BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-192D12.T7 (MSMg01no192_d12.b1) | MSMg01-192D12.TJ (MSMg01no192_d12.g1) |
ACC | AG381970 | AG381971 |
length | 1,263 | 1,250 |
length of high quality (start - end) | 410 (41 - 450) | 379 (72 - 450) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no192_d12.b1 PHD_FILE: MSMg01no192_d12.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:09:17 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no192_d12.g1 PHD_FILE: MSMg01no192_d12.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:09:17 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (39,906,993 - 39,907,373) | (39,735,379 - 39,735,755) |
---|
sequence | NNCCCTCATTGGCGCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTC
TGCAACATACAACTTCTTGTTAAAATTATTTCATTCTAAACCCAACCCTT
TATTTGGTTATAGTAATAATGTTATTTCAAGTAAATTAACCAAATACATT
GTGCAGACTTCATTTGGATTTAGATTAGCAAAAACATGCAAATAAAGTCT
GTGTTTTTGCAAACCCTTTGCACACAAATCCCACCAGGAGAAAGCGGATC
TCCCAGGACTGCTCTTCTTCCTAAGGTCAGAGGTGAGATCCCCACTTTGG
CTCCAAAAATTGTCCAAAGCAGTACAGGCCAGGAGCACATGGGACACAGT
AACAATGGAACAGCTGGGGACAGGATCATTCCTGTCTCCATTTGTACACT
AGAGCTAAGGCTGTACCATAGCCTTCTGCACCCAACCCCCTCCCAAGATT
TTTTTGTCCCCGCCCGGAGTGCTGACATACCTAATAACAAAAAGAGGGTT
ACAGGCCCACAGGAGGGACAAGCTCCAGTCAGAGACAGCAAGACTAACTA
ACACCAGACATAACTAGATGGGGAGAGGCAAGCTTAAGAACCTTACCAAC
AGAAACCAAGCCTACTTGTCATCATCAGAACCCAGTTCTCTCACCAAAGC
AAGTCCTGAATATCCCAACACACCATAAAAGCAAGATTCTGATTTAAAAT
CACATTTCATGATGATGATAAAGGACTTTAAGAAGGACATAAATAACTCC
CTTTAAGAAAAACAGAACATGTGTAAACAAGTAGAAGCCCTTAAAGAGGA
AACACAAAATCCCTTTAAAATTCCAGGAAAACACAACCAAATTAGTGAAG
GAATTGAACAAAATCATTCAGAATCTAAAAGTGGAAATAAAGAGTTCCCC
AAGGGAAACAACTCTGGAGATAAAAAACCCAAGAAAACCCAGCCAGGGGG
GTTTGCAGCCTTTAATCCCTCCACTTGTGAAACAAAAGAAAGGGGAATTT
CTGAATATTGAGCCACCCCTCGCTCCTTAAAGAGTATTTAGAAACACCGT
GCTTTCTATAAAAAAACTGTTCCTATAAACCCCCCCCCCCCCCCTCATAA
AAAAACTCCTAAAATAAAAATAGTTTCCTATTTATTCTCTTTTTCTCCCC
TTTCCCATTACTTTTGACTCTTTCACCAATATCGTCTTATTTATTTCCTT
TCTTCTCATATCTAATCTCCTAATTCATATCTCATTATTGATTTTCAATT
CTCTTTCTTCTTC
| NNCCCTTTGATGGAGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCTTTGAAAGTCACTTGTATAGAGCAATC
AGGCATGTTCATGGGAGGGTGGTGTTGCCATGCAAATTGCTTAACATTAA
GATGTAGACTTCATATTTTTTACAAGCTCTACATTATTATGATTATGATT
ATTATTATTCACCCCTCCAACTCTTCATATTTTTCTTACTCTTTTTGCCT
CAATATACCTTCCCATAAGAATCAAAGTAACTTAAAACTTAATTACATAA
AACTCTTGAACTTGAATATGAGTTGACTATGTCTGCTCAATCTGCCATAG
CTAAAACTGTACATTTTTTTTGAAATTATTTTTCTCGTAAAGAAAGCCAT
CTTCGTGCCTATGACTCTGTTTCTATGACAAGCTATTAAACTGCCTTATT
TTTTCTCCCCCCCCCGTTCCTGTTTAAGACTCACCTAAAAAAAGGGGGGA
GGGGAACTAGGAAAGAGGATAACATTTGAAACGTAAATAAAGAAAAATAT
CTAATTTAAAAATCAGCTTTTATGTATACTTGGGACTCATGTTTCCTCCT
TCATTTTATGGACCATTTGTTTGTATGACTATGATTATAATGTTGACTGG
GTATATGTTTACATTTTGGTGTTACTTTCAAGATTAATGTTGTTACATAT
AGTCCACGAGAAGAAAAAAATATGCCCGAGCACTGGCATGGTATTTTTCT
AAGGACCCAAACTGTACTCCATTTGAGGCAAATCTTCGAGAGGGTTATTT
ATGGCCCCCAGAACCGTATGGCTTTCTTCAAGCCCCATCTGTGGGACTTC
CTATCTACTGGAACCCCCAGAAAAGTCTTTTAATTGTTCCGGATGCGCCT
TAAATGCCTGGTTTTTACAGGATTCCTCCTCCCAGACCTTTGGGATAACA
ACACTTCCCCCAAACCCTACCTTTGTTCCTCTAAAATTATTTTCTTCTCG
TCCCCTTTCTTAATTACTGTGTCTCCCTTATCTATTACATCCCCGTATCT
CTATCTGTTTTACACTTCCCTCCCTTGAATACTCCCTCTCTTTTCCTTCT
TCTTCATTCTTTTCTTCATCCCATATCACATACCTTTCCTTTTCTTTTTC
TTATTTCTCCCTATTACTATCCATCGCACTCCCTTCATCATTCTTTTTTC
ATTCCTTTCGTTCTTATCTCTTCTTACTTATATNCCTTCTTTCCCCCTTG
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 7 9 9 8 8 8 13 12 12 15 10 8 8 8 12 17 21 24 15 15 8 8 8 19 21 37 34 42 34 37 37 42 42 42 50 48 50 50 50 68 68 48 54 54
50 50 50 54 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 50 50 50 47 54 54 50 50 50 51 51 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50
50 68 68 68 68 59 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 52 52 52 57 57 43 57 39 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 52 52 52 59 57 57 57 57 57 57 57 57
68 68 57 57 57 52 52 52 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 59 59 68 59 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59
59 59 59 59 59 57 57 54 54 54 54 57 57 57 59 59 57 42 42 42 48 48 48 48 50 50 48 57 57 57 57 59 59 48 48 59 59 59 59 59 48 59 59 36 32 24 17 14 12 12
12 15 15 32 41 59 59 48 48 48 59 57 48 48 57 57 57 57 59 48 48 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 59 48 48 47 59 32 25 15 11 11 11 10
11 17 16 19 9 9 9 9 8 8 8 8 9 9 11 11 12 18 27 36 59 59 42 39 30 24 17 18 26 26 33 32 32 24 14 9 9 9 9 11 10 10 8 8 8 10 8 8 8 15
19 34 37 47 46 48 48 48 48 48 48 47 47 47 47 47 47 47 47 47 48 57 57 48 57 48 48 48 57 57 54 54 54 48 48 54 54 54 59 54 54 54 54 54 54 57 59 59 59 59
59 68 59 59 57 54 54 57 57 68 68 68 57 57 59 40 40 40 44 44 47 37 42 31 37 39 47 47 48 48 54 54 54 54 44 44 41 37 44 44 44 54 54 57 57 57 54 54 47 48
46 46 43 48 43 57 48 48 48 59 57 48 59 57 59 59 59 47 46 46 46 46 48 47 59 47 31 31 31 39 31 37 39 37 39 32 26 39 39 41 37 37 30 30 30 34 34 28 32 32
36 36 42 43 43 43 47 48 37 37 37 37 37 37 39 32 25 25 32 37 37 39 39 41 37 37 34 31 36 36 47 47 47 47 59 36 31 31 41 41 41 43 46 47 59 48 50 50 41 37
28 28 28 37 37 41 39 30 30 32 39 37 48 46 46 40 39 39 39 39 37 37 39 39 39 33 33 33 26 26 17 25 18 19 23 14 19 19 33 32 40 43 43 43 37 32 37 35 39 39
39 39 37 19 14 8 8 8 11 12 17 19 28 19 19 17 21 16 19 19 28 28 37 32 28 31 25 25 18 20 21 23 10 11 12 15 19 19 28 32 24 13 16 16 13 17 15 14 9 11
11 11 15 18 22 22 22 37 37 41 41 47 47 47 30 22 19 19 19 13 10 10 10 16 18 37 39 36 31 30 22 22 22 24 28 26 23 11 9 9 10 8 8 10 8 11 14 20 19 19
19 20 24 30 41 39 34 34 23 17 9 9 9 13 8 8 8 8 8 8 12 8 8 8 8 8 15 21 27 19 15 15 15 20 18 24 20 15 15 12 10 12 9 6 6 10 7 7 8 8
8 8 8 8 8 9 10 12 12 9 8 8 8 8 8 8 8 12 11 9 10 9 11 14 22 28 34 13 12 11 11 10 13 13 15 14 12 8 8 8 8 8 8 10 11 8 12 10 11 11
12 10 8 8 7 8 8 8 8 8 9 9 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 14 14 12 8 8 8 9 9 11 17 8 8 8 6 8 8 11 13 11 10 10 13 12 13 18 15
15 11 11 8 10 6 6 6 8 8 9 10 10 14 23 19 22 12 11 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 9 9 9 9 9 9 10 11 9 9 9 6 6 6 6 10 8 8 8
8 8 8 10 8 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 9 9 9 9 10 13 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 15 15 20 14 24 25 18 18 22 14 12 8 8 8 8 8 8 8 8
10 18 15 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 15 15 12 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 7 7 12 10 10 8 8 8 11 12 10 9 9 9 9 9 11 12
12 10 10 10 6 8 6 6 10 8 7 6 8 8 9 9 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 10 8 6 6 7 6 9 9 12 8 10 10 10 10 8 8 6 7 10
10 8 8 8 8 8 6 7 8 8 9 9 9 9 9 8 10 10 12 14 10 12 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 10 6 6 6 6 10 10 9 8 8 6 6 6
7 8 7 7 11 7 10 8 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 10 8 6 6 6 7 6 10 9 9 9 9 9 9 9 13 15 19 9 11 11 8 8 12 11 18 19 17 19 12 20 20 37 32 33 23 30 18 19 15 16 16 17 26
21 47 42 37 36 42 42 48 48 59 59 54 43 43 36 43 43 34 32 42 39 48 48 48 48 46 46 43 42 43 43 44 42 30 30 36 26 17 30 30 42 37 37 37 42 42 43 43 42 42
37 42 44 37 28 32 32 37 39 35 35 24 32 24 24 32 44 43 28 24 24 22 22 22 43 43 52 50 43 35 35 37 43 44 43 50 43 43 37 37 36 37 25 43 24 32 32 38 38 17
17 17 36 24 38 14 15 15 38 38 57 52 45 45 57 57 57 57 57 57 57 57 45 57 57 39 39 39 39 39 39 35 39 35 42 42 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 43 52 52 52
52 52 52 52 52 43 43 43 43 35 43 43 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 54 52 52 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 43 43
35 44 43 52 52 44 62 52 62 62 62 62 62 62 52 43 43 26 26 27 43 43 52 62 52 52 52 43 43 31 31 43 44 43 59 52 43 43 43 57 39 39 39 43 43 26 26 26 44 44
43 42 43 43 52 52 43 43 42 43 52 52 52 52 57 52 43 43 41 38 23 43 43 43 43 52 52 52 50 50 43 43 35 43 43 43 43 52 52 52 52 52 52 52 52 57 42 42 35 43
43 50 59 57 47 42 43 43 32 43 43 48 48 54 59 59 68 59 59 48 48 44 44 59 59 47 47 47 59 59 59 44 44 43 40 40 42 42 42 42 32 43 39 37 27 18 15 15 11 11
11 15 26 25 37 37 39 47 47 48 46 43 43 43 43 43 43 43 43 43 43 43 43 43 43 43 43 43 47 43 48 48 48 48 57 43 43 40 59 47 35 37 37 36 23 23 12 12 12 21
27 19 13 8 8 8 8 9 9 31 31 14 10 8 8 8 8 10 19 29 32 35 59 41 28 21 12 11 11 11 11 12 12 12 9 11 12 16 15 11 9 9 9 9 11 16 18 25 15 15
15 23 23 37 37 37 37 39 39 39 48 41 43 32 35 35 40 40 48 48 48 57 43 43 43 57 57 48 48 48 43 43 43 43 43 43 43 39 47 39 43 43 43 44 46 39 39 35 37 39
41 39 44 47 48 57 57 54 54 47 57 44 42 42 35 31 31 42 44 46 54 42 44 36 36 27 32 36 43 42 34 41 39 37 36 37 37 43 43 43 41 41 41 43 43 43 37 37 46 32
46 39 43 43 46 46 54 48 48 48 48 48 48 42 42 48 47 47 42 48 37 40 30 37 33 37 37 39 43 39 43 32 34 23 22 19 29 22 30 16 16 10 10 10 18 24 37 34 26 24
26 29 17 22 20 18 11 11 11 21 22 23 23 23 34 28 28 22 22 24 24 28 15 16 19 20 22 23 18 19 19 12 12 15 24 24 24 28 20 25 28 34 37 34 32 20 19 17 21 21
13 10 9 9 9 10 13 19 11 11 11 11 11 11 12 15 19 20 10 10 10 10 10 9 10 10 10 10 11 16 12 15 13 20 12 17 16 16 10 10 11 14 14 15 22 30 26 16 10 9
9 9 9 13 17 13 13 10 10 10 16 16 10 16 8 8 6 7 7 11 11 9 9 9 9 8 8 10 8 9 14 13 13 8 8 8 8 10 12 10 10 8 8 10 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 12 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 9 8 10 10 11 11 10 9 8 8 8 8 8 8 9 10 9 9 9 10 9 9 14 16
12 10 8 10 8 10 6 6 8 8 10 11 11 11 13 11 12 17 11 11 11 9 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 12 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 12 9 9 9 9 9
10 10 19 16 16 12 12 12 12 11 11 11 11 11 9 6 8 6 6 8 8 6 6 6 6 8 10 10 10 10 8 10 10 10 8 8 11 11 10 10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8
8 10 10 10 10 10 9 12 15 11 12 12 11 9 9 9 9 10 10 10 10 10 12 11 11 11 10 8 8 7 7 8 10 8 8 12 8 8 6 6 8 8 10 10 10 10 10 10 11 11
11 11 13 10 10 18 18 16 11 8 8 8 8 13 13 11 11 10 8 8 10 8 8 8 8 8 6 7 8 8 8 6 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 9 9 9 9 10 10 10
10 10 8 8 8 8 8 8 9 9 8 6 8 8 8 8 13 8 8 6 6 8 8 6 7 8 8 8 9 8 8 8 8 10 8 9 8 8 6 7 11 13 10 10 10 10 8 7 6 10
8 8 8 8 7 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 11 11 11 11 11 11 8 10 6 6 8 10 9 8 6 6
6 8 8 10 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 11 11 13 11 11 11 10 8 8 6 6 6 8 8 8 8 9 12 15 11 10 15 13 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 10
8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 9 8 8 6 6 6 6 8 6 6 8 8 9 10 3 0 3 8 13 13 15 10 10 8 8 8 8 9 9 11 9 9
|