seq1  TGTAGCTGAAGTTACAGATGGCTGTGAACCATCATGTGGATGCTGGGATC  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGCTGAAGTTACAGATGGCTGTGAACCATCATGTGGATGCTGGGATC  944

seq1  AGTCCTGGGTCTTTTGGAAGAGCAGCTAGTGCTGTTAACTGCTGAGCCAT  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCTGGGTCTTTTGGAAGAGCAGCTAGTGCTGTTAACTGCTGAGCCAT  994

seq1  CTGTCCAGCGCTGTGTTTAGTTTACTGAGACAATTTTACGCATCGCCCAC  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCCAGCGCTGTGTTTAGTTTACTGAGACAATTTTACGCATCGCCCAC  1044

seq1  AGGCTGGCCAAGCCCTCACTGTGTAGCTGAGGATGAATCTGAATTC  1091
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTGGCCAAGCCCTCACTGTGTAGCTGAGGATGAATCTGAATTC  1090