BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-055B08
Chromosome12 (Build37)
Map Location 32,791,169 - 32,929,032
singlet/doubletdoublet
Overlap genePik3cg
Upstream geneLOC668781, LOC100043065, LOC100043514, EG629667, LOC100043068, Lamb1-1, Dld, LOC668786, Slc26a3, Cbll1, Slc26a4, LOC100043531, Bcap29, Dus4l, LOC100043081, Gpr22, Hbp1, Prkar2b
Downstream gene2010109K11Rik, LOC100043548, Pbef1, LOC100043553, 4933406C10Rik, Sypl, LOC100043109, 1110049B09Rik, Atxn7l4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-055B08.bB6Ng01-055B08.g
ACCDH877644DH877645
length8431,035
definitionDH877644|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-055B08, 5' end.DH877645|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-055B08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(32,928,192 - 32,929,032)(32,791,169 - 32,792,211)
sequence
gaattcctccttcaaacattagtgctggtatctcaatgagaagtgagcga
taaagagaaagaaatgaaaatttttcaaaaatccactcttcagtgctatt
gctggtgttggcttgggcaggggtgttcagtatgtcccatgtgtaaaagg
ggcagagtgtgatatatataagggtggggccatgtctgttcagtgtgtca
catatacagggtggggacatgtctattcagtgtgtgacatatgtaagggt
ggggccaagtcttttcagagtgtcacaaatgtaagggtggggccatgtct
gttcagtgtgtcacatttgcaatggtgtgggcatgtcttttcagggtgtc
acatatgtaagggtgggggcgtgtctgttcagtgtgtgacatatgcaagg
atgtgggcatatctgttcagtgtgtgaccattgtaaaggtgtggacatgt
ctgttcagtgtgtcacaaatataagggtgtggccatgtctgttcagtgtg
tgacatatgcaagggtgtggccatgcctgttcagtgtatcacatatgcag
gttggggacatgcctattcagtgggtgacatatgtaagggtggggccagg
tatgttcagtgtatcacatatgttagggtggagccatgtctattcagtgt
gtcacaaatgttaggaggtgggaaggcctgttcagtgtgtcacatatgta
agagtggggccatgtctattcaatctgtcacatatgtaagtgtgtaggca
tgtctgtttcagtgtgtgacatatgtaaagggtgggtccatgtctgttca
atgtgtgacaaatgtaaggttgtggtcgtgtctgttcagtgtg
gaattcttttttcaagtgactggttgtgttaagcatgggggaaaggctct
gaaaaacgacagttaacaaaagttcttatatattttttagtgccaacaca
ttccagatttgaaggcttaggcaagattatttccctggtcaagtctgggt
tctgcgattggcctaaacttccaggaatggcaaaaagtaaataaaatata
aaataaaataaaatcaataatcagaccatgtgagagagagttccagaaag
gggtttgtactggctggttttgggtgtcaacttgacacaggctggagtta
tcacacagaaagaagcctcagttgaggaaatgtctccacgagatccagct
ataaggcattttctcatctagtgatcaagggggaaaggccccttgtgagt
gggaccatctctgggctggtagtcttgggttctataagagagcaggctga
gcaagccagtaaagaacatccctccatggcctctgcatcagctcctgctt
tctgacctgcttgagttccagtcctgacttcctttggtgatgaacagcag
tgtggaagtgtaagccgaataaaccctttcctccccagcttgcttcttgg
tcctgatgtttgtgcaggaatagaaaccctgactaagacagggttcttca
gattctccgcaaatactactgagtccagggtcttgaggccaggaagtgaa
tagatggctctgctgttgtctattatattcacgcatgaaagattctattt
agagtttcatctcccagatggtaatagccctaaactcatattctgggcat
tcaagttttacaacccagtaggcatagagagaccagatgaagttatgtca
gagacatacaagtcagttttgtagctcctaaggtttagcagaattgttac
ctggtgcttcctatggcaaaaggctgctaatactggcttgacagctaagg
attctactccatttccattgccactgcagctatgtccgagtacgtgatgt
gaggctatagccagcgtgtctgtcctagaccttaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_32928192_32929032
seq2: B6Ng01-055B08.b_46_888 (reverse)

seq1  CACACTGAACAGACACGCCCACACCCTTACATTTGTCACACATTGAACAG  50
      ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACTGAACAGACACGACCACAACCTTACATTTGTCACACATTGAACAG  50

seq1  ACATGGGCCCACCC-TTACATATGTCACACACTG-AACAGACATGCCTAC  98
      |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  ACATGGACCCACCCTTTACATATGTCACACACTGAAACAGACATGCCTAC  100

seq1  ACACTTACATATGTGACAGATTGAATAGACATGGCCCCACTCTTACATAT  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTTACATATGTGACAGATTGAATAGACATGGCCCCACTCTTACATAT  150

seq1  GTGACACACTGAACAGGCCTTCCCACCTCCTAACATTTGTGACACACTGA  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACACACTGAACAGGCCTTCCCACCTCCTAACATTTGTGACACACTGA  200

seq1  ATAGACATGGCTCCACCCTAACATATGTGATACACTGAACATACCTGGCC  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGACATGGCTCCACCCTAACATATGTGATACACTGAACATACCTGGCC  250

seq1  CCACCCTTACATATGTCACCCACTGAATAGGCATGTCCCCAACCTGCATA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCCTTACATATGTCACCCACTGAATAGGCATGTCCCCAACCTGCATA  300

seq1  TGTGATACACTGAACAGGCATGGCCACACCCTTGCATATGTCACACACTG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGATACACTGAACAGGCATGGCCACACCCTTGCATATGTCACACACTG  350

seq1  AACAGACATGGCCACACCCTTATATTTGTGACACACTGAACAGACATGTC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGACATGGCCACACCCTTATATTTGTGACACACTGAACAGACATGTC  400

seq1  CACACCTTTACAATGGTCACACACTGAACAGATATGCCCACATCCTTGCA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACCTTTACAATGGTCACACACTGAACAGATATGCCCACATCCTTGCA  450

seq1  TATGTCACACACTGAACAGACACGCCCCCACCCTTACATATGTGACACCC  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTCACACACTGAACAGACACGCCCCCACCCTTACATATGTGACACCC  500

seq1  TGAAAAGACATGCCCACACCATTGCAAATGTGACACACTGAACAGACATG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAAGACATGCCCACACCATTGCAAATGTGACACACTGAACAGACATG  550

seq1  GCCCCACCCTTACATTTGTGACACTCTGAAAAGACTTGGCCCCACCCTTA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCACCCTTACATTTGTGACACTCTGAAAAGACTTGGCCCCACCCTTA  600

seq1  CATATGTCACACACTGAATAGACATGTCCCCACCCTGTATATGTGACACA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATGTCACACACTGAATAGACATGTCCCCACCCTGTATATGTGACACA  650

seq1  CTGAACAGACATGGCCCCACCCTTATATATATCACACTCTGCCCCTTTTA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAACAGACATGGCCCCACCCTTATATATATCACACTCTGCCCCTTTTA  700

seq1  CACATGGGACATACTGAACACCCCTGCCCAAGCCAACACCAGCAATAGCA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATGGGACATACTGAACACCCCTGCCCAAGCCAACACCAGCAATAGCA  750

seq1  CTGAAGAGTGGATTTTTGAAAAATTTTCATTTCTTTCTCTTTATCGCTCA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAGAGTGGATTTTTGAAAAATTTTCATTTCTTTCTCTTTATCGCTCA  800

seq1  CTTCTCATTGAGATACCAGCACTAATGTTTGAAGGAGGAATTC  841
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTCATTGAGATACCAGCACTAATGTTTGAAGGAGGAATTC  843

seq1: chr12_32791169_32792211
seq2: B6Ng01-055B08.g_69_1103

seq1  GAATTCTTTTTTCAAGTGACTGGTTGTGTTAAGCATGGGGGAAAGGCTCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTTTTCAAGTGACTGGTTGTGTTAAGCATGGGGGAAAGGCTCT  50

seq1  GAAAAACGACAGTTAACAAAAGTTCTTATATATTTTTTAGTGCCAACACA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAACGACAGTTAACAAAAGTTCTTATATATTTTTTAGTGCCAACACA  100

seq1  TTCCAGATTTGAAGGCTTAGGCAAGATTATTTCCCTGGTCAAGTCTGGGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGATTTGAAGGCTTAGGCAAGATTATTTCCCTGGTCAAGTCTGGGT  150

seq1  TCTGCGATTGGCCTAAACTTCCAGGAATGGCAAAAAGTAAATAAAATATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCGATTGGCCTAAACTTCCAGGAATGGCAAAAAGTAAATAAAATATA  200

seq1  AAATAAAATAAAATCAATAATCAGACCATGTGAGAGAGAGTTCCAGAAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAAAATAAAATCAATAATCAGACCATGTGAGAGAGAGTTCCAGAAAG  250

seq1  GGGTTTGTACTGGCTGGTTTTGGGTGTCAACTTGACACAGGCTGGAGTTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTTGTACTGGCTGGTTTTGGGTGTCAACTTGACACAGGCTGGAGTTA  300

seq1  TCACACAGAAAGAAGCCTCAGTTGAGGAAATGTCTCCACGAGATCCAGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACACAGAAAGAAGCCTCAGTTGAGGAAATGTCTCCACGAGATCCAGCT  350

seq1  ATAAGGCATTTTCTCATCTAGTGATCAAGGGGGAAAGGCCCCTTGTGAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGGCATTTTCTCATCTAGTGATCAAGGGGGAAAGGCCCCTTGTGAGT  400

seq1  GGGACCATCTCTGGGCTGGTAGTCTTGGGTTCTATAAGAGAGCAGGCTGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACCATCTCTGGGCTGGTAGTCTTGGGTTCTATAAGAGAGCAGGCTGA  450

seq1  GCAAGCCAGTAAAGAACATCCCTCCATGGCCTCTGCATCAGCTCCTGCTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGCCAGTAAAGAACATCCCTCCATGGCCTCTGCATCAGCTCCTGCTT  500

seq1  TCTGACCTGCTTGAGTTCCAGTCCTGACTTCCTTTGGTGATGAACAGCAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGACCTGCTTGAGTTCCAGTCCTGACTTCCTTTGGTGATGAACAGCAG  550

seq1  TGTGGAAGTGTAAGCCGAATAAACCCTTTCCTCCCCAGCTTGCTTCTTGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGAAGTGTAAGCCGAATAAACCCTTTCCTCCCCAGCTTGCTTCTTGG  600

seq1  TCCTGATGTTTGTGCAGGAATAGAAACCCTGACTAAGACAGGGTTCTTCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGATGTTTGTGCAGGAATAGAAACCCTGACTAAGACAGGGTTCTTCA  650

seq1  GATTCTCCGCAAATACTACTGAGTCCAGGGTCTTGAGGCCAGGAAGTGAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCTCCGCAAATACTACTGAGTCCAGGGTCTTGAGGCCAGGAAGTGAA  700

seq1  TAGATGGCTCTGCTGTTGTCTATTATATTCACGCATGAAAGATTCTATTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATGGCTCTGCTGTTGTCTATTATATTCACGCATGAAAGATTCTATTT  750

seq1  AGAGTTTCATCTCCCAGATGGTAATAGCCCTAAACTCATATTCTGGGCAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTTTCATCTCCCAGATGGTAATAGCCCTAAACTCATATTCTGGGCAT  800

seq1  TCAAGTTTTACAACCCAGTAGGCATAGAGAGACCAGATGAAGTTATGTCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGTTTTACAACCCAGTAGGCATAGAGAGACCAGATGAAGTTATGTCA  850

seq1  GAGACATACAAGTCAGTTTTGTAGCTCCTAAGG-TTAGCAGAATTGTTTA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||
seq2  GAGACATACAAGTCAGTTTTGTAGCTCCTAAGGTTTAGCAGAATTG-TTA  899

seq1  CCTGGTGCTTTCCTATGGCAAAAAGGCTGCTAATACTGGCTTGACAAGCT  949
      |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  CCTGGTGC-TTCCTATGGC-AAAAGGCTGCTAATACTGGCTTGAC-AGCT  946

seq1  AAGGATTCTAACTTCCATTTCCAATTGCCACTGCAGCTATGTCCGAGTAC  999
      ||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGATTCTA--CTCCATTTCC-ATTGCCACTGCAGCTATGTCCGAGTAC  993

seq1  GTGATGTGAGGGCTATAGCCAAGCGTGTCTGTCCTAGACCTTAA  1043
      ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATGTGA-GGCTATAGCC-AGCGTGTCTGTCCTAGACCTTAA  1035