BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-480O20.T7 (MSMg01no480_o20.b1) | MSMg01-480O20.TJ (MSMg01no480_o20.g1) |
ACC | AG561452 | AG561453 |
length | 731 | 726 |
length of high quality (start - end) | 575 (77 - 651) | 243 (331 - 573) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no480_o20.b1 PHD_FILE: MSMg01no480_o20.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:01:23 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no480_o20.g1 PHD_FILE: MSMg01no480_o20.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:01:23 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (117,796,097 - 117,796,661) | (117,973,628 - 117,973,870) |
---|
sequence | NACTTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCAGAGAGATGC
GCGGAATTCACACTCCATGCTGCAAGGTGGGCCTGAGATGGGCCTCACAC
CTCTCCCCCTGTTCCCATCAGTATCCGGTCTGTGTTTTCAGGCTGAGGCA
ATCTTCAGGTGCCTGTGCAGAATGCCCTGCCCTTGTGTAAGCTACCAAGC
ACCAGCCACTTGCAGGATCTTTCTCTCTTCAGAAGACTTCTTCCAACTTC
CATCTCCGTGGAGAGTATTCTGGGTCTTTCAGTGTGCTGAATGCATAGAC
TGCTGAGGGGCGTCTCTGCAGTATGTTGTATGGATGCTTCCATAATCCAG
CTTCTTACAGATGCTCTGAGAATCATAGATGAATCTTCTCCCTCTCCTCA
GGATAATGTGGCAACCAGCTCTGACCCCAGCACCTTGCAGCCAGATGTGG
GTCTGCTGCAGGGGCCTGGGAGCCACATCCCATCTCTCTTGTGCTGTTAG
CCCCACATCCCACCTCTTGTGCTGTTAGCCACATCTGTTGCTCTGACCTC
TGCTGTGCTCAGTGAGAGGGGAGGAAGGGTCCGGGTCTGAGGCAGCTGGG
GAATTCGGCTTTGGAATCCGGACAGCAACCCCCAGGAAACTTTCCACCAT
GGTGTCTTGGCTCCTGAGGAGACAGGAAAGATGATCATGTTCCTCAGAAG
AGAGGAGAGAGCTCCCATGTTCCCCCGGACG
| NCCCGATGATAGGGGAGGCCTGGNGGNCGCCTGGCCTCATAAACAGGGTG
AACTATAGAAGGATTTCAAAAACACAGTTTTCCCTTGACTGGCACACTCA
CGCCCCCAAGAACTCCCCTTAGGGCCCTCTGCACAGGTGCTCACAGATCC
CAGGGTACCGGAGACACAGGAAGGCTCCCTCCCAAGAGAGCATGGTGGAG
GGGCCAGACTGAGTGTGCCATCCCTGAAAGGGCTGTGGTTTCCCTCCAGG
AGTGGTCAGCCAACCCCCTGTTTGAAAGGAAGGACAACAAGAAGGAAGCC
CTGTTGGACCTGGACGGCATGTTGTCCAACCTGAACAAGCGGTACGCTGC
GGTCAAGGAAGCTGGTGTGAGAATCCAAGCCATGGTTGTGGTAAGGAGAC
CCCCCCAGGGGGTCTTTTGGAAGCTGCTTGCTTTTTATAGAGGGGAAGAG
AAAAGAGGAGTAGCCAAGCATTTTATTAAGATGACCAATCAGAAGTGTTC
TGATGACCACAGAGTCTGTTAGATTTCATCTAAGACAGCCTGACCCAAGA
GCAGCTTCAAAGCCCGGTTCCTGTTGTTACACGCCTGTGCTCTATCTAAA
AGTGGCCAGAGCACCACCAACCCCTGCCTTTAAGTCCATATGTGCCCGGT
GACATCTTCCCCTAAGCCAACAGGGACAAGGCTGCTGCGAGCTTACATGT
ATCCTTTCACGGGTTCCCCCTCCTGG
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 8 8 8 10 13 16 18 24 34 33 32 27 25 25 37 41 37 37 37 39 37 37 43 48 30 28 28 25 23 21 27 9 9 9 9 9 9 9 7 7 7 8 8 8 10 10
12 21 18 28 28 31 31 33 33 33 33 30 21 21 9 9 9 9 9 9 9 7 13 10 8 8 8 13 28 30 47 47 48 38 38 35 35 30 37 37 50 59 57 53 53 53 53 53 53 53
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 54 54 54 57 44 57 44 44 43 46 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 59 59 48 47 47 43 43 44 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57
57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 36 36 17 20 11 11 12 11 11 11 13 13 25 30 41 41 50 50 59 53 53 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57
57 59 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 59 68 68 68 59 59 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 54 57 59 54 54 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 44 41 41 44 44 44 47 59 50 42 48 48 48 48 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 48 53 50 50 50 50 47 37 37 37 37 31 32 44 44 44 47 46 46 47 59 59 59 47 47 41 32 29 29 37 37 37 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 41 41 41 31 31 41 59
59 59 59 59 59 59 59 59 34 34 25 25 34 34 31 37 30 31 32 36 43 41 31 29 30 25 25 25 29 32 27 25 32 29 29 32 39 28 28 13 13 12 25 25 37 37 39 34 34 37
25 27 19 13 13 19 18 26 27 28 26 24 29 29 32 31 35 31 31 31 22 21 28 23 30 30 18 18 20 30 35 30 31 35 31 31 30 31 22 28 24 34 30 26 22 28 24 22 25 25
20 19 16 16 15 15 18 23 15 13 12 12 15 18 21 23 25 18 19 11 11 11 11 8 10 10 12 13 8 9 9 14 10 10 10 10 11 11 11 15 17 24 20 16 16 11 11 11 9 9
9 9 9 14 14 11 11 11 11 11 16 16 20 19 16 7 6 6 6 6 6 9 11 15 11 8 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 3 6 6 6 6 15 8 8 8 8 8 8 19 10 10 10 12 29 40 27 27 3 0 3 3 0 3 23 27 24 22 15 9 9 7 7 8 7 7 6 7 6 6 6 6 12 12 15 15
12 11 26 26 50 50 42 41 25 25 8 6 6 6 7 6 9 9 9 10 7 7 6 6 8 8 9 12 15 24 30 36 47 50 50 50 50 53 53 53 57 57 50 50 50 37 37 47 53 53
53 53 53 53 47 53 53 50 50 50 57 57 57 53 48 48 25 21 8 8 8 8 10 11 11 11 12 25 30 47 47 50 50 50 50 50 50 59 59 57 57 57 57 53 53 53 53 53 53 53
53 53 53 53 68 68 68 68 50 42 29 29 22 22 25 29 31 39 39 41 42 47 48 48 54 54 59 59 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 44 44 39 33 33 33
23 23 12 11 11 11 11 11 16 22 30 41 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 53 53
53 57 57 57 57 53 53 53 53 44 41 50 50 42 41 28 28 12 8 6 6 6 6 6 6 6 9 9 9 9 15 23 34 39 42 50 50 50 50 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59
57 57 57 57 59 57 43 43 31 20 20 20 23 31 28 41 41 39 39 37 37 39 46 46 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 57 57 57 57
57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 47 48 47 54 48 57 48 48 48 59 57 57 57 53 53 53 57 57 57 57 57 57 53 53 59 59 59
59 59 59 59 59 44 41 41 44 44 44 41 41 41 36 36 36 44 59 59 59 57 57 48 48 48 43 39 41 41 47 41 41 44 37 37 44 41 39 37 35 35 34 34 27 30 27 21 21 30
39 59 47 47 47 41 48 43 43 40 43 43 48 48 48 48 48 48 59 43 37 37 30 39 37 41 36 36 36 39 32 31 19 24 17 26 26 39 36 37 37 37 32 20 20 18 18 18 23 33
36 36 37 37 38 19 19 18 16 16 21 34 37 37 41 36 34 26 26 22 19 19 20 17 17 24 19 19 28 20 20 20 24 17 17 21 17 17 17 24 24 30 30 30 18 16 14 8 8 8
9 10 12 12 11 11 11 21 18 25 24 22 19 15 14 14 14 19 19 14 16 9 9 9 14 13 22 14 15 9 9 10 10 9 19 17 18 19 20 25 22 14 14 14 14 14 17 15 10 10
11 19 11 12 11 6 6 7 6 6 6 8 8 8 8 13 9 11 11 11 11 15 17 19 11 11 11 11 11 11 16 12 12 15 15 15 15 15 15 17 15 16 13 11 10 9 9 9 9 9
9 10 11 10 10 9 10 9 9 9 9 9 9 10 10 10 8 10 8 8 8 8 12 12 12 12 |