BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-076M23
Chromosome12 (Build37)
Map Location 78,558,357 - 78,695,159
singlet/doubletdoublet
Overlap geneFut8
Upstream genePlekhg3, Spnb1, Churc1, Gpx2, Rab15, Fntb, Max, LOC100041765, LOC100041772
Downstream geneLOC230765, LOC666659, EG626215, Gphn
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-076M23.bB6Ng01-076M23.g
ACCDH892966DH892967
length1,1311,084
definitionDH892966|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-076M23, 5' end.DH892967|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-076M23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(78,694,042 - 78,695,159)(78,558,357 - 78,559,431)
sequence
gaattcatcacgtatgcactcttctctatacccatatagattttcctgtg
cattcatgtccatatgtttgccttcttacccagcacagacactaatttta
catgtattagcagtgaagggatgacacagactggttgccatgtgggacaa
ggcaaggaataaagtcttacctcataggactgccaagatataggaagtca
gtggttaacaaacttggagcgctgatggacagtcccaaacgtgaaagtgc
catagtgatgtcatcaggaaatctacccaaacatccttgacattcaagaa
acaagccaatcaaagaccctcacgacactttcacgaacgtggctagatcc
agaacatatttagatgtgtctccatccagaatgtgtttacttactgtccc
agataagacgggtggattttttttccagcgtctcaaccctttcctctgtg
gtccccttacgccactggtgctgtgtagcttatgctttcagagaaccttt
aaattgtttgacccacaggataccttccaatgcgatcgtaagatacagat
ctcttttttctctttcttcgcttagcccttaatcccagacctttcataaa
acaaacacctaatagacatcgcctgacaggcttggtgtaacctcaaaggt
atcggcatgatgtcaatcttgcattgcgcggcgctctgtgaagagaacat
gaagagagaggggctgaggttggaaactttcctgtaaaaccactgcagca
ctcactgatgaccctatagtttgccttttgatatatttttgctctgacaa
tattatgtagtatatatcatgtttgtgtctattaaggtctagcttatggt
atttatgtgtcacatatgaatacattttaatcatgctattggggtgtagt
tactcttccagttggtgaattcaagatctacccatttcaaaattgccccc
atcccaaggagtcacaagacacattttggctagaaggccaaagacaacgt
gtactcaggaaaggacaagaacagtttctcacccaaggacctcaagagct
atggaaagccacttgttcccaaggatggttctcccaatggtgaggttcga
aaaaaacgtgggcagcccttggtaaatatgg
gaattcacattgtaggtacatgccagctttataattgttgtaacctctta
agaacagttttagctgagaggagtataggtgctgctgctttgtttaggtc
tcctttggcttagaccacacctttattcaatgtccaatgatgatgtataa
acaccatgtttaatgactcaactgtatacccactgtgtgaatctgctgtt
gatggcttgagctagcattttccgaatactggattgttaggttattttca
gtgttttactactataaatagtgatacaaagtatgtctaaaaattcttat
attatttcctcaagctgggtttccagactttgaactatttacataaaagg
atataaacattttacagcattgatccagtcccacacatgacatttttatg
ctgagcaaccactatagtacaggtagcaatatctcctttactgtgaaaat
agtaaaacctgaattttctttttccttagcacctctgacccctccctata
gtggtccaggaagcagttttctctgtgttctactataaaatcagtggtag
cattttatgtatattttacctctttggaaatcttttcagtttagtttccc
aagtcattgctaatatattaaccaggagtttaactgccatctctcttcat
tcttttacttaaatattttccattctgaattaactctctttagacctctt
gtgatgggttttgctatataagcaaattataaaacctttactattctttt
ttataagcaaccaaaagcattcatttaccctgcaacaggtatatcatgtc
caaggtaatatcgaaagaatgttctactttaagaagagttaaatgaaaat
ttaaatttaaatgatgcacagacttcactcaagaaagaagggaagccttt
ttctaggtagtttatctgaagaggatgtcaagatgagcattacctgtcta
gctctatgtgcaggtgtgcagttaatcctctgtcacttggcataacccct
tcatgtttcttttaggtggagacagagttccatctatgaaaaatcttagc
cactggcttcccaggaaactggtagcagaccatt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_78694042_78695159
seq2: B6Ng01-076M23.b_42_1172 (reverse)

seq1  CCATATT----ACAGGCTGCCACAGTTTTCT--GAACCTCAC--ATGGTA  42
      |||||||    |  |||||||   ||||| |  |||||||||   ||| |
seq2  CCATATTTACCAAGGGCTGCCCACGTTTTTTTCGAACCTCACCATTGGGA  50

seq1  G-ACCATCCCTGGGGACAAGTGGCTTTCCAT-GCTC-TGA-GTCC-TGGG  87
      | ||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||
seq2  GAACCATCCTTGGGAACAAGTGGCTTTCCATAGCTCTTGAGGTCCTTGGG  100

seq1  TGAGAAACTGTTCTTGTCCTTTCTTGAGTACACG-TGTCTTTTGGCCTCT  136
      ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | | |||
seq2  TGAGAAACTGTTCTTGTCCTTTCCTGAGTACACGTTGTCTTTGGCCTTCT  150

seq1  AGCCAAAATGTGTCTTTGTGACTCCTTGGGATGGGGGCAATTTTGAAATG  186
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAAAATGTGTC-TTGTGACTCCTTGGGATGGGGGCAATTTTGAAATG  199

seq1  GGTAGATCTTGAATTCACCACCTGGAAGAGTAACTACACCCCAATAGCAT  236
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAGATCTTGAATTCACCAACTGGAAGAGTAACTACACCCCAATAGCAT  249

seq1  GATTAAAATGTATTCATATGTGACACATAAATACCATAAGCTAGACCTTA  286
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTAAAATGTATTCATATGTGACACATAAATACCATAAGCTAGACCTTA  299

seq1  ATAGACACAAACATGATATATACTACATAATATTGTCAGAGCAAAAATAT  336
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGACACAAACATGATATATACTACATAATATTGTCAGAGCAAAAATAT  349

seq1  ATCAAAAGGCAAACTATAGGGTCATCAGTGAGTGCTGCAGTGGTTTTACA  386
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAAAGGCAAACTATAGGGTCATCAGTGAGTGCTGCAGTGGTTTTACA  399

seq1  GGAAAGTTTCCAACCTCAGCCCCTCTCTCTTCATGTTCTCTTCACAGAGC  436
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAGTTTCCAACCTCAGCCCCTCTCTCTTCATGTTCTCTTCACAGAGC  449

seq1  GCCGCGCAATGCAAGATTGACATCATGCCGATACCTTTGAGGTTACACCA  486
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCGCGCAATGCAAGATTGACATCATGCCGATACCTTTGAGGTTACACCA  499

seq1  AGCCTGTCAGGCGATGTCTATTAGGTGTTTGTTTTATGAAAGGTCTGGGA  536
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTGTCAGGCGATGTCTATTAGGTGTTTGTTTTATGAAAGGTCTGGGA  549

seq1  TTAAGGGCTAAGCGAAGAAAGAGAAAAAAGAGATCTGTATCTTACGATCG  586
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGGGCTAAGCGAAGAAAGAGAAAAAAGAGATCTGTATCTTACGATCG  599

seq1  CATTGGAAGGTATCCTGTGGGTCAAACAATTTAAAGGTTCTCTGAAAGCA  636
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGGAAGGTATCCTGTGGGTCAAACAATTTAAAGGTTCTCTGAAAGCA  649

seq1  TAAGCTACACAGCACCAGTGGCGTAAGGGGACCACAGAGGAAAGGGTTGA  686
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGCTACACAGCACCAGTGGCGTAAGGGGACCACAGAGGAAAGGGTTGA  699

seq1  GACGCTGGAAAAAAAATCCACCCGTCTTATCTGGGACAGTAAGTAAACAC  736
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACGCTGGAAAAAAAATCCACCCGTCTTATCTGGGACAGTAAGTAAACAC  749

seq1  ATTCTGGATGGAGACACATCTAAATATGTTCTGGATCTAGCCACGTTCGT  786
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTGGATGGAGACACATCTAAATATGTTCTGGATCTAGCCACGTTCGT  799

seq1  GAAAGTGTCGTGAGGGTCTTTGATTGGCTTGTTTCTTGAATGTCAAGGAT  836
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGTGTCGTGAGGGTCTTTGATTGGCTTGTTTCTTGAATGTCAAGGAT  849

seq1  GTTTGGGTAGATTTCCTGATGACATCACTATGGCACTTTCACGTTTGGGA  886
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGGGTAGATTTCCTGATGACATCACTATGGCACTTTCACGTTTGGGA  899

seq1  CTGTCCATCAGCGCTCCAAGTTTGTTAACCACTGACTTCCTATATCTTGG  936
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCCATCAGCGCTCCAAGTTTGTTAACCACTGACTTCCTATATCTTGG  949

seq1  CAGTCCTATGAGGTAAGACTTTATTCCTTGCCTTGTCCCACATGGCAACC  986
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCCTATGAGGTAAGACTTTATTCCTTGCCTTGTCCCACATGGCAACC  999

seq1  AGTCTGTGTCATCCCTTCACTGCTAATACATGTAAAATTAGTGTCTGTGC  1036
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTGTGTCATCCCTTCACTGCTAATACATGTAAAATTAGTGTCTGTGC  1049

seq1  TGGGTAAGAAGGCAAACATATGGACATGAATGCACAGGAAAATCTATATG  1086
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTAAGAAGGCAAACATATGGACATGAATGCACAGGAAAATCTATATG  1099

seq1  GGTATAGAGAAGAGTGCATACGTGATGAATTC  1118
      ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTATAGAGAAGAGTGCATACGTGATGAATTC  1131

seq1: chr12_78558357_78559431
seq2: B6Ng01-076M23.g_71_1154

seq1  GAATTCACATTGTAGGTACATGCCAGCTTTATAATTGTTGTAACCTCTTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACATTGTAGGTACATGCCAGCTTTATAATTGTTGTAACCTCTTA  50

seq1  AGAACAGTTTTAGCTGAGAGGAGTATAGGTGCTGCTGCTTTGTTTAGGTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACAGTTTTAGCTGAGAGGAGTATAGGTGCTGCTGCTTTGTTTAGGTC  100

seq1  TCCTTTGGCTTAGACCACACCTTTATTCAATGTCCAATGATGATGTATAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTTGGCTTAGACCACACCTTTATTCAATGTCCAATGATGATGTATAA  150

seq1  ACACCATGTTTAATGACTCAACTGTATACCCACTGTGTGAATCTGCTGTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCATGTTTAATGACTCAACTGTATACCCACTGTGTGAATCTGCTGTT  200

seq1  GATGGCTTGAGCTAGCATTTTCCGAATACTGGATTGTTAGGTTATTTTCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGCTTGAGCTAGCATTTTCCGAATACTGGATTGTTAGGTTATTTTCA  250

seq1  GTGTTTTACTACTATAAATAGTGATACAAAGTATGTCTAAAAATTCTTAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTTTACTACTATAAATAGTGATACAAAGTATGTCTAAAAATTCTTAT  300

seq1  ATTATTTCCTCAAGCTGGGTTTCCAGACTTTGAACTATTTACATAAAAGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATTTCCTCAAGCTGGGTTTCCAGACTTTGAACTATTTACATAAAAGG  350

seq1  ATATAAACATTTTACAGCATTGATCCAGTCCCACACATGACATTTTTATG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAAACATTTTACAGCATTGATCCAGTCCCACACATGACATTTTTATG  400

seq1  CTGAGCAACCACTATAGTACAGGTAGCAATATCTCCTTTACTGTGAAAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGCAACCACTATAGTACAGGTAGCAATATCTCCTTTACTGTGAAAAT  450

seq1  AGTAAAACCTGAATTTTCTTTTTCCTTAGCACCTCTGACCCCTCCCTATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAAAACCTGAATTTTCTTTTTCCTTAGCACCTCTGACCCCTCCCTATA  500

seq1  GTGGTCCAGGAAGCAGTTTTCTCTGTGTTCTACTATAAAATCAGTGGTAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTCCAGGAAGCAGTTTTCTCTGTGTTCTACTATAAAATCAGTGGTAG  550

seq1  CATTTTATGTATATTTTACCTCTTTGGAAATCTTTTCAGTTTAGTTTCCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTTATGTATATTTTACCTCTTTGGAAATCTTTTCAGTTTAGTTTCCC  600

seq1  AAGTCATTGCTAATATATTAACCAGGAGTTTAACTGCCATCTCTCTTCAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCATTGCTAATATATTAACCAGGAGTTTAACTGCCATCTCTCTTCAT  650

seq1  TCTTTTACTTAAATATTTTCCATTCTGAATTAACTCTCTTTAGACCTCTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTTACTTAAATATTTTCCATTCTGAATTAACTCTCTTTAGACCTCTT  700

seq1  GTGATGGGTTTTGCTATATAAGCAAATTATAAAACCTTTACTATTCTTTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATGGGTTTTGCTATATAAGCAAATTATAAAACCTTTACTATTCTTTT  750

seq1  TTATAAGCAACCAAAAGCATTCATTTACCCTGCAACAGGTATATCATGTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAAGCAACCAAAAGCATTCATTTACCCTGCAACAGGTATATCATGTC  800

seq1  CAAGGTAATATCGAAAGAATGTTCTACTTTAAGAAGAGTTAAATGAAAAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGTAATATCGAAAGAATGTTCTACTTTAAGAAGAGTTAAATGAAAAT  850

seq1  TTAAATTTAAATGATGCACAGACTTCACTCAAGAAAGAAGGGAAGCCTTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAATTTAAATGATGCACAGACTTCACTCAAGAAAGAAGGGAAGCCTTT  900

seq1  TTCTAGGTAGTTTATCTGAAGAGGATGTCAAGATGAGCATTACCTGTCTA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAGGTAGTTTATCTGAAGAGGATGTCAAGATGAGCATTACCTGTCTA  950

seq1  GCTCTATGTGCAGGTGTGCAGTTAATCCTCTGTCACTTGGCATAA-CACT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||
seq2  GCTCTATGTGCAGGTGTGCAGTTAATCCTCTGTCACTTGGCATAACCCCT  1000

seq1  TCATGTTTC-TTTAGGTGGAGACAGAGTT-CATCTATG--AGATCTTAG-  1044
      ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||| 
seq2  TCATGTTTCTTTTAGGTGGAGACAGAGTTCCATCTATGAAAAATCTTAGC  1050

seq1  CACTGGCTTCCCAGG-AACT-GTAGCAG-CCATT  1075
      ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||
seq2  CACTGGCTTCCCAGGAAACTGGTAGCAGACCATT  1084