seq1: chr11_3687109_3688043
seq2: B6Ng01-282J20.b_45_941
seq1 GAATTCATGTACCATGTGGATGCAGTGCCTGCAGAGGCTAGAATAGGGTA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAATTCATGTACCATGTGGATGCAGTGCCTGCAGAGGCTAGAATAGGGTA 50
seq1 CTGGATCCCCTAGGACAGTTGTAGGTGGTAGTGAGCTGCCATCCAGGTGC 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTGGATCCCCTAGGACAGTTGTAGGTGGTAGTGAGCTGCCATCCAGGTGC 100
seq1 TGGGAATTGAACCACAGAGCTCTCTCCCCCTCAAAATAAAAAAAATGTAA 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGGGAATTGAACCACAGAGCTCTCTCCCCCTCAAAATAAAAAAAATGTAA 150
seq1 AGTGATGCCACCACTCCCTACCAGCCCTTTTCCGAACAGCATGAAGGATG 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGTGATGCCACCACTCCCTACCAGCCCTTTTCCGAACAGCATGAAGGATG 200
seq1 CTTCACTGGCAACCAAACTTTCCACCAAAGGCATCGTCGCTGTAGTTTGT 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTTCACTGGCAACCAAACTTTCCACCAAAGGCATCGTCGCTGTAGTTTGT 250
seq1 TTTGGACACTGTGGGACAGGCATGGTGCTGCTGACACCGAACAGCATGAA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTTGGACACTGTGGGACAGGCATGGTGCTGCTGACACCGAACAGCATGAA 300
seq1 GGATGCTTCACTGGCAACCAAACTTTCCACCAAAGGCATCGTCGCTGTAG 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGATGCTTCACTGGCAACCAAACTTTCCACCAAAGGCATCGTCGCTGTAG 350
seq1 TTTGTTATGGACACTGTGGGACAGGCATGGTGCTGCTGACACCTTACATA 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTTGTTATGGACACTGTGGGACAGGCATGGTGCTGCTGACACCTTACATA 400
seq1 TCTTTGCAACAATCCAGTTCTTCAAATAAAGGAACTGAGCCAGTCAGCTT 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCTTTGCAACAATCCAGTTCTTCAAATAAAGGAACTGAGCCAGTCAGCTT 450
seq1 GAGGAGGGTTCACATGGCAACAGAGTGACATGGCTAAGAGCTTTGGGAAC 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAGGAGGGTTCACATGGCAACAGAGTGACATGGCTAAGAGCTTTGGGAAC 500
seq1 TCACTTGGGAGTTCATGTGGAGCAAACTAGACACAGAGCTTGGTTCTACT 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCACTTGGGAGTTCATGTGGAGCAAACTAGACACAGAGCTTGGTTCTACT 550
seq1 CCCTGGGACTGTCCCTCTCCACTGATACTGCCATCCATCATCAGACACCA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCCTGGGACTGTCCCTCTCCACTGATACTGCCATCCATCATCAGACACCA 600
seq1 CTGTCCTGCTTAGCTCTGAACAAAGCTAAGACTGAAGCTGTCCCATTCTG 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTGTCCTGCTTAGCTCTGAACAAAGCTAAGACTGAAGCTGTCCCATTCTG 650
seq1 GTTAGTCTCTAACTCTGCAGGTGGCCACGCTGGCTCCTCTCCAACACCAG 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTTAGTCTCTAACTCTGCAGGTGGCCACGCTGGCTCCTCTCCAACACCAG 700
seq1 CCCCAACCCACCTCTTCTTAGTGGTGGGCAGGATCACTTAGTGGTGGGCA 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCCCAACCCACCTCTTCTTAGTGGTGGGCAGGATCACTTAGTGGTGGGCA 750
seq1 GGATCACTTAGTGGTGGGCAGGATCACTTAGTGGTGGGTAGGATCGCTTA 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGATCACTTAGTGGTGGGCAGGATCACTTAGTGGTGGGTAGGATCGCTTA 800
seq1 GTGGTGGGTAGGATCGCTTAGTGGTGGGTAGGATCGCTTAGTGGTGGGTA 850
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
seq2 GTGGTGGGTAGGATCGCTTAGTGGTGGGCAGGATCGCTTAGTGGTGGGCA 850
seq1 GGATCGCTTAGTGGTGGGCAGGATCGC-TTAGTGG-TGGGTAGGATCACT 898
||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||
seq2 GGATCACTTAGTGGTGGGTAGGATCGCTTTAGTGGTTGGGTAGGATC--- 897
seq1 TAGTGGTGGGTAGGATCACTTAGTGGTGGGTAGGATC 935
seq2 ------------------------------------- 897
| seq1: chr11_3875964_3876106
seq2: B6Ng01-282J20.g_74_216 (reverse)
seq1 CCACCCACCCCACCCCCAGATGAGGTTCCCTGCCTGCAAGCAGGCCTCCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCACCCACCCCACCCCCAGATGAGGTTCCCTGCCTGCAAGCAGGCCTCCT 50
seq1 TGCAATTCTACTCTCTCCCTACAGAAACTGGCTGCCCTCAGTGCCAGCCT 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGCAATTCTACTCTCTCCCTACAGAAACTGGCTGCCCTCAGTGCCAGCCT 100
seq1 GGCCCGAGTGGTGGTGCCTGCTATAGAGGAGGCTGAGGCTGAT 143
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGCCCGAGTGGTGGTGCCTGCTATAGAGGAGGCTGAGGCTGAT 143
|