BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-288N07
Chromosome11 (Build37)
Map Location 67,328,694 - 67,495,083
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGas7
Upstream geneGm879, LOC668323, A530088H08Rik, 9130409J20Rik, A730055C05Rik, 2310004I24Rik, Sco1, Myh3, Myh2, Myh1, Myh4, Myh8, Myh13
Downstream geneRcvrn, Glp2r, LOC544792, Dhrs7c, LOC100041899, Usp43, Wdr16, Stx8, Ntn1, Pik3r5, BB220380, BC024997, Ccdc42
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-288N07.bB6Ng01-288N07.g
ACCGA086394GA086395
length667498
definitionB6Ng01-288N07.b B6Ng01-288N07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(67,328,694 - 67,329,359)(67,494,580 - 67,495,083)
sequence
gaattccatggggtgtgggatgaaaaatcaaagctgagataatcaagtct
gggtgctctggccctgggacgggacatgcaaggaattgtgtgtcccctgg
ctacctcttccctgtcctcctacccccttgactcaggacttcccacagca
ggaggtcagcacaggaacatcccagcagagcaagcagtggcctctggact
ctgggcaaggacttgatttaggaagggattagggaactgtttcctccacc
acagaatggagtcctgaagcatcttggcctgtgcctcccacgtgtgggct
gggtgtggagcagccccggggactgttggtgtgggctgtgaggctgcacc
aaccgccttggcttcttctatgactcagcctggtccaagactgggtcaag
gacctgagtcccagacctggccaggttccctggaaactggacctgaatct
ttcactggtccagttcagagtccacccaactgacccagagagcagaagat
ttagttaagccccagatgtttacatgtctgactcagtgtttgcctgtact
ctgcagagaacttatgtggcccaagaggtggtcatggaatttgctcagat
ctctgtgagggttctactgttgaaatcagcatctgcagggaggagctgaa
ggggtgggaggggggaa
cctggtggaccctgacctctctcagggctcagacaaaggagaacagagta
agacctggttcttgcagagttcacagagtaaggcaagctagcacagggac
ccgaatttacggtcaggtacagattgagggctggaccccagtgctgggaa
ggctctaatgaccatctgtgttgttaccccacccccatccttccatgacc
actgtcccctgcccagggctgcctgtgtcttagcctctttaccacatgca
cacgcatctctgatcacataccagtgtggtcgtcaccatctcttcaaacc
acttggactgggcctggttgtagaggtccacacagcgcatgaggtcatct
cctgggaaaagccaacggccaccatcatgccccgtcacatgccaccctgc
ctccactttggctgcccttttctgtctgtgcccatgggtatggctgttcc
tttcaatggtcaatgcaaagtcagggtgtgaaggggggtggggaagaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_67328694_67329359
seq2: B6Ng01-288N07.b_47_713

seq1  GAATTCCATGGGGTGTGGGATGAAAAATCAAAGCTGAGATAATCAAGTCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCATGGGGTGTGGGATGAAAAATCAAAGCTGAGATAATCAAGTCT  50

seq1  GGGTGCTCTGGCCCTGGGACGGGACATGCAAGGAATTGTGTGTCCCCTGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTGCTCTGGCCCTGGGACGGGACATGCAAGGAATTGTGTGTCCCCTGG  100

seq1  CTACCTCTTCCCTGTCCTCCTACCCCCTTGACTCAGGACTTCCCACAGCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACCTCTTCCCTGTCCTCCTACCCCCTTGACTCAGGACTTCCCACAGCA  150

seq1  GGAGGTCAGCACAGGAACATCCCAGCAGAGCAAGCAGTGGCCTCTGGACT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGTCAGCACAGGAACATCCCAGCAGAGCAAGCAGTGGCCTCTGGACT  200

seq1  CTGGGCAAGGACTTGATTTAGGAAGGGATTAGGGAACTGTTTCCTCCACC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGCAAGGACTTGATTTAGGAAGGGATTAGGGAACTGTTTCCTCCACC  250

seq1  ACAGAATGGAGTCCTGAAGCATCTTGGCCTGTGCCTCCCACGTGTGGGCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAATGGAGTCCTGAAGCATCTTGGCCTGTGCCTCCCACGTGTGGGCT  300

seq1  GGGTGTGGAGCAGCCCCGGGGACTGTTGGTGTGGGCTGTGAGGCTGCACC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTGTGGAGCAGCCCCGGGGACTGTTGGTGTGGGCTGTGAGGCTGCACC  350

seq1  AACCGCCTTGGCTTCTTCTATGACTCAGCCTGGTCCAAGACTGGGTCAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCGCCTTGGCTTCTTCTATGACTCAGCCTGGTCCAAGACTGGGTCAAG  400

seq1  GACCTGAGTCCCAGACCTGGCCAGGTTCCCTGGAAACTGGACCTGAATCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTGAGTCCCAGACCTGGCCAGGTTCCCTGGAAACTGGACCTGAATCT  450

seq1  TTCACTGGTCCAGTTCAGAGTCCACCCAACTGACCCAGAGAGCAGAAGAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACTGGTCCAGTTCAGAGTCCACCCAACTGACCCAGAGAGCAGAAGAT  500

seq1  TTAGTTAAGCCCCAGATGTTTACATGTCTGACTCAGTGTTTGCCTGTACT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTTAAGCCCCAGATGTTTACATGTCTGACTCAGTGTTTGCCTGTACT  550

seq1  CTGCAGAGAACTTATGTGGCCCAAGAGGTGGTCATGGAATTTGCTCAGAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCAGAGAACTTATGTGGCCCAAGAGGTGGTCATGGAATTTGCTCAGAT  600

seq1  CTCTGTGAGGGTTCTACTGTTG-AATCAGCATCTGCAGGGAGGAGCTGAA  649
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGTGAGGGTTCTACTGTTGAAATCAGCATCTGCAGGGAGGAGCTGAA  650

seq1  GGGGTGGGAGGGGGGAA  666
      |||||||||||||||||
seq2  GGGGTGGGAGGGGGGAA  667

seq1: chr11_67494580_67495083
seq2: B6Ng01-288N07.g_72_575 (reverse)

seq1  TTCTTCCCCACCCCCCTTCACACCCTGACTTTGCATTGACCATTGAAAGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTCCCCACCCCCCTTCACACCCTGACTTTGCATTGACCATTGAAAGG  50

seq1  AACAGCCATACCCATGGGCACAGACAGAAAAGGGCAGCCAAAGTGGAGGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGCCATACCCATGGGCACAGACAGAAAAGGGCAGCCAAAGTGGAGGC  100

seq1  AGGGTGGCATGTGACGGGGCATGATGGTGGCCGTTGGCTTTTCCCAGGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTGGCATGTGACGGGGCATGATGGTGGCCGTTGGCTTTTCCCAGGAG  150

seq1  ATGACCTCATGCGCTGTGTGGACCTCTACAACCAGGCCCAGTCCAAGTGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACCTCATGCGCTGTGTGGACCTCTACAACCAGGCCCAGTCCAAGTGG  200

seq1  TTTGAAGAGATGGTGACGACCACACTGGTATGTGATCAGAGATGCGTGTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAAGAGATGGTGACGACCACACTGGTATGTGATCAGAGATGCGTGTG  250

seq1  CATGTGGTAAAGAGGCTAAGACACAGGCAGCCCTGGGCAGGGGACAGTGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTGGTAAAGAGGCTAAGACACAGGCAGCCCTGGGCAGGGGACAGTGG  300

seq1  TCATGGAAGGATGGGGGTGGGGTAACAACACAGATGGTCATTAGAGCCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGGAAGGATGGGGGTGGGGTAACAACACAGATGGTCATTAGAGCCTT  350

seq1  CCCAGCACTGGGGTCCAGCCCTCAATCTGTACCTGACCGTAAATTCGGGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGCACTGGGGTCCAGCCCTCAATCTGTACCTGACCGTAAATTCGGGT  400

seq1  CCCTGTGCTAGCTTGCCTTACTCTGTGAACTCTGCAAGAACCAGGTCTTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGTGCTAGCTTGCCTTACTCTGTGAACTCTGCAAGAACCAGGTCTTA  450

seq1  CTCTGTTCTCCTTTGTCTGAGCCCTGAGAGAGGTCAGGGTCCACCAGGGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGTTCTCCTTTGTCTGAGCCCTGAGAGAGGTCAGGGTCCACCAGGGA  500

seq1  ATTC  504
      ||||
seq2  ATTC  504