BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-344P15
Chromosome11 (Build37)
Map Location 58,294,241 - 58,448,239
singlet/doubletdoublet
Overlap geneOlfr332, Olfr331, Olfr330, Olfr329, Olfr328, Olfr327-ps1, Olfr325, Olfr324, 2210407C18Rik, Olfr323
Upstream gene1810073G14Rik, Mfap3, Galnt10, Sap30l, Hand1, LOC624605, Larp1, LOC676527, LOC667947, Cnot8, Gemin5, Mrpl22, Irgb10, Igtp, LOC263305, LOC100041816, EG668249, 4930438A08Rik, Zfp692, Zfp672, 1700047K16Rik, Sh3bp5l, 2210415F13Rik, LOC624814, 1810065E05Rik, OTTMUSG00000005737, 4930504O13Rik, Olfr30, Olfr333-ps1
Downstream geneTrim58, Olfr216, OTTMUSG00000005755, Olfr320, LOC668058, Olfr319, Olfr318, Olfr317, Olfr316, Olfr315, Olfr314, 3100002J23Rik, Olfr313, Olfr312, GA_x5J8B7W3UM0-1747565-1747342, Olfr311, 2810021J22Rik, Zfp39, Butr1, Rnf187, LOC676691, Hist3h2ba, Hist3h2bb, Hist3h2a, LOC382523, Trim17, Trim11, Obscn, A230051G13Rik, 4930543L23Rik, Gja12, Guk1, Mrpl55, 2310033P09Rik, Arf1, Wnt3a, Wnt9a, Gm249, 1110031B06Rik, Jmjd4, BC050078, LOC432565, Zkscan17, Nlrp3, Olfr222, LOC668157, Olfr223, GA_x5J8B7W3UM0-970645-971221, Olfr225
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-344P15.bB6Ng01-344P15.g
ACCGA127323GA127324
length1,0841,141
definitionB6Ng01-344P15.b B6Ng01-344P15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(58,447,153 - 58,448,239)(58,294,241 - 58,295,373)
sequence
gaattcaacatgggatattcaaaagtgagactttctaattaggcaccaag
tggctcacgaagacaatagcaagtcacctgtgattccatgatgtggctgt
ctggaaaggggtaactgttgatcccccacactggacatctttcctcgatg
gctctttgttttaatttaacagtggtttgattcatttgcttgatttcaga
gaatggttctaaatcaatagcagccctggcacccaaatcttcccttggaa
tactaagaagcactaataagattctggtgttatcgattgctctccgggga
agatgctgccagacagtgctcacaccagcgcgtccacactacagatacag
acccacgatgcagagtcagtcctcactgcattccttatagacaaagcaag
gaagtgatgcctgaagataattctcccaacggccacagtttctggctcta
ggtttctcaggcagagtccgaataagaacggtgttggtatggcttctgag
gcaggtgcaggtgggctttgaggagagaatctgatttttagaaaaacctc
ctcctctgtcctcactctggcaaagctgcactgagatttggtcatcagtc
tgcatctaattagtacagataagtaaacaaacaaacaaacaaacaaacaa
agttcttcttgtctatgagatcatagaataacattctggaagatgcatgg
ctgtctctcccgcctgtcagaatcattattgcttgtatggtgcctaagta
tagcacacttctgaacaaccaaaagccttaggaccgccttccctttacac
ttaaatgtatgtatctaaagtctcaagctgccaatgacattcatgaatgt
gtgtatagctctgagtggtgacatgcaactttaatcccaataactgcgag
tcagaagcaggcagatctctgggttttgaggccaacctgggtctacacag
gaagttcccagtcactctgggatacatatttagaccgtcaaaatgcatta
aaatgtgcagttaagctaacatatactcttgtaaacccatttattcagtc
ctctttcatcctttttttggaagggggggtgggg
gaattctgtggtaagtccttcagcaatcactctaataacattctgaggtt
gcttggttgtagctcaaacataagacaccatggttgcccaagatcagtac
aggtacagtccttggacttgatccaggcagtctgatcatgctctcagccc
ccagtacatttaaactagtcaccctaacaatgttgcttccacagccttga
ccttgacagagaaccaagtcaggaatggagcgtctgggacattgttgagg
atcaggaactggggcctgtggggaagcacattgctgggtggcctttctct
cccctccacatccccatctcccactcccgaaaaagccactgtccctactc
gaatctctagatctcaggctttggggaggaaactcattgattagtgcagg
gcacaaatgaccacatcttgagaggaattacctgggactgagccccactt
cacctcagcaaggaccggattatgaagctgttcacacccagtgagtaatg
acctcagataatgtggcctccctgagtggagtctggctcctctggaaaat
ccattcggatgatagattgatctgagacacacagaagagaagatagcttg
ttcgatgcacaccacaccacaacagagactctgacaccccagaaatgagg
aattaatggaagactgcatctcagacaggagccgtctgatgaaaccaatg
cctccattacataaccacttctgggatcccctcccctgtcacctttcccc
tctgggaatccccccaccccagacatcaattagttgtgttccttaataga
tgcttgcctttctctgggattccaacataactgtctgatcaagtgctagg
gactttagagagtgatgtttgcatctttactgtggcatctgaggtgacac
aggtcagagatacaccttggaagcttccactgggaggatattctcccagc
ttaattataggcaacacctcaactatagaactgatttcatgggttacttt
tggactttcccacatagattttatgttctctttgaaagttttttctttca
tagtctttgtaatcctccccctatcagcctctcttgtcatccctcccttc
caacgaaccccgacctttctccaactaggcgtctattttta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_58447153_58448239
seq2: B6Ng01-344P15.b_50_1133 (reverse)

seq1  CCCCA--CCCCCTCCAAAAAAAAGGAATGGAAAGAGGAACTGAATTAAAT  48
      |||||  |||||| | ||||||||||   |||||||| |||||| |||||
seq2  CCCCACCCCCCCTTCCAAAAAAAGGA--TGAAAGAGG-ACTGAA-TAAAT  46

seq1  GGGTTTACAAGAGTTAATATGTTAGCTT-ACTGCACATTTTAAATGCATT  97
      ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||| |
seq2  GGGTTTACAAGAGT--ATATGTTAGCTTAACTGCACATTTT-AATGCA-T  92

seq1  TTTGACGGTCTAAATATGTATCCCAGAGTGACTGGGAACTTCCTGTGTAG  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGACGGTCTAAATATGTATCCCAGAGTGACTGGGAACTTCCTGTGTAG  142

seq1  A-CCAGGTTGGCCTCAAAA-CCAGAGATCTGCCTGCTTCTGACTCGCAGT  195
      | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCAGGTTGGCCTCAAAACCCAGAGATCTGCCTGCTTCTGACTCGCAGT  192

seq1  TATTGGGATTAAAGTTGCATGTCACCACTCAGAGCTATACACACATTCAT  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGGGATTAAAGTTGCATGTCACCACTCAGAGCTATACACACATTCAT  242

seq1  GAATGTCATTGGCAGCTTGAGACTTTAGATACATACATTTAAGTGTAAAG  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGTCATTGGCAGCTTGAGACTTTAGATACATACATTTAAGTGTAAAG  292

seq1  GGAAGGCGGTCCTAAGGCTTTTGGTTGTTCAGAAGTGTGCTATACTTAGG  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGGCGGTCCTAAGGCTTTTGGTTGTTCAGAAGTGTGCTATACTTAGG  342

seq1  CACCATACAAGCAATAATGATTCTGACAGGCGGGAGAGACAGCCATGCAT  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCATACAAGCAATAATGATTCTGACAGGCGGGAGAGACAGCCATGCAT  392

seq1  CTTCCAGAATGTTATTCTATGATCTCATAGACAAGAAGAACTTTGTTTGT  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCAGAATGTTATTCTATGATCTCATAGACAAGAAGAACTTTGTTTGT  442

seq1  TTGTTTGTTTGTTTGTTTACTTATCTGTACTAATTAGATGCAGACTGATG  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTTGTTTGTTTGTTTACTTATCTGTACTAATTAGATGCAGACTGATG  492

seq1  ACCAAATCTCAGTGCAGCTTTGCCAGAGTGAGGACAGAGGAGGAGGTTTT  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAAATCTCAGTGCAGCTTTGCCAGAGTGAGGACAGAGGAGGAGGTTTT  542

seq1  TCTAAAAATCAGATTCTCTCCTCAAAGCCCACCTGCACCTGCCTCAGAAG  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAAAATCAGATTCTCTCCTCAAAGCCCACCTGCACCTGCCTCAGAAG  592

seq1  CCATACCAACACCGTTCTTATTCGGACTCTGCCTGAGAAACCTAGAGCCA  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATACCAACACCGTTCTTATTCGGACTCTGCCTGAGAAACCTAGAGCCA  642

seq1  GAAACTGTGGCCGTTGGGAGAATTATCTTCAGGCATCACTTCCTTGCTTT  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACTGTGGCCGTTGGGAGAATTATCTTCAGGCATCACTTCCTTGCTTT  692

seq1  GTCTATAAGGAATGCAGTGAGGACTGACTCTGCATCGTGGGTCTGTATCT  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTATAAGGAATGCAGTGAGGACTGACTCTGCATCGTGGGTCTGTATCT  742

seq1  GTAGTGTGGACGCGCTGGTGTGAGCACTGTCTGGCAGCATCTTCCCCGGA  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGTGTGGACGCGCTGGTGTGAGCACTGTCTGGCAGCATCTTCCCCGGA  792

seq1  GAGCAATCGATAACACCAGAATCTTATTAGTGCTTCTTAGTATTCCAAGG  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAATCGATAACACCAGAATCTTATTAGTGCTTCTTAGTATTCCAAGG  842

seq1  GAAGATTTGGGTGCCAGGGCTGCTATTGATTTAGAACCATTCTCTGAAAT  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGATTTGGGTGCCAGGGCTGCTATTGATTTAGAACCATTCTCTGAAAT  892

seq1  CAAGCAAATGAATCAAACCACTGTTAAATTAAAACAAAGAGCCATCGAGG  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCAAATGAATCAAACCACTGTTAAATTAAAACAAAGAGCCATCGAGG  942

seq1  AAAGATGTCCAGTGTGGGGGATCAACAGTTACCCCTTTCCAGACAGCCAC  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGATGTCCAGTGTGGGGGATCAACAGTTACCCCTTTCCAGACAGCCAC  992

seq1  ATCATGGAATCACAGGTGACTTGCTATTGTCTTCGTGAGCCACTTGGTGC  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATGGAATCACAGGTGACTTGCTATTGTCTTCGTGAGCCACTTGGTGC  1042

seq1  CTAATTAGAAAGTCTCACTTTTGAATATCCCATGTTGAATTC  1087
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATTAGAAAGTCTCACTTTTGAATATCCCATGTTGAATTC  1084

seq1: chr11_58294241_58295373
seq2: B6Ng01-344P15.g_70_1210

seq1  GAATTCTGTGGTAAGTCCTTCAGCAATCACTCTAATAACATTCTGAGGTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGTGGTAAGTCCTTCAGCAATCACTCTAATAACATTCTGAGGTT  50

seq1  GCTTGGTTGTAGCTCAAACATAAGACACCATGGTTGCCCAAGATCAGTAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGGTTGTAGCTCAAACATAAGACACCATGGTTGCCCAAGATCAGTAC  100

seq1  AGGTACAGTCCTTGGACTTGATCCAGGCAGTCTGATCATGCTCTCAGCCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTACAGTCCTTGGACTTGATCCAGGCAGTCTGATCATGCTCTCAGCCC  150

seq1  CCAGTACATTTAAACTAGTCACCCTAACAATGTTGCTTCCACAGCCTTGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTACATTTAAACTAGTCACCCTAACAATGTTGCTTCCACAGCCTTGA  200

seq1  CCTTGACAGAGAACCAAGTCAGGAATGGAGCGTCTGGGACATTGTTGAGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGACAGAGAACCAAGTCAGGAATGGAGCGTCTGGGACATTGTTGAGG  250

seq1  ATCAGGAACTGGGGCCTGTGGGGAAGCACATTGCTGGGTGGCCTTTCTCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGGAACTGGGGCCTGTGGGGAAGCACATTGCTGGGTGGCCTTTCTCT  300

seq1  CCCCTCCACATCCCCATCTCCCACTCCCGAAAAAGCCACTGTCCCTACTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTCCACATCCCCATCTCCCACTCCCGAAAAAGCCACTGTCCCTACTC  350

seq1  GAATCTCTAGATCTCAGGCTTTGGGGAGGAAACTCATTGATTAGTGCAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCTCTAGATCTCAGGCTTTGGGGAGGAAACTCATTGATTAGTGCAGG  400

seq1  GCACAAATGACCACATCTTGAGAGGAATTACCTGGGACTGAGCCCCACTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACAAATGACCACATCTTGAGAGGAATTACCTGGGACTGAGCCCCACTT  450

seq1  CACCTCAGCAAGGACCGGATTATGAAGCTGTTCACACCCAGTGAGTAATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTCAGCAAGGACCGGATTATGAAGCTGTTCACACCCAGTGAGTAATG  500

seq1  ACCTCAGATAATGTGGCCTCCCTGAGTGGAGTCTGGCTCCTCTGGAAAAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCAGATAATGTGGCCTCCCTGAGTGGAGTCTGGCTCCTCTGGAAAAT  550

seq1  CCATTCGGATGATAGATTGATCTGAGACACACAGAAGAGAAGATAGCTTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTCGGATGATAGATTGATCTGAGACACACAGAAGAGAAGATAGCTTG  600

seq1  TTCGATGCACACCACACCACAACAGAGACTCTGACACCCCAGAAATGAGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCGATGCACACCACACCACAACAGAGACTCTGACACCCCAGAAATGAGG  650

seq1  AATTAATGGAAGACTGCATCTCAGACAGGAGCCGTCTGATGAAACCAATG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTAATGGAAGACTGCATCTCAGACAGGAGCCGTCTGATGAAACCAATG  700

seq1  CCTCCATTACATAACCACTTCTGGGATCCCCTCCCCTGTCACCTTTCCCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCATTACATAACCACTTCTGGGATCCCCTCCCCTGTCACCTTTCCCC  750

seq1  TCTGGGAATCCCCCCACCCCAGACATCAATTAGTTGTGTTCCTTAATAGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGGAATCCCCCCACCCCAGACATCAATTAGTTGTGTTCCTTAATAGA  800

seq1  TGCTTGCCTTTCTCTGGGATTCCAACATAACTGTCTGATCAAGTGCTAGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTGCCTTTCTCTGGGATTCCAACATAACTGTCTGATCAAGTGCTAGG  850

seq1  GACTTTAGAGAGTGATGTTTGCATC-TTACTGTGGCATCTGAGGTGACAC  899
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTTAGAGAGTGATGTTTGCATCTTTACTGTGGCATCTGAGGTGACAC  900

seq1  AGGTCAGAGATACACCTTGGAAGCTTCCACTGGAAGGATATTCTCCCAGC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  AGGTCAGAGATACACCTTGGAAGCTTCCACTGGGAGGATATTCTCCCAGC  950

seq1  TTAA-TATAGGC-ACA-CTCAACTATAGAACTGATTTCAT-GGTTACTTT  995
      |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TTAATTATAGGCAACACCTCAACTATAGAACTGATTTCATGGGTTACTTT  1000

seq1  TGGAC-TTCCCACATTAGATTTTATG-TCTCTTTGAAAG-TTTTTCTTTC  1042
      ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||
seq2  TGGACTTTCCCACA-TAGATTTTATGTTCTCTTTGAAAGTTTTTTCTTTC  1049

seq1  ATAGTCTTTGT-ATCCT-CCCCTATCAGCCTCTCTTGTCATCCCTCCCTT  1090
      ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTCTTTGTAATCCTCCCCCTATCAGCCTCTCTTGTCATCCCTCCCTT  1099

seq1  CCACCAAACCCCGA-CTTTCTCCCAACTAGCCTTCCTATTTTTA  1133
      ||| | |||||||| |||||| |||||||| | | |||||||||
seq2  CCAACGAACCCCGACCTTTCT-CCAACTAGGCGT-CTATTTTTA  1141