gaattcagcttcttgaatcaatgtaagcaatcaagatagttctttaggac
aaggctcagtgctcttatgagcttataatttatggcaagttgatattgaa
accaaccaccagactgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
tgtgtgtgtgagtgtatgcaagtagtacgatgtgtgtgtctaccctctcc
gtgtattgacgaattgatcaatgtttttatt

gaattcactatgtagcccaggctagctttgaactcttaatccttctacct
catcctcttgatttctggccccgtggcagcaggctttggattcttggtgg
ggtgcagattacttaagtagcacatacaagatcttggctccaacctcaag
taacaaaaacaaatgaaagaaagaagaagaaggagaaggagaaggagaga
gaagaagaagaaaagagatatagaacaaggttcatgaagctgtagaaaag
ctggaacccttatatactgttgtgagattgaaaaatggtgcatccattac
tgaaaacaaatgtcattcagttaaaaaaaatacaataaagactaggataa
ctcaatgattctattcctgggtatatgatttcaaaaactcaaatcagtct
cggtgagatatttggtccatgttcttagaagcatgattcacaggtggaaa
agaagtggaagcatcccacatgtgcactgatgcaagacatacactttgtg
agaaggggccagtcagactgtcgcttaggaagggagggcattcaggaggc
tttgtattcaactcttcctctgaaaaaccaaagatcggtatgcactacag
agaggcaatggaatattatatggcctggaaatgaagagacgtaaattatg
acccatgctataacatggatagaccttgaggatgatactaagtgaaacac
aggagtcattaaaggacaaagctgaatggctgtccttgtgtgaagatagg
cagcgcagtcgcatgcagagacacaatggtggcctacagctggggatggg
gatagaaacttgtacataatgagatcatttcacttttttctagataaaaa
agaaccccaagggctacaataatatgaacatagttgtgtaggaaaaaatg
gccgagatgttgttgctcattggaggtgaagataggattccatgaaacaa
gcactaggatgcttttagcacaaagtaacttttgtgtaggcacatcaata
ccgaacaaaaggagtaatacacaaaagtccaatgagtctaatctgcatgg
atgtaaccacaacccatcttggttatgtagagcttgaatgggtgtcaatg
acatccaagttga

seq1: chr11_63744310_63745428
seq2: B6Ng01-307J23.g_67_1179 (reverse)

seq1  TCAACTTGGATTTCTCACTGACA--CATCAAAACTTCTACATAACCAAGA  48
      ||||||||||  | ||| |||||  |||  || | |||||||||||||||
seq2  TCAACTTGGA--TGTCATTGACACCCATTCAAGC-TCTACATAACCAAGA  47

seq1  TGGGTTTGTTGTTACACCCCAATGCAGATTTAGAACTCA-TGGACTTTTG  97
      |||| |||| |||||| ||  ||||||| |||| ||||| ||||||||||
seq2  TGGG-TTGTGGTTACATCC--ATGCAGA-TTAG-ACTCATTGGACTTTTG  92

seq1  TTGTATTACTCTTTTTTGTCGGTATTGATGTTGCCTAACACAAAAGTTAC  147
       |||||||||| ||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||
seq2  -TGTATTACTCCTTTTGTTCGGTATTGATG-TGCCT-ACACAAAAGTTAC  139

seq1  TTTGTGCTAAAAGCATCCTAGTGC-TGTTTCATGGAATCCTATCTTCACC  196
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTGCTAAAAGCATCCTAGTGCTTGTTTCATGGAATCCTATCTTCACC  189

seq1  TCCAATGAGCAACAACATCTCGGCCATTTTTTCCTACACAACTATGTTCA  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAATGAGCAACAACATCTCGGCCATTTTTTCCTACACAACTATGTTCA  239

seq1  TATTATTTGTAAGCCTTGGGGTTC-TTTTTATCTAG-AAAAAGTGAAATG  294
      ||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
seq2  TATTA-TTGTAGCCCTTGGGGTTCTTTTTTATCTAGAAAAAAGTGAAATG  288

seq1  ATCTCATTATGTACAAAGTTTCTAT-CCCATCCCCAGCTGTAGGCCACCA  343
      |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCATTATGTAC-AAGTTTCTATCCCCATCCCCAGCTGTAGGCCACCA  337

seq1  TTGTGTCTCTGCATGCGACTGCGCTGCCTATCTTCACACAAGGACAGCCA  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGTCTCTGCATGCGACTGCGCTGCCTATCTTCACACAAGGACAGCCA  387

seq1  TTCAGCTTTGTCCTTTAATGACTCCTGTGTTTCACTTAGTATCATCCTCA  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGCTTTGTCCTTTAATGACTCCTGTGTTTCACTTAGTATCATCCTCA  437

seq1  AGGTCTATCCATGTTATAGCATGGGTCATAATTTACGTCTCTTCATTTCC  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCTATCCATGTTATAGCATGGGTCATAATTTACGTCTCTTCATTTCC  487

seq1  AGGCCATATAATATTCCATTGCCTCTCTGTAGTGCATACCGATCTTTGGT  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCATATAATATTCCATTGCCTCTCTGTAGTGCATACCGATCTTTGGT  537

seq1  TTTTCAGAGGAAGAGTTGAATACAAAGCCTCCTGAATGCCCTCCCTTCCT  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCAGAGGAAGAGTTGAATACAAAGCCTCCTGAATGCCCTCCCTTCCT  587

seq1  AAGCGACAGTCTGACTGGCCCCTTCTCACAAAGTGTATGTCTTGCATCAG  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCGACAGTCTGACTGGCCCCTTCTCACAAAGTGTATGTCTTGCATCAG  637

seq1  TGCACATGTGGGATGCTTCCACTTCTTTTCCACCTGTGAATCATGCTTCT  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACATGTGGGATGCTTCCACTTCTTTTCCACCTGTGAATCATGCTTCT  687

seq1  AAGAACATGGACCAAATATCTCACCGAGACTGATTTGAGTTTTTGAAATC  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAACATGGACCAAATATCTCACCGAGACTGATTTGAGTTTTTGAAATC  737

seq1  ATATACCCAGGAATAGAATCATTGAGTTATCCTAGTCTTTATTGTATTTT  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATACCCAGGAATAGAATCATTGAGTTATCCTAGTCTTTATTGTATTTT  787

seq1  TTTTAACTGAATGACATTTGTTTTCAGTAATGGATGCACCATTTTTCAAT  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAACTGAATGACATTTGTTTTCAGTAATGGATGCACCATTTTTCAAT  837

seq1  CTCACAACAGTATATAAGGGTTCCAGCTTTTCTACAGCTTCATGAACCTT  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACAACAGTATATAAGGGTTCCAGCTTTTCTACAGCTTCATGAACCTT  887

seq1  GTTCTATATCTCTTTTCTTCTTCTTCTCTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTT  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTATATCTCTTTTCTTCTTCTTCTCTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTT  937

seq1  CTTCTTTCTTTCATTTGTTTTTGTTACTTGAGGTTGGAGCCAAGATCTTG  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTTTCTTTCATTTGTTTTTGTTACTTGAGGTTGGAGCCAAGATCTTG  987

seq1  TATGTGCTACTTAAGTAATCTGCACCCCACCAAGAATCCAAAGCCTGCTG  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTGCTACTTAAGTAATCTGCACCCCACCAAGAATCCAAAGCCTGCTG  1037

seq1  CCACGGGGCCAGAAATCAAGAGGATGAGGTAGAAGGATTAAGAGTTCAAA  1093
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACGGGGCCAGAAATCAAGAGGATGAGGTAGAAGGATTAAGAGTTCAAA  1087

seq1  GCTAGCCTGGGCTACATAGTGAATTC  1119
      ||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGCCTGGGCTACATAGTGAATTC  1113