BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-124C15.T7 (MSMg01no124_c15.b1) | MSMg01-124C15.TJ (MSMg01no124_c15.g1) |
ACC | AG333587 | AG333588 |
length | 1,262 | 1,256 |
length of high quality (start - end) | 471 (122 - 592) | 491 (128 - 618) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no124_c15.b1 PHD_FILE: MSMg01no124_c15.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:34:53 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no124_c15.g1 PHD_FILE: MSMg01no124_c15.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:34:53 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | ATTATTATATTGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAA
TTCCTTAATTTCCTTCTTGCCCTTTAAGCTCCCATAGCTCTTAGTCAGTA
GTGTGTTGTTCTTGTTTCTGTGAATTTGTGTGTTTTATGAAGTTTGTATT
GTTGTTAATAGCCATCTTTATTCTATTATAGTCAGATAAAATGCAGGAGG
TTATTTCAATTCTATATTTGGGGAGACTTGTTTTTTAATGTTCTAAGATG
TGATCTGTTTTGAAGACAGTTCCATGGGCTGCTGAGAACAATGTACAGTT
TTCAAAGTTTGGGAGGAATGTTCTGTAGATATCTGTTAGGTGCATTGAAT
TTATGATTTCATTTAGCTGCAGAGTTTCACTGTTTAGGTTTTTCCTCTCA
TATGACCAGAGGCAAGACTCAGGTAATGAAGTCATCCATTACCACTGTGT
TGTGGTTAATCTTTGGTTTTAGATCTAATAGTATTTCTTTCATGTAATTT
GGTTCCTCCTGTGTTTGGTGCATACATTTGTACAACTGCACAGTTCATGT
TTCTTTCATGGGTAGGAAGTACCTCTCCTTACCGTTTCTGACTAGTTTTG
GCTTGAAGTCTATTTTGCTGGGTATTAGAATGGTTGCATCTGCTCAGTTT
CTCAGTTACATTTGCTTGGAATACCTTTTTCCATCCTGTTACCCTACAGT
GTCATCCATCCTTGACTGTAAAGTGTGTTTCTGGCTACTCGCTCAAAGAT
GGATCCTGTTTCCTCATCTAATTTGTTAATCTGTGTCTGTTTCCTGTGAC
ATGAGACTATTAATATTTAGAATTATTATTCCATGGTGTTTATTAATGCC
TTTTGTTGCTTTCTTTGATTCCTTTACATTAAGTTATGCCAATTTTTCCC
TCTTGTACTGTAATTTAACCCTTCTCTTTACTTATTACTATTCTCTTCCC
GTCATTCTCCCGTTTTTCCTTAATACTTCTTTAATTTTTCTTAAATTCCC
TTTTTCATTTATGGTAAACCTCTTCTTTTTTTCCTTTTGAATTCTCTTGA
ACTATTTTTTGCTGTGCATAATCCATTCCTGGGCTCTTCTCCTATACCTG
TCATCGCTATATATAAAAAGCCCTTTTCTGGGTTCTTTCTAAACTCTCCT
TTGGCAATATATCCCTCCTTTATTCTTGCATCTACCCTGGATCTTCCTAT
TTGGCACCGTGATCTTCTTTCCCCCTGTATACTTCTTTCTATATAAACTT
CTATTCTTCCTG
| TTTTCTTTCCCTATGGAGGCTGGGGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCCTTATAAAGGACAGGGATTATAAGCAG
ACAGTCCTCTAGCTCCTGTCCCTTACAGTGAATGCAATCAGAAATGAAAG
TTTCACAAGGGAAGGGTCTTTCAACACTTGAACACCCAACAATGCAGTGG
CCTAGATAAAAGGGATGTAGTCCTTGAAAGAAACTACCAAGCTTGACTCA
TGAGAAAACATAAGTTCAGCTATCAACCCACCACCACCACCAAAGAGCCA
GTGGAGATAGCTCAGTTAGTAAAGTGCTTAAGAAGCCAACATGAGGACTT
AGGCTTGCATCTCTAGCATCCATGTAAAAGAGCTAAGCATGGTACTATGC
ATCTGTAATCTCACTGGAGGACGTAGAGACAGACAGATCCCTGAGTTCAT
TAGCCAGCCAGGCGAACTCACTCAATGAACTCCAGATTCAGAGAGAGGAT
CTGTCTCCAAACAAGAAAGGTGAAGAACAATTGCAGAAGACATCTGATCT
TTGGCCGCCCCACAGACACACAAACAAATGTGTGTACAAAACCCCACACT
AATATGTACATAGAATACACACAGAGACAGGTGTGCACCCACACTTCAAA
GGAGAAAGCACAACGTCATGTTACTTCAATATGAATTCTATAAGATAGAA
CAAATCAATGGCTATTCTTTTTAAACTCCCCCACAAAAGAACGGAGAAAA
ATACTTCACAAGATATTATGGCTAGTCTTGGTGTAATACAAGGAATTTAT
AATCAAAGACTGTATCTCTTGCGAATCTAGATTCATGCTTCTCTCAAAGA
TTATCACATGTAATCTATCCTCTACTTTTGAAAGAAACCATGTAATTTTC
CACACAATACCATAACTGTTTCTCTTTCTAAACCATTATATCAAAATACC
TTTGTATTAATTATCATAACAGAAAAAAATTTGCATGTTTATGTTTAACT
ATTGTAAAAAATCGTCTTTTTCAAATATGTTCGCCATTTTTCACATTTTT
AACTAATCCCTTATTTTAAAAGAATTAGTTTCCCCCCCTGATGGAAAACC
CGCCTTCTGTTTGGATCTCAAACACCTCTTAACTTTTTTGAACTAATATC
CTTCCCTCAATAATTTTTTTTTTTGAACTGAATGTTTTCTAAACACCTTT
CCCCCCACGCCCTCTGGCCTCTGGTTAACTCTGGTTCTCTCTGCTGTATA
TCTAAC
|
quality values | Open.Hide. 6 8 6 6 8 8 6 6 6 6 7 6 7 9 14 13 14 14 13 13 13 9 15 10 13 8 8 8 10 14 14 24 29 37 30 23 24 26 36 42 43 42 42 32 25 24 31 31 37 37
37 50 53 53 53 53 38 36 36 50 50 50 50 47 47 33 25 15 10 10 11 11 14 11 10 9 6 6 6 6 8 8 10 15 17 27 27 33 44 36 36 36 35 35 35 34 34 33 35 35
35 31 31 28 33 31 21 17 9 9 9 9 9 10 11 18 21 24 30 24 22 22 22 23 28 30 41 41 48 48 48 48 57 43 47 47 47 47 47 57 57 54 54 57 54 54 48 48 39 46
43 46 43 41 47 47 47 41 50 48 48 48 54 54 54 57 50 50 50 57 57 57 47 47 57 57 57 57 57 57 57 57 43 43 39 44 46 48 48 48 43 44 36 32 28 32 32 43 43 57
48 48 57 57 57 57 37 37 37 42 43 43 52 52 57 57 57 57 59 57 54 54 57 50 50 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 43 43 35 39 39 43 44 33 43 35 35 38 43 52 52 57 57 43 52 43 44 43 43 43 43 43 52 52 52 62 62 62 62 52 52 62 62
62 62 52 52 52 52 62 62 62 62 62 45 45 45 62 62 62 62 62 43 43 35 43 43 38 38 41 41 41 62 44 62 62 62 52 43 43 39 47 43 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 41 41 43 43 39 39 39 39 39 35 26 35 35 43 44 62 43 39 39 62 62 52 52 43 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 43 43 26 26
12 18 13 13 12 13 15 18 34 43 52 52 45 52 52 52 43 43 35 43 34 35 43 43 43 62 52 43 43 39 39 35 35 35 35 43 43 45 52 57 52 52 45 52 43 43 35 35 26 43
43 43 44 26 26 23 43 44 44 59 52 52 43 43 41 43 43 52 57 57 57 57 43 57 57 52 52 43 43 32 23 23 23 44 44 57 54 57 50 43 37 37 43 43 52 46 46 50 50 38
35 33 33 31 43 43 57 57 50 59 37 37 37 50 43 43 35 42 36 37 43 42 37 42 35 42 42 44 42 43 32 32 25 32 24 32 18 18 14 14 14 29 25 42 42 44 44 32 28 28
32 41 41 48 44 44 37 29 32 22 12 12 13 19 19 31 28 28 23 28 23 32 32 43 39 43 43 43 33 39 33 33 37 30 31 34 28 28 24 32 20 15 15 12 12 11 10 10 10 13
9 10 10 14 17 23 19 20 29 29 37 33 33 33 37 37 30 28 28 22 12 12 10 11 8 8 8 8 10 25 25 17 18 28 32 32 22 22 22 31 24 34 20 18 15 19 15 13 15 10
10 10 19 15 8 8 8 15 17 21 18 18 18 22 24 16 21 15 15 23 21 19 9 9 9 11 14 17 18 24 28 19 19 19 31 29 37 37 29 35 34 34 30 29 31 23 20 20 20 20
23 24 15 15 11 11 10 10 13 10 10 10 10 21 19 21 23 14 14 14 14 12 22 9 9 9 9 10 10 15 11 20 12 10 10 10 8 6 6 6 8 8 8 8 8 16 15 12 12 15
15 15 15 13 12 11 19 18 18 14 16 12 14 14 9 10 8 8 8 8 8 13 22 25 13 11 11 9 10 9 8 8 11 9 9 9 10 17 17 19 12 10 10 10 10 11 10 12 7 7
6 8 8 9 8 8 6 6 8 8 15 8 8 8 10 13 10 8 8 8 8 10 10 12 10 10 9 8 8 8 8 8 8 9 8 9 9 9 9 10 13 10 9 9 9 9 10 12 14 16
19 15 19 16 14 14 12 18 18 18 12 9 9 9 15 10 10 8 8 8 8 10 13 12 12 9 8 8 8 8 8 8 10 9 9 8 8 8 8 8 8 10 8 7 7 9 10 18 22 23
15 10 8 8 6 6 8 8 8 8 15 10 8 8 8 9 8 13 8 12 12 15 8 8 8 8 10 10 17 13 8 8 7 6 8 8 9 10 10 11 10 12 9 9 10 13 12 10 11 8
8 6 6 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 12 11 9 11 10 10 12 10 11 11 11 9 9 9 9 9 9 10 12 12 12 12 13 6 6 6 6 8 8 9 8 8 6 6 8 8
10 16 19 12 10 10 10 10 8 8 8 8 8 10 9 10 11 12 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 12 19 13 17 17 16 21 19 19 13 10 11 11 10 10 10 10 8 8 8 8 6
6 7 8 8 9 12 12 12 11 8 8 8 8 11 9 9 8 8 6 6 8 7 7 8 8 8 8 6 8 8 9 9 9 9 10 12 11 8 9 9 8 10 6 7 7 7 8 8 9 9
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 10 10 10 8 7 7 7 10 10 8 8 8 8 8 8 8 13 8 7 8 8 8 10 9 9 10 8 8 7 7 13 8 10
10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 7 9 9 8 13 10 11 11 7 7 8 10 8 10 8 7 8 6 6 8 8 8 6 6 6 6 11 11 11 9 9 8 8 8 8
13 11 11 8 8 8 10 8 8 8 8 10 8 8 8 10 10 8 13 8 8 8 8 9 9 9 8 8 7 6 8 8 8 11 15 8 13 6 6 8 8 8 8 8 8 12 10 8 8 8
8 8 6 6 7 6 6 7 9 9 9 9 | Open.Hide. 9 9 9 9 9 9 15 13 9 6 6 6 6 7 8 8 6 6 6 15 6 6 6 8 12 9 9 6 8 7 9 8 7 8 8 8 10 8 8 13 16 19 27 18 18 18 29 28 32 36
36 33 37 26 24 14 14 24 34 37 39 39 48 40 40 36 23 19 8 8 8 8 9 12 8 8 8 8 10 9 11 10 10 8 8 8 11 14 32 33 36 36 50 47 35 34 34 42 39 39
43 39 39 39 44 41 37 28 28 25 22 21 10 9 9 9 9 9 9 12 16 14 19 16 19 14 14 18 20 24 32 39 48 48 48 48 48 43 43 43 43 43 48 48 57 59 48 48 48 48
48 43 46 43 43 40 46 40 43 43 43 43 46 47 48 48 48 57 57 44 57 43 43 43 57 44 47 47 57 57 54 54 54 57 57 47 24 24 11 11 11 24 25 30 41 31 42 42 42 42
35 32 32 32 32 43 57 57 57 57 59 59 57 57 52 57 57 57 43 43 32 42 43 52 57 57 52 57 52 52 43 43 43 52 52 52 52 52 52 52 43 43 52 52 52 52 57 57 57 57
43 44 33 33 33 44 44 57 52 52 43 57 43 44 43 43 43 39 43 43 52 57 52 57 57 52 45 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 43 43 43
32 32 35 35 35 43 43 57 52 52 52 50 59 52 44 43 43 42 43 43 57 50 50 43 35 35 43 43 44 36 28 27 18 28 28 33 42 42 42 43 46 48 57 44 40 40 44 57 44 44
42 30 30 37 37 57 48 48 48 48 57 57 57 57 43 44 37 37 43 47 47 48 47 46 43 43 39 42 39 43 40 43 43 42 43 36 43 37 40 40 37 37 35 35 39 47 47 43 41 41
43 43 47 47 36 32 12 10 9 9 9 13 13 18 19 19 24 28 37 37 37 37 26 23 15 15 16 29 30 37 43 43 43 43 43 43 39 42 39 43 43 42 40 35 27 27 20 28 28 32
32 30 21 24 21 18 23 28 28 28 18 18 14 14 14 23 30 30 27 17 17 17 17 27 28 42 42 48 48 48 48 47 43 37 42 42 42 32 31 20 20 23 32 32 37 37 43 43 43 44
44 47 50 50 43 36 32 29 32 24 32 19 23 25 25 29 43 43 43 38 29 21 26 15 18 20 38 32 32 32 46 38 36 32 18 18 14 18 18 20 32 32 35 50 50 50 50 37 37 43
32 21 14 14 15 18 28 29 31 32 32 18 15 11 15 12 24 14 13 13 14 20 20 43 32 37 28 32 28 21 21 20 19 20 20 20 20 42 30 37 37 40 36 36 25 25 28 44 37 46
43 43 43 43 40 40 33 32 30 30 29 25 25 28 37 23 28 13 13 13 15 11 11 11 11 11 13 12 14 10 10 10 10 15 13 17 17 15 19 12 12 12 12 12 22 20 13 11 13 12
20 9 9 9 12 17 12 10 10 10 10 10 11 17 24 19 17 17 17 30 30 40 35 35 25 29 13 14 14 17 21 26 33 43 43 48 48 48 43 32 24 15 12 12 12 21 15 15 12 13
12 16 19 23 19 15 10 10 10 19 15 15 12 16 18 30 22 28 28 29 27 24 29 26 30 22 16 9 9 9 10 10 15 15 16 15 18 13 10 10 14 17 18 15 12 12 15 19 19 11
9 9 9 9 14 15 14 14 10 13 10 9 8 12 14 11 11 11 12 9 9 9 9 10 10 10 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 10 10 9 8 8 10 8 10 15 19 15 14 10
10 13 10 12 11 11 9 9 10 13 13 10 10 10 10 10 10 10 11 11 8 8 11 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 9 8 10 10 10 12 9 8 8
9 10 9 9 11 10 10 8 10 6 6 8 6 9 14 22 14 10 10 10 10 8 9 11 12 20 24 37 32 28 19 16 10 10 9 8 8 8 8 8 8 10 12 10 10 9 15 10 10 9
10 8 8 8 8 8 9 9 10 8 8 8 10 11 8 10 10 10 10 12 13 8 8 8 8 10 19 12 12 12 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 15 20 10 10 11 8 10 8
8 8 10 9 9 13 11 8 8 6 6 8 8 10 10 10 8 9 8 10 10 10 10 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 10 10 10 15 8 9 9 9 9 9 10 8 10
8 8 8 6 6 8 8 12 9 9 8 8 8 8 8 8 12 10 13 13 12 11 11 8 8 7 7 9 9 10 10 9 6 6 6 6 8 8 8 11 10 13 10 10 10 15 15 10 10 6
6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 10 10 8 8 8 8 6 6 6 8 10 8 8 9 8 10 12 12 8 8 10 11 11 11 8 8 8 8 8 8 11 11 19 12 10 9
7 6 6 10 8 8 10 10 11 11 12 8 9 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 12 10 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 10 11
9 9 10 10 11 8 8 8 8 6 6 6 10 10 11 14 15 15 11 12 15 9 11 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 10 6 7 8 8 8 8 8 6 8 6 7 8 8
16 11 13 8 10 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 11 12 11 11 11 11 11 11 11 10 10 8 8 6 6 6 6 10 13 13 15 8 9 10 10 11 13 11 11 8 8 8 8
8 8 12 12 10 10 |