BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-308F21
Chromosome11 (Build37)
Map Location 81,782,300 - 81,903,718
singlet/doubletdoublet
Overlap geneCcl2, Ccl7, Ccl11
Upstream geneAccn1, 1700071K01Rik, 5530401A14Rik
Downstream geneCcl12, Ccl8, Ccl1, Tmem132e, Cct6b, Ccdc16, Lig3, Rffl, Rad51l3, Fndc8, Nle1, Unc45b, Slfn5, Set8-ps, Slfn9, Slfn8, LOC668706, Slfn10, Slfn2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-308F21.bB6Ng01-308F21.g
ACCGA100888GA100889
length7641,099
definitionB6Ng01-308F21.b B6Ng01-308F21.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(81,782,300 - 81,783,063)(81,902,622 - 81,903,718)
sequence
gaattccaattgcgggctgcggctgctgttgccgagggagaggacgctgc
gctccgcctccgagagaagcaaggatgcgggggtttctgtgggctccttg
cttccagcctccggagaaagaggaagaccgttgggctcaaaacgagccct
tctccctggcctgcctctggcaaggctgttagaaggaggagaggcttgtg
caggggagcaggaccgataggggttggggacatggagaaagtttttagcc
ttttttaaaaaatctgctgggggtcttctactccacgtaatgagctactc
ccagaggaaggagaacttaaccccctatccccatggatggcaggaaagtg
gatacttaactgcatgtggccagtgagatgctggcaaggggttttgcacc
aatgtgggctccagggtcacatccatgaggggtctctatgggagagatga
tgaaaacgaagggagcaattttaaaaccacgggtctccctctgcaggcta
gagggggacacttcagagtagagagaagcccttctagagatagaaaaatc
agtgtgcccataggaacccgagagagagagagagagagagagagagagag
agagagagagagagagagagagcgcaacaagtatcccacccccaccccca
tatgtctgccaggactttttgtgtttaacaaaggaagacagctgggtgcc
ctgtaggactggtttaattccattcctttcaaggtgtgtgtgtgtgtgtg
tgtgtgtgtgtgtg
gaattcagatcctatacaacatcatatatctcctatataactgtacttgc
ccttaactgctaatccatccctgcagccttaccacaggaacataaccagt
aattcttctagccagagaggaactggggatgttatagcaaactgccttct
agtctgtggagatgccacatgtgtcctgtgggtctgattctgcggaggtg
tgttggcttaccaaacagatttatgtatgttttttacttagaaatcaagt
cgctgtcttccataatgccaccagagcttcactagtctcttctgagctgc
cataagcaagcagcattaataagtatgagaagcatagctacagggaaaga
aagggctggcgagatgaaaaaggagtctttgttaagcaacttgagattag
tcataatttagccaataactttcccagtatgcctgaggtagtctttttaa
ctttgatataaaggataacattctgacaagtttagtgatgacagagagtt
atcaagtatgtgtcagccttagagtctggtagaggatggccagaaggtgc
tgtagaaaaatgaagagacaaacagcaattaagttttaacttgagttaat
gaataggatgctgtgattgacagacacgtttaggtctgttgtgggcacag
cagcagacaatggtactgcctatgtagttgccactcctgaattgaatagt
attcaagaccctgggtatttgcaaagaagcaatttttatcagctatgaga
gaaacagaataccaaagggatcaaagtctggattcagttactaggaaatc
aggttaaatttcttactgaaattaggatcagagcctggaccttgacagcc
ctctaataaatcaagttcagtcattgtcttagaatttccattgctgtgaa
gagacaccacgaccaagtaactcttataaaggaaaacatttaattgggga
tggcttcaggttcagaggtccagctcatttattctaaggttagaaacatg
gcagcatccagggcagcatggtgctgaaagaagctgagaagctctacatc
tgttctgaaggcaacagttgactgtcttctatgttgcctagggagaagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_81782300_81783063
seq2: B6Ng01-308F21.b_45_808

seq1  GAATTCCAATTGCGGGCTGCGGCTGCTGTTGCCGAGGGAGAGGACGCTGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAATTGCGGGCTGCGGCTGCTGTTGCCGAGGGAGAGGACGCTGC  50

seq1  GCTCCGCCTCCGAGAGAAGCAAGGATGCGGGGGTTTCTGTGGGCTCCTTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCGCCTCCGAGAGAAGCAAGGATGCGGGGGTTTCTGTGGGCTCCTTG  100

seq1  CTTCCAGCCTCCGGAGAAAGAGGAAGACCGTTGGGCTCAAAACGAGCCCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCAGCCTCCGGAGAAAGAGGAAGACCGTTGGGCTCAAAACGAGCCCT  150

seq1  TCTCCCTGGCCTGCCTCTGGCAAGGCTGTTAGAAGGAGGAGAGGCTTGTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCCTGGCCTGCCTCTGGCAAGGCTGTTAGAAGGAGGAGAGGCTTGTG  200

seq1  CAGGGGAGCAGGACCGATAGGGGTTGGGGACATGGAGAAAGTTTTTAGCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGGAGCAGGACCGATAGGGGTTGGGGACATGGAGAAAGTTTTTAGCC  250

seq1  TTTTTTAAAAAATCTGCTGGGGGTCTTCTACTCCACGTAATGAGCTACTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTAAAAAATCTGCTGGGGGTCTTCTACTCCACGTAATGAGCTACTC  300

seq1  CCAGAGGAAGGAGAACTTAACCCCCTATCCCCATGGATGGCAGGAAAGTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAGGAAGGAGAACTTAACCCCCTATCCCCATGGATGGCAGGAAAGTG  350

seq1  GATACTTAACTGCATGTGGCCAGTGAGATGCTGGCAAGGGGTTTTGCACC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATACTTAACTGCATGTGGCCAGTGAGATGCTGGCAAGGGGTTTTGCACC  400

seq1  AATGTGGGCTCCAGGGTCACATCCATGAGGGGTCTCTATGGGAGAGATGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTGGGCTCCAGGGTCACATCCATGAGGGGTCTCTATGGGAGAGATGA  450

seq1  TGAAAACGAAGGGAGCAATTTTAAAACCACGGGTCTCCCTCTGCAGGCTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAACGAAGGGAGCAATTTTAAAACCACGGGTCTCCCTCTGCAGGCTA  500

seq1  GAGGGGGACACTTCAGAGTAGAGAGAAGCCCTTCTAGAGATAGAAAAATC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGGGACACTTCAGAGTAGAGAGAAGCCCTTCTAGAGATAGAAAAATC  550

seq1  AGTGTGCCCATAGGAACCCGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTGCCCATAGGAACCCGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG  600

seq1  AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGCAACAAGTATCCCACCCCCACCCCCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGCAACAAGTATCCCACCCCCACCCCCA  650

seq1  TATGTCTGCCAGGACTTTTTGTGTTTAACAAAGGAAGACAGCTGGGTGCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTCTGCCAGGACTTTTTGTGTTTAACAAAGGAAGACAGCTGGGTGCC  700

seq1  CTGTAGGACTGGTTTAATTCCATTCCTTTCAAGGTGTGTGTGTGTGTGTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTAGGACTGGTTTAATTCCATTCCTTTCAAGGTGTGTGTGTGTGTGTG  750

seq1  TGTGTGTGTGTGTG  764
      ||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTGTGTG  764

seq1: chr11_81902622_81903718
seq2: B6Ng01-308F21.g_66_1164 (reverse)

seq1  CCTTCT-CCTA-GCCACATAGGAGACAGTCAACTGTTTGCCTTCAGAACA  48
      |||||| |||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| 
seq2  CCTTCTCCCTAGGCAACATAGAAGACAGTCAACTG-TTGCCTTCAGAAC-  48

seq1  AGATGTAGAGC-TCTCAGC-TCTTTCAGCACCATGCCTGCCTGGATGCTG  96
      ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||
seq2  AGATGTAGAGCTTCTCAGCTTCTTTCAGCACCATGCTGCCCTGGATGCTG  98

seq1  CCATGTTTCTAACCTTAGAAT-AATGAGCTGGACCTCTGAACCTGAAGCC  145
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGTTTCTAACCTTAGAATAAATGAGCTGGACCTCTGAACCTGAAGCC  148

seq1  ATCCCCAATTAAATGTTTTCCTTTATAAGAGTTACCTTGGTCGTGGTGTC  195
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  ATCCCCAATTAAATGTTTTCCTTTATAAGAGTTA-CTTGGTCGTGGTGTC  197

seq1  TCTTCACAGCAATGGAAATTCTAAGACAATGACTGAACTTGATTTATTAG  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCACAGCAATGGAAATTCTAAGACAATGACTGAACTTGATTTATTAG  247

seq1  AGGGCTGTCAAGGTCCAGGCTCTGATCCTAATTTCAGTAAGAAATTTAAC  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCTGTCAAGGTCCAGGCTCTGATCCTAATTTCAGTAAGAAATTTAAC  297

seq1  CTGATTTCCTAGTAACTGAATCCAGACTTTGATCCCTTTGGTATTCTGTT  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATTTCCTAGTAACTGAATCCAGACTTTGATCCCTTTGGTATTCTGTT  347

seq1  TCTCTCATAGCTGATAAAAATTGCTTCTTTGCAAATACCCAGGGTCTTGA  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCATAGCTGATAAAAATTGCTTCTTTGCAAATACCCAGGGTCTTGA  397

seq1  ATACTATTCAATTCAGGAGTGGCAACTACATAGGCAGTACCATTGTCTGC  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTATTCAATTCAGGAGTGGCAACTACATAGGCAGTACCATTGTCTGC  447

seq1  TGCTGTGCCCACAACAGACCTAAACGTGTCTGTCAATCACAGCATCCTAT  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGTGCCCACAACAGACCTAAACGTGTCTGTCAATCACAGCATCCTAT  497

seq1  TCATTAACTCAAGTTAAAACTTAATTGCTGTTTGTCTCTTCATTTTTCTA  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTAACTCAAGTTAAAACTTAATTGCTGTTTGTCTCTTCATTTTTCTA  547

seq1  CAGCACCTTCTGGCCATCCTCTACCAGACTCTAAGGCTGACACATACTTG  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCACCTTCTGGCCATCCTCTACCAGACTCTAAGGCTGACACATACTTG  597

seq1  ATAACTCTCTGTCATCACTAAACTTGTCAGAATGTTATCCTTTATATCAA  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACTCTCTGTCATCACTAAACTTGTCAGAATGTTATCCTTTATATCAA  647

seq1  AGTTAAAAAGACTACCTCAGGCATACTGGGAAAGTTATTGGCTAAATTAT  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTAAAAAGACTACCTCAGGCATACTGGGAAAGTTATTGGCTAAATTAT  697

seq1  GACTAATCTCAAGTTGCTTAACAAAGACTCCTTTTTCATCTCGCCAGCCC  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTAATCTCAAGTTGCTTAACAAAGACTCCTTTTTCATCTCGCCAGCCC  747

seq1  TTTCTTTCCCTGTAGCTATGCTTCTCATACTTATTAATGCTGCTTGCTTA  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTTCCCTGTAGCTATGCTTCTCATACTTATTAATGCTGCTTGCTTA  797

seq1  TGGCAGCTCAGAAGAGACTAGTGAAGCTCTGGTGGCATTATGGAAGACAG  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAGCTCAGAAGAGACTAGTGAAGCTCTGGTGGCATTATGGAAGACAG  847

seq1  CGACTTGATTTCTAAGTAAAAAACATACATAAATCTGTTTGGTAAGCCAA  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGACTTGATTTCTAAGTAAAAAACATACATAAATCTGTTTGGTAAGCCAA  897

seq1  CACACCTCCGCAGAATCAGACCCACAGGACACATGTGGCATCTCCACAGA  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACCTCCGCAGAATCAGACCCACAGGACACATGTGGCATCTCCACAGA  947

seq1  CTAGAAGGCAGTTTGCTATAACATCCCCAGTTCCTCTCTGGCTAGAAGAA  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGAAGGCAGTTTGCTATAACATCCCCAGTTCCTCTCTGGCTAGAAGAA  997

seq1  TTACTGGTTATGTTCCTGTGGTAAGGCTGCAGGGATGGATTAGCAGTTAA  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTGGTTATGTTCCTGTGGTAAGGCTGCAGGGATGGATTAGCAGTTAA  1047

seq1  GGGCAAGTACAGTTATATAGGAGATATATGATGTTGTATAGGATCTGAAT  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCAAGTACAGTTATATAGGAGATATATGATGTTGTATAGGATCTGAAT  1097

seq1  TC  1097
      ||
seq2  TC  1099