BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-160J08.T7 (MSMg01no160_j08.b1) | MSMg01-160J08.TJ (MSMg01no160_j08.g1) |
ACC | AG360216 | AG360217 |
length | 736 | 722 |
length of high quality (start - end) | 635 (51 - 685) | --- |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no160_j08.b1 PHD_FILE: MSMg01no160_j08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:26:35 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no160_j08.g1 PHD_FILE: MSMg01no160_j08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:26:35 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CAAATCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
CGCGGAATTCTCAGCTCAAATCCTACCACGTTGTGACCTCCGGGATACCG
TTTAACTTCAATGTGCCTGTTTCCCCAGCCATAAATTTGTGGTGAAATGA
TATCCACCTTACAAGACTAAGCATGAAATAATGAATGGTGAGAGTTAACA
CATGAGCCAGGAACATAGTAAAAGTTAAGTAGGCGCAGGCTATTTCATCA
TCATCACTGTTGTTGTTGTCATTGCCGTCATCATCATCATCATCACTATT
CTCCCTTGTTTGTGCAGCTTCTCAAAGAGGAACCCGAGCCTTGATAAATT
CCAGCTCACCAGGGTCCATAACAACTCCATTATCATAGCCATAAAGCACT
GGGGGCACCTTGAACACTCCGCCTGATATAATGCTATACTCTGGGTGACA
GAGGCCAGCCCATAAATATATCAGACCAAGCCTCAAAGCCACAGCACTCA
GCCCCTTAAAAGTCAGCAGTCTGTTCTCCTCTCAGAATATATCCTCCTGG
CAGATGCAGAGTCCCATGGCCTAAATTTCCATACCCCACCAGTCCACACA
GATTTAATGCCAAGAGGAGCTGGGAGGGATGATGACAGAGATAAAGAGTA
CAAGAAGGAGTGAGGCCGTAGTGTTATTGTGGTACACGTGTCTGGGTTAA
ATGCATTGTACATACGATACCACTTATCACCATCCG
| ATTCACCACTCAGGTGTAAATCCCAACAACAATCGCCTGTCGCCAAACCC
AATTCGGCTAAAATAACTTACTTTCGCCAACCTCTAATCCTTCCCCTTTT
TTTTTTCCCTCTTCACTATCAATATTTCTACCTTTTTTCCCTTATCATGC
CCCATTCTCACCCCATTCAATGCTCTCACCAACTATTAATCTTTTTACTG
TTATATGGCTCCCGGGATGTTTTTTTACCATTATAATTATTATTTATCTT
AATTTTAGATATTTTTTCTTTATTATCTCCTTTTTCGTACCCTGAATTTT
TTTTTATCCGTTCAACGACACTATAATTATTCTTATCCTTTTTATTTNTT
CCNNNNNNNNNCCCAGCTAAGTACTATGGGGTAAGGCCCTGGCCGGNCCG
CCCCTGGGCCGTTCGGAACATTTTTAGGGTGAAACACTAATAGAAAAGGA
ATCCCGCCGGGAAAATTTCAAATTGCCCTGGTTTTCTCCCCTGGAATCCT
TCCTGGTAAGGGGCACCCCAAAAACAATTGGCCATTAACCCACCCTCCAG
GGGGTTAAAAAAAAAACCATTTACCCTTTTAAAAAATGGGAAACCAAAGG
AAATCCTTAAATTTTTTAAAGGCCCAAAGGGCTGGGGGGGTTGGGGGCCA
ATAAAAAAACACTTTTTTTTAAAAAATTCCCCCCCGGGGGCCAAAAAAAA
GGTTTAAAGGGTCCACAGAAAA
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 8 9 13 15 10 10 10 15 17 25 37 34 33 32 30 28 28 37 37 37 37 37 37 37 37 39 43 27 24 24 24 24 35 43 47 39 39 39 40 43 48 53 33 42 22 26 26
36 34 47 43 42 42 42 42 47 47 42 42 37 42 42 50 50 47 42 42 47 47 57 57 48 47 47 47 47 47 57 57 57 57 57 57 47 47 57 57 44 42 48 48 50 48 48 57 57 57
57 57 68 68 68 57 50 50 37 37 37 37 43 59 59 52 52 57 52 59 59 59 59 57 57 52 52 57 52 52 52 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 52 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62
62 62 62 62 62 62 52 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 57 57 57
59 59 59 57 57 57 52 57 52 57 57 52 52 52 52 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57
59 59 59 59 59 57 57 43 59 59 57 52 52 57 59 59 68 59 59 50 50 43 37 35 50 50 54 57 57 57 57 57 44 50 47 50 57 57 54 54 57 57 57 57 57 68 68 59 59 57
57 57 57 57 57 57 57 57 42 32 24 13 12 12 12 19 18 27 30 37 37 23 25 25 25 36 36 30 30 30 42 42 59 57 57 57 57 57 54 57 59 59 59 59 59 59 59 59 43 47
39 59 59 59 48 37 39 39 46 48 48 48 46 46 34 34 16 11 8 8 8 8 10 25 32 41 41 41 47 47 43 43 41 43 59 59 59 59 59 48 47 40 43 43 59 48 57 57 57 57
57 57 57 57 48 48 43 43 43 43 47 47 59 59 59 59 68 68 59 59 37 37 23 36 36 44 44 48 44 43 41 39 40 36 28 44 42 42 42 43 43 47 46 59 59 47 57 42 42 33
36 33 36 40 46 44 44 57 57 59 54 54 47 44 43 37 37 43 47 43 43 47 43 47 41 44 41 43 43 47 46 40 43 34 43 43 57 57 57 57 57 48 48 48 48 48 47 47 43 43
43 43 43 36 47 39 39 33 43 47 59 37 40 39 39 37 34 22 32 30 37 43 43 59 59 41 41 41 48 48 48 48 57 57 57 48 48 48 43 43 33 40 28 28 32 42 47 48 57 48
57 48 57 57 57 48 43 43 39 39 39 39 40 43 47 47 47 43 43 43 43 31 28 26 30 23 22 11 11 18 27 34 48 43 43 36 32 32 33 33 33 37 37 40 39 26 21 17 17 19
19 23 28 28 22 22 30 25 27 30 25 28 19 18 18 18 14 12 15 10 13 16 28 28 35 39 37 39 22 21 12 11 11 11 15 15 10 10 10 13 19 19 24 15 9 8 6 6 8 8
12 22 10 11 11 20 17 15 15 16 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 10 11 8 8 8 9 9 9 9 | Open.Hide. 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 10 15 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 10 10 8 8 8 8 12 8 8 8 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6
6 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 10 9 9 9 10 8 8 8 10 8 8 9 10 10 10 10 10 10 10 10 9 9 9 9 9 8 8 6 6 10 8 8 8 8 13 11 10 11
13 13 14 13 11 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 10 9 11 11 10 10 9 10 10 12 13 11 11 10 10 10 10 10 13 10 9 8 8 13
10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 19 13 13 8 8 6 6 10 6 6 6 8 10 10 8 8 8 6 6 10 8 10 8 8 10 11 10 10 10 9 9 8 10 10 8 8 8 8
10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 11 8 12 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 12 12 12 9 9 9 14 9 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8
8 8 8 8 8 11 10 10 9 10 10 10 10 11 12 12 12 12 10 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 12 13 13 15 14 13 13 12 10 9 9 9 9 9 8 8 8 8
8 8 8 9 15 10 8 8 10 11 8 8 8 8 8 6 6 8 6 8 8 8 9 9 9 11 10 10 10 10 11 11 10 8 8 6 6 8 10 13 19 15 10 10 8 10 3 0 3 6
6 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 6 6 6 9 9 9 7 8 6 6 6 6 6 6 7 7 9 17 18 6 6 6 6 9 9 9 8 8 6 8 7 7 8 3 0 3 10 9
8 12 8 8 9 9 8 10 9 8 10 9 8 10 8 7 6 6 6 9 9 11 11 8 10 10 11 14 11 11 7 7 7 9 8 10 11 9 10 10 10 15 22 12 17 13 10 9 11 9
10 10 12 10 10 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 12 18 18 20 14 14 16 11 11 10 10 10 9 9 9 9 9 8 7 6 6 6 6 6 9 8 8 9 9 9 9 14 11 10 11
11 11 14 14 18 14 19 10 10 13 10 9 9 10 11 11 8 12 9 9 9 13 12 11 9 9 8 8 8 7 9 9 14 13 12 12 12 16 12 12 11 11 9 9 9 9 9 11 8 8
13 9 8 8 9 10 10 15 19 14 13 28 16 16 11 10 9 9 9 9 9 12 10 8 8 9 9 8 8 12 15 27 25 17 10 8 8 8 8 10 10 9 8 10 10 8 9 12 10 11
9 10 9 9 9 11 11 16 15 11 12 9 9 16 11 12 12 8 8 8 10 8 13 12 10 11 14 15 12 7 8 6 6 6 7 12 16 11 12 9 8 8 10 9 11 12 14 13 9 8
8 8 8 9 9 10 14 7 6 6 6 6 10 8 11 19 11 11 10 8 10 11 16 11 15 11 11 10 10 14 26 33 28 18 20 18 21 17 11 8 8 11 11 13 15 16 18 19 16 10
8 8 10 10 10 13 13 13 15 16 12 12 8 8 7 6 6 6 11 13 17 16 |