BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-388O06.T7 (MSMg01no388_o06.b1) | MSMg01-388O06.TJ (MSMg01no388_o06.g1) |
ACC | AG491277 | AG491278 |
length | 798 | 777 |
length of high quality (start - end) | 292 (66 - 357) | 239 (83 - 321) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no388_o06.b1 PHD_FILE: MSMg01no388_o06.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:32:19 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no388_o06.g1 PHD_FILE: MSMg01no388_o06.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:32:19 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | plural | no hit data |
---|
sequence | GGCCGCTATACGACTACTATATCCCGAGGATCCGCGGAATTCAGAACGTT
TGCCGCACACTGGCAAGATCATCCAAGCTGCCTGCCCTCACCAAAGCGCC
CATGTTCTCCCCCCCTGGCTGAGGGCTTGGGAGAGGAAAGGAAGGTCTAG
GGGACTAAGATACAAGCATAAAACAAGACAATGAGATTTCACGTTGGTTA
AGTAGAAAATGAAGATGAGGTCCTTTCTCAAAAGAAAAGAAAGAAAAAAA
AAAAAGCCGGACAGTGGTGGCACACGCCTTTAATCCCAGAATTTGGAAGG
AAGAGACAGGTAGATTTCTTAGTTCAAAGCCAGCCTGTTCCACAGAGTGA
GTTCCTGCACAGCCATGGTATACGAAAAACCCTGTGTCGAAAAACAAAAA
CGTCCCATCCACCCCCCCGCTATTTAAGGGATGAGAGAAGGATCAGCAGC
TAAGAGCATTTGCTCTTGTAGAACAACCCGGATTCAGTTTCTCAACACCC
ACATGTGACCACAAACCATCCATAACTGTAGTTTTCAGCCTACCTGCGCT
TGCGCGCGTATAAATATACCTCTCTATATCTACCGGACGACCGACCGTAT
TTTTCTATGCTTACCCATACTCATCTCCATAACCAAATTCGTTCCCACCC
CCCCACGGGGGTGGCTCCCCTTCTCTCCCCCCCCCTCCCCAGGCCCAACC
CCGGCGTTCCCGCACCCCCCCTTGCCCTCTCCTTCTCCTCGGCTTCTCCG
CCACCCTCGCTCCTGTCTTGCCTCCCCATTCACCTCTCTCCCCCCCTG
| NNCCTCCTATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTATCCCCTCTTCTGGCCA
ACAAGAGCACCAGACATATATGTGGTGTACAAATATACATGCAGGCAAAA
ATATTCATACACATAAAAGTAAATAAATTCCCCTATTTATTTATTTATTT
ATTTATTTATTTATTTATTTATGTGTATATGTATCCATGTATGTGCTTAA
AGAGGTCAGAGAGGTGTTGTGATGGTTTGTAAATGCTGGGCCCAGGGTTT
GACACTATTAGAAGGTGTGGTTTTTTTGGAGTAGGTGTGGCCTTGTTGGA
GTAGGTGTGTCACTGTGGGTGTGGGCTATAACACCCTCCTCATAGCTGCC
TGGAAGCCAGTCTTCCACCCCCCCCCCTCAGATGAAGATGTACGCCAGGT
GGTGGTGTTGTTGCTCCCCCAGCTTTTTTCTCATGCACCTTGCCTTCTAT
CACCCTCGCCTCCCCCTTATATTTCCCCCCCCCCCCCTTCTCTCCTCCGG
GTCTTTTTCCCCCGTGCCGGTTTTTTTCCGCCCTCTTCTGCTCCTCCATT
CTAACCCCTGCCCCTTATTACGCCCCCTCCTCCCCCCTTTTTCCCCCTCC
TCGTTTGTCGCGCCCGTGCGCCCCTTTTTCTCTCCCTCTCTCCCCGTCCC
CTCCCTTTTTTTCCCCCCCCCCCTTCCCCCCCCTCTTCTCCCCTTTTTTC
TCCGCCCCCACCGATGTCTCTTTCTTT
|
quality values | Open.Hide.15 19 15 15 15 10 8 8 13 8 21 19 14 14 9 10 10 19 21 9 9 9 13 14 10 11 11 12 14 14 14 11 11 15 21 30 30 33 31 23 23 9 9 9 10 28 22 22 12 11
11 12 11 11 9 11 12 12 12 15 16 13 10 10 10 26 26 30 30 30 25 20 23 12 12 13 25 17 24 28 35 25 34 25 30 28 22 22 14 21 21 28 25 28 37 41 57 57 37 39
37 37 40 25 25 12 12 12 30 20 20 20 20 32 25 34 32 34 34 48 48 59 59 59 59 39 37 39 43 43 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 54 43 43 28 37 37 43
44 47 42 42 33 33 32 42 42 42 42 42 33 43 43 48 43 50 50 57 57 43 43 39 39 42 37 41 30 30 30 41 41 37 37 37 37 37 37 29 29 32 37 47 59 59 59 46 48 48
59 59 59 59 59 59 50 42 37 37 40 47 47 47 42 47 47 47 57 59 43 43 47 47 57 59 42 32 25 20 20 35 41 59 68 68 68 68 59 59 59 59 54 54 54 54 59 59 59 59
59 59 59 57 57 48 42 35 39 39 57 43 57 57 43 59 37 37 37 48 43 57 57 57 44 44 44 43 43 42 44 44 47 47 47 57 46 54 54 57 57 57 44 44 43 59 59 59 47 47
47 47 47 48 47 48 43 37 37 37 41 32 32 32 44 44 48 48 40 40 40 59 44 39 39 35 35 42 34 29 14 14 14 34 28 47 39 47 39 47 32 32 19 19 15 33 31 43 47 47
30 32 15 12 8 8 8 8 10 11 11 11 16 12 12 12 15 11 12 12 41 41 48 48 48 48 59 59 41 39 43 39 39 28 43 31 28 14 18 18 30 30 46 47 41 41 34 25 18 8
8 6 6 6 7 6 6 6 6 6 6 6 12 13 27 17 17 10 9 10 16 16 36 34 59 59 59 59 41 47 47 50 50 50 59 59 57 57 37 43 25 20 20 30 25 28 28 37 33 43
24 19 12 24 15 19 10 13 10 12 19 19 17 17 22 22 32 15 15 11 9 8 8 8 8 13 13 8 11 8 8 10 11 18 16 30 19 23 9 11 12 23 18 22 22 30 34 33 37 31
20 15 9 9 9 16 16 12 8 6 6 8 8 9 9 16 12 16 15 23 11 11 11 18 18 12 19 11 12 12 20 20 9 9 9 9 9 11 11 16 15 15 10 9 9 9 9 10 10 10
9 8 8 8 10 8 13 8 11 14 15 10 10 10 8 8 8 6 6 8 10 12 17 17 11 10 8 8 8 10 10 10 10 10 8 8 8 8 10 9 9 13 11 8 8 8 6 6 8 10
8 6 7 6 6 8 8 6 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 10 15 12 10 8 10 10 11 8 8 8 9 21 17
13 9 8 8 8 6 6 6 6 8 8 9 10 10 13 11 11 10 10 8 8 8 10 10 9 9 10 12 14 28 28 28 12 13 8 8 8 10 10 11 11 12 12 13 11 9 9 9 8 8
8 8 10 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 15 17 22 20 15 8 8 6 6 10 14 9 9 9 7 10 8 8 8 8 13 8 8 8 6 6 6 6 6 10 10 10 8 8 8
8 8 8 8 9 6 10 8 10 8 8 12 14 11 11 13 16 11 11 8 8 8 8 10 13 15 8 8 8 8 6 6 8 8 9 8 8 6 6 6 12 24 32 19 17 10 10 10 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 6 6 9 18 10 10 10 10 8 8 9 9 9 16 17 31 31 34 29 27 29 29 29 37 25 21 17 15 11 6 6 6 6 8 10 10 10 10 10 11 17 18 28 22
24 22 25 35 37 37 37 37 37 37 37 37 29 20 9 9 11 12 12 10 10 10 18 18 28 23 16 19 22 26 31 35 59 59 59 59 59 59 59 59 59 53 53 50 50 50 42 42 19 28
28 40 42 48 51 57 57 57 54 48 48 47 48 50 53 68 68 68 68 68 68 68 57 44 37 28 28 28 38 42 57 57 57 57 68 57 57 47 47 47 50 57 68 68 68 68 68 68 51 51
50 50 50 50 50 50 50 57 57 50 48 48 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68
59 59 59 42 42 28 31 20 27 32 44 57 57 57 68 68 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 47 46 43 54 54 57 47 59 47 47 43 43 43 43 43 43 59 59 59 57
57 57 48 48 48 59 59 59 59 57 48 47 59 47 46 34 32 28 16 16 11 12 12 13 13 15 15 11 11 16 22 30 59 59 48 48 48 48 47 47 39 39 43 59 59 59 46 43 43 59
47 57 59 59 59 59 54 47 40 31 28 28 28 35 36 26 23 14 17 17 27 21 22 17 27 41 59 59 59 59 41 41 35 33 33 39 43 43 39 39 43 37 43 43 57 40 59 39 43 37
37 32 36 43 43 43 37 43 43 40 43 41 41 32 28 16 16 11 10 9 11 10 12 11 19 11 10 11 11 9 9 9 22 23 30 28 32 37 37 31 33 19 12 12 12 13 11 24 26 30
28 28 25 30 19 23 10 9 9 9 9 9 9 8 13 13 11 10 10 8 8 8 8 8 12 21 10 8 8 8 8 8 8 8 11 10 10 15 18 24 13 11 10 10 9 10 9 9 8 8
8 8 8 8 15 15 12 12 11 10 10 12 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 9 9 10 8 10 10 9 9 9 8 8 8 6 9 11 12 12 12 8 12 6 6 6
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 12 8 8 8 9 10 10 11 11 8 10 8 10 8 7 8 8 8 8 8 8 10 11 12 11 12 12 9 9 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 11 15 10 10 10 10 10 16 11 11 11 9 9 8 8 8 7 10 10 10 9 9 9 8 8 6 6 8 10 8 9 10 8 10 8 10 13 16 18 12 11 10 11 11 10
10 10 10 10 10 10 9 9 9 9 9 10 11 13 10 10 8 8 10 6 6 8 8 8 10 8 8 10 8 8 8 8 8 7 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 12
8 9 9 12 12 17 18 14 21 12 15 12 12 13 12 12 11 18 13 14 13 10 10 13 21 21 17 13 10 10 8 8 10 8 8 8 10 10 6 6 8 8 9 9 9 9 10 10 10 12
10 12 6 9 10 12 16 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 14 10 9 9 9 9 9 9 9 |