BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-314P16
Chromosome11 (Build37)
Map Location 61,254,702 - 61,365,387
singlet/doubletdoublet
Overlap geneZfp179, Mfap4, Mapk7, 3110043A19Rik, Eppb9, Epn2
Upstream gene4933439F18Rik, LOC674310, Drg2, Myo15, Alkbh5, LOC100042448, LOC624403, LOC624424, OTTMUSG00000007757, LOC668206, Llgl1, Flii, Smcr7, Top3a, LOC100042517, Smcr8, Shmt1, LOC625958, LOC637900, Dhrs7b, Tmem11, Gtlf3b, Map2k3, Kcnj12, LOC668228, Tnfrsf13b, Usp22, LOC668239, Aldh3a1, Aldh3a2, 4933429E10Rik, 1300013J15Rik, LOC100042602, LOC626150
Downstream geneGrap, Slc5a10, 2310040C09Rik, Prpsap2, Ulk2, Akap10, D630015H07, LOC626325, LOC100041558, Specc1, Adora2b, 2410012H22Rik, Ttc19, Ncor1, Pigl, Prr6, Ubb
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-314P16.bB6Ng01-314P16.g
ACCGA105751GA105752
length1,1391,146
definitionB6Ng01-314P16.b B6Ng01-314P16.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(61,364,256 - 61,365,387)(61,254,702 - 61,255,855)
sequence
gaattccactgtttttatgttgtaagaggaaagagaactcccttttcact
tgtcccctctgtgtgagcaacagtttatgaggctttaagttaaagctagc
ctggctgaggcagagacacaatagccctttctcttcaaactaaaatgatc
actgttaaaaagaatgtggcactgtccatattgttctgactgggctgttg
tcctctggagggcctgcttggttctgtcacatggaccgtgtggtctcagt
accctcctcggagggacaccatggtacttgtctctgaagaagacttaagt
ctttcctcttctagactccctatacaggcgatagccagttaattaaggat
caccaagtttcaccttgtttaggtccctgctcctcatatggcagtaggca
ttgtggcttctcttcagtgtgtcttctgccccccacccctcttctgcttc
tggattatgaatacatttccaggaactcgtggtaaaatgggtatgtggaa
catattggcatgatactggtggaaatgtaggcacattcacttcacaggct
gttagcttcttttagaaagatgaagtatgtgtaaagtcacaggaagctcc
taggctcccattttgagtttccatctgagacaagaatacccagtcaatca
aataatttattgattgggcctggattagcagtatcattgtggaatgacct
gtgttttgaggtttggagagggagtggtgacagacgacaggtggtgttgt
gtccctcagagtaggtattgatccttgatagtaaccatggagcctggtgt
aaactagtggttaaggttctccttactgtttttatttaatatgtttgagt
gttttgtctgcatgcatgtatgtataatttgtatgatgcccaaagatgcc
agaaatgggtatctgagcccctggaattggaaattacagatggttggggg
gctaccttgtggtttgctgggatctgaactccagtccctttgtcctcttg
gaacagccagcactctaactgttgagccatctgtccagcccctgttgttt
gacagattcctgcctggctgctcagaggcaatgcaggtctaaggatggaa
ttgccatttcctgacttagcctgcacaagtctaggacat
gaattcacctgggcaaaacagtgatgtttctaaatggcagggcagccctc
atacttaaaaccccaattttcctatgacaaggaacttctgttccttgtca
gaactacccctcacaatggaaataatgaatggacaagaaaagccctaagt
gacctcagctaggccatgagctagctaacagttctatagcttgtccccac
tccttggtgttctcctctgaggaagggttttaaagcacccccactatgcc
ccaccatgttgggcaggtggcattatccaagatgtgttagaggccaggcg
tggggggctcatgtctgtaatctcagcacccgggaggccaaaggattgta
tgagttcagagcaagcctgggttacacaatgagttctaatcctgcttggt
ctagagtgaggtcctttctctgacacccctccctgctggtcaatgacaac
tctgagagatccagagcctgtcagcagggttcctgacatgcaggagttct
ccgcacagggtgctacgaaagtatcttctctgccagcgttgccagggacc
tggggacaagtggattctattgaagcaaacctgtggagggtaagagattc
ggtctccttgtggtgtgtaggaagcccaggtggcctgggggcgctgtcat
tcaggaatgaggtaggtcatgctgagtattcctgcgcacaccatcctctg
cataagtagaacagatgagtcagactctgcaaatccatccggagctcttc
ctgggaggctgctaaccctcctctgctagccttgctaaagatgagaggag
ccccacaggcaagcttcacactgtcctttgagctcttgtctgacaggctg
tggatatgggtttgagaccatggcctgtacccaatttagcccaattctct
catactgtgttcggtgcttaaaaggacttctcttttccctgccaagccct
gagatataaatcagaaggacctaaaagttcctccttgggagctactgccc
catcacagaccagagatttcatgacagagagaggaggtgctctggagaga
gtcaagctcctccccatatgggggaggctctgtcgtgattctgattgtga
catcaagagagagatgcatctgactcaatgcctttccacacaaggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_61364256_61365387
seq2: B6Ng01-314P16.b_45_1183 (reverse)

seq1  ATGTCCTTAAGACTTGTGCA-GCTAGGCAGGGAAATGCCA--TCCAACC-  46
      |||||||  ||||||||||| |||| |   ||||||| ||  |||| || 
seq2  ATGTCCT--AGACTTGTGCAGGCTAAGTCAGGAAATGGCAATTCCATCCT  48

seq1  TAGAACTGCA-TGGCTCTGAGCAGCCCAGCAAGGAATCTGTCAAAC-ACA  94
      |||| ||||| || |||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||
seq2  TAGACCTGCATTGCCTCTGAGCAG-CCAGGCAGGAATCTGTCAAACAACA  97

seq1  GGGGCTGGACAGATGGCTCAACAGTTAAGAGTGCTGGCTGTTCC-AGAGG  143
      |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||
seq2  GGGGCTGGACAGATGGCTCAACAGTT-AGAGTGCTGGCTGTTCCAAGAGG  146

seq1  ACAAA-GGACTGGAGTTCAGATCCCAGC-AACCACAAGGTAG-CCCCCAA  190
      ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||
seq2  ACAAAGGGACTGGAGTTCAGATCCCAGCAAACCACAAGGTAGCCCCCCAA  196

seq1  CCATCTGTAA-TTCCAATTCCAGGGGCTCAGATACCCATTTCTGGCATCT  239
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCTGTAATTTCCAATTCCAGGGGCTCAGATACCCATTTCTGGCATCT  246

seq1  TTGGGCATCATACAAATTATACATACATGCATGCAGACAAAACACTCAAA  289
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGCATCATACAAATTATACATACATGCATGCAGACAAAACACTCAAA  296

seq1  CATATTAAATAAAAACAGTAAGGAGAACCTTAACCACTAGTTTACACCAG  339
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATTAAATAAAAACAGTAAGGAGAACCTTAACCACTAGTTTACACCAG  346

seq1  GCTCCATGGTTACTATCAAGGATCAATACCTACTCTGAGGGACACAACAC  389
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCATGGTTACTATCAAGGATCAATACCTACTCTGAGGGACACAACAC  396

seq1  CACCTGTCGTCTGTCACCACTCCCTCTCCAAACCTCAAAACACAGGTCAT  439
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTGTCGTCTGTCACCACTCCCTCTCCAAACCTCAAAACACAGGTCAT  446

seq1  TCCACAATGATACTGCTAATCCAGGCCCAATCAATAAATTATTTGATTGA  489
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACAATGATACTGCTAATCCAGGCCCAATCAATAAATTATTTGATTGA  496

seq1  CTGGGTATTCTTGTCTCAGATGGAAACTCAAAATGGGAGCCTAGGAGCTT  539
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGTATTCTTGTCTCAGATGGAAACTCAAAATGGGAGCCTAGGAGCTT  546

seq1  CCTGTGACTTTACACATACTTCATCTTTCTAAAAGAAGCTAACAGCCTGT  589
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTGACTTTACACATACTTCATCTTTCTAAAAGAAGCTAACAGCCTGT  596

seq1  GAAGTGAATGTGCCTACATTTCCACCAGTATCATGCCAATATGTTCCACA  639
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTGAATGTGCCTACATTTCCACCAGTATCATGCCAATATGTTCCACA  646

seq1  TACCCATTTTACCACGAGTTCCTGGAAATGTATTCATAATCCAGAAGCAG  689
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCCATTTTACCACGAGTTCCTGGAAATGTATTCATAATCCAGAAGCAG  696

seq1  AAGAGGGGTGGGGGGCAGAAGACACACTGAAGAGAAGCCACAATGCCTAC  739
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGGGGTGGGGGGCAGAAGACACACTGAAGAGAAGCCACAATGCCTAC  746

seq1  TGCCATATGAGGAGCAGGGACCTAAACAAGGTGAAACTTGGTGATCCTTA  789
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCATATGAGGAGCAGGGACCTAAACAAGGTGAAACTTGGTGATCCTTA  796

seq1  ATTAACTGGCTATCGCCTGTATAGGGAGTCTAGAAGAGGAAAGACTTAAG  839
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAACTGGCTATCGCCTGTATAGGGAGTCTAGAAGAGGAAAGACTTAAG  846

seq1  TCTTCTTCAGAGACAAGTACCATGGTGTCCCTCCGAGGAGGGTACTGAGA  889
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCTTCAGAGACAAGTACCATGGTGTCCCTCCGAGGAGGGTACTGAGA  896

seq1  CCACACGGTCCATGTGACAGAACCAAGCAGGCCCTCCAGAGGACAACAGC  939
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACACGGTCCATGTGACAGAACCAAGCAGGCCCTCCAGAGGACAACAGC  946

seq1  CCAGTCAGAACAATATGGACAGTGCCACATTCTTTTTAACAGTGATCATT  989
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTCAGAACAATATGGACAGTGCCACATTCTTTTTAACAGTGATCATT  996

seq1  TTAGTTTGAAGAGAAAGGGCTATTGTGTCTCTGCCTCAGCCAGGCTAGCT  1039
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTTTGAAGAGAAAGGGCTATTGTGTCTCTGCCTCAGCCAGGCTAGCT  1046

seq1  TTAACTTAAAGCCTCATAAACTGTTGCTCACACAGAGGGGACAAGTGAAA  1089
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACTTAAAGCCTCATAAACTGTTGCTCACACAGAGGGGACAAGTGAAA  1096

seq1  AGGGAGTTCTCTTTCCTCTTACAACATAAAAACAGTGGAATTC  1132
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAGTTCTCTTTCCTCTTACAACATAAAAACAGTGGAATTC  1139

seq1: chr11_61254702_61255855
seq2: B6Ng01-314P16.g_68_1212

seq1  GAATTCACCTGGGCAAAACAGTGATGTTTCTAAATGGCAGGGCAGCCCTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACCTGGGCAAAACAGTGATGTTTCTAAATGGCAGGGCAGCCCTC  50

seq1  ATACTTAAAACCCCAATTTTCCTATGACAAGGAACTTCTGTTCCTTGTCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTTAAAACCCCAATTTTCCTATGACAAGGAACTTCTGTTCCTTGTCA  100

seq1  GAACTACCCCTCACAATGGAAATAATGAATGGACAAGAAAAGCCCTAAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTACCCCTCACAATGGAAATAATGAATGGACAAGAAAAGCCCTAAGT  150

seq1  GACCTCAGCTAGGCCATGAGCTAGCTAACAGTTCTATAGCTTGTCCCCAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTCAGCTAGGCCATGAGCTAGCTAACAGTTCTATAGCTTGTCCCCAC  200

seq1  TCCTTGGTGTTCTCCTCTGAGGAAGGGTTTTAAAGCACCCCCACTATGCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTGGTGTTCTCCTCTGAGGAAGGGTTTTAAAGCACCCCCACTATGCC  250

seq1  CCACCATGTTGGGCAGGTGGCATTATCCAAGATGTGTTAGAGGCCAGGCG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCATGTTGGGCAGGTGGCATTATCCAAGATGTGTTAGAGGCCAGGCG  300

seq1  TGGGGGGCTCATGTCTGTAATCTCAGCACCCGGGAGGCCAAAGGATTGTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGGGCTCATGTCTGTAATCTCAGCACCCGGGAGGCCAAAGGATTGTA  350

seq1  TGAGTTCAGAGCAAGCCTGGGTTACACAATGAGTTCTAATCCTGCTTGGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTTCAGAGCAAGCCTGGGTTACACAATGAGTTCTAATCCTGCTTGGT  400

seq1  CTAGAGTGAGGTCCTTTCTCTGACACCCCTCCCTGCTGGTCAATGACAAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGAGTGAGGTCCTTTCTCTGACACCCCTCCCTGCTGGTCAATGACAAC  450

seq1  TCTGAGAGATCCAGAGCCTGTCAGCAGGGTTCCTGACATGCAGGAGTTCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAGAGATCCAGAGCCTGTCAGCAGGGTTCCTGACATGCAGGAGTTCT  500

seq1  CCGCACAGGGTGCTACGAAAGTATCTTCTCTGCCAGCGTTGCCAGGGACC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGCACAGGGTGCTACGAAAGTATCTTCTCTGCCAGCGTTGCCAGGGACC  550

seq1  TGGGGACAAGTGGATTCTATTGAAGCAAACCTGTGGAGGGTAAGAGATTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGACAAGTGGATTCTATTGAAGCAAACCTGTGGAGGGTAAGAGATTC  600

seq1  GGTCTCCTTGTGGTGTGTAGGAAGCCCAGGTGGCCTGGGGGCGCTGTCAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTCCTTGTGGTGTGTAGGAAGCCCAGGTGGCCTGGGGGCGCTGTCAT  650

seq1  TCAGGAATGAGGTAGGTCATGCTGAGTATTCCTGCGCACACCATCCTCTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGAATGAGGTAGGTCATGCTGAGTATTCCTGCGCACACCATCCTCTG  700

seq1  CATAAGTAGAACAGATGAGTCAGACTCTGCAAATCCATCCGGAGCTCTTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAGTAGAACAGATGAGTCAGACTCTGCAAATCCATCCGGAGCTCTTC  750

seq1  CTGGGAGGCTGCTAACCCTCCTCTGCTAGCCTTGCTAAAGATGAGAGGAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGAGGCTGCTAACCCTCCTCTGCTAGCCTTGCTAAAGATGAGAGGAG  800

seq1  CCCCACAGGCAAGCTTCACACTGTCCTTTGAGCTCTTGTCTGACAGGCTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCACAGGCAAGCTTCACACTGTCCTTTGAGCTCTTGTCTGACAGGCTG  850

seq1  TGGATATGGG-TTGAGACCATGGCCTGTACCCAATTTAGCCCAATTCTCT  899
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATATGGGTTTGAGACCATGGCCTGTACCCAATTTAGCCCAATTCTCT  900

seq1  CATACTGTGTTCGGTGCTTAAAAGGACTTCTCTTTTCCCTGCCAAG-CCT  948
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  CATACTGTGTTCGGTGCTTAAAAGGACTTCTCTTTTCCCTGCCAAGCCCT  950

seq1  GAGATATAAAATCAGAAGGACCTAAAAGGTCCTCCTTGGGAGCCTACTGC  998
      ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||
seq2  GAGATAT-AAATCAGAAGGACCTAAAAGTTCCTCCTTGGGAG-CTACTGC  998

seq1  CCCATCAACAGACCAGAGATTTCATGGACAGAGAGA-GAGGTGCTCTGGA  1047
      |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||
seq2  CCCATC-ACAGACCAGAGATTTCAT-GACAGAGAGAGGAGGTGCTCTGGA  1046

seq1  GAAGAGTCAGGCT-CTCCCCATATGGGGAGGGCTCCTGTCCGTG-TTCTG  1095
      | ||||||| ||| ||||||||||||||  |||| |||| |||| |||||
seq2  G-AGAGTCAAGCTCCTCCCCATATGGGGGAGGCT-CTGT-CGTGATTCTG  1093

seq1  A-TGTGACCATCAAAGGAGAAGAAGAAGAATGCGTCTGAGCTC-ATGCC-  1142
      | ||||| ||||||  ||||         |||| ||||| ||| ||||| 
seq2  ATTGTGA-CATCAAGAGAGA--------GATGCATCTGA-CTCAATGCCT  1133

seq1  TTCCACACAAGG  1154
      ||||||||||||
seq2  TTCCACACAAGG  1145