BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-313O08.T7 (MSMg01no313_o08.b1) | MSMg01-313O08.TJ (MSMg01no313_o08.g1) |
ACC | AG435692 | AG435693 |
length | 1,295 | 1,293 |
length of high quality (start - end) | 634 (128 - 761) | 378 (85 - 462) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_o08.b1 PHD_FILE: MSMg01no313_o08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:56:07 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_o08.g1 PHD_FILE: MSMg01no313_o08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:56:08 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NGGTTTTTNNNNNNGATCAGTGGGCGCTATAGACTCCTATANGGAGAGGA
TCCGCGGAATTCTACCTGAATTCAATCCCCATAACAACTTCCAAGAGTTG
TTCTCTGACTTTCACAGGTCTATCATGTAATGTATGCCCCTACAGTGTCA
CACATAAACACACACCATACACACACACAATAATAATAATAATAATAATA
ATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAACTCATGGTAAGGAATTGCC
AGACGAGGTTTAGCTCAGGGGACATAAACAAGATCATGTGTTCCATCCCC
AGCATCAAACACAGAACAATATTATCATTTTATGACTACTTTAAGTAAAA
TGCAATGACAGTGGTTATGTATGTTCTAATATTTTAGAGATACATAACTA
AACACTTTAAAAAGAGTCTTCACCTTAAAAAGTGTCTTAGTCCCTAAAAA
TTATCTATAGCTTGCTTTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCT
TTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTGT
TCTCTATTAAAATTTGATGTCCTTTAGCTGCATCTTCATTTCCTCTAAAG
GATTCTTTCTTTTTTTAATATTTTTATTAGGTATTTTCCTCAATTACATT
TCCAAAGCTATCCCAAAAGTCCCCCATACCCTCTCTCCCACTCCCCTACC
CACCCACTCCCACTTTTTGGCCCTGGCATTCCCCTGTACTAAGGCATATA
AAGTTTGCATGTCCAATGGGCCTCTCTAGTGCAAAAAAAAAATGGAATCA
TATTTAGTAAAATCTTTATAGTTGACCCAAAATTTAATGACTAAATTTAG
ACAAGTATAGTATCATTTCAATGCCTTCTAGTCTCTGGTCTGAAAAGATC
AGTTTAATTTTTTTAAAGATTTATTTAATTTATTTTACGAAAAGAACAAC
CTATAGTTGTCTTCACACCCCCCCAAAGAAAAAAATCAAATCCCCTTACA
AATTGTTTTTATCCCCCCTGTGGTTGTCTGGAAATATAACCTCCAATTTT
TGTAAAAAAAAATTATTCTTTTAAACAATTAAACCATTTCTCCACCCCAA
ATTTTTTTCTTAATCTCCTCTTAATTTCATCCACAATCCCTGCAAAATTC
TTTTCTTTTTCTTGTCTATACCATTGCTTTTTTCTTTCTATCAACTAAAA
AATTTTTAACATTCATATCCTATCGTCTTATCTCTTTCTATAATTCTCTT
TATTACATCTCTCATTTATTCTCTTTAATCATCTCTCCTATATTC
| TTAACAGTTTNNNNNNNGATGACGGCAGGCTGGXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTCTGACAAATGGAGA
TTCCCTACAGAAACTTAAAAGAACAGCCAAGTTACCTCCGCATGCAAGAA
TTTACTAAGGCCTAGGAAATAGGGGGGTTGTGATATTGTATTATTCATGA
GAAGGTCAGCTAGAGCAGAGCCCCCTGGTGCTAGCTTTCACAAGGCTCAA
AGGAGTAGCACAAATTGTGACTAGGGTGTAAAATCCTTACCTGTCATCAG
CTGACCCTAGGCAGGGCTGTTTTATCTTTACTGTAAATATTACCTGGTTC
CTGTAAGTCCTTTTGAAGTTATTCCTCTGTTTTGGGTCAGATAACTTCAA
TGTACTTTGCTTGCTGTGACATCCTACTCCTTTGTTTTCTGTATCATATA
AGACTGGTGTTCTTTTTTTTACACCCCCCCTCAGATTCAACACATTCTCT
CAATATAAAGCGGGCATTCGCCAACTCCTTCACTCACTTGCCACCAGAGA
CCCGTTCCACACAAATAGGAGACCCAAAAGGGAGGATAGACTGCGGCAAG
TGGGAATTTCTTTTTTGCCTCTACTTTTTTAGTGGTCTTTGTGATGAATC
TTTGAGTTCTTTGAAGGCCCAGGGACAGTGTCAGCTAACAGCTGTGCACC
AGTTTCCTGGGGAGCCTCACAGATGCATGGGAGCACTCAGACTTCCTGTT
CCCAACACTGCCTCCTGGAAGCCAGACCTGGGCCAGACCTGCTCTCACTG
ACCTCACGCCCTGACCACGACTTGGTTGTACACCTACCCTCACCCATTGT
TGGTATTGTGCTATTCCATTTTGCGCATTTTATGTTCTTCCAGAGGATTT
ATTCAGACATCAAGAAGGCATTCTGTCCTCTGAGTCTCCCTAGGTCAGTG
GGTTTTATTCTGATCCCCATACATAAATCTTCCTGAAGAATTGAACCCTT
TAGGAACCCAGTAATTTGAACCCCTGTAAACGGCCCTTTATGGGGCCCAT
GGAAAGTTTTCCTCTCTTCAAAATTACCTCCCTGAGGGGCGAATGGGCAA
CACTTGCGCATTGTTGGGGGCTTTGATATTTTCTCAAATTTTTCATTCTC
TCTCCCTGTTTTTCCATAGATATTTTAAATGTAGGGTCTCTCACCCTGGG
GAACCGTCTCTCTTTAATATTTGGTGGGGTTCTATAAAATCTCACTCCAT
CCCCGGGGTGCCTTAATCTGATGCTCTTCCTTCTTCTTTTTTC
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 6 6 6 3 0 0 0 0 0 0 3 6 7 6 3 3 3 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 10 15 9 8 8 10 13 11 3 0 3 17 9 11 13 14 19 28
34 37 37 37 33 32 30 32 26 29 30 30 30 31 31 28 31 31 36 36 35 53 38 38 38 42 35 25 26 14 11 8 8 8 8 21 22 36 54 40 40 48 42 47 47 53 42 40 47 47
47 42 50 50 50 50 50 50 50 36 36 33 50 50 37 27 13 10 8 8 6 8 8 8 13 15 16 18 24 28 33 37 26 21 12 10 10 10 10 22 23 30 28 30 33 33 33 36 36 50
57 53 38 38 42 42 42 53 57 59 59 59 57 53 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 48 44 37 31 30 32 32 42 44 57 68 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57
57 57 57 57 57 50 50 43 52 43 44 43 52 52 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 68 68 68 62 62 62 62 62
62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 39 39 39 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 68 68 62 44 44 31 27 23 26 17 17 19 38 43 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 44 44 35 43 44 62 62 62 62 62 62 62
68 68 68 68 68 62 59 59 54 54 59 43 43 35 35 35 59 59 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57
57 52 52 52 52 52 52 52 52 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 68 68 68 59 59 57 57 57 32 41 20 41
28 44 44 48 48 48 44 44 44 59 57 43 44 44 57 57 48 48 48 48 48 57 57 41 41 27 27 41 44 44 54 57 57 44 44 36 28 28 36 44 47 48 46 47 47 59 59 59 48 43
43 43 43 43 48 57 57 57 48 48 59 59 59 59 48 48 48 48 47 44 43 47 47 47 41 41 27 27 12 12 12 30 25 47 47 47 59 59 59 48 48 48 59 59 37 41 28 28 28 36
36 59 41 37 41 41 43 41 47 59 47 47 48 48 59 59 57 50 50 39 39 39 39 48 48 59 48 48 48 47 59 43 48 48 48 48 54 48 54 41 41 23 23 23 33 41 59 35 35 32
43 43 48 48 48 47 59 40 43 43 43 39 39 47 59 59 59 34 26 20 20 15 30 28 23 23 32 28 28 26 32 39 47 30 47 35 36 36 36 34 22 22 23 23 23 32 32 34 37 39
37 37 35 31 32 40 39 36 22 16 9 9 9 15 21 29 30 19 13 15 11 15 23 34 41 23 23 12 12 16 18 13 15 15 16 19 30 39 39 38 34 31 39 28 18 20 20 17 10 9
9 9 12 10 13 9 16 9 17 17 18 18 16 21 23 30 25 19 21 12 12 12 24 15 15 7 7 6 8 8 7 8 14 19 22 20 37 37 30 19 13 11 9 8 10 8 9 17 8 9
9 13 12 12 9 9 10 15 9 9 9 11 16 14 10 10 10 11 10 13 12 16 11 11 11 11 11 14 14 11 11 9 9 10 10 15 12 15 12 11 16 11 11 10 17 8 10 11 12 12
11 11 8 8 6 6 8 6 9 14 14 19 10 9 8 8 8 6 9 10 9 17 8 8 8 8 7 6 6 6 10 13 13 26 12 12 9 7 8 9 9 8 9 9 12 9 10 10 11 17
18 21 11 10 9 7 7 8 8 9 9 11 11 11 8 8 7 9 9 9 10 9 8 8 8 6 6 7 7 8 13 11 8 8 8 8 8 8 9 9 10 9 11 8 8 8 9 11 11 11
14 14 11 12 12 15 16 10 8 8 8 8 8 8 16 15 13 10 9 9 9 9 9 6 8 6 6 6 6 6 6 10 8 11 6 6 6 12 13 12 14 8 8 8 8 8 8 10 11 13
8 8 8 8 8 10 11 25 18 14 9 8 8 8 10 8 11 10 8 13 9 11 10 10 10 8 8 8 10 8 12 10 10 11 11 9 9 8 7 8 8 8 8 8 10 10 10 13 15 21
17 15 15 21 30 27 19 11 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 10 9 10 12 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8
8 8 10 9 9 8 10 8 8 8 8 13 8 6 6 6 6 8 8 8 8 7 6 8 6 9 9 9 9 17 17 14 15 21 14 14 19 18 8 8 6 6 8 8 12 12 12 12 12 13
11 11 9 9 9 18 18 13 18 10 10 10 8 8 6 6 6 6 8 10 15 10 10 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 10 7 6 9 7 7 6 10 10 11 8 8 10 8 8 8
8 6 6 8 6 6 8 6 8 11 10 10 12 12 19 18 12 12 19 19 11 10 10 10 12 8 8 6 6 8 8 10 8 8 10 8 8 7 6 12 8 8 8 11 8 | Open.Hide. 7 7 7 6 6 8 6 6 7 3 0 0 0 0 0 0 0 3 9 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 7 10 17 8 9 10 8 6 9 8 8 8 13 15 15 8 8 9
23 22 28 28 28 28 28 28 30 28 29 29 33 28 28 42 42 47 50 50 50 53 53 50 54 57 54 54 54 54 40 40 47 47 41 41 41 41 42 36 50 54 50 50 50 50 47 47 54 50
50 48 48 48 48 42 36 42 43 54 57 48 50 42 47 47 47 53 50 59 44 43 48 43 43 43 43 46 39 39 31 31 31 29 29 30 24 18 10 8 8 10 15 19 34 41 47 47 46 48
47 47 38 36 42 42 47 44 48 57 42 42 47 42 48 48 57 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 53 53 50 50 50 53 57 68 50 50 50 53 50 48 44 46 37 37 28 32 32 44 47
57 57 57 57 44 44 43 44 44 47 47 57 57 57 54 54 54 57 57 59 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 54 54 54 57 59 57 54 54 54 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 57 57 68 57 57 57 59 57 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 57 59 59 59 59
59 59 57 59 59 68 59 59 57 59 59 68 68 68 68 59 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 59 59 59 59 54 54 54 59 59 68 68 59 59 57 57 54
57 54 59 59 59 59 59 59 41 41 30 30 17 14 15 30 30 48 48 54 54 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57
50 48 48 48 46 59 59 59 27 27 11 12 12 20 20 30 29 20 15 11 11 9 9 9 9 9 11 11 13 12 12 11 27 27 50 50 50 59 47 47 32 28 19 14 12 28 24 32 32 23
17 13 9 9 9 9 9 12 12 11 11 11 11 11 16 20 28 34 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 54 48 48 50 48
48 48 57 54 59 48 59 54 59 59 59 57 57 59 59 68 68 57 57 57 57 46 57 42 37 35 47 59 59 59 68 68 57 57 57 57 57 57 57 48 48 48 57 57 59 59 59 68 68 68
59 59 59 57 68 68 48 57 57 57 57 59 59 68 68 59 59 59 59 54 54 54 59 59 68 68 68 68 68 59 59 48 48 39 43 39 43 47 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 48 48
57 57 48 53 50 43 43 41 47 47 59 59 47 47 40 39 35 26 26 36 43 39 37 37 37 37 37 44 43 43 35 35 37 39 43 46 59 48 43 43 43 43 43 59 59 47 40 40 39 37
32 30 27 28 29 37 37 37 32 36 43 59 37 37 33 33 37 37 37 43 43 40 41 41 39 39 39 41 41 37 39 39 39 39 41 41 39 37 35 37 32 32 32 35 31 31 39 39 39 41
37 37 37 37 37 37 39 37 39 35 32 32 41 41 39 39 31 29 29 26 32 26 29 32 37 37 31 31 39 30 36 36 20 20 28 25 23 15 15 25 27 27 37 37 41 41 47 37 23 23
21 17 16 18 9 9 9 18 16 31 37 37 37 33 24 23 20 28 30 32 33 28 25 11 14 11 13 13 19 12 13 11 10 16 19 19 17 22 25 14 10 10 17 16 17 32 25 27 39 39
23 20 11 11 11 17 17 14 14 14 27 27 29 41 32 29 29 30 37 30 16 16 11 12 12 17 17 19 25 18 20 18 28 28 33 36 39 37 25 23 10 10 10 15 17 22 25 20 20 19
22 14 13 10 10 10 10 12 24 28 30 21 19 10 8 8 8 8 8 13 8 8 8 13 9 8 8 8 10 10 8 10 8 8 8 8 10 10 9 8 10 8 8 8 10 13 15 12 13 13
15 17 12 9 10 10 11 8 10 10 12 14 11 14 12 11 13 11 11 11 11 11 11 11 13 10 10 10 10 10 10 17 9 9 8 8 8 8 8 13 15 10 10 12 11 12 12 11 11 11
10 8 9 9 10 10 10 12 10 8 8 8 8 11 11 12 15 18 11 11 13 13 10 6 6 6 6 8 10 11 11 11 11 9 9 9 10 8 8 8 8 8 17 8 10 12 15 13 14 14
15 13 9 8 8 10 8 9 15 9 11 11 16 12 11 12 8 8 6 8 8 8 7 8 7 7 8 6 6 8 8 10 8 9 8 8 6 7 7 8 8 8 13 8 9 8 8 10 8 8
8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 7 8 8 8 8 8 6 6 6 6 10 11 8 8 13 6 6 8 10 10 8 6 6 8 13 10 11 14 15 13 10 10 11 11 10 10 9 9 8
8 6 6 8 6 12 12 12 10 19 12 10 8 8 8 10 8 8 8 10 6 6 8 6 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 11 16 9 9 9 11 8 8 6 6 10 8 8 8 8 8
8 8 8 8 6 6 6 7 7 8 8 9 8 10 6 6 6 6 6 6 8 6 6 8 10 11 9 11 12 12 10 10 6 6 6 6 10 8 11 9 9 6 8 6 6 10 10 8 8 9
12 14 15 11 11 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 10 10 9 9 9 9 8 8 8 8 6 6 8 8 7 8 11 8 8 8 7 9 11 12 11 10 8 8 |