BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-176F24.T7 (MSMg01no176_f24.b1) | MSMg01-176F24.TJ (MSMg01no176_f24.g1) |
ACC | AG371091 | AG371092 |
length | 1,216 | 1,236 |
length of high quality (start - end) | 118 (239 - 356) | 333 (123 - 455) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no176_f24.b1 PHD_FILE: MSMg01no176_f24.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:48:03 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no176_f24.g1 PHD_FILE: MSMg01no176_f24.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:48:03 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NGGTCAGTGGGCGCTATAGACTACTATAGGGAGAGGATCCGCGGAATTCC
TTATAATCTGATGGGACTAGGAATTGTTGACTGTGTGTGCGTGCATCACA
CTCTGAAAAATTGGCTTTGAAAAATAAAAGAAGGGAAGTTATACCCTCCA
AGGTCACCAAAAGCACACCTTGCTTTTATCTTGTTTTAGATTTTTTTGCC
AACTACTGTTAAAGGTCAGTTTGCAGCAGATCAACTCTGGCATCCAGTCA
CTTCTAGCTCATATACCATGATGGTGAGACCCCCTAACTAATACATGCAA
TGGTCCTGACCCTGTTTTACTATGGTCGCAAATGTGTTTTTTCACAAAAA
GAAAATGGTAGCCCCATGGTTGCCTGAAAGATTGGTTCATCAAGCGGACT
CTTATCCTGAGCCTTCTAGTGATTATGATACCAATGAAGAAGATGGTTCT
TTTTTTCTCCCCCCCCCCCAAGTTAACCGGACTATAAAAAAAAAAATGAA
GTGGAGAACGAGTACTTACTATCAATTCTCAAAGCCACCCCCCCCCATAT
ACCTGGTGGCCAGATTTTGTGCTTAATCTTTGTCGATTGGCAGCTGAATT
GGACACCTGGGACATCCCTACCGACAACTTTAATTTCTAATTATTATTCT
GATTCGCTGAACTTTTGGACTTTTTATCTTAAACAGATTGGCTGCCTTCA
TACAGGATCACTTTCAGTAAGCTCAGTCATTCACCATGCCGTTTGTTCAT
GGCTATGAACAAATGCATTGCGTGCATATTCACATGTCCCTTGCGACTTT
GGACTGAATGTCACAGAGTGCGCTATACAGGGCCGTAAGTCAGAAACCGG
TAAGAGTGTTCCTGCATTTCCTATTGGACTACCACCGAAACTAACTTTAC
AAAGTTATGCCTGAACTTCTCGATGGGCATGAAGGATCTATATATACCCC
TGACCTAAAGCAGGTCCCTGTAACCTAATCCACCCTATTTCCTAAATGTG
CTTAAGGAAAAAAAATAACTCTTGCTTCCCCCCTCCCCTCTTTTTTTTTA
CAAACCAATAATGGGTAATTTGGTCCTTTCCCCCCCCCTTTAAAAGTTTT
AACCCCCATTTTTTTTAAAGCTTTTTATATACTCAACTTTCTGTACAACC
ACATGGGAAATCTTCTTACCTATGCACCCCCCCTATATTCTCCAAACAAA
AAACTCTTCTCTTTTA
| CCCCAACCACGCGAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTAAATCCCCCCACTGAGTCCTCTGAGGGGN
TGGNACTACTTTTATCTCCTATGTCTGGNTTTAGTTTGCAACTTAAAGGG
AAATGCAATGGGCTCACAATTGCCAACAGCATAGGACTCAGCACCTGATA
TCAGTACTTACCACTGCCCGGCCTGGCAAATTTTTCTTAAATAATCACAG
AAGAGGGCGAAATTAGTACAATTAAAATCTGACTACTAAGCCAAGCCATT
AAGAGGGGTACAGTGTTACAGAGTAGAAAGGGCTCACTGGATGCATGTGA
CAGAAGACTCATAACTGTAATGTCTGAGGACCTCATGGCAATCAGCTTCT
TATCTGCAACAAATAAGGATTTAAATGGGCAGCAGATTTGAACAGGTAGT
TCAGATAAATGAATGGAAAATAAAGATATGACTATATGCCTGGTATCTAT
GACCATCAAGAGAATGTGCATTAAAATCACACGGAATACCATTCCAAACC
CACACTTAATTGCTAAATTGAAAGCCTTATATCTGGGTCACCCATACCTC
TCCACATTTCTGGTTGTACACATGGTATTGCCACCTTGGGGAAACTTTTG
ATCATTTTTATAAACTTAAACAAGGCCTACTCAATGAGCCACTAAGTCTA
CTCATGGGTATTTACCCAAGGAAAATGAACGTATATATCCTAAAAGGAAC
GGGGTGACCAATTTCATGGAAACTTTATTTAAAACAGCAATCAAACTTAA
ATAACTTAGATGCCAATCAACAAGATGGATCACCAACCCTGGAGTAGCCA
TACAGAAAGACCCTGCTTGCCATCTCCATCACAGCACATACATTCACGTT
GGATTTTATTTCATGCCCATCTGGCCGTCTTCAAATATCCCCATTCCTTG
TTTACCGGTTTCACCCAGGGCTCTGTCCCTTGCCCTGCCTTGGCCTCCGG
GAACCAAAAAGGTTTACTAAACCAACGGGAACTTGCCAAGCACAAAAAAA
AAACTATTTACCTATTTAATCTAATTACCATTCTTAAAACCTTGAACAGT
ATTTTTCTCCATAAGCCCCCCCCCCTCCCCGCCTCTCGTTATTTGTCTTT
GCCCCCCAACACTTTTCATCCATCTCTCTTCCTTCCTTCTCTCTTCCTTC
CTCTCCCCACTACTTCTTCCCTCACTCACCTTTACT
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 6 9 9 9 11 10 10 10 10 10 8 10 8 8 8 13 19 9 8 8 10 12 16 17 23 24 33 31 32 31 28 28 34 34 36 30 28 19 11 11 13 24 29 43 39 34
42 42 42 36 31 22 22 30 37 37 28 29 28 33 23 19 8 8 10 15 15 35 37 32 32 34 20 15 24 15 13 23 15 10 10 12 14 14 10 10 10 15 15 14 15 24 31 44 42 50
57 57 43 32 32 15 15 15 32 32 43 36 29 29 29 43 33 33 36 23 18 18 11 11 11 18 16 12 14 14 18 32 38 38 38 20 32 25 38 38 25 32 32 42 42 57 57 57 41 52
57 57 32 32 12 12 12 15 18 18 18 15 14 14 28 28 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 38 38 20 15 15 18 18 18 13 13 11 28 33 43 43 35 35 35 35 28 16 17 17
17 38 38 32 14 14 14 24 24 33 43 43 33 35 26 43 36 38 20 31 31 35 24 38 26 27 27 20 18 16 27 22 18 18 12 12 12 21 18 12 32 32 43 43 43 44 39 45 45 38
38 39 43 43 44 33 35 35 57 42 57 39 39 39 43 43 52 57 43 43 35 44 35 24 24 15 12 14 27 27 32 35 43 43 43 43 43 43 28 33 32 42 42 30 18 10 10 10 10 19
20 27 27 24 27 24 19 23 18 22 22 43 36 35 35 35 37 37 42 32 24 15 10 9 8 8 8 8 10 10 20 21 44 32 36 24 24 14 18 24 28 44 32 34 27 14 14 14 24 24
42 29 24 12 11 9 9 10 15 19 19 10 13 10 10 10 20 18 12 11 11 12 29 34 19 19 13 34 25 28 13 12 12 16 12 14 28 24 24 32 41 29 20 15 10 10 10 7 8 7
8 8 10 13 11 26 24 16 18 11 15 15 18 30 31 32 24 21 14 14 25 28 15 20 21 28 23 28 28 30 30 57 43 43 43 39 39 48 39 47 24 24 15 24 15 15 15 9 15 13
13 14 14 16 14 10 11 11 12 12 11 16 12 14 13 11 10 8 10 11 11 12 15 29 28 59 34 34 18 18 12 12 11 15 21 25 26 20 20 24 29 25 19 16 14 10 10 10 10 10
10 18 25 30 33 33 33 39 28 30 20 18 20 35 27 22 17 17 20 23 19 14 34 34 34 20 24 24 32 32 43 37 32 23 20 20 28 28 28 37 30 28 28 30 30 32 32 32 32 28
28 23 15 16 23 22 28 23 20 20 20 24 24 33 33 33 21 25 11 11 11 15 13 19 25 29 29 19 19 15 19 11 11 22 18 18 15 15 11 16 16 22 30 31 39 29 25 25 23 24
13 11 11 15 15 29 19 21 13 13 13 14 16 19 13 13 14 23 24 24 23 16 16 29 27 19 14 13 15 15 16 15 30 30 43 43 48 41 46 28 30 12 10 10 10 10 18 13 20 17
19 18 15 24 18 18 18 12 18 12 12 12 22 28 18 18 11 18 23 29 19 29 21 22 28 33 32 32 25 31 19 20 20 30 30 16 15 19 13 8 8 8 8 13 15 28 28 24 13 10
11 11 11 10 13 11 11 11 11 11 11 15 27 19 10 8 8 8 10 13 25 37 28 25 12 11 9 9 12 17 19 24 32 26 23 32 28 18 18 14 10 9 9 9 9 8 10 10 10 10
10 9 10 11 16 15 15 13 18 18 20 22 17 12 9 9 9 8 22 8 8 8 8 8 11 24 18 26 24 23 12 10 10 10 19 18 24 16 10 10 10 17 17 19 15 10 10 10 25 23
11 9 9 9 10 9 11 8 10 8 8 8 8 8 8 10 11 11 11 11 12 19 22 24 15 10 10 13 10 10 8 12 10 7 7 8 8 8 16 19 16 11 11 9 10 10 10 10 12 13
17 11 10 10 10 11 11 12 11 22 10 8 8 10 8 8 10 8 8 8 8 10 10 11 10 9 8 8 8 10 8 8 9 10 10 13 10 10 8 8 8 6 6 6 10 10 9 8 8 8
8 8 8 10 10 11 11 11 16 13 15 12 12 9 9 9 9 9 9 9 11 10 10 10 8 8 8 8 6 6 6 6 8 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 12 19 10 10
9 9 9 9 12 12 12 15 9 8 8 8 8 8 9 9 9 10 12 12 11 11 10 8 10 10 8 10 8 10 8 8 8 8 8 8 10 16 15 7 12 6 6 6 6 10 10 10 10 11
9 9 9 9 8 8 8 8 15 11 12 10 12 15 15 15 13 10 11 12 12 13 11 11 12 13 9 13 10 9 9 9 9 10 10 10 11 11 13 10 11 11 16 18 23 19 19 10 10 10
10 10 11 14 14 14 10 10 9 8 8 6 6 8 8 8 12 10 12 8 6 6 6 6 8 10 13 13 12 10 11 14 19 19 21 21 18 20 21 21 12 11 11 16 10 10 11 16 17 11
15 15 16 12 10 11 6 6 8 8 8 8 9 10 15 16 13 9 8 8 8 10 10 12 10 9 8 8 7 6 8 6 10 11 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8
8 8 6 6 8 8 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 16 15 15 8 8 8 8 8 8 8 12 11 11 12 10 10 10 10 10 10 10 9
9 9 9 9 14 15 8 8 8 8 6 6 8 11 6 6 | Open.Hide. 7 7 7 13 6 7 7 7 6 6 8 8 8 8 9 9 13 9 9 9 9 16 14 15 11 10 9 8 9 9 17 19 19 8 9 10 19 19 24 15 24 26 36 35 36 36 36 36 36 38
36 36 33 33 50 50 59 59 59 24 24 9 7 7 6 6 11 11 11 12 11 11 11 11 17 22 18 18 16 23 15 18 18 25 23 31 31 36 36 33 31 31 31 31 30 33 21 21 3 0
3 23 3 0 3 9 8 8 8 9 9 9 17 15 21 18 19 10 10 11 13 17 19 26 37 23 23 3 0 3 21 21 33 33 33 37 39 48 48 47 47 50 47 50 53 50 50 57 57 59
59 59 59 59 59 48 48 48 57 48 54 48 36 36 36 36 41 41 48 50 54 54 59 54 54 48 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 36 42 28 42 40 47 46 47 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 43 43 50 50 57 57 59 59 59 47 44 50 43 59 52 54 59 59 59 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 52 52 52 52 57 50
57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 52 52 43 44 43 43 24 32 32 35 43 43 52 52 52 50
50 57 52 52 57 44 50 50 46 44 50 50 43 44 44 57 57 57 48 48 44 57 36 36 18 18 13 26 26 41 33 44 35 42 42 57 44 57 48 48 48 57 46 57 47 47 43 57 57 57
48 48 47 57 48 44 36 29 30 41 41 41 47 59 48 48 48 48 47 43 37 30 30 37 40 48 43 43 48 43 43 48 48 48 47 47 59 37 35 35 37 39 39 40 40 23 23 15 10 8
8 8 8 8 8 11 16 23 28 34 59 59 59 50 53 50 50 50 50 48 50 57 47 47 39 37 29 28 28 20 24 24 32 30 39 39 59 57 57 57 54 54 54 46 44 36 28 25 25 28
30 30 17 17 17 27 26 28 23 20 27 18 15 12 12 12 12 24 24 42 42 57 46 47 47 44 57 46 54 46 46 43 43 43 44 43 44 43 43 37 32 32 32 36 43 43 43 43 57 57
57 57 52 52 52 50 43 37 37 57 52 50 52 52 52 52 57 57 52 52 52 57 52 54 54 57 57 54 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 52 52 57 57 52 52 52 57 57 52 52 52
52 52 52 57 57 59 59 43 43 39 43 43 52 59 57 57 57 54 54 57 59 32 32 11 11 11 24 25 44 27 27 33 41 34 57 57 47 47 42 42 47 47 57 57 57 57 57 57 57 57
59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 44 44 26 26 30 37 39 44 42 43 37 36 36 37 36 36 36 36 43 43 43 43 36 43 32 30 19 20 20 24 24 37 37 48 57 48 48 48 48
48 48 48 48 39 39 33 36 33 33 30 31 37 37 41 28 27 31 28 28 28 25 27 32 33 35 28 19 18 16 16 16 18 37 39 39 34 26 26 16 16 20 24 23 23 24 20 28 21 29
19 19 20 21 18 23 13 18 23 23 21 23 23 22 16 17 11 11 12 22 22 32 32 32 30 28 21 15 15 12 13 13 23 23 25 27 25 24 22 22 25 25 30 25 24 30 22 22 20 25
19 18 23 23 19 17 18 10 12 12 15 18 23 27 37 27 27 20 20 21 24 18 23 28 28 26 26 11 11 10 11 13 25 25 25 14 13 12 9 9 14 28 22 25 17 12 11 17 17 28
19 26 19 19 20 13 13 10 10 10 19 19 23 10 9 9 9 9 9 9 11 11 11 18 18 21 13 12 11 12 9 9 9 12 11 10 9 8 10 10 8 8 9 9 10 9 10 9 10 10
8 8 8 10 8 8 8 8 10 10 11 16 16 19 14 14 10 18 8 8 8 8 10 8 9 8 8 8 8 9 12 12 12 25 10 10 9 10 10 12 8 8 9 10 9 9 9 12 12 9
9 9 12 11 11 19 13 19 21 11 12 10 10 10 9 9 10 10 8 8 10 10 8 8 8 10 8 8 8 8 10 11 11 9 8 8 10 11 9 9 12 8 8 8 8 8 12 13 15 9
9 9 10 10 9 10 12 9 9 9 9 9 9 15 10 9 9 9 8 8 10 8 8 8 8 8 10 19 17 11 11 15 16 20 14 13 12 8 8 8 8 8 8 7 9 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 12 11 8 8 6 6 8 8 11 10 9 9 9 10 11 11 11 11 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 10 11 11 11 18 21 20 15 15 12
8 8 8 10 10 12 12 10 10 9 9 9 12 11 11 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 10 8 8 8 8 8 10 10 10 17 11 8 8 8 9 9 8 8 8 8
8 8 11 15 11 12 9 9 9 10 9 9 8 8 11 11 15 11 15 14 16 19 15 17 9 9 9 14 14 9 10 15 8 10 9 9 10 8 19 12 12 11 11 9 9 9 9 6 8 6
6 8 8 10 8 9 10 8 8 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 9 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 11 9 9 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8
10 15 16 10 10 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 8 8 10 10 10 12 8 8 7 8 8 8 10 15 9 9 9 9 9 |