BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-010F14
Chromosome12 (Build37)
Map Location 26,729,666 - 26,770,360
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneC330002I19Rik, Id2, LOC100042973, LOC100042974, LOC668726
Downstream geneRnf144, Rsad2, Tyki, LOC668731, 1700020D12Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-010F14.bB6Ng01-010F14.g
ACCDH846041DH846042
length1,1221,075
definitionDH846041|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-010F14, 5' end.DH846042|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-010F14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(26,769,208 - 26,770,360)(26,729,666 - 26,730,573)
sequence
gaattctttacagtgttaactaacggcctggttctctgtgttcgaggctc
tagcaccagaatggtgagtagaataccatccttactgccaattagcaggg
agctgtaaactatcaggatgcgctggaggaagggaactgaagttgaactg
gtatttttcatgatgtgacatcatgtgacattgcctcagtctccttagtc
tcagtacgtgcgtcttccactgaacatgactgcataggtattggtggcta
tctagaagagaccatgaccatattttaggactgacttcagttgctcacaa
tccatttcagtcttggtcctggaggactgtttttttaattatggaaacaa
agtcttgtaatgttctggtttcctgctcttttttatgttcctttgttcct
aggagaaaaaagtgtactcccactgataccaactatacaagaaagtcgat
atgaggaaagctgcatctgagtctttccttaaagcatccttgaggctata
gatatcctgttcttagcatatcataagtcaaggcagcagggcattcatct
ccccatgtgcatcctcagaggagctgacatctacattatatcacttgcat
tgtggttttgataccttccctttctgtggagatcatggggacaaatatca
tcaaagggagatcttctctactataattcagaggaaaagggttgccatac
acaagtcatactcataaaaaatacagattttactgtgttgttctctattt
agggggcagcctactccaatctctcttcagagtgtttattttggtctgct
aagtaaatatctgcatgtgtctcttgagagatatcctgctcacaaaaccc
ccaggaagaacacaacatagtcactactttatgaaatatagtaatataat
ggaatactgtactaattgccatcctatatgagttgataattttgacttcc
tccaggttaatattttagcaacatagtgtaagtacatgaaaggattagta
ctgctggacaggtagtgggacttaagattatcgagtttaatgatcgatgt
agttaggatgaggctagagacgagaggacgattccagtctgagcacgttc
taagaatgctgctgcttggcag
gaattcagagatctgcctgcctttgtaagcacagacaataagctagctga
gtgggctctggctctgagatcaccattccctctgtgcttgggcctaaacc
aactctgtcttaggctagacatgaattcatgaatctgccggccttcgtaa
gtgcagacaataagtttacttgggtgggatcttgctctgtgatcatcact
ccctaaatctctatatctcctttaatatctttctgacaagctggctcatg
gtgaagctgtctctttttttgtaggtcagtaaagcacctcatataattca
tattacatccttatattttgcatacttgagaaattatatattttaacttg
tgtttttagagttctttctcacagccttaagggctgtcttgaaggtcaca
gcatttaccattttgctaaggacattagacacacctttgcctcctggact
cagacttttgctgcctttaattatcatagtcattaaccttcacaggaaga
acatccccccataatgaacatctctcaaaggaggaacatcaagtaaatta
tgtatattgttgtataaacaagtcccatgcccactgctaccgttagcatt
tgtggagattcttgccctgctagctctgccccaagggcaggaactgtgtc
acattgacccttctgcatgaccatgcagaacttgccacttttactcactg
agctatctcacttatgaaacttccataaagtagaaacaaaaaagcatggg
tgaagtgattatttacaaaccactttaaaaagtaaaggtcgtgaattgaa
aagtaattgaagagtgagagtctctcaaggctgactcacatgctacattc
tgcccatggtgcataggatgtgagatcaagattttggcaccctggccata
tgcatctgaatccacactaccactaactttctcaagtgtagtactatggg
gcttcaacatcaatgagtacaggtcagttcatgccacttctcttgctgag
actgtgacacaaagctgggtagagctatgtaaagcctagtctaaatgcat
gagtttttatgattgaccatgtgag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_26769208_26770360
seq2: B6Ng01-010F14.b_48_1169 (reverse)

seq1  CTGCCACAGCAGCAGCATTCTTGTAGAACTGTTGCTCTAGACTGGGATTT  50
      |||||| ||||||||||||||  ||||||   ||||| ||||||| ||  
seq2  CTGCCA-AGCAGCAGCATTCT--TAGAAC--GTGCTC-AGACTGGAAT--  42

seq1  CTGTCTCTCTCTGTCTCTTCTAGGCCTCCATTTCCTAAACTACATCTGAA  100
        ||| ||||| ||||||     |||||    |||| ||||||||| || 
seq2  -CGTC-CTCTC-GTCTCT----AGCCTC---ATCCT-AACTACATC-GA-  79

seq1  TTCATGTAAACCTTCGATAATCTTTAAAGTCCCACTACCCTGTCCAGGCA  150
       |||| |||||  |||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||
seq2  -TCAT-TAAAC--TCGATAATCTT--AAGTCCCACTA-CCTGTCCA-GCA  121

seq1  GTACTAATTCTGTCATGTACCTTACACTATTGTTGCT-AAATATTAACCT  199
      |||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| 
seq2  GTACTAATCCTTTCATGTA-CTTACACTA-TGTTGCTAAAATATTAACC-  168

seq1  TGGAGGAAGTCAAAATTATCACCTCATATAGGATGGCAATTAGTACAGTA  249
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGGAAGTCAAAATTATCAACTCATATAGGATGGCAATTAGTACAGTA  218

seq1  TTCCATTATATTACTATATTTCATAAAGTAGTGACTATGTTGTGTTCTTC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCATTATATTACTATATTTCATAAAGTAGTGACTATGTTGTGTTCTTC  268

seq1  CTGGGGGTTTTGTGAGCAGGATATCTCTCAAGAGACACATGCAGATATTT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGGGTTTTGTGAGCAGGATATCTCTCAAGAGACACATGCAGATATTT  318

seq1  ACTTAGCAGACCAAAATAAACACTCTGAAGAGAGATTGGAGTAGGCTGCC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTAGCAGACCAAAATAAACACTCTGAAGAGAGATTGGAGTAGGCTGCC  368

seq1  CCCTAAATAGAGAACAACACAGTAAAATCTGTATTTTTTATGAGTATGAC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTAAATAGAGAACAACACAGTAAAATCTGTATTTTTTATGAGTATGAC  418

seq1  TTGTGTATGGCAACCCTTTTCCTCTGAATTATAGTAGAGAAGATCTCCCT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGTATGGCAACCCTTTTCCTCTGAATTATAGTAGAGAAGATCTCCCT  468

seq1  TTGATGATATTTGTCCCCATGATCTCCACAGAAAGGGAAGGTATCAAAAC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATGATATTTGTCCCCATGATCTCCACAGAAAGGGAAGGTATCAAAAC  518

seq1  CACAATGCAAGTGATATAATGTAGATGTCAGCTCCTCTGAGGATGCACAT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAATGCAAGTGATATAATGTAGATGTCAGCTCCTCTGAGGATGCACAT  568

seq1  GGGGAGATGAATGCCCTGCTGCCTTGACTTATGATATGCTAAGAACAGGA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGAGATGAATGCCCTGCTGCCTTGACTTATGATATGCTAAGAACAGGA  618

seq1  TATCTATAGCCTCAAGGATGCTTTAAGGAAAGACTCAGATGCAGCTTTCC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTATAGCCTCAAGGATGCTTTAAGGAAAGACTCAGATGCAGCTTTCC  668

seq1  TCATATCGACTTTCTTGTATAGTTGGTATCAGTGGGAGTACACTTTTTTC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATATCGACTTTCTTGTATAGTTGGTATCAGTGGGAGTACACTTTTTTC  718

seq1  TCCTAGGAACAAAGGAACATAAAAAAGAGCAGGAAACCAGAACATTACAA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTAGGAACAAAGGAACATAAAAAAGAGCAGGAAACCAGAACATTACAA  768

seq1  GACTTTGTTTCCATAATTAAAAAAACAGTCCTCCAGGACCAAGACTGAAA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTTGTTTCCATAATTAAAAAAACAGTCCTCCAGGACCAAGACTGAAA  818

seq1  TGGATTGTGAGCAACTGAAGTCAGTCCTAAAATATGGTCATGGTCTCTTC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATTGTGAGCAACTGAAGTCAGTCCTAAAATATGGTCATGGTCTCTTC  868

seq1  TAGATAGCCACCAATACCTATGCAGTCATGTTCAGTGGAAGACGCACGTA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATAGCCACCAATACCTATGCAGTCATGTTCAGTGGAAGACGCACGTA  918

seq1  CTGAGACTAAGGAGACTGAGGCAATGTCACATGATGTCACATCATGAAAA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGACTAAGGAGACTGAGGCAATGTCACATGATGTCACATCATGAAAA  968

seq1  ATACCAGTTCAACTTCAGTTCCCTTCCTCCAGCGCATCCTGATAGTTTAC  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCAGTTCAACTTCAGTTCCCTTCCTCCAGCGCATCCTGATAGTTTAC  1018

seq1  AGCTCCCTGCTAATTGGCAGTAAGGATGGTATTCTACTCACCATTCTGGT  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCCCTGCTAATTGGCAGTAAGGATGGTATTCTACTCACCATTCTGGT  1068

seq1  GCTAGAGCCTCGAACACAGAGAACCAGGCCGTTAGTTAACACTGTAAAGA  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGAGCCTCGAACACAGAGAACCAGGCCGTTAGTTAACACTGTAAAGA  1118

seq1  ATTC  1153
      ||||
seq2  ATTC  1122

seq1: chr12_26729666_26730573
seq2: B6Ng01-010F14.g_256_1140

seq1  GATCATCACTCCCTAAATCTCTATATCTCCTTTAATATCTTTCTGACAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCATCACTCCCTAAATCTCTATATCTCCTTTAATATCTTTCTGACAAG  50

seq1  CTGGCTCATGGTGAAGCTGTCTCTTTTTTTGTAGGTCAGTAAAGCACCTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCTCATGGTGAAGCTGTCTCTTTTTTTGTAGGTCAGTAAAGCACCTC  100

seq1  ATATAATTCATATTACATCCTTATATTTTGCATACTTGAGAAATTATATA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAATTCATATTACATCCTTATATTTTGCATACTTGAGAAATTATATA  150

seq1  TTTTAACTTGTGTTTTTAGAGTTCTTTCTCACAGCCTTAAGGGCTGTCTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAACTTGTGTTTTTAGAGTTCTTTCTCACAGCCTTAAGGGCTGTCTT  200

seq1  GAAGGTCACAGCATTTACCATTTTGCTAAGGACATTAGACACACCTTTGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGTCACAGCATTTACCATTTTGCTAAGGACATTAGACACACCTTTGC  250

seq1  CTCCTGGACTCAGACTTTTGCTGCCTTTAATTATCATAGTCATTAACCTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTGGACTCAGACTTTTGCTGCCTTTAATTATCATAGTCATTAACCTT  300

seq1  CACAGGAAGAACATCCCCCCATAATGAACATCTCTCAAAGGAGGAACATC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGGAAGAACATCCCCCCATAATGAACATCTCTCAAAGGAGGAACATC  350

seq1  AAGTAAATTATGTATATTGTTGTATAAACAAGTCCCATGCCCACTGCTAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTAAATTATGTATATTGTTGTATAAACAAGTCCCATGCCCACTGCTAC  400

seq1  CGTTAGCATTTGTGGAGATTCTTGCCCTGCTAGCTCTGCCCCAAGGGCAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTTAGCATTTGTGGAGATTCTTGCCCTGCTAGCTCTGCCCCAAGGGCAG  450

seq1  GAACTGTGTCACATTGACCCTTCTGCATGACCATGCAGAACTTGCCACTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTGTGTCACATTGACCCTTCTGCATGACCATGCAGAACTTGCCACTT  500

seq1  TTACTCACTGAGCTATCTCACTTATGAAACTTCCATAAAGTAGAAACAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTCACTGAGCTATCTCACTTATGAAACTTCCATAAAGTAGAAACAAA  550

seq1  AAAGCATGGGTGAAGTGATTATTTACAAACCACTTTAAAAAGTAAAGGTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCATGGGTGAAGTGATTATTTACAAACCACTTTAAAAAGTAAAGGTC  600

seq1  GTGAATTGAAAAGTAATTGAAGAGTGAGAGTCTCTCAAGGCTGACTCACA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAATTGAAAAGTAATTGAAGAGTGAGAGTCTCTCAAGGCTGACTCACA  650

seq1  TGCTACATTCTGCCCATGGTGCAATAGGATGTGAGATCAAGATTTTGGCA  700
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTACATTCTGCCCATGGTGC-ATAGGATGTGAGATCAAGATTTTGGCA  699

seq1  CCCTGGCCATATGCATCTGAAATCCACACCTACCACTAACTTTCTCAAGT  750
      ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGGCCATATGCATCTG-AATCCACA-CTACCACTAACTTTCTCAAGT  747

seq1  GTTAGTTACTAATTGGGCTTTCAACATCCAATTGAGGTACAGGTCAAGTT  800
      | ||| |||||  ||||  |||||||||  | ||| ||||||||| ||||
seq2  G-TAG-TACTA--TGGGGCTTCAACATC--AATGA-GTACAGGTC-AGTT  789

seq1  CATTGCCAAACTTCTCTGCTTGAAGACTGTGACACAAAGCTGGGTTAGAG  850
      || ||||  ||||||||   || ||||||||||||||||||||| |||||
seq2  CA-TGCC--ACTTCTCTTGCTG-AGACTGTGACACAAAGCTGGG-TAGAG  834

seq1  CTATGTAAAGCCCTAGTCTAAAATGGCAAGGAGGTTTTTTTATGATGGGC  900
      |||||||||| |||||||| |||||   | |||   |||||||||| | |
seq2  CTATGTAAAG-CCTAGTCT-AAATG--CATGAG---TTTTTATGATTGAC  877

seq1  CATGTGAG  908
      ||||||||
seq2  CATGTGAG  885