BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-053H08
Chromosome12 (Build37)
Map Location 26,350,452 - 26,505,988
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100042974, LOC668726
Upstream geneCys1, Rrm2, LOC668719, Mboat2, EG629397, C330002I19Rik, Id2, LOC100042973
Downstream geneRnf144, Rsad2, Tyki, LOC668731, 1700020D12Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-053H08.bB6Ng01-053H08.g
ACCDH876499DH876500
length1,168836
definitionDH876499|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-053H08, 5' end.DH876500|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-053H08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(26,504,817 - 26,505,988)(26,350,452 - 26,351,287)
sequence
gaattccactctcctcctgcctgcctttggagagctataaagctctcaga
tgtagtgttctcaggctcctctagcactagtgtctgtctgcactctgcca
tgcttcctgccataatgataatggactaaacctctgaagctgtatctagc
ctcaggtaaatgtctacctctataagagttgccttggtcatagtgtctct
tcacagcaatagaaaccctaactaaccaatgggtcttttgaaaatgaaat
gcaggcagatcattcacctattaacaatttgatctgggatttctcatcac
tattagaagtggacctaaattctttagcatggcttacaggatctcagagg
tagggtgcctagaatacttgaaaaagaaaaaagaactagatctcctatag
gaacatttgaccctattgatttttaataaatatcacctaaagaatttcat
aggaaagtatccatctaaacacaatagtttggtccataaatctaacatga
ggagaaaatgccgttaccataagaaataaattgtttcccactgaaattgg
cttgcctatctgaactgctggaaggccagttcttgtttaaggagcaagat
cccatcagcaacaaatggagtgatgctggtgcggagtatgctatagaatc
ttctggtatcttcattacaatggagaaaaccagggactactggaagggta
aatctaaaatagccatcttctttgccccttctactgattcccctactaat
tcccccatgtttgtgatgggtgtgaaccatgacagaagtatgaaaattta
ctcgagattgtcagcaatgcttcctgaagcatcaagagggtacaaactca
tgatgctaatgacagctttagcattgttcacaaattcatgaccacagtcc
atgacatcactgccacacacaagactgtcgatgacccatctgggaagctt
gtggaatgatgactatgagtgatggcttggggcttcccagaacatcatac
ctgatccactgggtaccaccaaggctgtagcaagccatccaaagctgaac
agatgctcactagcacagatttccatgttcatctcactaaatctgctgtg
gaatcctatgtgctgcctaagaaagctatcgagacaatgacatctcagga
aggttggtgacaggcatc
gaattctttggtcccaagccacagcggatgacccaccaagagacctgtac
ctgtcagattgcaggcactattgtggatgagcccatctttccagattggc
tgcagccgggagtgctgcttagagaggaatggacagcggctgcccagaac
agatgctatattggaaagcagcctctcttattgcctaaagttgccagagc
tccactgggcaccagagttgagccacagcaaacacaagctaggggctgtg
aaccccttataggtaaccagatgtgcagggaatggcagatcaaaggctgc
tctccagatgtcccctgctgagggtgagcagctggtgcagaagtgtcccc
tttggcaacttctgggactctgtgccactgctggctcaggaggtggctgg
caggaaaggctccagaagagacattaaagggaaatttgggcctcagtgtg
atgctaaactgacagctctatgaactacctaacatttcatcaatgctgtt
tgtaatatgacggaagatgatggttattctgctatgatgcacctcagcat
atgtcccccatgtgtggcttctggtcagtgccaggacaggagtcattttg
ttaccatagcttcccaaccaggatgtaaaatctcccataccccatacctt
ccactcctatttggaacgggaatgtgggctttggctttgctccagtttct
tgatccttccttccaagttctcaccctctaacacaacttgaaactcaaaa
ttacgggcagcagaactgggctgctgaatccaaagacagttaaaagtgtg
tttgagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_26504817_26505988
seq2: B6Ng01-053H08.b_45_1212 (reverse)

seq1  GATGCCTGTCACC-ACCTTCTT--GATGTCATTGTACTCGATAGCTTTCT  47
      ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||
seq2  GATGCCTGTCACCAACCTTCCTGAGATGTCATTGT-CTCGATAGCTTTCT  49

seq1  CTAGGCAGCACATAGGA-TCCACAGCAGATATAGTGAGGATGGAAACATG  96
       |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||  ||||||
seq2  -TAGGCAGCACATAGGATTCCACAGCAGATTTAGTGA-GATG--AACATG  95

seq1  GAAATCTGTGCTAGTGAGCATCCTGTTCAGCTTTGGGATGGCCTTGCCTA  146
      ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||
seq2  GAAATCTGTGCTAGTGAGCAT-CTGTTCAGCTTT-GGATGG-CTTG-CTA  141

seq1  CAGCCTTGGTGGTA-CCAGTGGATTCAGGTATGATGTTCTGGGAAGCCCC  195
      |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCTTGGTGGTACCCAGTGGA-TCAGGTATGATGTTCTGGGAAGCCCC  190

seq1  AAGCCATCACTCATAGTCATCATTCCAC-AGCTTCCCAGATGGGTCATCG  244
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCATCACTCATAGTCATCATTCCACAAGCTTCCCAGATGGGTCATCG  240

seq1  ACAGTCTTGTGTGTGGCAGTGATGTCATGGACTGTGGTCATGAATTTGTG  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTCTTGTGTGTGGCAGTGATGTCATGGACTGTGGTCATGAATTTGTG  290

seq1  AACAATGCTAAAGCTGTCATTAGCATCATGAGTTTGTACCCTCTTGATGC  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAATGCTAAAGCTGTCATTAGCATCATGAGTTTGTACCCTCTTGATGC  340

seq1  TTCAGGAAGCATTGCTGACAATCTCGAGTAAATTTTCATACTTCTGTCAT  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGGAAGCATTGCTGACAATCTCGAGTAAATTTTCATACTTCTGTCAT  390

seq1  GGTTCACACCCATCACAAACATGGGGGAATTAGTAGGGGAATCAGTAGAA  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCACACCCATCACAAACATGGGGGAATTAGTAGGGGAATCAGTAGAA  440

seq1  GGGGCAAAGAAGATGGCTATTTTAGATTTACCCTTCCAGTAGTCCCTGGT  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGCAAAGAAGATGGCTATTTTAGATTTACCCTTCCAGTAGTCCCTGGT  490

seq1  TTTCTCCATTGTAATGAAGATACCAGAAGATTCTATAGCATACTCCGCAC  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTCCATTGTAATGAAGATACCAGAAGATTCTATAGCATACTCCGCAC  540

seq1  CAGCATCACTCCATTTGTTGCTGATGGGATCTTGCTCCTTAAACAAGAAC  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCATCACTCCATTTGTTGCTGATGGGATCTTGCTCCTTAAACAAGAAC  590

seq1  TGGCCTTCCAGCAGTTCAGATAGGCAAGCCAATTTCAGTGGGAAACAATT  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCTTCCAGCAGTTCAGATAGGCAAGCCAATTTCAGTGGGAAACAATT  640

seq1  TATTTCTTATGGTAACGGCATTTTCTCCTCATGTTAGATTTATGGACCAA  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTCTTATGGTAACGGCATTTTCTCCTCATGTTAGATTTATGGACCAA  690

seq1  ACTATTGTGTTTAGATGGATACTTTCCTATGAAATTCTTTAGGTGATATT  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATTGTGTTTAGATGGATACTTTCCTATGAAATTCTTTAGGTGATATT  740

seq1  TATTAAAAATCAATAGGGTCAAATGTTCCTATAGGAGATCTAGTTCTTTT  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTAAAAATCAATAGGGTCAAATGTTCCTATAGGAGATCTAGTTCTTTT  790

seq1  TTCTTTTTCAAGTATTCTAGGCACCCTACCTCTGAGATCCTGTAAGCCAT  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTTTCAAGTATTCTAGGCACCCTACCTCTGAGATCCTGTAAGCCAT  840

seq1  GCTAAAGAATTTAGGTCCACTTCTAATAGTGATGAGAAATCCCAGATCAA  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAAAGAATTTAGGTCCACTTCTAATAGTGATGAGAAATCCCAGATCAA  890

seq1  ATTGTTAATAGGTGAATGATCTGCCTGCATTTCATTTTCAAAAGACCCAT  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTTAATAGGTGAATGATCTGCCTGCATTTCATTTTCAAAAGACCCAT  940

seq1  TGGTTAGTTAGGGTTTCTATTGCTGTGAAGAGACACTATGACCAAGGCAA  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTAGTTAGGGTTTCTATTGCTGTGAAGAGACACTATGACCAAGGCAA  990

seq1  CTCTTATAGAGGTAGACATTTACCTGAGGCTAGATACAGCTTCAGAGGTT  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTATAGAGGTAGACATTTACCTGAGGCTAGATACAGCTTCAGAGGTT  1040

seq1  TAGTCCATTATCATTATGGCAGGAAGCATGGCAGAGTGCAGACAGACACT  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCCATTATCATTATGGCAGGAAGCATGGCAGAGTGCAGACAGACACT  1090

seq1  AGTGCTAGAGGAGCCTGAGAACACTACATCTGAGAGCTTTATAGCTCTCC  1144
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCTAGAGGAGCCTGAGAACACTACATCTGAGAGCTTTATAGCTCTCC  1140

seq1  AAAGGCAGGCAGGAGGAGAGTGGAATTC  1172
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGCAGGCAGGAGGAGAGTGGAATTC  1168

seq1: chr12_26350452_26351287
seq2: B6Ng01-053H08.g_70_905

seq1  GAATTCTTTGGTCCCAAGCCACAGCGGATGACCCACCAAGAGACCTGTAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTGGTCCCAAGCCACAGCGGATGACCCACCAAGAGACCTGTAC  50

seq1  CTGTCAGATTGCAGGCACTATTGTGGATGAGCCCATCTTTCCAGATTGGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCAGATTGCAGGCACTATTGTGGATGAGCCCATCTTTCCAGATTGGC  100

seq1  TGCAGCCGGGAGTGCTGCTTAGAGAGGAATGGACAGCGGCTGCCCAGAAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGCCGGGAGTGCTGCTTAGAGAGGAATGGACAGCGGCTGCCCAGAAC  150

seq1  AGATGCTATATTGGAAAGCAGCCTCTCTTATTGCCTAAAGTTGCCAGAGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGCTATATTGGAAAGCAGCCTCTCTTATTGCCTAAAGTTGCCAGAGC  200

seq1  TCCACTGGGCACCAGAGTTGAGCCACAGCAAACACAAGCTAGGGGCTGTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACTGGGCACCAGAGTTGAGCCACAGCAAACACAAGCTAGGGGCTGTG  250

seq1  AACCCCTTATAGGTAACCAGATGTGCAGGGAATGGCAGATCAAAGGCTGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCCTTATAGGTAACCAGATGTGCAGGGAATGGCAGATCAAAGGCTGC  300

seq1  TCTCCAGATGTCCCCTGCTGAGGGTGAGCAGCTGGTGCAGAAGTGTCCCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCAGATGTCCCCTGCTGAGGGTGAGCAGCTGGTGCAGAAGTGTCCCC  350

seq1  TTTGGCAACTTCTGGGACTCTGTGCCACTGCTGGCTCAGGAGGTGGCTGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGCAACTTCTGGGACTCTGTGCCACTGCTGGCTCAGGAGGTGGCTGG  400

seq1  CAGGAAAGGCTCCAGAAGAGACATTAAAGGGAAATTTGGGCCTCAGTGTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAAAGGCTCCAGAAGAGACATTAAAGGGAAATTTGGGCCTCAGTGTG  450

seq1  ATGCTAAACTGACAGCTCTATGAACTACCTAACATTTCATCAATGCTGTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTAAACTGACAGCTCTATGAACTACCTAACATTTCATCAATGCTGTT  500

seq1  TGTAATATGACGGAAGATGATGGTTATTCTGCTATGATGCACCTCAGCAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAATATGACGGAAGATGATGGTTATTCTGCTATGATGCACCTCAGCAT  550

seq1  ATGTCCCCCATGTGTGGCTTCTGGTCAGTGCCAGGACAGGAGTCATTTTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCCCCCATGTGTGGCTTCTGGTCAGTGCCAGGACAGGAGTCATTTTG  600

seq1  TTACCATAGCTTCCCAACCAGGATGTAAAATCTCCCATACCCCATACCTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACCATAGCTTCCCAACCAGGATGTAAAATCTCCCATACCCCATACCTT  650

seq1  CCACTCCTATTTGGAACGGGAATGTGGGCTTTGGCTTTGCTCCAGTTTCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTCCTATTTGGAACGGGAATGTGGGCTTTGGCTTTGCTCCAGTTTCT  700

seq1  TGATCCTTCCTTCCAAGTTCTCACCCTCTAACACAACTTGAAACTCAAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATCCTTCCTTCCAAGTTCTCACCCTCTAACACAACTTGAAACTCAAAA  750

seq1  TTACGGGCAGCAGAACTGGGCTGCTGAATCCAAAGACAGTTAAAAGTGTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACGGGCAGCAGAACTGGGCTGCTGAATCCAAAGACAGTTAAAAGTGTG  800

seq1  TTTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  836
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  TTTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCG  836