BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-049F24.T7 (MSMg01no049_f24.b1) | MSMg01-049F24.TJ (MSMg01no049_f24.g1) |
ACC | AG278853 | AG278854 |
length | 1,256 | 1,215 |
length of high quality (start - end) | 635 (71 - 705) | 669 (80 - 748) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no049_f24.b1 PHD_FILE: MSMg01no049_f24.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:11:19 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no049_f24.g1 PHD_FILE: MSMg01no049_f24.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:11:19 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TCTATGGGGCTATAGACTACTAAGGGAGAGGATCCGCGGAATTACCCTTT
CTAATTGGACCCTTAATTTCAACAATAGTTCAGTTCTTGTTATGTGTTTT
CTGAGTATGTGTTGCTTAAGATTGGCATCCATGAAATAAAAATGGCATCC
CCATTGTGGGGAATCCCAGGCGAATTAATACATTTAAAGCAACCTGAGAT
AAGACAGCTGGAAGTTAATAAAGTTAGGGGAACTGTTTTAGGGAGAAAAT
AATTCATATGCTAAGGGCATGGTTGGTGAAGCAAATAAAAAAAAGTACAG
TTTCACACAGTTATCACTGGAGTTTGGGTTTCTAAAATCTGCAGGCCCTT
TTGAATTGAAAAGGTACCTCCAATATAAGATGTCATTGGGCCTGTTTAGA
TCCAACACAATTCAAACATTAGGTCAATGGAGACAACAAAGATGTATTGT
AATTAAGCTATTGCTAATCCATCAGGGCTGCAGGACAGACACAGGAACTA
AACTGCAACCCCAACCCCACCCTGAGCCAGAGTGTTACAGAGCTTTTAAT
CTTAAAAACCACAAACATCTATGCCAAATTGCAAGTATATTTTCCCACCA
ATCAGGGCTTAGAAATAGAGGACTTCCTTAGGAACATTTCTCTGAGGTAA
ACTTATCCTCGTCTCATTGGTTTTTTTTTTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTT
TTTGTTGTTGTTTTTCTTTTTGTTTTTTTGTTTGCTTGGTACTGATATTT
TCCTAATCTTATTTATATTTTTTCTATTTTACCTTTACCTACTTTTTTTT
TTATCTTTCTTAATTATTTTTCTTTCTATTTATTTTTCCTTTTTACCTTT
CTTTTTATCTTATATTTTTCTATATTATATCCCCATATATTTTTTCAATA
TCCTTATTTTTACTCATCTATATATTACCCTCTTTCTTCCTTTATCTTTA
TTCTTTATTCTCTCAACGTATTTTTATATCTCATTTCTTTTATACCTTTA
CACTTCTTCCCTTTTTTTCTTAACATCTCTTTCTCTTCTATCTCCCAACC
TTATCTTAATTACCTCTCTACATTCTATCTTATTTTACTCTCTACCTATT
TTTTCATTTCTCATTTATTTCTATTCAACTTATATTTTTATTATATCTCA
TCTATTACTTCATCTTCTTTGAGCTCTGATCATAACTCTTTATTCATTTT
TATTATTTCTTAACCTCTCTATACTCTAATCTGTCTTATATATCTATCAT
CTATAC
| NNAAAACGATGGTAACTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXCTCTATTCTCATCAACCACATGGTGCCTCACAAC
CATCCATACTGAGATCTGACACCTCTTCTCTTGTGTTTGAAGACAGCTAC
AGTGTTCTCATATAAATAAAAATAAATAAATAAGTCTTAAAAAAACCCTA
AGCCTATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAA
TAAATAAATAAAAATCTAAGCCTACAACTCCCTCAAATTCTCCTCCATCT
TTTACTCCTGCACCTTTGTAAGGCAGGACAAATTGAGTCAAAGTTTGTAT
TGCTGGGTTGGTGTCCTTACCCCTCAATTGTCTTGTCTGGTTGCAGTAGA
TAGCTGCTTCTGACTCCATATCCCTCATTGCTAGAAGTCTTGGCTAGAAC
TTCTGGGAGTTTTTATTGTATTTGGTTTCTAGCTCATCCCAGAGATGCTC
CCCAGCCCAGTTATCTCTTCCAGTATTCTCTCCCTACATCCTCCCTACAT
CTCATCCCTCCTGGCCCCAATCTTGCCCCTCCCCCACTAAGTTTCCTCCC
TCAATTCCCCCCTGATGTTGTCTAACTTATTTTCCCTTCTCAGAGATATT
CCCCTCTTGGGCCATCCTTGTTACTCAGCTTCTCTGGTTCTGTGGTTTGT
AGCATGGGCAGCCCTGTACTTTATGACCAATCTCCACTTACTTTTATCCT
AATATTACTCTGCTGTGGTTCTTCATTGAACTTAATAATATAAATTACCT
CCCTGAAAAGAACTATTTTGTGCTCCATGCCCTTGAAAGGTTGTATGTTG
AAAAAAATCCTTTCATTGCTTTTGAAAAAACCTTAATCCAGGTCGCATTA
ATTTAAGGGGAAATTACCTTTCCCTTACTCATTAAGGGNAAAAAACTGGA
ATGCTGAATGGAAAAAATTTCTCCACGGCTGGGTTGGCCCGGCTTCATTC
TTTGAATTCTAAGGGAATTTCTTTAACTTCCCCCTGGAACCCTTTCTTTT
TTAAAAGCTTTTAACTTATAATTTAAAAACCCCCCCCCCACTTTTAAAAA
AAAGTTTCTCGTGGTACCAGATAAAAAACCCACCGGTTTATAAAAGTTGT
CTCCCTTACAATCCCCGAAGATTTTATAAATATTTCTATATATCACCCTC
NTAACTCTCTTTTTG
|
quality values | Open.Hide. 7 7 9 9 12 11 9 9 8 8 8 10 8 8 8 8 8 9 8 15 8 8 8 21 21 31 36 36 36 36 41 41 39 42 41 33 39 37 30 18 15 9 9 9 23 23 37 40 43 33
33 33 33 33 31 39 37 30 20 18 14 21 21 12 12 11 13 12 11 11 11 17 26 37 44 47 47 47 50 53 47 47 42 42 40 43 40 40 32 42 42 42 42 37 48 43 30 30 21 24
23 21 21 22 24 36 39 46 39 39 39 41 41 47 41 38 38 35 39 39 43 57 57 57 57 57 37 44 46 57 57 57 57 54 47 47 57 57 57 54 57 57 46 44 36 36 29 36 43 57
57 57 57 57 57 43 43 50 46 48 52 52 57 57 57 57 52 52 43 43 41 42 43 52 43 43 43 32 32 38 43 50 57 57 68 68 68 57 59 52 52 52 57 57 57 57 52 52 57 57
57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 52 52 57 57 59 57 57 57 52 52 62 62 52 52 52 52 52 52 52 62 62 52 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 52 52 52 62 62 62 52 52 62 52 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 52 52 62 52 62 52 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 43 43 39 31 44 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 52 52 62 52 52 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 39 39 39 62 62 62 44 44 35 43 35 43 43 35 39 43 43 45 43 44 43 52 52
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 43 43 26 20 20 13 13 13 38 24 35 35 62 62 62 62
62 62 62 62 62 52 59 47 43 43 43 59 59 68 68 59 59 57 57 57 59 59 59 57 57 32 32 12 13 15 32 32 57 52 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 43
39 39 43 57 52 52 43 43 37 43 43 43 43 52 57 57 57 57 52 52 52 52 52 57 52 52 52 52 43 43 25 23 23 23 28 44 44 59 59 59 57 57 57 59 59 59 57 54 54 32
32 24 27 14 34 34 57 32 32 14 14 14 32 32 47 42 43 43 43 43 59 59 57 48 48 48 57 59 59 57 48 48 47 48 48 53 53 53 44 44 39 37 37 47 59 59 54 48 48 48
48 43 42 35 35 35 35 42 28 30 14 14 23 41 43 59 30 25 12 16 16 32 32 37 37 39 41 30 30 39 36 35 31 36 41 44 44 59 59 59 59 50 48 48 43 43 36 43 44 37
43 42 42 47 59 59 59 59 57 57 46 43 43 43 43 48 48 48 48 48 42 30 30 13 16 16 19 16 20 30 21 28 19 28 29 30 20 20 19 21 27 22 24 24 30 28 23 20 20 32
32 28 28 13 12 12 22 19 16 13 10 9 9 9 14 15 37 30 30 15 15 11 11 12 19 18 22 21 21 14 21 15 17 10 10 8 10 7 9 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8
9 9 9 9 9 9 8 10 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 10 9 9 16 16 16 11 12 11 11 12
10 11 11 10 11 11 9 8 8 10 6 6 8 8 7 7 8 10 10 12 10 8 10 10 8 8 6 6 8 8 11 14 11 11 12 12 12 13 11 11 11 11 10 10 6 6 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 10 10 8 8 10 13 13 8 10 8 8 10 10 6 6 6 6 6 6 15 13 8 8 8 8 10 10 10 10 10 11 16 13 8 8 8 8 8
9 11 10 10 10 9 9 9 9 11 11 10 9 9 12 12 8 8 8 8 6 6 8 6 7 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8 9 9 10 10 10 8 8 8 8 8
6 8 12 8 10 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 7 10 8 9 9 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 9 8
8 6 6 6 8 8 10 9 9 9 11 16 11 13 12 10 9 9 9 9 9 9 9 9 9 10 15 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10
13 10 10 10 16 12 10 15 9 8 8 6 6 8 10 10 8 9 6 6 8 8 11 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 10 10 10 10 10 10 10 10 10 8 10 6 6 8 10
19 20 13 8 7 6 8 8 8 6 6 8 6 8 8 10 10 8 10 13 12 15 9 9 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 10 10 8 6 8 7 6 8 8 9 7 8 8 6
6 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 12 12 12 13 10 10 11 7 9 9 9 9 10 10 9 9 9 11 8 8 7 7 8 6 6 7 6 8 6 7 10 8 8 8 8 7 9 9
8 8 8 8 8 8 15 8 8 8 8 8 6 7 8 6 8 8 6 6 7 6 8 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 6 7 6 8 9 9 9
10 8 7 6 8 6 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 6 7 7 7 6 6 6 6 6 6 7 7 9 9 11 11 15 12 9 9 3 0 3 13 15 13 8 9 13 15 22 23 12 12 19 24 26 28 34 42 43 37 35 36
36 36 36 53 53 59 59 59 59 59 47 30 27 11 9 11 11 11 11 10 11 11 11 12 18 18 11 11 11 22 21 30 37 37 39 42 36 32 33 33 33 37 43 57 44 57 46 46 43 48
48 57 53 48 42 24 18 10 10 10 21 11 22 21 36 37 47 48 47 48 47 47 47 48 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 44 44 44 43 43 41 39 37 44 57 50 50 50 48 48
30 37 37 37 37 37 50 50 47 47 47 50 50 50 47 37 37 37 37 52 57 57 44 43 32 32 32 35 28 42 38 43 33 33 41 43 50 57 57 57 52 52 52 59 59 57 57 57 57 43
43 43 57 52 57 57 57 57 57 57 52 52 45 45 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 59 57 57 57 52 45 45 45 57 52 52 52 57 57 57 57 57 62 52 52 52 52 62
62 62 62 62 43 43 39 62 43 43 39 43 35 43 43 52 43 43 35 35 35 43 62 52 44 43 35 35 35 59 47 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68
68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 43 43 43 43 43 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 52 52 62 62 44 44 35 35 24 39 12
39 12 14 14 16 39 43 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 52 45 45 52 43 43 39 43 43
62 62 62 47 43 39 43 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 57 57 59 59 59 47 35 43 43 57 57 43 43 42 42 52 57 57 57 57 57 57 57
52 43 43 57 57 52 52 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 52 52 52 57 57 68 68 59 59 59 54 52 52 59 59 54 54 57 59 59 68 68 57 57 41 38 20 20
32 41 44 59 59 59 59 57 57 57 57 57 50 43 43 50 43 42 48 57 48 48 57 57 44 43 43 44 44 57 57 57 47 47 47 47 41 41 46 44 44 48 57 57 57 59 59 59 68 68
68 59 57 57 57 54 54 54 54 54 57 57 54 54 34 34 23 20 20 31 32 43 47 47 59 59 43 46 46 59 57 50 50 48 48 48 48 48 59 59 43 40 40 31 34 23 34 30 23 23
28 29 29 26 28 15 15 15 18 18 28 24 25 25 28 30 30 24 25 24 12 12 12 25 23 37 32 30 28 32 34 39 41 39 32 29 16 16 11 16 16 23 23 25 27 32 37 39 34 33
28 28 34 34 39 25 11 14 13 16 15 34 32 37 37 33 33 32 23 23 23 23 25 29 29 24 19 19 18 24 24 28 28 28 33 32 32 32 37 32 36 28 25 21 18 22 15 13 10 15
10 9 10 15 9 10 10 19 15 20 21 16 10 9 9 9 9 10 12 11 11 13 18 15 20 21 30 28 28 24 24 19 27 10 10 10 12 12 15 18 15 11 14 8 8 8 10 11 13 13
11 9 12 9 15 15 21 19 28 16 10 11 10 10 12 15 16 9 9 10 10 11 18 18 24 22 22 24 24 15 10 8 8 8 13 10 8 10 9 10 10 10 10 10 10 13 10 10 11 15
16 24 17 10 9 10 10 10 9 10 10 13 13 13 10 10 10 13 11 15 14 23 12 12 10 10 10 13 10 8 8 8 8 8 8 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 14 8 9 9
12 12 8 10 8 8 8 8 15 13 11 11 10 12 11 11 11 11 16 26 22 30 14 14 9 9 8 8 9 10 12 12 11 10 10 10 12 3 0 3 13 19 19 15 8 8 8 8 8 8
10 10 13 15 11 9 9 11 11 8 8 8 10 12 12 9 12 13 15 12 8 8 8 8 8 8 8 7 8 8 10 12 11 10 10 10 9 9 9 11 9 9 9 8 8 8 8 8 6 6
8 8 10 10 8 8 8 8 7 6 6 8 8 8 8 13 11 8 8 12 8 8 8 6 6 6 6 8 8 13 12 13 13 11 11 10 8 8 8 8 8 8 10 13 12 14 14 20 25 22
10 10 10 10 10 6 6 6 6 8 6 6 7 6 8 8 8 8 8 10 19 13 13 8 9 9 17 17 12 12 14 21 16 11 11 9 10 13 6 6 6 6 10 12 10 9 9 13 13 19
13 10 10 10 10 10 9 9 9 9 9 6 8 6 7 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 9 9 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8
8 8 10 8 8 8 7 6 8 8 6 6 8 8 10 9 9 6 8 6 7 13 15 19 8 8 6 7 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 10 8 8 6 6 8 6 7 6 3
0 3 8 8 12 11 11 7 7 8 7 9 14 9 9 |