BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-466H05.T7 (MSMg01no466_h05.b1) | MSMg01-466H05.TJ (MSMg01no466_h05.g1) |
ACC | AG550394 | AG550395 |
length | 753 | 785 |
length of high quality (start - end) | 406 (79 - 484) | 235 (84 - 318) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no466_h05.b1 PHD_FILE: MSMg01no466_h05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:41:56 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no466_h05.g1 PHD_FILE: MSMg01no466_h05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:41:56 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NNNAACTTCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXCGCGGAATTCTTATTTTACGTCCAGGAAATGGTTCATTGGGTAGAAGT
GCTTACTGCTAAACCTAGCAACCAAAGTTCCATTATGATATCTACAAAGT
ACAGAGAGCCAACATTTTTAAATTTTCCTATGATCCCTGCTTGTTCACCA
TAGATTCATGAACATACGTGCACACACACACACACACACACACACACACA
CACACACACACACACACACACACATAAAAATGCACTTTTATACATCGCAA
TTAAAATCATGCTCCAAAAGCATTTCAAAGTGCTGGACCACTCCAATGTC
ATATTAACAAGTTTCTTCTTTCTTTTTGTTTGTAGTCCAGTGGCTACAGT
TTCAGTGCAGAAGGTTAGTCTCTTTAAAAGTCTAAATAGGACATACTTGA
TTATTGGTTCGAATATATCGTTCAAAATGAGGAGTACAGTTGAGAGCAGA
TAATGAGACTTAATCTAAATGACCATATCCGGAGGAAGAATTATATGATT
CACTGGCTCCCTTGTTCTAATAATTAAACCACCCTTTTGGTTGTTTTTAT
AGAACCTAACATTGGTGACAAAATATGCATTTTGCATTGCTGAAAAGCCA
TGCATCTGGTATATCCCTCATTAACCCCTTTTTATTCACTTTTTAATATC
ATATTCGCTCTTCTTTTTGTTTCCAAGGGGATCCCTTTTTACTCCTTATA
CTC
| CCCCCACGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTCTATATGAAAACATC
CAATTACATCAGCTCCTTTTGTGGAAGATGCTTTCCATTTTTCAATGTAT
GATTTTGGCTTCTTTGTAAAAAAAAAAATCAAGTGTCTGTAGGTTTGTGG
GTTTATTTCTGGGCCTTTGACTCAATTCCCTTTACTCAACTTCCTTGATC
CACCTGTTTCTATATTGATACCATTCAGTTTTTATTAGTACTGCTCTGTA
ATACAGCTTGAAATCAGGGATTTTTATGTTCTTTTATTGGACAATATTGC
TTTAGCTATTCTGTTTTCTGCTTTTCCATATGAAGCTGAGGATTGTTCTT
AAAGGGTCTTAAGAATTTTTTTTCACCCCCCATCTAATCTGTTCCATGCT
TTTCGTTAAACATCTTTATTTATTATTTTATCTCTTCTGTGCTACCTTGA
AGAATAATCTTTTAAATTGTTGATATGATACATATTATCCTTCTCCACCC
TACCCTTCTCTTTTTTTTTCCTTTTGATTCTACCCCGCCCGTTATTTCTT
ATTATATTCGATCATCGCCCTTTCTTCTTCCCTTATGATGAGCTTTATGA
GTGTCTACTTTTTTTATTCTCTTTCCCCCTTCCTCCTTCCTTCTATAACC
TATTCTCTATCTACCTTTGATCGGTGCGTTCACTCACGTGATACGGTGTT
TATTCAGCCCCTCCTCTGTGTCTCTCCACTCACGA
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 7 6 6 7 10 9 8 8 8 9 11 13 22 30 25 25 22 24 19 25 23 23 12 12 12 26 26 47 28 25 20 16 13 6 6 6 6 6 6 9 9 11 9 9 9 13
15 16 17 24 33 41 31 30 24 24 31 31 41 44 44 27 16 8 6 6 6 6 6 9 23 21 22 22 20 28 26 28 24 29 39 48 37 37 43 37 32 43 43 59 59 59 44 48 43 48
48 48 57 57 57 48 48 48 57 48 68 59 59 43 43 47 59 59 44 37 32 30 32 30 44 36 44 44 47 47 47 47 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 47 54 57 57 57 57
48 48 48 57 57 68 57 57 43 43 47 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 57 52 52 52 59 59 57 52 52 52 52 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 57 52 52 52 52 52 52 57 52 52 52 62 52 52
52 43 43 39 39 39 43 43 52 52 62 62 62 62 62 62 57 57 57 57 57 52 52 52 59 59 59 57 57 57 57 52 52 52 52 57 59 59 68 59 57 57 52 52 52 57 52 57 57 57
57 59 59 57 44 44 43 43 52 52 57 57 57 57 57 52 57 44 44 27 23 23 24 34 24 12 11 12 24 18 27 27 44 43 52 52 57 57 57 57 59 43 43 37 43 43 57 44 43 43
44 57 57 68 68 68 68 57 57 48 48 44 59 46 47 54 54 57 57 59 57 57 57 59 59 47 47 43 59 59 47 43 43 40 44 30 30 37 40 36 37 30 39 37 44 40 36 36 40 41
42 43 39 39 30 33 32 43 37 43 43 57 57 43 47 43 39 37 30 30 37 37 43 39 33 28 25 18 21 15 18 29 30 40 41 41 59 41 30 30 30 37 37 47 41 46 40 39 37 37
37 37 39 39 28 23 15 15 10 17 19 26 24 30 30 37 37 37 37 30 28 28 26 24 23 23 28 32 32 37 37 26 26 13 10 10 10 10 15 18 22 25 17 22 19 21 21 15 15 19
19 15 10 10 10 10 13 11 16 16 15 11 10 8 8 6 6 8 8 8 10 6 8 8 8 11 11 11 14 13 16 20 11 11 10 9 9 12 12 16 11 8 6 6 6 8 8 10 9 10
10 9 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 6 8 13 8 8 6 6 6 6 9 10 12 10 10 8 6 8 6 6 8 8 10 16 13 15 8 8 8 8 11 11 20 16 16 14 13 8 8
8 6 6 6 6 8 8 15 9 11 8 11 8 8 8 8 10 11 11 10 10 10 7 7 6 6 8 8 9 8 7 7 6 6 8 8 8 8 9 9 9 10 10 9 8 8 8 10 10 10
11 16 8 8 6 6 6 8 8 6 6 6 10 10 8 8 9 8 8 6 6 8 8 11 11 11 11 11 14 15 12 8 8 8 8 8 8 8 8 14 16 15 12 8 8 8 8 8 8 10
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 16 11 11 10 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 11 8 8 6 6 8 8 11 9 8 8 8
8 8 8 | Open.Hide.15 17 17 15 6 6 6 7 8 8 8 10 10 10 10 15 24 36 34 34 28 24 24 24 22 30 30 30 34 37 39 37 37 40 27 23 22 9 9 6 6 6 6 6 6 10 10 10 10 21
19 34 23 24 34 34 44 41 37 37 42 42 59 59 29 17 9 9 8 8 8 8 7 8 10 13 8 8 8 19 19 30 28 46 50 50 50 53 59 57 57 57 57 57 42 53 42 47 47 40
40 40 50 50 53 50 43 43 43 43 43 47 43 57 48 48 54 57 48 48 43 43 40 43 43 42 42 47 47 47 47 57 57 57 57 57 57 57 57 59 51 50 42 42 37 37 33 44 42 47
47 50 50 50 48 57 48 48 57 57 57 57 57 57 57 48 48 59 59 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 59 54 52 52 52 52 52 43 43 57 59 59 59 52 57 43 43 43 38
50 50 57 57 68 57 57 57 57 44 43 29 44 43 52 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 59 59 57 57 57 57 44 43 43 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 47
42 37 35 35 42 42 44 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 68 68 68 59 57 57 54 46 43 43 47 47 43 59 43 47 47 43 47 57
57 57 48 48 48 57 57 46 46 46 48 41 42 42 41 30 21 11 9 9 8 8 8 9 9 9 9 11 11 25 25 39 39 31 31 31 16 9 9 9 9 14 16 18 18 18 30 30 43 43
47 37 39 35 35 35 37 30 30 31 19 14 10 10 9 11 12 16 17 15 15 20 24 32 34 33 33 23 23 20 20 20 12 12 6 6 8 8 12 15 15 20 32 34 32 30 28 28 18 18
15 15 20 19 16 14 12 16 22 18 13 11 11 12 13 19 22 16 12 13 10 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 12 13 11 9 8 6 6 8 8 8 12
16 20 19 11 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 12 9 9 11 10 12 12 12 15 19 13 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 10 11 11 9 10 9 6 6 8 8 8 8 8 10 10 14 12 11 11 8 8 8 8 8 8 6 6 8 10 10 10 9 9 9 9 9 9 10 21 15 10 8 9 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 13 12 14 19 14 10 10 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 8 8 9 11 11 10 10 10 9 9 8 10 10
10 8 6 6 8 8 9 8 8 8 8 8 8 9 8 8 6 6 12 11 10 8 6 6 8 8 8 8 9 9 10 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 10 8 10 10 10 8 8 8
6 6 6 8 8 8 8 10 12 11 11 15 14 14 16 19 20 21 21 11 11 11 15 13 16 18 12 8 8 8 8 8 13 10 12 9 9 9 16 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 12 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 10 9 13 8 8 6 6 10 8 8 8 9 9 9 8 8 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 9 8 10 7 6 8
8 11 8 8 6 6 8 8 9 9 9 9 8 8 6 6 8 10 8 8 10 11 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 |