BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-118K10.T7 (MSMg01no118_k10.b1) | MSMg01-118K10.TJ (MSMg01no118_k10.g1) |
ACC | AG329469 | AG329470 |
length | 765 | 1,275 |
length of high quality (start - end) | 512 (108 - 619) | --- |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no118_k10.b1 PHD_FILE: MSMg01no118_k10.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:25:34 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no118_k10.g1 PHD_FILE: MSMg01no118_k10.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:25:34 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CCCGATCCTTCCCTAAATTCTGGCGCCGTGGNTCCTTCCCCNNNNCCCCG
ANNNNNNNNGCTCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXCGCGGAATTCTGTTGGTTGCTTTTATAATTCTTTGTGTATTGA
ATAATTTTTGGCTGGAGCCAGATATTGTGAATTTTATAATATAAGTACCT
TAGCTTTTATTATATAGCTTTAATGGCTGTTAATTTTGACTAGAATGCAA
ATGGCTTCTCTAGACCCATATTGCTAACTATCTCTTGAGAGGGAACTTAA
ATATTGGATCCATTTTCACGCTTTATGGGGCTCAAGACACAGCCAGAGCT
GATGTACAGGATCTGGGCTCTTTTGTCTGACTCTGTCCTTCTTGGAAAAT
ACTCTCAAATTGCAGAGACTGATATAATTCTAAATTTTACACTTTAATTC
ATCCAAAAGCTGGCATGTCAGTTTCCTGTTTGAGTTTCATCCATTGAGTA
TTCTATAGGTGTCACCTATATGCCAGAATCCTGTAGTTAAGAAATGCACC
CAGGGAAAACCCATTATCCTACCTGTAAAATCCCTTCCAAAACCAGCCTT
TCCTGTTTATTCTCTAGAATTTTAAATAGCTACTTAGTATATTTAGCCAG
ACAAAAAATTATTATTATCTGAAAGAGGGTTCAACCTGACAGCTACCTAA
AGAAAATCTTTTTTACTTTAAGCCAAATTTAAATGTTTTAAACATTTTGT
TGTCTATAAGGCACA
| TTTAATTTAATATTNNNNTNNNCTNNTATTATNTATCTTNNNTTCTTTTC
ATACATTTCAAAATTTTATTCAATTAATATATATTATCATCATTTTATTT
TACATATTTTTACTCAATATCTTTTTATCCTCCACAATCATAAATAAAAA
ATAAACATTACATTACAACCCTTATCTATTACATTTTTTTATATAATATC
TTCCGAACTCTTTATATCTACATTATCACCTTGATCTTTTATAGTTCCTC
TGACCTCCTTAATACATACCTGTTGAATTATAGATATATATCCTGTTTAC
ATACTTTTAACAACACTTATTTACTCCGTGCTCCTACCGCGTCACATTCC
ACCATCTACTCTCTCATAGTCCGTTTATGCGTATCATGGTCTGTATTTTA
TTTTGCAGTCGTAGGTCTTCGTGCGTTTTTTTGGTCCGCTNATTGTTACT
CATATTCCTATTGTGCCGTCCTGCTACGCCTCGGTGCCCGCCCAGCGGAC
TTGTAGTACAGTCTCAGTTCACAGATAATGATAANGCGCAGCTAGTCTTT
GGCGCNGATCATCGTTGCTTCACGCCGTTTGCTAGCTCCCCACTTGACTA
CTGCCGCCTTTATTAGCGCACCACACACTGAGGTGCGTTTGTTATTTGTT
TTATGGCTTTGCTTTACATGCGGNCTTTCCGTGTATTCGCCAACGTGTCA
GGTTGTATCGATATACATATCATATGCTTCGATGCTATCGTATTCGCGCA
ATCACGTGATCTACGCGTTATTTACGTTAACGATCATCTGTCTCTCCTAG
TGCGTCGCGCGACGTGGCAGTGGGATTACTGCATGCGTTAGATGATGTAC
AATTGTATGTGCATTACACTGCGTGTCGCTAGTCGGTGGCTGAGCGTTGT
CGTAGTTATGTTCGCTGTGTTGTGTCGCGCGTACGGTGCACATGCATTCT
TGGCGGTGCCGATAGTGAGTGAGCGTGTGCAGTTATGCAGTTACTGTACG
TTGCTTACGATGACTCGGAGGATTTACTGTATTGTGATATTGCGCGCAAC
GCATCTACACAGCCTNATCGCAATNTAATGGCTGTTCACCCGTGTGGTAT
CANTANCCTGCATGATCTAGATACTTATACGTCTTATTACTCGCATATGT
AATAATCGCTTACGACAGACATACGATCACCGAAAATCTGATCGCGTGTG
CGACTAAGTGTGATAGAACACACATATCTAGTGTAGTCCGCAGTTATATG
NTATTATCCATGTCACACTGCTCAN
|
quality values | Open.Hide. 7 15 8 8 8 7 6 6 6 8 13 15 8 9 9 9 9 10 10 14 11 9 9 9 9 8 8 6 6 8 3 0 3 6 6 6 6 7 7 7 3 0 0 0 0 3 6 7 7 6
3 0 0 0 0 0 0 0 0 3 9 10 18 19 10 10 10 10 10 12 22 30 41 41 37 32 32 39 39 33 33 33 40 33 33 37 41 33 33 33 33 33 23 23 18 12 12 10 11 11
17 18 18 18 24 28 28 29 44 47 53 35 35 31 31 28 30 37 35 30 24 17 12 12 10 10 10 10 10 19 28 41 37 37 33 33 36 36 53 53 53 53 53 50 50 50 50 50 50 50
50 47 47 47 47 47 42 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 41 41 41 50 50 50 68 42 33 29 28 30 30 30 33 40 42 47 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57
59 54 54 54 59 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 54 54 54 57 54 54 54 59 57 57 52 54 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 68 68 59 59 59 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 50 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 44 42 37 43 43 43 42 43 59 59 68 68 68 68 68 59 68 59 59 59 57 57 57 57
57 57 59 59 59 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 42 42 34 39 19 15 8 8 8 17 22 39 39 39 36 35 32 32 30 30 33 39 36 36 32 39 39 59 57 57 48 48 57 57 48
42 42 48 48 48 50 68 59 59 59 59 57 54 59 59 68 57 57 54 54 54 57 57 59 59 34 32 17 17 17 30 32 46 46 54 46 46 47 48 43 48 48 54 54 54 57 42 42 42 42
42 42 48 57 59 59 59 57 48 48 48 57 48 57 57 48 48 48 48 47 47 41 41 39 37 19 17 15 19 19 27 39 32 34 28 28 24 24 34 37 39 25 30 26 32 32 37 39 34 34
23 20 20 32 32 39 39 39 41 37 32 37 37 37 37 37 42 34 41 28 28 28 30 30 43 43 43 43 47 50 33 28 25 21 21 18 11 11 11 10 15 22 28 20 31 31 31 22 30 25
23 23 21 21 19 29 20 28 28 30 37 30 30 18 15 12 18 16 12 12 14 19 19 23 23 26 20 10 10 10 23 20 32 25 29 19 19 11 13 18 23 25 20 19 10 10 11 14 14 17
30 19 10 10 9 9 9 16 15 10 11 10 11 14 12 24 12 13 13 18 14 9 9 8 8 8 8 8 9 10 8 8 6 6 6 8 10 11 8 8 8 10 16 15 21 19 20 25 24 24
20 15 13 11 8 8 8 11 16 25 27 28 19 20 24 30 32 32 18 16 11 11 11 11 16 28 28 28 24 20 15 14 11 11 12 11 11 11 17 17 12 13 10 15 8 9 8 8 8 8
8 8 6 6 6 10 8 8 6 6 6 6 8 8 6 | Open.Hide. 6 6 6 6 10 10 8 6 6 8 8 10 10 3 0 0 0 0 3 0 0 0 3 3 0 0 3 8 8 8 8 3 0 3 6 8 8 10 3 0 0 0 3 9 8 8 9 6 8 8
8 8 8 8 8 8 8 17 15 10 10 8 8 11 8 10 10 12 8 8 10 11 11 9 9 9 9 10 8 10 8 8 8 8 9 9 11 10 8 8 8 8 8 9 10 8 8 8 8 8
10 8 8 6 6 8 8 10 10 10 13 11 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 12 13 15 13 11 11 11 11 12 8 8 8 8 8 8 11 8 6 6 6 8 8 10 10 9 9 8 10
6 6 8 8 8 8 8 8 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 6 8 6 6 8 8 10 11 15 9 9 9 9 9 9 10 11 12 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8
8 10 8 8 8 8 6 6 10 8 19 12 13 8 8 8 8 9 9 8 9 9 9 8 8 10 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 11 10 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 7
6 6 6 7 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6 8 8 10 10 10 8 8 8 6 6 6 6 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 9 9 9 12 12 7 6
8 8 8 8 10 10 12 15 11 11 11 11 8 12 7 7 12 7 9 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 6 8 8 8 10 10 10 8 8 9 10 6
6 6 8 8 10 8 8 6 6 6 6 6 7 9 8 8 10 8 8 8 8 10 12 13 13 8 10 7 9 10 10 10 12 12 8 8 6 6 6 6 6 6 10 8 8 8 8 8 6 6
6 8 6 11 15 12 10 10 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 12 14 18 16 7 6 6 6 6 6 10 10 3 0 3 8 10 11 13 9 8 8 8
10 10 10 10 10 10 12 10 9 9 8 10 10 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 6 6 6 6 7 10 8 8 8 6 8 8 10 10 8 8 8
8 8 10 8 8 8 8 10 10 10 9 8 10 8 8 7 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 3 0 3 9 10 10 11 8 8 8 8 6 6 6 6 8 9
10 12 10 10 3 0 3 10 10 8 8 8 8 10 8 8 8 10 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 11 10 8 8
8 8 10 10 7 7 8 6 10 10 8 6 6 6 6 8 10 10 10 8 8 9 9 10 8 8 10 8 8 8 6 6 8 8 10 10 10 10 10 11 11 8 8 8 9 10 13 19 18 18
11 10 10 8 8 6 6 6 6 6 8 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 3 0 3 11 10 6 8 6 6 6 6 8 8 8 8 9 8 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 10 12 12 12 10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 12 10 10 9 11 11 11 11 16 10 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8
9 9 9 8 8 10 8 8 9 8 7 7 7 8 9 8 8 7 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 11 10 8 8 8 8 10 8 9 9 7 7 10 10 10
9 8 7 7 6 8 8 8 8 8 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 6 8 8 8 6 6 7 8 10 10 10 11 10 10 10 12 10 10 9 8 8 8 8
8 8 8 8 8 10 8 10 6 6 6 6 9 9 9 9 9 9 9 9 12 11 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 10 7 7 6 6 6 8 10 10 10 10 10 10 10 10 8 8
8 8 8 10 7 7 6 6 6 13 9 9 6 6 6 6 8 6 8 8 8 7 6 6 6 6 8 8 9 9 10 19 17 13 10 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 10 9 8 8
8 8 8 8 10 8 6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 7 8 8 10 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 7 9 9 10 10 10 10 8 8 9 8 8 6 6 8 8 6 7
8 9 8 8 8 6 6 6 6 8 10 10 9 9 8 8 8 8 8 8 6 6 7 8 6 6 8 6 6 6 6 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 6 6 6 6 6 7 9 10 9 10 9 3 0 3 8 8 8 6 7 6 3 0 3 8 8 8 13 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 9 10 10 8
8 3 0 3 3 0 3 9 9 8 8 10 8 13 7 6 8 6 6 7 12 12 12 8 10 8 8 8 8 11 8 6 6 6 8 6 8 6 6 6 8 6 6 6 6 8 6 6 6 8
6 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 16 6 6 6 6 10 10 13 21 8 6 6 6 6 6 7 8 8 8 8 6 6 7 7 11 9 8 6 6 6 6 8 8 10 10 10 8
6 6 6 8 6 6 6 6 8 8 10 8 8 8 9 7 7 6 6 8 6 10 10 11 11 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 12 9 9 9 10 8 6 8 6 6 8 3
0 3 6 6 6 8 8 7 7 6 6 6 6 10 6 10 10 8 8 8 8 9 9 3 0 |