BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-091F14
Chromosome12 (Build37)
Map Location 32,731,331 - 32,908,089
singlet/doubletdoublet
Overlap genePrkar2b, Pik3cg
Upstream gene9030611O19Rik, LOC668781, LOC100043065, LOC100043514, EG629667, LOC100043068, Lamb1-1, Dld, LOC668786, Slc26a3, Cbll1, Slc26a4, LOC100043531, Bcap29, Dus4l, LOC100043081, Gpr22, Hbp1
Downstream gene2010109K11Rik, LOC100043548, Pbef1, LOC100043553, 4933406C10Rik, Sypl, LOC100043109, 1110049B09Rik, Atxn7l4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-091F14.bB6Ng01-091F14.g
ACCDH903396DH903397
length1,1231,161
definitionDH903396|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-091F14, 5' end.DH903397|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-091F14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(32,731,331 - 32,732,459)(32,906,926 - 32,908,089)
sequence
gaattcagcgcacaaaccagtagggctatgacaatggcctcctcctaaag
gtagtcagagaacatcctcaaacaatgaagatgtcgctgccgctccagcc
ttaaaccaaggaagcctttcaactgctccatcacagcacaccatgtcacc
tcctccagagcaaacagctagctaaaggcctctggcatcctgtgctgtct
tcttcttcacactaactcctcagcttgtccctggtcagtgtggttaccaa
tccctagcacatatgcatacacgttagaaagagtaaatctagatgaactg
tgctgatgaaaaagtatggacaggaggtgctccctgagaggtgatgctcc
ctgagaggaggtgctccctgagaggagatgctccctgagaggagatgctc
cctgagaggaggtgctccctgagaggaggtgctccctgagaggaggtgct
ccctgagaggaggtgctccctgagaggagatgctccctgagaggagatgc
tccctgagaggagatgctccctgagaggtgctccttgagaggaggtgctc
cctgagaggtcctccctgacttctactgatttttttttccagacaaatga
aggcgataatcacaaagtattaagttggtgaaactgatatattacagtcc
tggttggaaacattcaatagatttaaaggtagcaaaaactgacaacgctt
tgattgcctttccctcaaatgtcaaaaaacattctcatgtatgctccatt
attatgaaaatggaatctgggttttggtctacaagacaaaaaaggaagga
aagaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggattgattgactttacaaaa
gacccatcacataatggcatttctcaattaaagaccagaaaacaggattc
caaccatccatgcttctgttttccttgagctgaagtaaaattaacattca
atggcgtgtgccatccaatgagctttgacaaatgtcctggtcatgtacat
gacatctcaatgcatgtaatcactttagcactgggcaggttctatgctgg
tagtcagtccctgccaccccacaggatcctctagataatgtctgcatacc
catctcacttacctgtctgggaa
gaattctcagggacaaagagctggacagttatgtgttctgactcctgcag
ggccttcctcagctgattggctctgaggggttctacagccctgcagctca
tgtggaaggaacctcagaggaaggaacaagttagggtccttgggtcacta
aggacactgactgccccagaatccattggagtcctcataggacctggact
tcactttcatgaaagtggtggttctaaagcctcaagtccccattctggat
cattctctggcctcgtgccacgtcttactctcacactcatcatccatggc
tttggtccaactgaagacaacaaccacgtccccggaccttctgaaacttt
agataaataagcctctttgtgaagtgatatagcctcaaatattttatcct
aacaatgaaaaacagatagaatgaccttagctgagaaagacccagtatcc
agcagagatgtctagatggagcagattcctatatacttccttaggtgttt
tggttcaggaaggttgagatgacacctgagaccaagagaattctgccata
acatgaacaaagatagatagttggaagcccctagcagatcccattctgtc
tccaactgagcccggaacgtcaagcttttccattaacacaggagaacctt
gggattgctgtcaggtatattgactaaggcttcctggagtccaggatgta
aggcagccacccttgacaaacctttgcacaactgacaaatataatactgc
aactgatttttcccttggatttttaacttaacacatacaattctaatgga
gcagtatatattatcactacacatacatatgttaaatcaggtacacatat
tcaattcctcaaatatttatcatcttttatgctgaaaacattcaaatgct
gcctctcctctttttgaaattcttttaatctataggcaactgccctttgc
tatgttccctattctgtatgactgtgatgtagtaccatggtaaatctacc
tctggccctgcagtcttcccagtttctggtgtatcaccatcctcatctac
acctcctggtgagaatcatgtgtggaagccacgtgtgagaatgctgccag
tatgggtcttttggtctcgcattttcctccaaccataatgaatttctcct
tctttatggtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_32731331_32732459
seq2: B6Ng01-091F14.b_48_1170

seq1  GAATTCAGCGCACAAACCAGTAGGGCTATGACAATGGCCTCCTCCTAAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGCGCACAAACCAGTAGGGCTATGACAATGGCCTCCTCCTAAAG  50

seq1  GTAGTCAGAGAACATCCTCAAACAATGAAGATGTCGCTGCCGCTCCAGCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGTCAGAGAACATCCTCAAACAATGAAGATGTCGCTGCCGCTCCAGCC  100

seq1  TTAAACCAAGGAAGCCTTTCAACTGCTCCATCACAGCACACCATGTCACC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAACCAAGGAAGCCTTTCAACTGCTCCATCACAGCACACCATGTCACC  150

seq1  TCCTCCAGAGCAAACAGCTAGCTAAAGGCCTCTGGCATCCTGTGCTGTCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCCAGAGCAAACAGCTAGCTAAAGGCCTCTGGCATCCTGTGCTGTCT  200

seq1  TCTTCTTCACACTAACTCCTCAGCTTGTCCCTGGTCAGTGTGGTTACCAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCTTCACACTAACTCCTCAGCTTGTCCCTGGTCAGTGTGGTTACCAA  250

seq1  TCCCTAGCACATATGCATACACGTTAGAAAGAGTAAATCTAGATGAACTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTAGCACATATGCATACACGTTAGAAAGAGTAAATCTAGATGAACTG  300

seq1  TGCTGATGAAAAAGTATGGACAGGAGGTGCTCCCTGAGAGGTGATGCTCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGATGAAAAAGTATGGACAGGAGGTGCTCCCTGAGAGGTGATGCTCC  350

seq1  CTGAGAGGAGGTGCTCCCTGAGAGGAGATGCTCCCTGAGAGGAGATGCTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGAGGAGGTGCTCCCTGAGAGGAGATGCTCCCTGAGAGGAGATGCTC  400

seq1  CCTGAGAGGAGGTGCTCCCTGAGAGGAGGTGCTCCCTGAGAGGAGGTGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAGAGGAGGTGCTCCCTGAGAGGAGGTGCTCCCTGAGAGGAGGTGCT  450

seq1  CCCTGAGAGGAGGTGCTCCCTGAGAGGAGATGCTCCCTGAGAGGAGATGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGAGAGGAGGTGCTCCCTGAGAGGAGATGCTCCCTGAGAGGAGATGC  500

seq1  TCCCTGAGAGGAGATGCTCCCTGAGAGGTGCTCCTTGAGAGGAGGTGCTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTGAGAGGAGATGCTCCCTGAGAGGTGCTCCTTGAGAGGAGGTGCTC  550

seq1  CCTGAGAGGTCCTCCCTGACTTCTACTGATTTTTTTTTCCAGACAAATGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAGAGGTCCTCCCTGACTTCTACTGATTTTTTTTTCCAGACAAATGA  600

seq1  AGGCGATAATCACAAAGTATTAAGTTGGTGAAACTGATATATTACAGTCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCGATAATCACAAAGTATTAAGTTGGTGAAACTGATATATTACAGTCC  650

seq1  TGGTTGGAAACATTCAATAGATTTAAAGGTAGCAAAAACTGACAACGCTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTGGAAACATTCAATAGATTTAAAGGTAGCAAAAACTGACAACGCTT  700

seq1  TGATTGCCTTTCCCTCAAATGTCAAAAAACATTCTCATGTATGCTCCATT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTGCCTTTCCCTCAAATGTCAAAAAACATTCTCATGTATGCTCCATT  750

seq1  ATTATGAAAATGGAATCTGGGTTTTGGTCTACAAGACAAAAAAGGAAGGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATGAAAATGGAATCTGGGTTTTGGTCTACAAGACAAAAAAGGAAGGA  800

seq1  AGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGATTGATTGACTTTACAAAA  850
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGATTGATTGACTTTACAAAA  850

seq1  GACCCATCACAATAATGGCATTTCTCAATTAAAGACCAGAAAACAGGATT  900
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCCATCAC-ATAATGGCATTTCTCAATTAAAGACCAGAAAACAGGATT  899

seq1  CCAACCATCCATGCTTCTGTTTTCCTTGAGCTGAAGTAAAATTAACATTC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACCATCCATGCTTCTGTTTTCCTTGAGCTGAAGTAAAATTAACATTC  949

seq1  AATGGCGTGTGCCATCCAATGAGCTTTGACAAATGTCCTGGGTCATGTAC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  AATGGCGTGTGCCATCCAATGAGCTTTGACAAATGTCCT-GGTCATGTAC  998

seq1  ATGACATCTCAATGCAATGTTAATCACTTTAGCACTGGGCAGTTTCTATG  1050
      ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  ATGACATCTCAATGC-ATG-TAATCACTTTAGCACTGGGCAGGTTCTATG  1046

seq1  CTGGTAGTCAGTCCCTGCCACCCCACAGGATCCTCTAGTATAATGTCTGC  1100
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  CTGGTAGTCAGTCCCTGCCACCCCACAGGATCCTCTAG-ATAATGTCTGC  1095

seq1  ATACCCATCTCACTTTACCTGTCTGGGAA  1129
      ||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  ATACCCATCTCAC-TTACCTGTCTGGGAA  1123

seq1: chr12_32906926_32908089
seq2: B6Ng01-091F14.g_70_1230 (reverse)

seq1  CACCATATATAGAAGTAGAAA-TCATTATGTTGAGTGAAATATGCCAGAC  49
      ||||  ||| ||||| ||||| |||||||| |  | | || |||| ||||
seq2  CACC--ATAAAGAAGGAGAAATTCATTATGGTTGGAGGAAAATGCGAGAC  48

seq1  ACAAAAGACACATACT-GCAGCA-TCTCACACGTGGGCTCTCAACACATT  97
       |||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||| || |||||| 
seq2  -CAAAAGACCCATACTGGCAGCATTCTCACACGT-GGCT-TCCACACATG  95

seq1  GATCTCA-CAGGA-GTGTAGATGAGGATGGTGATACACCAGAGACTGGGA  145
        ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  ATTCTCACCAGGAGGTGTAGATGAGGATGGTGATACACCAGAAACTGGGA  145

seq1  AGACTGCAGGGCCAAGGAGTAGATTTACCAATGGTTACTACATCACAGTC  195
      ||||||||||||| ||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||
seq2  AGACTGCAGGGCC-AGAGGTAGATTTACC-ATGG-TACTACATCACAGTC  192

seq1  ATACAGAATAGGGAACATAGCAAA-GGCAGTTGCCTATAGATTAAAAGAA  244
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACAGAATAGGGAACATAGCAAAGGGCAGTTGCCTATAGATTAAAAGAA  242

seq1  TTTCAAAAAGA-GAGAGGCAGCATTTTGAATGTTTTCAGCATAAAAGATG  293
      ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAAAAAGAGGAGAGGCAGCA-TTTGAATGTTTTCAGCATAAAAGATG  291

seq1  ATAAATATTTGAGGAATTGAATATGTGTAACCTGATTTAACATATGTATG  343
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATATTTGAGGAATTGAATATGTGT-ACCTGATTTAACATATGTATG  340

seq1  TGTAGTGATAATATATACTGCTCCATTAGAATTGTATGTGTTAAGTTAAA  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGTGATAATATATACTGCTCCATTAGAATTGTATGTGTTAAGTTAAA  390

seq1  AATCCAAGGGAAAAATCAGTTGCAGTATTATATTTGTCAGTTGTGCAAAG  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCCAAGGGAAAAATCAGTTGCAGTATTATATTTGTCAGTTGTGCAAAG  440

seq1  GTTTGTCAAGGGTGGCTGCCTTACATCCTGGACTCCAGGAAGCCTTAGTC  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGTCAAGGGTGGCTGCCTTACATCCTGGACTCCAGGAAGCCTTAGTC  490

seq1  AATATACCTGACAGCAATCCCAAGGTTCTCCTGTGTTAATGGAAAAGCTT  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATACCTGACAGCAATCCCAAGGTTCTCCTGTGTTAATGGAAAAGCTT  540

seq1  GACGTTCCGGGCTCAGTTGGAGACAGAATGGGATCTGCTAGGGGCTTCCA  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACGTTCCGGGCTCAGTTGGAGACAGAATGGGATCTGCTAGGGGCTTCCA  590

seq1  ACTATCTATCTTTGTTCATGTTATGGCAGAATTCTCTTGGTCTCAGGTGT  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATCTATCTTTGTTCATGTTATGGCAGAATTCTCTTGGTCTCAGGTGT  640

seq1  CATCTCAACCTTCCTGAACCAAAACACCTAAGGAAGTATATAGGAATCTG  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTCAACCTTCCTGAACCAAAACACCTAAGGAAGTATATAGGAATCTG  690

seq1  CTCCATCTAGACATCTCTGCTGGATACTGGGTCTTTCTCAGCTAAGGTCA  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCATCTAGACATCTCTGCTGGATACTGGGTCTTTCTCAGCTAAGGTCA  740

seq1  TTCTATCTGTTTTTCATTGTTAGGATAAAATATTTGAGGCTATATCACTT  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTATCTGTTTTTCATTGTTAGGATAAAATATTTGAGGCTATATCACTT  790

seq1  CACAAAGAGGCTTATTTATCTAAAGTTTCAGAAGGTCCGGGGACGTGGTT  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAAGAGGCTTATTTATCTAAAGTTTCAGAAGGTCCGGGGACGTGGTT  840

seq1  GTTGTCTTCAGTTGGACCAAAGCCATGGATGATGAGTGTGAGAGTAAGAC  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTCTTCAGTTGGACCAAAGCCATGGATGATGAGTGTGAGAGTAAGAC  890

seq1  GTGGCACGAGGCCAGAGAATGATCCAGAATGGGGACTTGAGGCTTTAGAA  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCACGAGGCCAGAGAATGATCCAGAATGGGGACTTGAGGCTTTAGAA  940

seq1  CCACCACTTTCATGAAAGTGAAGTCCAGGTCCTATGAGGACTCCAATGGA  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCACTTTCATGAAAGTGAAGTCCAGGTCCTATGAGGACTCCAATGGA  990

seq1  TTCTGGGGCAGTCAGTGTCCTTAGTGACCCAAGGACCCTAACTTGTTCCT  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGGGGCAGTCAGTGTCCTTAGTGACCCAAGGACCCTAACTTGTTCCT  1040

seq1  TCCTCTGAGGTTCCTTCCACATGAGCTGCAGGGCTGTAGAACCCCTCAGA  1093
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCTGAGGTTCCTTCCACATGAGCTGCAGGGCTGTAGAACCCCTCAGA  1090

seq1  GCCAATCAGCTGAGGAAGGCCCTGCAGGAGTCAGAACACATAACTGTCCA  1143
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAATCAGCTGAGGAAGGCCCTGCAGGAGTCAGAACACATAACTGTCCA  1140

seq1  GCTCTTTGTCCCTGAGAATTC  1164
      |||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTTTGTCCCTGAGAATTC  1161