BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-070E07
Chromosome12 (Build37)
Map Location 110,097,180 - 110,304,744
singlet/doubletdoublet
Overlap geneWars, Wdr25, BM948371
Upstream geneBcl11b, Setd3, Ccnk, EG668158, 1600002O04Rik, Cyp46a1, Eml1, Evl, Degs2, LOC668164, Yy1, Slc25a29, AI132487
Downstream geneLOC668194, Dlk1, Gtl2, Rtl1, 6430411K18Rik, B830012L14Rik, LOC100040715, LOC100040724, LOC675987, LOC100041509, LOC100040746
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-070E07.bB6Ng01-070E07.g
ACCDH888323DH888324
length1,177859
definitionDH888323|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-070E07, 5' end.DH888324|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-070E07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(110,097,180 - 110,098,375)(110,303,886 - 110,304,744)
sequence
gaattctctgaaccatttggtactggacactattccaggctgccccatta
aatagcctgcataactttcagggagctcagagagaccacaggtttttggc
gaatgtggcagtggatgttgcagacttgaggctaccttcactctgaggag
cagcagccttgggcatcacctttgtatttttacatggaggagatggagct
cgcaggaggacaagtgactcacccagttgtggctgacgggggatgggatg
gcctgggccctcattcctccctgggcccaggatcccacctaagccatcag
acgacagcaatgtctttctcacctccacactagaacgttccatgggtgca
atggtgcttcaatgtcagggcattatttgagtggcattggtcatcttgga
ccacagcaagagagcaaggcaatcctctctctgtttggccacctttggcc
acacccaggtaggtgaggtgttggcctgggaagtgtggtcagtctaatgg
gagggggccacctccacgccacactttgacactctcaggctctgagtcca
agagcttggcttcccagggtgcaaatcttagtgttctcaggattaagcca
gaacagactgctcagcagtaaactcactgtctggccttggacaggtcatg
tctgcctgactgcagacgaggacaggtggatagggtgaagcagcttccat
tatggccgggtctcaccgcaccgctggctcaggcctgcgctgcccactac
agaatctgagtacccagctggctgcaaatggtacgtcacacgcacacact
ctcctcaggctgtgagactgtcaaacaaggtggaacagccatctcaagga
gcaggggggcttcttaagacaagtggccccacacaatgatccctaagagc
ctggctctaaacaccatggaattctaagcatcccaattttcctaagtgct
gccccccccccccgccaaagggacagctacacacctagagaaagtgtagt
ggggaggcctttacagtccacattcctctggggcctggttggtcgaacag
agagcaaaaggagctcaacaagtttatgttttttctaaaaatagtatcag
gacagaaacttgaatgtgcctgtgcgttctgtaggacgacatttaacagg
cctctctgaagtacgcttctgcttttc
gaattccccacagcttccaggagaagacccacaggctaagctgggggaga
tgaagttagcactgggttagcaggaagaggcttgcagggagtgagaaggc
gtgagtctgagaaccacaaaaagcatcctgcagaaatgttcagtcaaagg
ccagggcagcccttccagtttaagactctgatggtcagagctgcaaactg
tgttggtccacagttgtcccagggtcccctctcacctcccatcctgcctc
agaactcgtcatgtgactaatggagaactttggacagggtttgaagccct
aggttccagtctctgttctgggctgatttgctgtgtgacctctacagagc
ctggtgtcagaggtcaagcccctaggacagcctgaggagtgactcagagc
agtccccagcaggtgactggtgactggcagctggatggtgctatccctgt
tgggtcagtcttaggaatgggcagatgggtgaatgggttgaggcatcctc
tctgctcaccttgcatagtttctttggacgcacactatcacttaggcaaa
ccagccttcaggagctcatggtctaacgagagatgtagatcctagccagc
atagcagggaatgggaaggtatttctatgtcctactaatcaagaagaggc
caacaaatgagcctgggagtcagcatggtgcttcagagggaatctccttc
aggaatgcagcagctatccagccctaggctgagccagtgagctgaagttg
tgtccgatcaacaagctttgaactacgttgggaaatggggtaagaagaga
agtgaagagaccataggtcatacgttggtgcatgctgagatggaggggag
gggagatgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_110097180_110098375
seq2: B6Ng01-070E07.b_41_1217

seq1  GAATTCTCTGAACCATTTGGTACTGGACACTATTCCAGGCTGCCCCATTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTGAACCATTTGGTACTGGACACTATTCCAGGCTGCCCCATTA  50

seq1  AATAGCCTGCATAACTTTCAGGGAGCTCAGAGAGACCACAGGTTTTTGGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGCCTGCATAACTTTCAGGGAGCTCAGAGAGACCACAGGTTTTTGGC  100

seq1  GAATGTGGCAGTGGATGTTGCAGACTTGAGGCTACCTTCACTCTGAGGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGTGGCAGTGGATGTTGCAGACTTGAGGCTACCTTCACTCTGAGGAG  150

seq1  CAGCAGCCTTGGGCATCACCTTTGTATTTTTACATGGAGGAGATGGAGCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAGCCTTGGGCATCACCTTTGTATTTTTACATGGAGGAGATGGAGCT  200

seq1  CGCAGGAGGACAAGTGACTCACCCAGTTGTGGCTGACGGGGGATGGGATG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCAGGAGGACAAGTGACTCACCCAGTTGTGGCTGACGGGGGATGGGATG  250

seq1  GCCTGGGCCCTCATTCCTCCCTGGGCCCAGGATCCCACCTAAGCCATCAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGGGCCCTCATTCCTCCCTGGGCCCAGGATCCCACCTAAGCCATCAG  300

seq1  ACGACAGCAATGTCTTTCTCACCTCCACACTAGAACGTTCCATGGGTGCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGACAGCAATGTCTTTCTCACCTCCACACTAGAACGTTCCATGGGTGCA  350

seq1  ATGGTGCTTCAATGTCAGGGCATTATTTGAGTGGCATTGGTCATCTTGGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTGCTTCAATGTCAGGGCATTATTTGAGTGGCATTGGTCATCTTGGA  400

seq1  CCACAGCAAGAGAGCAAGGCAATCCTCTCTCTGTTTGGCCACCTTTGGCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAGCAAGAGAGCAAGGCAATCCTCTCTCTGTTTGGCCACCTTTGGCC  450

seq1  ACACCCAGGTAGGTGAGGTGTTGGCCTGGGAAGTGTGGTCAGTCTAATGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCCAGGTAGGTGAGGTGTTGGCCTGGGAAGTGTGGTCAGTCTAATGG  500

seq1  GAGGGGGCCACCTCCACGCCACACTTTGACACTCTCAGGCTCTGAGTCCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGGGCCACCTCCACGCCACACTTTGACACTCTCAGGCTCTGAGTCCA  550

seq1  AGAGCTTGGCTTCCCAGGGTGCAAATCTTAGTGTTCTCAGGATTAAGCCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCTTGGCTTCCCAGGGTGCAAATCTTAGTGTTCTCAGGATTAAGCCA  600

seq1  GAACAGACTGCTCAGCAGTAAACTCACTGTCTGGCCTTGGACAGGTCATG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAGACTGCTCAGCAGTAAACTCACTGTCTGGCCTTGGACAGGTCATG  650

seq1  TCTGCCTGACTGCAGACGAGGACAGGTGGATAGGGTGAAGCAGCTTCCAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCCTGACTGCAGACGAGGACAGGTGGATAGGGTGAAGCAGCTTCCAT  700

seq1  TATGGCCGGGTCTCACCGCACCGCTGGCTCAGGCCTGCGCTGCCCACTAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGCCGGGTCTCACCGCACCGCTGGCTCAGGCCTGCGCTGCCCACTAC  750

seq1  AGAATCTGAGTACCCAGCTGGCTGCAAATGGTACGTCACACGCACACACT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATCTGAGTACCCAGCTGGCTGCAAATGGTACGTCACACGCACACACT  800

seq1  CTCCTCAGGCTGTGAGACTGTCAAACAAGGTGGAACAGCCATCTCAGGGA  850
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  CTCCTCAGGCTGTGAGACTGTCAAACAAGGTGGAACAGCCATCTCAAGGA  850

seq1  GCAGGGGGGCTTCTTAGGACAAGTGGCCCCACACAATGATCCCTAGGAGC  900
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  GCAGGGGGGCTTCTTAAGACAAGTGGCCCCACACAATGATCCCTAAGAGC  900

seq1  CTGCCTCTAAGCACCATGGGATTTCACAGC-TCCCAATTTTCCTAAGTGC  949
      ||| |||||| |||||| ||| |||  ||| |||||||||||||||||||
seq2  CTGGCTCTAAACACCAT-GGAATTCTAAGCATCCCAATTTTCCTAAGTGC  949

seq1  TGCCCCCCACCCCCCGCCAATGGGAACAGCTACAGCCTTAGCAGTAGGTG  999
      |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||  | ||| || | |||
seq2  TGCCCCCC-CCCCCCGCCAAAGGG-ACAGCTACACACCTAG-AGAAAGTG  996

seq1  TAGTGCGTAGGCCTTTAGCAAGTCCACGTTCCTCTGTGGCCTGCTTGGTC  1049
      ||||| | |||||||||   ||||||| |||||||| |||||| ||||||
seq2  TAGTGGGGAGGCCTTTA--CAGTCCACATTCCTCTGGGGCCTGGTTGGTC  1044

seq1  AGACAGTGACAGACAGGAGCTCAACAAAGTTTATTGTTTTTTCCTAAAAA  1099
        |||| ||   | ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||
seq2  GAACAGAGAGCAAAAGGAGCTCAAC-AAGTTTA-TGTTTTTT-CTAAAAA  1091

seq1  TGATGCAAGGACAGAACACTCAGAGTGGCCCTTGTGCCTTCAGAGAGGAC  1149
      |  |   ||||||||| |||  || ||  || ||||| ||| |  |||||
seq2  TAGTATCAGGACAGAA-ACT-TGAATGTGCC-TGTGCGTTCTG-TAGGAC  1137

seq1  AGACACTTCAACCAGGGGCTTTCCCTGAGGTACGGCTTCTGCTTTTC  1196
       |||| ||  | ||||     || |||| |||| |||||||||||||
seq2  -GACATTT--AACAGG---CCTCTCTGAAGTAC-GCTTCTGCTTTTC  1177

seq1: chr12_110303886_110304744
seq2: B6Ng01-070E07.g_66_924 (reverse)

seq1  CCATCTCCCCTCCCCTCCATCTCAGCATGCACCAACGTATGACCTATGGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCTCCCCTCCCCTCCATCTCAGCATGCACCAACGTATGACCTATGGT  50

seq1  CTCTTCACTTCTCTTCTTACCCCATTTCCCAACCTAGTTCAAAGCTTGTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  CTCTTCACTTCTCTTCTTACCCCATTTCCCAACGTAGTTCAAAGCTTGTT  100

seq1  GATCGGACACAACTTCAGCTCACTGGCTCAGCCTAGGGCTGGATAGCTGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCGGACACAACTTCAGCTCACTGGCTCAGCCTAGGGCTGGATAGCTGC  150

seq1  TGCATTCCTGAAGGAGATTCCCTCTGAAGCACCATGCTGACTCCCAGGCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATTCCTGAAGGAGATTCCCTCTGAAGCACCATGCTGACTCCCAGGCT  200

seq1  CATTTGTTGGCCTCTTCTTGATTAGTAGGACATAGAAATACCTTCCCATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTGTTGGCCTCTTCTTGATTAGTAGGACATAGAAATACCTTCCCATT  250

seq1  CCCTGCTATGCTGGCTAGGATCTACATCTCTCGTTAGACCATGAGCTCCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGCTATGCTGGCTAGGATCTACATCTCTCGTTAGACCATGAGCTCCT  300

seq1  GAAGGCTGGTTTGCCTAAGTGATAGTGTGCGTCCAAAGAAACTATGCAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGCTGGTTTGCCTAAGTGATAGTGTGCGTCCAAAGAAACTATGCAAG  350

seq1  GTGAGCAGAGAGGATGCCTCAACCCATTCACCCATCTGCCCATTCCTAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGCAGAGAGGATGCCTCAACCCATTCACCCATCTGCCCATTCCTAAG  400

seq1  ACTGACCCAACAGGGATAGCACCATCCAGCTGCCAGTCACCAGTCACCTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGACCCAACAGGGATAGCACCATCCAGCTGCCAGTCACCAGTCACCTG  450

seq1  CTGGGGACTGCTCTGAGTCACTCCTCAGGCTGTCCTAGGGGCTTGACCTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGGACTGCTCTGAGTCACTCCTCAGGCTGTCCTAGGGGCTTGACCTC  500

seq1  TGACACCAGGCTCTGTAGAGGTCACACAGCAAATCAGCCCAGAACAGAGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACACCAGGCTCTGTAGAGGTCACACAGCAAATCAGCCCAGAACAGAGA  550

seq1  CTGGAACCTAGGGCTTCAAACCCTGTCCAAAGTTCTCCATTAGTCACATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAACCTAGGGCTTCAAACCCTGTCCAAAGTTCTCCATTAGTCACATG  600

seq1  ACGAGTTCTGAGGCAGGATGGGAGGTGAGAGGGGACCCTGGGACAACTGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGAGTTCTGAGGCAGGATGGGAGGTGAGAGGGGACCCTGGGACAACTGT  650

seq1  GGACCAACACAGTTTGCAGCTCTGACCATCAGAGTCTTAAACTGGAAGGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACCAACACAGTTTGCAGCTCTGACCATCAGAGTCTTAAACTGGAAGGG  700

seq1  CTGCCCTGGCCTTTGACTGAACATTTCTGCAGGATGCTTTTTGTGGTTCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCCTGGCCTTTGACTGAACATTTCTGCAGGATGCTTTTTGTGGTTCT  750

seq1  CAGACTCACGCCTTCTCACTCCCTGCAAGCCTCTTCCTGCTAACCCAGTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACTCACGCCTTCTCACTCCCTGCAAGCCTCTTCCTGCTAACCCAGTG  800

seq1  CTAACTTCATCTCCCCCAGCTTAGCCTGTGGGTCTTCTCCTGGAAGCTGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACTTCATCTCCCCCAGCTTAGCCTGTGGGTCTTCTCCTGGAAGCTGT  850

seq1  GGGGAATTC  859
      |||||||||
seq2  GGGGAATTC  859