BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-098O22
Chromosome12 (Build37)
Map Location 120,775,541 - 120,888,332
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC668632
Upstream geneLOC668611, EG668615, LOC620665, Sp8, Abcb5, Itgb8, EG627557, LOC100043011, 4732474O15Rik
Downstream geneLOC668633, Gm528, LOC100043017
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-098O22.bB6Ng01-098O22.g
ACCDH908869DH908870
length993987
definitionDH908869|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-098O22, 5' end.DH908870|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-098O22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(120,887,364 - 120,888,332)(120,775,541 - 120,776,391)
sequence
gaattccaaagtgctttcatgggttgaataattggtactgaaaggtgaag
tggacgtttctggttatgtcctgtgatgcagactcttgtggtgttttgct
gaggcagactcatgagatgttttgctaaggcaagacatacctgatgtttg
tagagactatgagctggactcaacggacagtgacagggtgctcgcatagt
tagatttgcaatgcttcattgatcttgcatcttcactgatctttactttg
ttgagagagacatggcaaaagtttgtcatatcatgctgccgttgctgatt
catgtttgatatcctgacactactaaacttgactgctggtatcctgacaa
aaggttattggaatcacccaaaagaactaattctaaacaggtccatgacc
ccttgttctatttgcaattctttcttccctacctttggacggtgtgctag
aagttgagtagaagtatttgagaacccttaactagaagtaggttttggaa
aatctcagcctacagaaagggttattatgtgtcaatagcctccacataag
agactttccttgccacttctagctttgagagggtgttgtcttcatttgac
aaacatgaaagtatctttaaacattggtttcttcatccgttgtttatata
cccttcttttctcttctgtggtcaaatcatcctctttgtaatgatacttg
agatttacacttaaagagcacaatagaaataaacaataacttcctttccc
ataggtccttaacttaaatctcatttgtcagtctctgcttctatcatata
aagcaaaaatccccagatctccacggatttgggtccttacgtctttgggg
gcatcattttaaattacccttggtcatttagagcttagttttacccaaat
tttcaatttaccgtgttcattaaaaaactgaatagaagtggggatatttt
catcatagaaacttccaattaaaacttataaactcaaagaaag
gaattctctgtgggaggaatttgagtatagagagcagtggcactgggtca
gctccagggtgcagaccaaagcaggaaggatcctattccaggttgttctt
tggttcctgtgtcctgatggttctgggtgggacactcttggctaggaatg
tgagcagatgtggtggtcttacctgtgctcacaggtgtgtcagcactcct
gggagaccagctatgtcccgatggtatttgtttattgagtgctgtgtcat
atgatcagatcttggtgcagacagaaaccagaaggagtatgtccccagct
caagttttagaaagtattttaatatctctttaaaattaatttgaggatat
tttattttttatatatttttattagttattttcctcatttacattgccaa
tgctatcccaaaagtcccccataccctccccccccactcccctacccacc
cagtcccactttttggccctggtgttcccctgtaatgggtcatataaagt
ttgtgtgtccagtgggcctctctttccagtgatggccaacttggccatct
tttgatacatatgcagctagagtcaagagctcctgggtactggttagttc
ataatgttgttccacctataggattgcagatccctttagctccttgggta
ctttctctagctcctccattgggggccctgtgatccatccaagagctgac
tgtgagcatccacttctgtgtttgctaggccccggcctagtctcacaaga
gacagctatatcagggtcctttcagcagaatcttgctagtgtatgcaatg
gtgtcagcatttggaggctgattatgggatggatccctggatatggcggt
cactagatggcccatccttttgtctcagctccaaactttgtctctgtaac
tccttccatgggtattttgttcccaattctagagggcaatgtccatgctt
tgggtcttcgttcttcttgagtttcatgtgtttgcaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_120887364_120888332
seq2: B6Ng01-098O22.b_36_1028 (reverse)

seq1  CTTTCTTT-TGTTTATGAGTTTT-ATTGTA--GTTCTATGATG-AAATAT  45
      ||||||||  |||||| |||||| |||| |   |||||||||| ||||||
seq2  CTTTCTTTGAGTTTATAAGTTTTAATTGGAAGTTTCTATGATGAAAATAT  50

seq1  -CCCACTTCTATTCAGTTTCTTAATGAACAC-GTAATTTGAAATTTTGG-  92
       |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| 
seq2  CCCCACTTCTATTCAGTTTTTTAATGAACACGGTAAATTGAAAATTTGGG  100

seq1  -TAAACTAAGCTCCTAATGACCAA-GGTAATTT-AAATGATGCCCCAAAA  139
        |||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||
seq2  TAAAACTAAGCTCTAAATGACCAAGGGTAATTTAAAATGATGCCCCCAAA  150

seq1  GACGTAA-GACCC-AATCCGT-GAGATCTGGGGA-TTTTGCTTTATATGA  185
      ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||
seq2  GACGTAAGGACCCAAATCCGTGGAGATCTGGGGATTTTTGCTTTATATGA  200

seq1  TAGAAGCAGAGACTGACAAATGAGA-TTAAGTTAAGGACCTATGGGAAAG  234
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAGCAGAGACTGACAAATGAGATTTAAGTTAAGGACCTATGGGAAAG  250

seq1  GAAGTTATTGTTTATTTCTATTGTGCTCTTTAAGTGT-AATCTCAAGTAT  283
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  GAAGTTATTGTTTATTTCTATTGTGCTCTTTAAGTGTAAATCTCAAGTAT  300

seq1  CATTAC-AAGAGGATGATTTGACCACAGAAGAG-AAAGAAGGGTATAT-A  330
      |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
seq2  CATTACAAAGAGGATGATTTGACCACAGAAGAGAAAAGAAGGGTATATAA  350

seq1  ACAACGGATGAAG-AACCAATGTTT-AAGATACTTTCATGTTTGTC-AAT  377
      ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
seq2  ACAACGGATGAAGAAACCAATGTTTAAAGATACTTTCATGTTTGTCAAAT  400

seq1  GAAGACAACACCCTCTCAAAGCTAGAAGTGGCAAGGAAAGTCTCTTATGT  427
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGACAACACCCTCTCAAAGCTAGAAGTGGCAAGGAAAGTCTCTTATGT  450

seq1  GGAGGCTATTGACACATAATAACCCTTTCTGTAGGCTGAGATTTTCCAAA  477
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGCTATTGACACATAATAACCCTTTCTGTAGGCTGAGATTTTCCAAA  500

seq1  ACCTACTTCTAGTTAAGGGTTCTCAAATACTTCTACTCAACTTCTAGCAC  527
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTACTTCTAGTTAAGGGTTCTCAAATACTTCTACTCAACTTCTAGCAC  550

seq1  ACCGTCCAAAGGTAGGGAAGAAAGAATTGCAAATAGAACAAGGGGTCATG  577
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCGTCCAAAGGTAGGGAAGAAAGAATTGCAAATAGAACAAGGGGTCATG  600

seq1  GACCTGTTTAGAATTAGTTCTTTTGGGTGATTCCAATAACCTTTTGTCAG  627
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTGTTTAGAATTAGTTCTTTTGGGTGATTCCAATAACCTTTTGTCAG  650

seq1  GATACCAGCAGTCAAGTTTAGTAGTGTCAGGATATCAAACATGAATCAGC  677
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATACCAGCAGTCAAGTTTAGTAGTGTCAGGATATCAAACATGAATCAGC  700

seq1  AACGGCAGCATGATATGACAAACTTTTGCCATGTCTCTCTCAACAAAGTA  727
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACGGCAGCATGATATGACAAACTTTTGCCATGTCTCTCTCAACAAAGTA  750

seq1  AAGATCAGTGAAGATGCAAGATCAATGAAGCATTGCAAATCTAACTATGC  777
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATCAGTGAAGATGCAAGATCAATGAAGCATTGCAAATCTAACTATGC  800

seq1  GAGCACCCTGTCACTGTCCGTTGAGTCCAGCTCATAGTCTCTACAAACAT  827
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCACCCTGTCACTGTCCGTTGAGTCCAGCTCATAGTCTCTACAAACAT  850

seq1  CAGGTATGTCTTGCCTTAGCAAAACATCTCATGAGTCTGCCTCAGCAAAA  877
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTATGTCTTGCCTTAGCAAAACATCTCATGAGTCTGCCTCAGCAAAA  900

seq1  CACCACAAGAGTCTGCATCACAGGACATAACCAGAAACGTCCACTTCACC  927
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCACAAGAGTCTGCATCACAGGACATAACCAGAAACGTCCACTTCACC  950

seq1  TTTCAGTACC-TTTATTCAACCCATGAAAGCACTTTGGAATTC  969
      ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAGTACCAATTATTCAACCCATGAAAGCACTTTGGAATTC  993

seq1: chr12_120775541_120776391
seq2: B6Ng01-098O22.g_66_916

seq1  GAATTCTCTGTGGGAGGAATTTGAGTATAGAGAGCAGTGGCACTGGGTCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTGTGGGAGGAATTTGAGTATAGAGAGCAGTGGCACTGGGTCA  50

seq1  GCTCCAGGGTGCAGACCAAAGCAGGAAGGATCCTATTCCAGGTTGTTCTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCAGGGTGCAGACCAAAGCAGGAAGGATCCTATTCCAGGTTGTTCTT  100

seq1  TGGTTCCTGTGTCCTGATGGTTCTGGGTGGGACACTCTTGGCTAGGAATG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTCCTGTGTCCTGATGGTTCTGGGTGGGACACTCTTGGCTAGGAATG  150

seq1  TGAGCAGATGTGGTGGTCTTACCTGTGCTCACAGGTGTGTCAGCACTCCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCAGATGTGGTGGTCTTACCTGTGCTCACAGGTGTGTCAGCACTCCT  200

seq1  GGGAGACCAGCTATGTCCCGATGGTATTTGTTTATTGAGTGCTGTGTCAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGACCAGCTATGTCCCGATGGTATTTGTTTATTGAGTGCTGTGTCAT  250

seq1  ATGATCAGATCTTGGTGCAGACAGAAACCAGAAGGAGTATGTCCCCAGCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATCAGATCTTGGTGCAGACAGAAACCAGAAGGAGTATGTCCCCAGCT  300

seq1  CAAGTTTTAGAAAGTATTTTAATATCTCTTTAAAATTAATTTGAGGATAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTTTTAGAAAGTATTTTAATATCTCTTTAAAATTAATTTGAGGATAT  350

seq1  TTTATTTTTTATATATTTTTATTAGTTATTTTCCTCATTTACATTGCCAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTTTTTATATATTTTTATTAGTTATTTTCCTCATTTACATTGCCAA  400

seq1  TGCTATCCCAAAAGTCCCCCATACCCTCCCCCCCCACTCCCCTACCCACC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTATCCCAAAAGTCCCCCATACCCTCCCCCCCCACTCCCCTACCCACC  450

seq1  CAGTCCCACTTTTTGGCCCTGGTGTTCCCCTGTAATGGGTCATATAAAGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCCCACTTTTTGGCCCTGGTGTTCCCCTGTAATGGGTCATATAAAGT  500

seq1  TTGTGTGTCCAGTGGGCCTCTCTTTCCAGTGATGGCCAACTTGGCCATCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGTGTCCAGTGGGCCTCTCTTTCCAGTGATGGCCAACTTGGCCATCT  550

seq1  TTTGATACATATGCAGCTAGAGTCAAGAGCTCCTGGGTACTGGTTAGTTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGATACATATGCAGCTAGAGTCAAGAGCTCCTGGGTACTGGTTAGTTC  600

seq1  ATAATGTTGTTCCACCTATAGGATTGCAGATCCCTTTAGCTCCTTGGGTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATGTTGTTCCACCTATAGGATTGCAGATCCCTTTAGCTCCTTGGGTA  650

seq1  CTTTCTCTAGCTCCTCCATTGGGGGCCCTGTGATCCATCCAAGAGCTGAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTCTAGCTCCTCCATTGGGGGCCCTGTGATCCATCCAAGAGCTGAC  700

seq1  TGTGAGCATCCACTTCTGTGTTTGCTAGGCCCCGGCCTAGTCTCACAAGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGCATCCACTTCTGTGTTTGCTAGGCCCCGGCCTAGTCTCACAAGA  750

seq1  GACAGCTATATCAGGGTCCTTTCAGCAGAATCTTGCTAGTGTATGCAATG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGCTATATCAGGGTCCTTTCAGCAGAATCTTGCTAGTGTATGCAATG  800

seq1  GTGTCAGCATTTGGAGGCTGATTATGGGATGGATCCCTGGATATGGCGGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCAGCATTTGGAGGCTGATTATGGGATGGATCCCTGGATATGGCGGT  850

seq1  C  851
      |
seq2  C  851