BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-057B01.T7 (MSMg01no057_b01.b1) | MSMg01-057B01.TJ (MSMg01no057_b01.g1) |
ACC | AG284316 | AG284317 |
length | 707 | 699 |
length of high quality (start - end) | 650 (45 - 694) | 563 (72 - 634) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no057_b01.b1 PHD_FILE: MSMg01no057_b01.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:58:53 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no057_b01.g1 PHD_FILE: MSMg01no057_b01.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:58:53 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXGCGCGGAA
TTCTTTTCAAAGCCGTGGCCCCGTACACAAAGGAAGTGTAGGGTTTTATT
CAAGGAGTCTACACACATTTAGGTAGAAAAACAGTGTGAGGGTCAGCACA
TTCCTGGGTGTGCTTGGCTTAGATCATAGTGCAAGGAGGAACGATGACAC
ATTCTTCAGCATGCTTAGCATAAATTATTGAGTTGAGTAGTTGAAAGAAA
CATCTCTGAGCATGCTCAATTTTCTCCAAAAGGCTATAACTTAAAAAGGA
AAGGAAACTTTGAAGGTGTGTTAACACAGGCATTTCTTCCTAAAGGGTTC
TGCTTTAGTTAGTTAATGGGTAAAATCTTAATATCCATAGATCATCCACC
TAATCTACATATTCAGGCGCTGTGTGGTACCAATTTGTGGCCACAACTGT
CCCACTTCAATTTTTGTGTGGATATATAGAGGGCCTTGCACACCCCATCA
GTGGAAGTTAATGTCTGAAAATTCCCCATCTGGGTCCTCTGTTCCTTCCT
AATCAAAACAGCAATGTCTTTAGACTGCTTTACAGCCTGTCACTTTGCCA
CATGCACAGAATATGAAGGTCAGCAGTGCTGTGCAGCCAAGTGTAAGTAA
GCAATGCAGTTATATCTACTATTTAACAAAACAGCATGTTTGTGCTCAGT
TCTATCN
| AATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTATTATCTGCAAACAGAGATGCTTTGACT
TCTTCCTTATTGCATTATATTCCTTTTATTTGCTTTATACTGTTCTAAGA
TTTTTTCAGTACCATCTTGAATAAGAGTCAGGAAAGTGGAAACCCTTCTT
TTCTCCATTTAATATAACATCAGCTAAAGGCTTGCCATACATATTATGGT
GAGATGTGTTTCTTATAGTCTGAGTTTCTTTGGGATGTTTGACATGATTG
ATATTGGCTTTGTCAAAAGTCTTCCATGTCTATCAAGATGTCATATGATT
TCTATTCTATAAAAAAAGAGATCACTTGTGAAATTTATAAAATCTATTGA
TTGACATATTGAACCAGCACTACATCTCTGGAATAAACCAGCTTGATCAT
GTTGAGTGACTTTTTGATATATTATTGAATGAAGTTTGCAAGTATTTTTA
AATAAATTTTGCATATATGTATACTTGTTTTGGACATTGGTCAGTAATTT
TTTTACTTTGTTTTTTTATCTTGTTTTATTATCAGGCTAATACTAGTTTC
ATAGAGTTTGATAATATAGCCTTCCTTTGCTATTTAATAGAATAGGTTGA
AAAGCATTTGTGTATTTCATTAAAAGTCTGGTAATTTTTTTAATTAGGA
|
quality values | Open.Hide. 6 8 6 6 7 17 27 29 30 23 23 19 13 10 17 10 8 8 19 19 33 48 48 26 26 17 17 16 19 23 9 9 9 12 12 11 11 11 15 11 11 8 7 7 13 19 31 37 37 37
47 48 48 50 53 33 28 18 16 10 10 15 10 10 9 10 17 21 33 34 42 47 43 42 36 36 36 41 41 42 42 68 68 43 40 37 37 37 40 48 40 40 40 43 46 50 57 57 48 42
36 36 43 43 57 57 57 43 42 42 42 35 35 37 37 41 47 57 48 68 50 50 50 50 50 50 68 68 59 50 38 35 35 46 46 50 50 50 50 50 50 50 41 50 46 54 54 57 57 57
57 52 52 52 50 50 57 50 50 50 50 47 50 57 57 57 54 57 57 57 57 42 42 42 43 57 57 57 57 57 47 57 52 57 57 68 68 68 57 57 52 52 57 57 57 57 57 52 45 45
43 44 57 43 52 43 43 39 57 57 57 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 52
52 52 52 62 62 62 43 44 44 52 52 62 62 62 62 52 45 45 62 62 62 62 62 52 43 43 39 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 43 44 44 62 62 62 62 62 62 62
62 62 68 68 62 62 52 62 62 62 62 68 68 62 62 68 68 68 68 68 62 44 62 43 39 39 43 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 43 43
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 43 39 39 43
43 62 62 52 52 43 62 62 62 62 44 44 43 39 19 14 8 8 8 10 22 43 62 62 62 62 62 62 52 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 39 39 39 43 43 52 52 62 62 62 62
45 52 52 62 62 43 43 35 35 44 44 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 39 39 57 59 43 52 52 44 43 39 43 43 52 57 43 42 35
43 43 52 52 52 52 52 52 52 59 59 59 59 52 52 52 57 52 57 59 59 57 52 52 52 57 57 57 57 57 59 57 44 43 33 33 43 43 52 52 50 50 35 42 43 57 44 43 43 43
44 50 50 48 48 59 59 44 47 44 46 44 47 57 38 41 27 27 36 34 34 48 57 37 44 42 48 48 57 57 48 44 37 37 37 43 41 47 42 37 37 43 39 46 47 47 40 42 39 32
32 39 40 37 36 36 43 43 43 43 48 48 48 48 59 59 43 34 33 23 23 23 20 20 20 32 28 35 37 39 39 37 34 28 18 13 10 10 10 10 23 29 37 37 37 37 37 37 48 48
48 48 48 39 39 39 16 14 10 10 10 19 23 43 39 37 37 39 47 47 41 33 32 30 25 26 32 35 28 31 31 38 41 39 41 47 37 35 31 26 32 20 20 18 28 28 21 21 10 10
9 10 10 19 18 3 0 | Open.Hide. 7 7 10 6 8 8 8 17 12 10 10 10 22 22 33 33 33 41 41 37 37 35 31 31 39 39 34 28 16 6 6 6 6 7 6 11 11 18 21 18 30 21 22 29 23 22 10 10 12 26
21 33 33 33 25 26 15 18 23 15 15 10 12 12 23 21 33 33 33 33 33 50 50 57 57 57 42 42 37 37 36 36 43 36 37 40 42 42 42 47 47 42 42 68 68 54 54 54 54 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 47 47 57 57 57 57 57 57 47 47 48 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 50 48 57 47 57 48 57 57 57 57 68 68
68 68 68 57 57 50 50 46 50 50 43 43 43 52 52 52 52 57 57 68 68 57 57 57 50 50 50 36 41 46 57 57 59 50 48 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 59 68 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 39 39 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 45 45 52 62 52 52 43 62 43 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 57 57 57 57 57 57 59 57 57 52 57 57 57 57 52 52 43 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 52 52 52 59 59 59 59 57
57 52 57 52 57 57 57 59 57 57 57 54 54 50 50 37 38 38 37 43 43 50 44 44 29 43 43 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 50 50 44 43 43 43 59 59 57 47 47 43 43
37 42 42 42 42 33 33 35 42 42 44 46 44 47 44 44 44 44 48 57 57 54 59 57 43 43 43 43 43 47 47 48 48 48 57 47 48 48 44 44 30 30 30 32 43 43 47 43 43 37
42 43 46 48 43 43 43 43 43 43 43 48 48 48 48 59 43 57 48 43 43 43 43 48 39 47 47 41 37 43 39 31 31 40 39 39 39 39 31 25 36 25 30 15 15 11 22 24 39 43
43 48 48 43 43 37 36 32 33 32 37 39 47 47 41 37 37 37 37 37 30 25 12 11 11 20 16 25 30 34 30 30 30 32 28 32 39 43 39 35 35 35 37 34 36 32 24 24 32 30
37 37 30 34 28 24 24 24 31 31 37 34 39 39 39 30 37 34 32 26 25 32 32 36 36 39 30 32 20 20 25 34 28 18 18 16 14 17 28 25 22 19 19 9 8 8 10 10 11 12
13 29 30 39 37 32 19 19 23 18 23 31 34 30 32 28 32 20 23 23 34 31 24 16 9 10 9 9 10 9 19 13 11 10 9 10 13 25 15 17 17 15 17 15 12 10 6 6 6 |