BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-302C22
Chromosome11 (Build37)
Map Location 119,396,710 - 119,513,418
singlet/doubletdoublet
Overlap geneNptx1, 4932417H02Rik
Upstream geneD11Bwg0517e, Enpp7, Cbx2, Cbx8, Cbx4, Tbc1d16, Ccdc40, Gaa, Eif4a3, Card14, Sgsh, Slc26a11, LOC672511, Rnf213, A730011L01Rik
Downstream geneChmp6, Baiap2, Aatk, Azi1, 2410002I01Rik, 1810043H04Rik, 1810073N04Rik, 2810410L24Rik, LOC100042332, LOC100043384, LOC100043389, Bahcc1, Actg1, Fscn2, 2310003H01Rik, Nploc4, Tspan10, Pde6g, 1810049H13Rik, 3110023B02Rik, 2600005N12Rik, Hgs, Mrpl12, Slc25a10, LOC667716, Gcgr, BC003940, Dysfip1, P4hb, Arhgdia, LOC100042371, Thoc4, Anapc11, Npb, Pcyt2, Sirt7, Mafg, Pycr1, 1110012N22Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-302C22.bB6Ng01-302C22.g
ACCGA096300GA096301
length1,1331,040
definitionB6Ng01-302C22.b B6Ng01-302C22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(119,512,281 - 119,513,418)(119,396,710 - 119,397,745)
sequence
gaattccagaacaacttagactacatgaaactctagctcaaagaagaaaa
agaatatcattcaagaaactgtataaaccaggtgtgttaagtgaacggct
ttcatcccagcactcaggaggcagagacaggaggatctctgcaaattcaa
gggcagcctggtctacagagtgagttccaggacagtcacaactagagaaa
gaccttgtcatcccccacccccaaaaatcaaaaagagggagggggaacac
tgtaagatgttcagtagctacccgagtctgcagcagacatcccatccatc
agcttccgcctgtccagaacagtgagaggagggtcagcaagctcttggtg
cccaggccctaaagtgctactcaggacctgtctctctggccatcctggag
gtgtccttgggattggatcccaatcaaaagctttgaggaaactttaaatt
ctagctgtagaaaatgggaggtgctggatatgttctaaaattcaaaattt
tttaaaaatcagaaattttgtctctaccccatatcttatgacacagcaag
cgcacatgaacatgtgtttgagagagcactaatggtcacacagtgaaatc
cccactgagtaagtgacttcagcatagacttgcccccaaacaaggacctg
tgtgcactgagcaccaccatggtggccgaagcatactgatgtctgttgcc
attcaaaggatgcagacaatactgcaaaggttttgtctatgtcttccttc
ttagctgactgacaaagccacctattgtttggaaggcatggctgatccag
caactctgccacgtttgaatgaaacatcacaggctaccgtgcctaacatc
tagatgaccgatgtgcagataagaaccaggagtaagcaaagctacctgac
ctgtgtgacctgtgtggtccaggcatgagtggtgctcacgcataaacagc
ttagcgtatggaagtgaagcagaaagccagcctgagggtcaacactgatg
tcacagaacattgttcacccactgtctgaggactgaccacccacttccag
agtcctcattaggatcaactttcaggaaacctgagctgagctgaggccta
cacagggtgcatagtttataggaccggtcagaa
gaattcaacatgaccaactgtctggagctcctgcccctgcagtgaacccc
tgtgtgcacctgcagtgagcccctgtgtgcacctgcagtgagcccctgtg
tgtacctgcagtgagcccctgtgtgcacctgcagtgagcccctgtgtgta
cctgcagtgagcccctgtgtgcacctgcagtgagcccctgtgtgtacctg
cagtgagcccctgtgtgcacctgcagtgagcccctgtgtgcacctgcagt
gagcccctgtgtgcaatgtgtctcatgagctgtgtccacttgcaaacgat
cacatcagcaggacttgatgactgttacatctcctcaaagaagggctaag
gtgtcacaagactgtcacctatgtatcccttggctctctgccacctgttg
cccacaactctgccctaactaaggtagccttgggaaaggctagagtattt
tgatggtttctatgtggttggcccaaagagtggtactatttggaggagtg
accttgttggagtacgtgtggccttttggagtaggtgtggccttttttgg
aggaagtgagtcactgtgggcatggactttaagaccctcaacctagctgc
ctggaagccagtcttctgctatcagccttcagatgaaggtgtagaaccct
cctacaccatgcctgcctggatgctgccatgttcctgccttgatgataat
cggctgaactctaaacttgtaagccagccccaattaaatgttattcttat
aagagttacctaggtcacgatgtctgttcacagcagtaaaaccctaacta
aggtgagtacgtaggccaggaaagaccagggggagggtccctttcatgtg
gctatgggaaagccatcatccttgctgggtagattttccagtgtgacctt
tgggactagcccggttcactccagtaacccctcacctatgttctgtaagg
aagccccaactcattggccccagagggaacctcagtgggatctgcctcac
tgtgttggttgaacttaaggaggggggagggggggagggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_119512281_119513418
seq2: B6Ng01-302C22.b_45_1177 (reverse)

seq1  TTCTGACTGTCTTTATAAATTATGCA-CCTGTGTA-GCCTCAGCTCAGCT  48
      ||||||| |    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||
seq2  TTCTGACCGGTCCTATAAACTATGCACCCTGTGTAGGCCTCAGCTCAGCT  50

seq1  CAGGTTTTCCTGAAGTTTTGAATCCTAATGAGGACTCTTGGGAGTGGGTG  98
      |||| |||||||||  ||   |||||||||||||||| ||| ||||||||
seq2  CAGG-TTTCCTGAAAGTT--GATCCTAATGAGGACTC-TGGAAGTGGGTG  96

seq1  GTTCAGTCCTCAGACAAGTGGGTGAACAATGTTCTGTGACATCAGTGTTG  148
      | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  G-TCAGTCCTCAGAC-AGTGGGTGAACAATGTTCTGTGACATCAGTGTTG  144

seq1  ACCCTCAGGCTGGCTTTCTGCTTCACTTCCATACGCTAAGCTGTTTATGC  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTCAGGCTGGCTTTCTGCTTCACTTCCATACGCTAAGCTGTTTATGC  194

seq1  GTGAGCACCACTCATGCCTGGACCACACAGGTCACACAGGTCAGGTAGCT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGCACCACTCATGCCTGGACCACACAGGTCACACAGGTCAGGTAGCT  244

seq1  TTGCTTACTCCTGGTTTCTTATCTGCACATCGGTCATCTAGATGTTAGGC  298
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTTACTCCTGG-TTCTTATCTGCACATCGGTCATCTAGATGTTAGGC  293

seq1  ACGGTAGCCTGTGATGTTTCATTCAAACGTGGCAGAGTTGCTGGATCAGC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGGTAGCCTGTGATGTTTCATTCAAACGTGGCAGAGTTGCTGGATCAGC  343

seq1  CATGCCTTCCAAACAATAGGTGGCTTTGTCAGTCAGCTAAGAAGGAAGAC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCCTTCCAAACAATAGGTGGCTTTGTCAGTCAGCTAAGAAGGAAGAC  393

seq1  ATAGACAAAACCTTTGCAGTATTGTCTGCATCCTTTGAATGGCAACAGAC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGACAAAACCTTTGCAGTATTGTCTGCATCCTTTGAATGGCAACAGAC  443

seq1  ATCAGTATGCTTCGGCCACCATGGTGGTGCTCAGTGCACACAGGTCCTTG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGTATGCTTCGGCCACCATGGTGGTGCTCAGTGCACACAGGTCCTTG  493

seq1  TTTGGGGGCAAGTCTATGCTGAAGTCACTTACTCAGTGGGGATTTCACTG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGGGGCAAGTCTATGCTGAAGTCACTTACTCAGTGGGGATTTCACTG  543

seq1  TGTGACCATTAGTGCTCTCTCAAACACATGTTCATGTGCGCTTGCTGTGT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGACCATTAGTGCTCTCTCAAACACATGTTCATGTGCGCTTGCTGTGT  593

seq1  CATAAGATATGGGGTAGAGACAAAATTTCTGATTTTTAAAAAATTTTGAA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAGATATGGGGTAGAGACAAAATTTCTGATTTTTAAAAAATTTTGAA  643

seq1  TTTTAGAACATATCCAGCACCTCCCATTTTCTACAGCTAGAATTTAAAGT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAGAACATATCCAGCACCTCCCATTTTCTACAGCTAGAATTTAAAGT  693

seq1  TTCCTCAAAGCTTTTGATTGGGATCCAATCCCAAGGACACCTCCAGGATG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTCAAAGCTTTTGATTGGGATCCAATCCCAAGGACACCTCCAGGATG  743

seq1  GCCAGAGAGACAGGTCCTGAGTAGCACTTTAGGGCCTGGGCACCAAGAGC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGAGAGACAGGTCCTGAGTAGCACTTTAGGGCCTGGGCACCAAGAGC  793

seq1  TTGCTGACCCTCCTCTCACTGTTCTGGACAGGCGGAAGCTGATGGATGGG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTGACCCTCCTCTCACTGTTCTGGACAGGCGGAAGCTGATGGATGGG  843

seq1  ATGTCTGCTGCAGACTCGGGTAGCTACTGAACATCTTACAGTGTTCCCCC  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCTGCTGCAGACTCGGGTAGCTACTGAACATCTTACAGTGTTCCCCC  893

seq1  TCCCTCTTTTTGATTTTTGGGGGTGGGGGATGACAAGGTCTTTCTCTAGT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTCTTTTTGATTTTTGGGGGTGGGGGATGACAAGGTCTTTCTCTAGT  943

seq1  TGTGACTGTCCTGGAACTCACTCTGTAGACCAGGCTGCCCTTGAATTTGC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGACTGTCCTGGAACTCACTCTGTAGACCAGGCTGCCCTTGAATTTGC  993

seq1  AGAGATCCTCCTGTCTCTGCCTCCTGAGTGCTGGGATGAAAGCCGTTCAC  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGATCCTCCTGTCTCTGCCTCCTGAGTGCTGGGATGAAAGCCGTTCAC  1043

seq1  TTAACACACCTGGTTTATACAGTTTCTTGAATGATATTCTTTTTCTTCTT  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACACACCTGGTTTATACAGTTTCTTGAATGATATTCTTTTTCTTCTT  1093

seq1  TGAGCTAGAGTTTCATGTAGTCTAAGTTGTTCTGGAATTC  1138
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCTAGAGTTTCATGTAGTCTAAGTTGTTCTGGAATTC  1133

seq1: chr11_119396710_119397745
seq2: B6Ng01-302C22.g_66_1105

seq1  GAATTCAACATGACCAACTGTCTGGAGCTCCTGCCCCTGCAGTGAACCCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAACATGACCAACTGTCTGGAGCTCCTGCCCCTGCAGTGAACCCC  50

seq1  TGTGTGCACCTGCAGTGAGCCCCTGTGTGCACCTGCAGTGAGCCCCTGTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGCACCTGCAGTGAGCCCCTGTGTGCACCTGCAGTGAGCCCCTGTG  100

seq1  TGTACCTGCAGTGAGCCCCTGTGTGCACCTGCAGTGAGCCCCTGTGTGTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTACCTGCAGTGAGCCCCTGTGTGCACCTGCAGTGAGCCCCTGTGTGTA  150

seq1  CCTGCAGTGAGCCCCTGTGTGCACCTGCAGTGAGCCCCTGTGTGTACCTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCAGTGAGCCCCTGTGTGCACCTGCAGTGAGCCCCTGTGTGTACCTG  200

seq1  CAGTGAGCCCCTGTGTGCACCTGCAGTGAGCCCCTGTGTGCACCTGCAGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGAGCCCCTGTGTGCACCTGCAGTGAGCCCCTGTGTGCACCTGCAGT  250

seq1  GAGCCCCTGTGTGCAATGTGTCTCATGAGCTGTGTCCACTTGCAAACGAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCCCTGTGTGCAATGTGTCTCATGAGCTGTGTCCACTTGCAAACGAT  300

seq1  CACATCAGCAGGACTTGATGACTGTTACATCTCCTCAAAGAAGGGCTAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATCAGCAGGACTTGATGACTGTTACATCTCCTCAAAGAAGGGCTAAG  350

seq1  GTGTCACAAGACTGTCACCTATGTATCCCTTGGCTCTCTGCCACCTGTTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCACAAGACTGTCACCTATGTATCCCTTGGCTCTCTGCCACCTGTTG  400

seq1  CCCACAACTCTGCCCTAACTAAGGTAGCCTTGGGAAAGGCTAGAGTATTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACAACTCTGCCCTAACTAAGGTAGCCTTGGGAAAGGCTAGAGTATTT  450

seq1  TGATGGTTTCTATGTGGTTGGCCCAAAGAGTGGTACTATTTGGAGGAGTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGGTTTCTATGTGGTTGGCCCAAAGAGTGGTACTATTTGGAGGAGTG  500

seq1  ACCTTGTTGGAGTACGTGTGGCCTTTTGGAGTAGGTGTGGCCTTTTTTGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTGTTGGAGTACGTGTGGCCTTTTGGAGTAGGTGTGGCCTTTTTTGG  550

seq1  AGGAAGTGAGTCACTGTGGGCATGGACTTTAAGACCCTCAACCTAGCTGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGTGAGTCACTGTGGGCATGGACTTTAAGACCCTCAACCTAGCTGC  600

seq1  CTGGAAGCCAGTCTTCTGCTATCAGCCTTCAGATGAAGGTGTAGAACCCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAAGCCAGTCTTCTGCTATCAGCCTTCAGATGAAGGTGTAGAACCCT  650

seq1  CCTACACCATGCCTGCCTGGATGCTGCCATGTTCCTGCCTTGATGATAAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTACACCATGCCTGCCTGGATGCTGCCATGTTCCTGCCTTGATGATAAT  700

seq1  CGGCTGAACTCTAAACTTGTAAGCCAGCCCCAATTAAATGTTATTCTTAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGCTGAACTCTAAACTTGTAAGCCAGCCCCAATTAAATGTTATTCTTAT  750

seq1  AAGAGTTACCTAGGTCACGATGTCTGTTCACAGCAGTAAAACCCTAACTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGTTACCTAGGTCACGATGTCTGTTCACAGCAGTAAAACCCTAACTA  800

seq1  AGGTGAGTACGTAGGCCAGGAAAGACCAGGGGGAGGGTCCCTTTCATGTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGAGTACGTAGGCCAGGAAAGACCAGGGGGAGGGTCCCTTTCATGTG  850

seq1  GCTATGGG-AAGCCATCATCCTTGCTGGGTAGATTTTCCAGTGTGACCTT  899
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATGGGAAAGCCATCATCCTTGCTGGGTAGATTTTCCAGTGTGACCTT  900

seq1  TGGGACTAGCCC-GTTCACTCCAGTAACCCCTCACCTATGTTCTGTAAGG  948
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGACTAGCCCGGTTCACTCCAGTAACCCCTCACCTATGTTCTGTAAGG  950

seq1  AAGCCCCAAACTCATTGGCCCCAGAGGGAACCTCAGTGGGATCTTGCCTC  998
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  AAGCCCC-AACTCATTGGCCCCAGAGGGAACCTCAGTGGGATC-TGCCTC  998

seq1  ACTGTGTT-GTTGAAACTTAGGAGGGG---GAGGGGGAGGGG  1036
      |||||||| ||||||  | ||||||||   | ||||||||||
seq2  ACTGTGTTGGTTGAACTTAAGGAGGGGGGAGGGGGGGAGGGG  1040