BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-091O07
Chromosome12 (Build37)
Map Location 24,257,601 - 24,413,140
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC668697, LOC100042923, LOC677338
Upstream geneEG668669, EG668670, LOC668680, LOC100042895, LOC100043435, EG628081, LOC100042903, LOC100043440, EG668518, LOC100043445
Downstream geneEG668701, LOC668471, LOC668703, LOC546534, 9030624G23Rik, EG668710, LOC100042945, EG668711, EG668714, LOC629364, Taf1b, Grhl1, EG629383, Klf11, Cys1, Rrm2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-091O07.bB6Ng01-091O07.g
ACCDH903800DH903801
length796702
definitionDH903800|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-091O07, 5' end.DH903801|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-091O07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(24,257,601 - 24,258,396)(24,412,439 - 24,413,140)
sequence
gaattcagtggacaacttgtggaagctggttctcttttcctaccatgtgg
gtcttatggatcgaacccaggctgccaggcttggtagcaagcacctttac
ccacagagtcagcccactggaccaaatacagagatggtttagagcatgga
gcaggaaggatacagtgtgcacataagcatcgctcctgtgaagaactgac
tgctgactcatcctttactgtgtcgttctgatttctataggaagccctat
agacagctaatgtgtgtgtatgttatacatgtgtgtgcagatgaacactc
atctgtgcagaggccaaacaggaatcccggtgttcacaatattccctttt
ctctctcactgaacccggccggggcttaccattttagctagggtgcctgc
tcagcaagcttctgggactaacttgtcccctagttctagggtttcgggca
tgctcagccactcctgacttttccgtgggtgttgggatcagaactcaggt
cctcatgctgggcatcaagcgttcttcaacactgagccattttaccagtt
cttgctttgacaattcttaatcacctatctgagcctcagatctcattaga
gcttaaaaaaaagacacattttatagaattgtgtgaataaaccttatgga
tgagctcagctggggcctgatgtccagcaagcaatcaatagatgcttggc
ttttatcgttactctctgcaaagacatgcagtcctttagtacaccaggta
gcaagtgggcagaggaatgacctggtgtatggggttggggatgggg
gaattccagggccactccatgctagaaactgggtcctccttagcatctcc
ttctacgtccatttaaaacaatgattctcaactttcctaatgctgtgacc
ctttaattcagcgaggagatgacagccccttcaggtcttggggatgagca
gaaatcagtgccagaggaccaaaggaggaagaaaattctatcgtgctcag
ggctgcatggaaaaggaatggaggtcagagagccacagtccagagatgca
attacactgcacaagtacttagaactgactgttcactatgtttgtctcca
gccttgaaaggcaactctgttaacaatggtgttcatgttcaaggtgtggt
taatccattattcctgcactagctgtcagagcatggaagctaaggccagg
actgtacaaggcttccatttggagtttcagctgatacctgctagtggaga
tctcccaggcccagaaagacagacatggcagatagtcctgagttagcctc
caagttctgaatggaaccctgctcagctcactgtgggacctggaggagag
atgcccagtctgacctggaatgttcatacaggttgcctgaagctggtaag
gggagttatggagcttaggctgcaagcagggacacctgcagaagaacaag
aagggtaatatagaggcaagatgatcagtggcaagggaggggaggggagg
gg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_24257601_24258396
seq2: B6Ng01-091O07.b_46_841

seq1  GAATTCAGTGGACAACTTGTGGAAGCTGGTTCTCTTTTCCTACCATGTGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTGGACAACTTGTGGAAGCTGGTTCTCTTTTCCTACCATGTGG  50

seq1  GTCTTATGGATCGAACCCAGGCTGCCAGGCTTGGTAGCAAGCACCTTTAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTATGGATCGAACCCAGGCTGCCAGGCTTGGTAGCAAGCACCTTTAC  100

seq1  CCACAGAGTCAGCCCACTGGACCAAATACAGAGATGGTTTAGAGCATGGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAGAGTCAGCCCACTGGACCAAATACAGAGATGGTTTAGAGCATGGA  150

seq1  GCAGGAAGGATACAGTGTGCACATAAGCATCGCTCCTGTGAAGAACTGAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGAAGGATACAGTGTGCACATAAGCATCGCTCCTGTGAAGAACTGAC  200

seq1  TGCTGACTCATCCTTTACTGTGTCGTTCTGATTTCTATAGGAAGCCCTAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGACTCATCCTTTACTGTGTCGTTCTGATTTCTATAGGAAGCCCTAT  250

seq1  AGACAGCTAATGTGTGTGTATGTTATACATGTGTGTGCAGATGAACACTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAGCTAATGTGTGTGTATGTTATACATGTGTGTGCAGATGAACACTC  300

seq1  ATCTGTGCAGAGGCCAAACAGGAATCCCGGTGTTCACAATATTCCCTTTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGTGCAGAGGCCAAACAGGAATCCCGGTGTTCACAATATTCCCTTTT  350

seq1  CTCTCTCACTGAACCCGGCCGGGGCTTACCATTTTAGCTAGGGTGCCTGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTCACTGAACCCGGCCGGGGCTTACCATTTTAGCTAGGGTGCCTGC  400

seq1  TCAGCAAGCTTCTGGGACTAACTTGTCCCCTAGTTCTAGGGTTTCGGGCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCAAGCTTCTGGGACTAACTTGTCCCCTAGTTCTAGGGTTTCGGGCA  450

seq1  TGCTCAGCCACTCCTGACTTTTCCGTGGGTGTTGGGATCAGAACTCAGGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCAGCCACTCCTGACTTTTCCGTGGGTGTTGGGATCAGAACTCAGGT  500

seq1  CCTCATGCTGGGCATCAAGCGTTCTTCAACACTGAGCCATTTTACCAGTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCATGCTGGGCATCAAGCGTTCTTCAACACTGAGCCATTTTACCAGTT  550

seq1  CTTGCTTTGACAATTCTTAATCACCTATCTGAGCCTCAGATCTCATTAGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCTTTGACAATTCTTAATCACCTATCTGAGCCTCAGATCTCATTAGA  600

seq1  GCTTAAAAAAAAGACACATTTTATAGAATTGTGTGAATAAACCTTATGGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTAAAAAAAAGACACATTTTATAGAATTGTGTGAATAAACCTTATGGA  650

seq1  TGAGCTCAGCTGGGGCCTGATGTCCAGCAAGCAATCAATAGATGCTTGGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCTCAGCTGGGGCCTGATGTCCAGCAAGCAATCAATAGATGCTTGGC  700

seq1  TTTTATCGTTACTCTCTGCAAAGACATGCAGTCCTTTAGTACACCAGGTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATCGTTACTCTCTGCAAAGACATGCAGTCCTTTAGTACACCAGGTA  750

seq1  GCAAGTGGGCAGAGGAATGACCTGGTGTATGGGGTTGGGGATGGGG  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGTGGGCAGAGGAATGACCTGGTGTATGGGGTTGGGGATGGGG  796

seq1: chr12_24412439_24413140
seq2: B6Ng01-091O07.g_68_769 (reverse)

seq1  CCCCTCCCCTCCCCTCCCTTGCCACTGATCATCTTGCCTCTATATTACCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTCCCCTCCCCTCCCTTGCCACTGATCATCTTGCCTCTATATTACCC  50

seq1  TTCTTGTTCTTCTGCAGGTGTCCCTGCTTGCAGCCTAAGCTCCATAACTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTGTTCTTCTGCAGGTGTCCCTGCTTGCAGCCTAAGCTCCATAACTC  100

seq1  CCCTTACCAGCTTCAGGCAACCTGTATGAACATTCCAGGTCAGACTGGGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTACCAGCTTCAGGCAACCTGTATGAACATTCCAGGTCAGACTGGGC  150

seq1  ATCTCTCCTCCAGGTCCCACAGTGAGCTGAGCAGGGTTCCATTCAGAACT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCTCCTCCAGGTCCCACAGTGAGCTGAGCAGGGTTCCATTCAGAACT  200

seq1  TGGAGGCTAACTCAGGACTATCTGCCATGTCTGTCTTTCTGGGCCTGGGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGGCTAACTCAGGACTATCTGCCATGTCTGTCTTTCTGGGCCTGGGA  250

seq1  GATCTCCACTAGCAGGTATCAGCTGAAACTCCAAATGGAAGCCTTGTACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTCCACTAGCAGGTATCAGCTGAAACTCCAAATGGAAGCCTTGTACA  300

seq1  GTCCTGGCCTTAGCTTCCATGCTCTGACAGCTAGTGCAGGAATAATGGAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTGGCCTTAGCTTCCATGCTCTGACAGCTAGTGCAGGAATAATGGAT  350

seq1  TAACCACACCTTGAACATGAACACCATTGTTAACAGAGTTGCCTTTCAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACCACACCTTGAACATGAACACCATTGTTAACAGAGTTGCCTTTCAAG  400

seq1  GCTGGAGACAAACATAGTGAACAGTCAGTTCTAAGTACTTGTGCAGTGTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGAGACAAACATAGTGAACAGTCAGTTCTAAGTACTTGTGCAGTGTA  450

seq1  ATTGCATCTCTGGACTGTGGCTCTCTGACCTCCATTCCTTTTCCATGCAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCATCTCTGGACTGTGGCTCTCTGACCTCCATTCCTTTTCCATGCAG  500

seq1  CCCTGAGCACGATAGAATTTTCTTCCTCCTTTGGTCCTCTGGCACTGATT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGAGCACGATAGAATTTTCTTCCTCCTTTGGTCCTCTGGCACTGATT  550

seq1  TCTGCTCATCCCCAAGACCTGAAGGGGCTGTCATCTCCTCGCTGAATTAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCTCATCCCCAAGACCTGAAGGGGCTGTCATCTCCTCGCTGAATTAA  600

seq1  AGGGTCACAGCATTAGGAAAGTTGAGAATCATTGTTTTAAATGGACGTAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTCACAGCATTAGGAAAGTTGAGAATCATTGTTTTAAATGGACGTAG  650

seq1  AAGGAGATGCTAAGGAGGACCCAGTTTCTAGCATGGAGTGGCCCTGGAAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAGATGCTAAGGAGGACCCAGTTTCTAGCATGGAGTGGCCCTGGAAT  700

seq1  TC  702
      ||
seq2  TC  702