BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-445G07.T7 (MSMg01no445_g07.b1) | MSMg01-445G07.TJ (MSMg01no445_g07.g1) |
ACC | AG534335 | AG534336 |
length | 734 | 753 |
length of high quality (start - end) | 500 (38 - 537) | 411 (70 - 480) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no445_g07.b1 PHD_FILE: MSMg01no445_g07.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:13:34 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no445_g07.g1 PHD_FILE: MSMg01no445_g07.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:13:34 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTCTTT
GTTTATACTCTGTACCCCATTTTTAATAGGGTTACTTGGTTTCCTGGGGT
CTAACTTCTTGAGTTCTTTGTATATATTGGATATTAGCACTTTATCAGAT
TTAGGATTGGTAAAATCTTTTCCCAATCTGTTGTTTTTGTCTTATTGACA
GTGTCCTTTGCCTTACAGAAGCTTTGCAATTTTATAAGGTCCCCTATGTC
AATTCTTGATCTTACAGCACAAGCCATTGGTGTTCTCTTCAGGAATTTTT
CCCCTGTGTTTTTATCTTTGAGGCTCTTCCCTACTGTCTCCTCTATAAGT
TTCAGTGTCTCTGGTTTTATGTGGAGTTCCTTGACCCACTTAGACTTGAG
CTTTGTACAAGGAGATAGGAATGGATCAATTTACATTCTTCTACATGCTG
ACTATCAGTTGAGCCAGCACCATTTGTTGAAGATGCTGTCTTTTTTTCCC
TGGATTGTTTTAGCTCCTTTGTCAAAGATCAAGTGACCATAGGTGTTGAG
GTCACTTCTGGGTATTCAGTTCTATTCCACTGATCTACCCGTCTGTCTTT
GTACCAGTACCATGCACGCTTTATACACACCGCTTTGTATTACAGTTGGA
GGCCAAGATAGTTGATTCCCCACAAATTCTCTTATTGGTGAAAAAACTTT
TCCCTTTCAGGTATTTTCTATCTTTCCCAATGTG
| XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXAAAGATAAAAGGAATGCTCAGTGGTAGAGTA
TTTGATTAGCTTATAAGAAGCCCTTAATTTAGTCCCAGGACCACAATATA
TTTATAAAAAAACAGGGCAACCAAATGACAGTACAAGAAACCTCTCCAGG
AATACAGAGTGAAATATTGGTGGTTTTGTTGATATTTTTAACATTTTTAA
AAATTATTTTGTTTATGTGTTAATTTGTGGAGAAATTTTATTTTCTCTAT
AGTAGTTATACTTCTATAATCCTTATATAGCTTTATGTACTTTGAGGCCA
CAGATGCCTGGGGAATCTGGTGATATATTTGTCATGAAAAAGAAAGAAAA
AGTAAATTTTACATACATTTCTAGGGAAGGTCCCCACTCAGCTTTCCATA
CCTCTCTGGGACCCTTTATCACCTCAGACTTAGGATCTCAGTTCTAATAG
AAGTGATTATTCCTCCAGGTTCGAGAAATGGCTGCTACCACCTTAAAGGG
TCTGGTACAGGGTAACTTCCTTTACATGGACAGCGGTATTGCTAATTCTT
TTTGAAGCAACTTGGTCATACACAATTACCCCAGAAAAAAAAACGAGACC
CTGGTTTCTGGGGATAAAACATTTTCTTTCGGCGGGAAGCGAATATTTCC
TCTCTCCTTTTCAAACCCTCTTGTTTTCGTCTTTTCTCTGCCACATTTTC
TCC
|
quality values | Open.Hide.26 28 30 30 30 25 23 22 28 21 13 8 8 8 23 23 59 29 29 30 30 25 21 19 10 12 12 10 10 11 12 12 12 12 16 22 24 28 47 47 48 35 30 28 28 31 31 59 59 44
39 23 15 8 8 7 8 7 13 12 23 18 30 30 47 43 41 47 47 50 53 57 57 57 57 53 53 53 53 53 53 57 57 48 59 57 57 48 59 59 59 59 48 47 47 43 59 59 59 54
57 59 57 57 51 51 48 48 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 47 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57
57 68 68 48 48 36 46 46 46 57 57 68 50 50 51 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 57 52 52 52 52 52 59 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59
52 52 52 59 59 68 59 59 59 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 42 42 35 35 42 42 57 59 57 59 48 59 59
59 68 68 68 59 59 57 57 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 48 48 43 59 43 48 48 59 59 59 59 57 57 57 48 48 48 57 57 57 57 53 59 59
59 50 46 46 25 25 12 14 14 15 15 20 22 26 25 36 41 59 47 48 48 48 50 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 46 46 43 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59
57 57 57 48 48 48 48 59 59 59 57 57 57 47 47 57 57 57 57 57 54 57 59 59 59 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 68 57 59 59 59 48 59 59 59 59 57 57
57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 43 43 43 57 57 68 68 68 68 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 44 44 42 43 43 59 44 59 57 57 57 57 57 57 59
48 54 54 57 47 43 39 35 42 39 59 39 47 46 46 46 48 59 47 47 39 43 43 43 43 25 25 25 40 43 40 40 28 32 32 30 30 23 23 23 34 34 59 59 50 50 42 41 39 39
39 29 29 32 26 24 14 14 14 31 31 31 31 31 36 41 43 43 30 30 15 15 16 21 23 28 31 33 33 28 19 19 32 23 19 19 19 22 19 23 11 11 11 22 18 23 18 28 21 21
12 25 15 24 18 19 12 10 10 9 11 9 14 12 15 19 16 16 16 16 11 15 15 20 24 24 32 24 30 28 33 33 23 18 14 13 10 9 8 8 7 7 7 13 9 9 9 12 12 17
16 16 18 15 12 9 9 9 11 12 12 19 11 10 10 10 10 8 8 10 12 8 10 8 6 8 8 10 10 12 12 11 11 10 13 11 10 9 8 8 8 8 9 9 14 12 12 13 23 14
16 14 10 8 10 8 6 6 6 6 8 8 9 9 10 12 12 11 11 10 11 15 15 10 9 8 10 10 10 10 10 9 10 10 11 10 8 8 8 8 10 10 10 11 7 6 8 8 8 8
13 13 15 11 10 10 12 12 11 10 10 10 9 10 10 10 10 10 8 8 9 10 10 17 14 14 11 15 12 12 11 11 9 9 | Open.Hide. 6 8 9 9 9 9 14 14 20 20 39 28 39 37 39 37 37 39 39 39 44 59 34 30 18 12 11 12 11 11 11 21 22 20 24 31 30 37 50 53 53 50 50 50 50 50 53 53 53 53
44 43 29 26 20 22 31 31 42 42 57 57 57 41 42 42 42 50 48 48 50 50 51 50 50 50 51 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 59 59 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 54 54 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 59 52 52 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57
57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59
59 57 57 59 59 59 59 59 59 57 47 59 52 52 43 57 43 57 57 57 59 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 52 52 57 59 59 68 68 68 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 54 54 54 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 47 59 54 59 59 59 59 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 57 59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59 57 57
57 47 47 47 48 48 68 54 54 54 54 54 57 57 43 43 43 48 57 57 48 48 48 57 48 59 59 39 37 30 37 37 37 37 39 39 37 37 39 41 40 41 30 30 19 19 18 31 20 28
30 37 41 59 59 41 39 39 27 27 22 25 25 30 37 33 37 24 24 17 17 19 27 27 30 22 22 14 17 16 18 12 14 12 19 16 24 24 16 16 11 14 13 19 13 16 11 17 11 11
11 12 10 10 10 17 20 25 28 37 31 34 22 18 14 10 10 10 11 11 11 15 15 31 32 20 24 28 21 15 11 11 11 11 11 19 18 21 16 17 18 18 25 19 14 8 8 8 9 8
8 8 8 9 10 10 10 8 8 8 9 8 8 10 10 10 14 10 10 9 11 10 8 10 8 8 9 9 8 8 8 8 7 9 9 12 13 12 10 10 8 8 8 8 8 10 11 10 10 10
19 21 11 8 6 6 8 8 8 13 10 18 8 8 6 6 8 6 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 13 8 11 11 10 13 10 9 9 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8
10 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 7 8 8 8 10 10 10 8 8 8 6 10 6 6 8 8 8 8 10 8 9 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 9 11 8
8 15 10 8 6 6 8 8 12 9 9 9 9 10 11 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 10 9 10 10 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 11
11 11 11 |