BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-217A19.T7 (MSMg01no217_a19.b1) | MSMg01-217A19.TJ (MSMg01no217_a19.g1) |
ACC | AG396710 | AG396711 |
length | 1,263 | 1,278 |
length of high quality (start - end) | 423 (29 - 451) | 382 (69 - 450) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no217_a19.b1 PHD_FILE: MSMg01no217_a19.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:44:20 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no217_a19.g1 PHD_FILE: MSMg01no217_a19.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:44:21 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NNATACACTGGGCGCTAAGACTCACTAAGGGAGAGGATCCGCGGAATTTT
CTCTACAACCGTGTTTCTTAAAAAATGCAGAGACCCTTTAAAATAATCCC
TCCTGTCCTGGTGACCTTCAATCATACCACTATTTTCCATGCTACTTTGT
AACTGCAATTTTGCTACTGTTACGAGTCCTAATGTAAATATCTGATAGGC
AAGATATCTGGTATTCGGCCCCTGAAAGGATCATTCAACCCCAAAGGCAT
CGTGACCCCCAGGTTGAGAACCACAGTTTCTATAACATGCAGCCTCCTGT
TATGCTTTCATACCCACCAGAAGCCAAAAACACTAAAGTCACACTGCCAT
AGTTAGGAGCCTCCAGAACAGGTAAACCCCAAAAAGCCTTTCTAAAAATT
TGATTATTTCAGGTGTTTCCTTACAGTGGATAAATCTCTTTAGCATAAGG
ATTATTTTCCCCCCCCCCCCCTAGTTCCAATGAAAATGTAAAGAGACTGA
ATTTTAAATTAACATCTCCTGTTTTGACCTTCGTTTCAGTTTCTCACTTA
GAATTTTGGGTTTTGAATGTTACCAGCAAAATTACTAATTTTTGAAATTC
CAGAAATTGGCACAGGGTTGTAATCTAACAATAACAGCATTATCACAAGC
GAATGCTTGGCAAGATGAAGAGAAGATATTTCTGTGTTTCAGATGTATTT
TACTGGAGACATTAGGATAACCAACATGTTTAAAAATCTCTAGAAACATA
TTTTTTTGTATATGGCTATATTCCCAAACTCAGTACACATGTCTTTTTCA
TTATTATTTTAATTTTTAGAAACAACATTTTATGTTCTTATCTTCTAATT
ATTTTAAATACTTATTTGATCCTCAAGTTTAAAATATTATACAAGAAATT
TCCAACTTCTGCCTTAATTTTATAATATTTTAAAATATAACTTTCCTAAA
AATTTTAATTTTTTAATTTCCTTCCAAAATTTGCCCCTTAAAATGGTCTT
TTACTTTATTTTAAAGAAACAAACCTATCGGTGTGTGGCAACTAAACCCT
CCCATTTGAATTTTCCTATTACCTTATCTTCCTTCACTCCTTTTTAAATA
ACACTCTCTTTTTTTCCTATTTTTTCCCCCCTTATTTTTAAATATATATT
CCTCCCATATTTTTTTATTTTGCCCACTTTTTTTTTTTGGTCCATATTTT
TATGTTTCTCCTCCATAATTTACAAAAAATTCTATTACTTCTTTTATATA
TTCCTACTCCCCT
| NNAAAACACGGTAGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXAAGAAGTTAGACTCCAGAGAATCAAATAACCC
TATTAAAAGTGAGGTACAGAGCTAACCCAAGAATTCTTAACTGAGGAATA
TCGAATGGCCAAGAAGCACCTAAGGAAATATTCAACATCCTTAGTCATCA
GGGAAATTCAAATCAAAATAACCCTGAGATTCCACCTCACACAAGTCAGA
ATGGCTAAGATCAAAAACTCAGGTGACAGCAGATGCTGGCAAGGATGTAG
AGAAAGAGGAGCACTTCTCCATTGCTGGTGGGATTGCAAGCTGGTATAAC
TACTCTAGAAACCAGTCTGATGGTTCCTCAGAAAATTGGACATAATACTA
CTTGATGACCTAGCTATACTATCTTCCTGGGCATATACCCAGAAGATACT
CTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCTGNTCNANTATGTTCATAAAAAAAAGA
GGGGGAATAGCCAGAAGATGGAAACAGCCCAGATGCCCCTCAACAGAGGA
ATGGATACAGAAAATGTGTTACATTTACACAATAGAATACTATCTGGCTA
TTTAAAACAGTGACTTCATGAAATTCACAGGCAAATGGGTGGATTTAGAA
AATATCATCCTGAGTGAAGTGACTCAGTCACAAAAGACTACATATGGTAT
ATACTCACTAATAAGCAGATATTAGGCAAAGAATGTGGAATAACCAAGAT
ACAACTCATGGACTACATGAAGCTCAAGAGGAAGGAAGACCAAAGAATGG
ATGCTTCAGTCCTACTTAGAAGGGGGAACAAAATAATCAAGGGAAGTAGA
GGGTAGGAGGGAGTTGTTAGTAAGATAAGAGTTGTTTTTCTTCTCTTTTT
TGTTTTTTTTTTCTTTATCCATCTTCTTCTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTT
TTATCCTCAATTCTTTATCTCTTATTTTTACTTTTTTTAAATCTTTCCCT
CTTTTTTATTACTTTATTTCTCTATCTCATCTCCCTTATTTTTATCATTT
TTTTTTTATTCTCAATCTTTTTCTTCTTTCATCATCTTTTATTTTCTCTC
ATACCATCTCTTCATTTTTTCTCTCTTTTTTCTTTTTCTCTGTTCTAATT
TGCTTTTTCTTCTTTCTCTTTCCTCTTTTTTTTCCTTATTTCTTTTCCCC
TTCTTTTTCTTTCTTTACCTTTCTCTCTATCATTTACTTTCTCTTATTAT
CTTTTGTTCTTCTTATCTCTTTCTCTAC
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 7 6 9 9 9 10 10 13 16 13 8 8 8 8 8 10 15 19 24 13 10 8 8 8 15 21 39 39 39 37 39 33 33 33 33 37 30 44 44 37 32 32 37 41 37 59
59 33 33 31 31 35 35 35 35 35 35 35 23 22 13 22 22 21 15 8 8 8 26 26 59 59 47 47 48 48 48 48 44 53 47 50 43 43 43 42 42 47 57 57 48 48 50 50 50 50
42 41 30 27 12 11 10 11 11 11 11 16 18 21 29 33 33 33 33 39 37 34 25 18 13 11 11 11 11 19 25 30 33 33 39 50 44 47 47 50 38 42 42 42 43 43 57 50 50 50
53 53 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 42 42 42 38 36 36 30 31 30 30 33 28 33 21 19 11 9 9 9 11 11 11 20 23 34 41 41 41 48 48 48 48 43 43 57 48 50 53
50 57 57 59 59 57 57 57 59 57 57 59 57 57 54 54 48 48 48 48 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 59 59 59 59 54 54 48 59 59 57 57 57
48 54 54 54 57 57 57 68 59 59 59 59 57 48 50 57 43 59 59 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 59 59 57 57 54 57
57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 52 52 52 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 54 54 54 59 59
59 52 52 52 57 54 57 54 54 54 57 59 57 57 50 48 48 57 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 44 43 43 44 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 44 41 30 41 24 34
13 14 14 21 34 32 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 54 48 48 48 57 48 48 48 48 48 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 41 25 15 11 11
11 15 11 11 11 13 15 17 17 17 19 29 32 32 27 22 20 14 17 11 11 16 16 25 36 34 34 25 34 34 34 41 35 28 21 20 20 11 12 11 23 11 12 11 16 12 18 16 30 25
31 37 59 37 44 57 57 57 57 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 54 54 57 59 59 68 68 68 59 59 59 68 68 68 68 59 44 42
30 30 44 44 59 59 59 47 47 47 47 59 59 59 57 57 57 57 54 54 54 57 46 46 40 48 48 57 57 54 59 59 59 59 68 68 68 68 57 57 57 57 48 57 59 48 48 57 59 59
59 59 59 48 57 57 48 43 48 43 43 35 37 37 37 35 35 31 34 43 37 41 47 47 47 59 48 48 48 48 59 59 48 43 43 43 43 43 28 34 28 28 28 37 32 32 32 32 39 41
43 43 57 57 57 57 47 44 41 30 30 23 32 29 39 41 32 30 23 23 31 37 43 39 39 39 48 48 50 57 57 59 57 48 48 48 57 59 59 47 40 40 40 43 43 48 48 42 47 47
41 41 34 30 15 17 11 11 11 25 25 34 34 23 23 23 23 27 28 28 28 34 34 43 43 40 33 37 25 23 23 21 27 27 30 37 37 41 41 34 34 28 30 22 27 32 29 29 23 23
30 37 37 33 36 36 38 57 57 57 57 57 39 39 30 30 22 28 19 28 28 34 28 39 32 20 20 16 16 15 26 12 12 12 27 24 34 36 28 28 20 19 16 29 23 36 28 32 28 34
34 28 21 19 25 21 28 22 22 28 28 23 25 28 28 21 21 24 24 30 34 34 43 33 28 28 28 26 27 28 41 30 27 15 10 10 12 12 15 21 23 24 26 36 35 41 25 24 24 24
18 13 10 10 10 16 21 32 37 39 33 33 27 19 17 17 19 19 19 10 10 10 17 13 22 20 32 23 18 13 12 8 8 8 8 17 8 9 7 7 7 10 10 19 19 15 10 10 11 18
25 32 29 29 17 14 9 9 9 14 12 15 11 15 9 8 8 12 12 16 15 15 10 8 8 8 8 9 8 8 8 10 10 14 14 27 22 21 14 10 10 9 9 12 12 10 10 11 16 22
22 16 16 15 11 14 26 31 39 28 25 12 10 8 8 8 8 11 12 13 17 15 15 14 12 11 9 11 8 8 8 8 9 10 11 17 13 12 10 10 13 9 15 14 11 9 9 13 10 8
8 8 8 8 8 8 10 12 11 22 25 22 16 12 13 13 8 8 7 8 11 6 8 8 6 6 6 6 8 6 8 8 8 6 8 6 6 8 8 11 8 8 8 8 8 10 12 19 15 15
12 9 9 9 10 11 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 10 8 10 10 8 8 8 15 10 10 13 10 9 9 9 11
10 10 8 8 8 6 8 15 13 10 8 11 9 9 9 12 12 11 12 12 12 24 13 13 13 13 13 13 8 8 8 8 10 10 16 19 12 13 12 12 10 9 6 8 8 10 11 11 10 10
6 8 12 10 10 6 8 8 8 8 8 13 15 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 10 10 8 8 8 8 11 10 10 13 18 13 10 10 8 6 6 10 8 8 8 8 8 8 17 17 20
11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 8 8 9 9 9 9 9 10 11 12 12 12 15 11 11 12 10 17 9 8 8 8 11 9 8 8 8 8 10 10 10 10 10 12 16 16 12 8
8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 9 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 10 8 6 6 6 6 9 9 13 10 7 9 8 11 15 22 21 19 10 10 10 21 21 31 28 28 28 38 42 42 50 50 43 37 47 40 40
40 37 48 48 48 57 59 59 59 57 57 43 34 24 22 16 19 12 16 16 23 31 40 36 41 41 41 50 43 57 50 48 48 47 47 47 36 36 25 25 20 20 20 28 32 39 40 37 42 42
48 50 48 48 40 40 28 29 28 33 33 39 36 33 36 33 33 37 48 33 29 20 16 15 15 16 12 12 12 22 25 39 40 37 37 41 41 37 37 36 35 37 39 43 43 48 47 47 47 47
47 47 42 42 32 28 28 34 34 43 43 40 40 43 46 47 54 57 50 48 48 48 48 54 54 54 54 54 57 57 46 43 39 37 37 37 43 44 57 57 47 44 39 39 39 48 48 48 57 59
57 54 54 54 57 57 57 59 54 57 57 57 57 57 57 59 48 48 48 57 57 50 50 52 43 43 33 33 33 43 43 52 57 52 52 52 52 52 57 59 59 59 57 57 57 43 43 35 35 35
38 38 33 43 43 43 44 31 31 31 44 44 59 57 57 57 43 43 43 57 44 57 52 52 52 57 52 52 57 57 43 37 37 52 52 52 43 43 43 43 52 57 59 59 57 52 43 43 43 43
52 59 59 59 59 57 59 59 59 57 57 54 54 57 57 57 50 50 50 57 57 37 50 43 44 42 47 43 43 43 39 39 39 46 46 48 57 57 57 57 54 42 44 37 37 37 57 44 57 54
48 57 48 48 47 47 47 54 54 54 54 57 48 48 43 39 32 37 37 36 39 39 42 43 43 47 47 47 42 35 35 35 40 40 57 43 43 40 43 43 57 57 57 59 47 47 24 25 18 16
13 13 11 13 11 11 12 18 28 30 39 46 46 48 48 48 48 57 48 48 48 59 59 57 57 47 43 43 39 43 40 48 48 57 59 59 59 59 59 48 48 37 37 28 28 28 34 28 26 12
12 12 15 17 17 18 15 15 14 14 16 19 28 35 36 23 22 20 18 17 18 20 12 16 3 0 3 3 0 3 0 3 25 25 41 41 34 34 18 11 10 10 10 12 18 18 20 11 11 11
12 12 15 11 12 12 21 30 41 59 59 48 57 48 43 39 43 36 43 43 43 43 43 39 39 35 35 37 40 41 41 36 36 43 43 59 43 43 39 30 34 30 37 35 39 39 48 57 46 43
43 43 43 46 57 44 44 42 35 35 42 40 44 42 42 37 42 42 48 48 57 57 57 57 59 57 57 48 57 48 48 46 50 43 50 37 42 42 47 50 57 57 59 54 44 43 43 43 52 59
59 59 59 59 59 59 59 38 36 14 14 14 36 38 44 44 52 52 52 50 43 52 52 52 57 57 57 57 52 52 52 57 43 43 43 43 23 23 8 8 8 23 25 57 57 57 48 48 44 57
44 48 48 57 46 40 40 44 46 48 47 57 37 37 37 37 42 46 43 42 42 39 39 37 40 37 30 30 30 32 32 39 44 48 48 48 41 41 36 37 36 42 42 48 48 48 48 46 54 42
43 48 48 43 40 39 32 24 26 11 13 11 25 20 23 23 23 24 21 26 26 26 29 24 28 23 23 20 20 34 17 12 12 15 16 20 28 24 30 21 15 10 10 9 12 12 25 25 30 30
33 43 35 35 32 30 30 18 18 15 14 19 21 22 25 13 13 13 25 17 26 30 32 30 30 20 18 17 26 30 32 20 19 19 19 25 22 30 28 31 28 28 28 34 28 22 22 15 16 16
18 19 17 17 15 26 16 20 20 28 19 21 20 22 25 21 23 20 19 14 19 22 31 27 26 19 18 18 18 18 14 15 15 19 16 18 19 29 30 32 15 10 9 9 9 10 10 11 12 12
24 22 30 33 24 22 19 24 27 20 25 23 28 22 20 13 10 13 8 8 8 9 9 9 10 11 15 11 11 10 10 10 8 8 6 8 8 8 8 8 9 10 10 10 10 10 13 15 13 17
9 9 9 12 12 12 15 21 19 9 8 8 6 6 8 8 13 11 8 8 8 10 12 10 14 10 10 6 6 8 8 8 6 8 8 8 9 10 10 8 8 8 8 11 13 15 8 8 8 8
10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 10 8 9 9 12 9 9 11 8 8 8 8 8 8 17 19 20 16 16 11 11 11 11 13 17 10 10 8 8 8 8 8
6 6 11 10 10 10 10 10 10 8 8 8 10 10 10 16 10 10 10 8 8 8 8 10 8 8 8 6 6 8 10 8 8 8 8 6 8 7 7 10 8 10 9 8 10 8 8 8 8 8
10 10 12 12 12 10 13 15 10 9 9 13 13 9 9 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 9 9 13 10 11 8 8 8 8 8 7 7 10 10 8 6 6 8 8 9 9 9 12 9 8
8 6 6 8 6 7 8 8 10 8 8 8 8 10 8 8 9 9 11 12 15 12 8 8 8 8 8 8 10 10 13 15 13 13 10 10 10 10 10 12 9 9 7 8 8 8 6 8 8 13
9 7 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 8 10 10 10 8 8 9 9 10 12 9 10 10 10 10 12 11 12 11 15 8 10 10 11 10 10 9 10
10 10 10 10 9 9 9 8 8 8 6 6 9 11 12 9 9 9 9 9 11 11 11 10 13 13 15 11 11 8 8 6 6 10 8 9 10 9 12 10 10 10 13 8 8 8 6 12 7 9
9 10 8 11 8 8 8 8 7 6 8 6 8 8 6 6 8 7 7 10 8 8 8 8 8 8 8 6 |