BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-112D22
Chromosome12 (Build37)
Map Location 12,889,710 - 13,053,217
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100043215, Mycn, EG668473
Upstream geneLOC100043209, D12Ertd553e
Downstream geneLOC628449, Ddx1, LOC627199, LOC627189, LOC100043243, LOC100042396, LOC238091, EG633789, LOC668481
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-112D22.bB6Ng01-112D22.g
ACCDH918359DH918360
length1891,117
definitionDH918359|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-112D22, 5' end.DH918360|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-112D22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(13,053,029 - 13,053,217)(12,889,710 - 12,890,839)
sequence
gaattcacattctccagagcaaagtactctcttaccccattctacatgca
gctgtcagccagggccccaccccaccccacccctcctcaccccactttgc
cccacctccacccctaccttcactctgcttagaaccccctgggggaaaca
gtatttgagactctggatggagcttaaggttgatggcat
gaattccatttgcttagagccaccatccttctctccagatggatgcagtc
gtactggcctggtagtatgggggtctgtgttctgccctgccactggggtt
gagcaagctgctggagcacgctatactgtgtttaccctgccctgctccag
agttgagggcccaagggctgaagattaagatgaggggcctggaactgggg
aatgggaactttggcttagcttatcagagaaagtccttagcttggtggta
gttgtctgggagcacagagaggccttctgtgggagcctacggttcttgat
aaaaagagactatgtttatccataccatttattgactgtttatcagggga
aatggggacatatcaccttctcagggtggaccagagattaaattacagga
aggaatgtccagaaatggaagcttattgtctaaaccctcagggcctctag
atacctcattaacatggagaactctgtgatcaatgtgggaagtggggtca
cgtgttctgggcaagcaatctaggagggagcagggagacacttaccatct
caggtgggtacctgggtgccagggtctcggacccacacaacctaagtttc
ttggcatgctccattgtcccacagtagtattgctataattaagcaaaaag
tgtgcagtccccagcacattagcaggtccataatagctacttgatagagg
actaaccctgtacatgaatgagaatttggaaggttggttggagagatcag
tgagtagcaggcaggatagatgcatgcatgcatgaagagagggaggaagg
aagagaggaacgattgctcagtgtatctgaagattctattcaaatgctgt
ctcctgcaagaagacatctccaacgaattcctcttagccccacatatcac
tccatcctccacactccccaggtgacctcttagacacacccctcactatt
ataaatttctcctaggtgccatcttctgagtgacatcttgtcaaggatag
atgtagactgtgcttggacggaccttcacctctatgctgtgggtagctcc
ggtgtgagctgtgagggagacttggttttcacgctgagcatgctgcgagc
attaccaatgtcactca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_13053029_13053217
seq2: B6Ng01-112D22.b_40_228 (reverse)

seq1  ATGCCCTCAACCTTCAGCTCCATCCAGAGTCTCCTATACTGTTTCCCCCA  50
      ||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||
seq2  ATGCCATCAACCTTAAGCTCCATCCAGAGTCTCAAATACTGTTTCCCCCA  50

seq1  GGGGGTTCTCAGCAGGGTGATGGTAGGGGTGGAGGTGGGGCAGGGTGGGG  100
      ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||
seq2  GGGGGTTCTAAGCAGAGTGAAGGTAGGGGTGGAGGTGGGGCAAAGTGGGG  100

seq1  TGAGGTGGGGTGGGGTGGGGTGGGGCCCTGGCTGACAGCTGCATGTAGAA  150
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGAGGGGTGGGGTGGGGTGGGGCCCTGGCTGACAGCTGCATGTAGAA  150

seq1  TGGGGTTAGAGAGTACTTTGCTCTGGAGAATGTGAATTC  189
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGTAAGAGAGTACTTTGCTCTGGAGAATGTGAATTC  189

seq1: chr12_12889710_12890839
seq2: B6Ng01-112D22.g_66_1182

seq1  GAATTCCATTTGCTTAGAGCCACCATCCTTCTCTCCAGATGGATGCAGTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCATTTGCTTAGAGCCACCATCCTTCTCTCCAGATGGATGCAGTC  50

seq1  GTACTGGCCTGGTAGTATGGGGGTCTGTGTTCTGCCCTGCCACTGGGGTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACTGGCCTGGTAGTATGGGGGTCTGTGTTCTGCCCTGCCACTGGGGTT  100

seq1  GAGCAAGCTGCTGGAGCACGCTATACTGTGTTTACCCTGCCCTGCTCCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAAGCTGCTGGAGCACGCTATACTGTGTTTACCCTGCCCTGCTCCAG  150

seq1  AGTTGAGGGCCCAAGGGCTGAAGATTAAGATGAGGGGCCTGGAACTGGGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGAGGGCCCAAGGGCTGAAGATTAAGATGAGGGGCCTGGAACTGGGG  200

seq1  AATGGGAACTTTGGCTTAGCTTATCAGAGAAAGTCCTTAGCTTGGTGGTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGGAACTTTGGCTTAGCTTATCAGAGAAAGTCCTTAGCTTGGTGGTA  250

seq1  GTTGTCTGGGAGCACAGAGAGGCCTTCTGTGGGAGCCTACGGTTCTTGAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTCTGGGAGCACAGAGAGGCCTTCTGTGGGAGCCTACGGTTCTTGAT  300

seq1  AAAAAGAGACTATGTTTATCCATACCATTTATTGACTGTTTATCAGGGGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAGAGACTATGTTTATCCATACCATTTATTGACTGTTTATCAGGGGA  350

seq1  AATGGGGACATATCACCTTCTCAGGGTGGACCAGAGATTAAATTACAGGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGGGACATATCACCTTCTCAGGGTGGACCAGAGATTAAATTACAGGA  400

seq1  AGGAATGTCCAGAAATGGAAGCTTATTGTCTAAACCCTCAGGGCCTCTAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAATGTCCAGAAATGGAAGCTTATTGTCTAAACCCTCAGGGCCTCTAG  450

seq1  ATACCTCATTAACATGGAGAACTCTGTGATCAATGTGGGAAGTGGGGTCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCTCATTAACATGGAGAACTCTGTGATCAATGTGGGAAGTGGGGTCA  500

seq1  CGTGTTCTGGGCAAGCAATCTAGGAGGGAGCAGGGAGACACTTACCATCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGTTCTGGGCAAGCAATCTAGGAGGGAGCAGGGAGACACTTACCATCT  550

seq1  CAGGTGGGTACCTGGGTGCCAGGGTCTCGGACCCACACAACCTAAGTTTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTGGGTACCTGGGTGCCAGGGTCTCGGACCCACACAACCTAAGTTTC  600

seq1  TTGGCATGCTCCATTGTCCCACAGTAGTATTGCTATAATTAAGCAAAAAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCATGCTCCATTGTCCCACAGTAGTATTGCTATAATTAAGCAAAAAG  650

seq1  TGTGCAGTCCCCAGCACATTAGCAGGTCCATAATAGCTACTTGATAGAGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCAGTCCCCAGCACATTAGCAGGTCCATAATAGCTACTTGATAGAGG  700

seq1  ACTAACCCTGTACATGAATGAGAATTTGGAAGGTTGGTTGGAGAGATCAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAACCCTGTACATGAATGAGAATTTGGAAGGTTGGTTGGAGAGATCAG  750

seq1  TGAGTAGCAGGCAGGATAGATGCATGCATGCATGAAGAGAGGGAGGAAGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTAGCAGGCAGGATAGATGCATGCATGCATGAAGAGAGGGAGGAAGG  800

seq1  AAGAGAGGAACGATTGCTCAGTGTATTCTGAAGATTCTATTCAAATGCTG  850
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGAGGAACGATTGCTCAGTGTA-TCTGAAGATTCTATTCAAATGCTG  849

seq1  TCTCCTGCAAGAAGACATCTCCAACGAATTCCTCTTAG-CCCACATATCA  899
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  TCTCCTGCAAGAAGACATCTCCAACGAATTCCTCTTAGCCCCACATATCA  899

seq1  CTCCATCCTCCACACTCCCCAGGTGACCTCTTAGACAACACCCCTCACTA  949
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  CTCCATCCTCCACACTCCCCAGGTGACCTCTTAGAC-ACACCCCTCACTA  948

seq1  TTATAAATTTCTCCTAGGTTGCCATCTTCTGAGTGACATCTTGTTCAAGG  999
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TTATAAATTTCTCCTAGG-TGCCATCTTCTGAGTGACATCTTG-TCAAGG  996

seq1  ATTAGATGTAAGACTGTGCTTGGAACGGACC-TCACCTCTATGCTGTGGG  1048
      | ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||
seq2  A-TAGATGT-AGACTGTGCTTGG-ACGGACCTTCACCTCTATGCTGTGGG  1043

seq1  TAGCCTCGGTGTGAAGCTGTGAGGGAGACATGGTTTTTCACGCTGAGCAT  1098
      ||||  ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||
seq2  TAGCTCCGGTGTG-AGCTGTGAGGGAGACTTGG-TTTTCACGCTGAGCAT  1091

seq1  GGCTGCGAGCATTTACCAATGCACCCCACTCA  1130
       |||||||||| |||||||||     ||||||
seq2  -GCTGCGAGCA-TTACCAATG----TCACTCA  1117