BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-118L08
Chromosome12 (Build37)
Map Location 32,073,558 - 32,213,822
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC668786, Slc26a3, Cbll1, Slc26a4
Upstream geneTmem18, LOC100043055, Acp1, Sh3yl1, LOC629656, 9030611O19Rik, LOC668781, LOC100043065, LOC100043514, EG629667, LOC100043068, Lamb1-1, Dld
Downstream geneLOC100043531, Bcap29, Dus4l, LOC100043081, Gpr22, Hbp1, Prkar2b, Pik3cg, 2010109K11Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-118L08.bB6Ng01-118L08.g
ACCDH923115DH923116
length1,2121,124
definitionDH923115|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-118L08, 5' end.DH923116|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-118L08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(32,073,558 - 32,074,798)(32,212,682 - 32,213,822)
sequence
gaattcttggagccaagtggtggatctattcagcaaacacacgttggcta
atgcttgccatgaccccaccattgttctcagtgttcctgtatgaataaat
cattcgatctttgcaacaactctctaggcaggggctcttatcactcctgc
tttccacacaaggaagtaagcacacagagattaggcaactctcttgagtt
gtatggctattaaaaattaaagccaagatgtagaagtcaaagacttggct
ccaaggttgccacactttgtcattatggtatacagactcagggagatgga
ctgaaaggaaggtgagttgccacctggaaggtttatgcaagcatacagca
gaaatggataggagatacgtctaagatgaaataggatcgttgagccagaa
acaacagtatatacccataacccaagcgcttgagaagttgaaatcaggag
ttcagcgccatccttagccatagctcaagtccagggacagcttgagttat
gtgagatctggtctcaaaacaaaaacaaagcaaaacaacaacaaaaacca
atcaatcaaccaaacaactagacaaataaaaacagaagaaaaaaaaagat
aaaagactgacattcataccttgatttccagcatgaagaactaggtaaac
tatgcagcttttagctgaatttgagtatacacagatacaagtttcagaag
cacataccaaaaatgaagacaaaaatggaactacttataaaacagcattt
atgtttcagacactgtaaatagtaactttgctaaattcttatagtttaaa
ctgtgggtactaagaatgcggtgctgagggtttagagacattccatgggg
tcacacagcacagtgcacatgtgtaggtttgggcagcaggcctcttagga
ggccatttggtttttatctcccatatcacacggctgttggagtgtttcat
ccctgcctgctgtgaagattctagaggaaccgcatcttctcttgaggact
tgggcgtagcccagagtaaacagatgaccagagctgtttgcttgcttgag
cttagaccacgtggtgagtgttaacacgaatcccacaattgctaaccctg
ccatgcacctgcagcttcatagcttccacctcagaaggtgtacatgcagc
gatgctcaccttgctatgaactttctaaccattgggtgcattccaggccg
agtgaagagtct
gaattccaaacaagagtctgtgcaaggcttttaagcatttggggtaaact
gctgaaaggcttttggtattattattgacaagtaagtccgaggtgttttc
ttcgttagaacgggatcataagtgatattggctcatcaaataatgccttc
gagcctgatgaagatgtggaagagccagaggaacttaatatcccaaccaa
agaaattgagattcaagtggactggaactccgaactcccggtgaaagtga
atgtcccaaaggtgccaatccacagcctggtgctggattgcggagctgta
tccttcctggatgtggtaggagtgaggtcattgcgaatggtgaggctctg
tttatttgtgcagtgaagtgatggaatgggtcacacagcctggtgaaggg
gctctgtaatttgtgaattttcttccctcttcctcttcctcctcctcttg
ctcctcctcctcctcctttttggcaactgagcataagctctgcagtcagg
ctctgtgaggtgaattctgcctccagcaccaagaacacgtttctcaatcc
gccttttttttggcttcttcttttctaatatcggcataatgatagtattt
actacccaggtatcatgaagatcaaataagcaatgcatagagggagtaaa
ggggagtatctggcacatagatacctcttagatgctaacacttagtatgt
tttatttttctaagaacataaatggaccgtgacaaaaaggaaagtggcaa
agtctgcattgagtattctatttttacttgttatagacacagcaacggga
caggacttaaagagcagacattgttctgcagcaggggcccggcctcaggt
tagacccaagaagtcagggcaagagctgagcacatgccggacagaagcac
tcacagcagcagctgcaggatttcagttcctttcttggatgcttcatgtg
tgcagttgctccactaacagagacgcatgtgatgagcagccatggtttct
ctaccagagaggaagcaaacattaacatcgataaccctttgagaatgctc
agaaatctttaatagggtgtgatcttaagggtcagtttaatgaaacttta
gttggtcaggagcccagacagcga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_32073558_32074798
seq2: B6Ng01-118L08.b_44_1255

seq1  GAATTCTTGGAGCCAAGTGGTGGATCTATTCAGCAAACACACGTTGGCTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTGGAGCCAAGTGGTGGATCTATTCAGCAAACACACGTTGGCTA  50

seq1  ATGCTTGCCATGACCCCACCATTGTTCTCAGTGTTCCTGTATGAATAAAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTTGCCATGACCCCACCATTGTTCTCAGTGTTCCTGTATGAATAAAT  100

seq1  CATTCGATCTTTGCAACAACTCTCTAGGCAGGGGCTCTTATCACTCCTGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCGATCTTTGCAACAACTCTCTAGGCAGGGGCTCTTATCACTCCTGC  150

seq1  TTTCCACACAAGGAAGTAAGCACACAGAGATTAGGCAACTCTCTTGAGTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCACACAAGGAAGTAAGCACACAGAGATTAGGCAACTCTCTTGAGTT  200

seq1  GTATGGCTATTAAAAATTAAAGCCAAGATGTAGAAGTCAAAGACTTGGCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGGCTATTAAAAATTAAAGCCAAGATGTAGAAGTCAAAGACTTGGCT  250

seq1  CCAAGGTTGCCACACTTTGTCATTATGGTATACAGACTCAGGGAGATGGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGGTTGCCACACTTTGTCATTATGGTATACAGACTCAGGGAGATGGA  300

seq1  CTGAAAGGAAGGTGAGTTGCCACCTGGAAGGTTTATGCAAGCATACAGCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAAGGAAGGTGAGTTGCCACCTGGAAGGTTTATGCAAGCATACAGCA  350

seq1  GAAATGGATAGGAGATACGTCTAAGATGAAATAGGATCGTTGAGCCAGAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATGGATAGGAGATACGTCTAAGATGAAATAGGATCGTTGAGCCAGAA  400

seq1  ACAACAGTATATACCCATAACCCAAGCGCTTGAGAAGTTGAAATCAGGAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACAGTATATACCCATAACCCAAGCGCTTGAGAAGTTGAAATCAGGAG  450

seq1  TTCAGCGCCATCCTTAGCCATAGCTCAAGTCCAGGGACAGCTTGAGTTAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGCGCCATCCTTAGCCATAGCTCAAGTCCAGGGACAGCTTGAGTTAT  500

seq1  GTGAGATCTGGTCTCAAAACAAAAACAAAGCAAAACAACAACAAAAACCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGATCTGGTCTCAAAACAAAAACAAAGCAAAACAACAACAAAAACCA  550

seq1  ATCAATCAACCAAACAACTAGACAAATAAAAACAGAAGAAAAAAAAAGAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAATCAACCAAACAACTAGACAAATAAAAACAGAAGAAAAAAAAAGAT  600

seq1  AAAAGACTGACATTCATACCTTGATTTCCAGCATGAAGAACTAGGTAAAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGACTGACATTCATACCTTGATTTCCAGCATGAAGAACTAGGTAAAC  650

seq1  TATGCAGCTTTTAGCTGAATTTGAGTATACACAGATACAAGTTTCAGAAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCAGCTTTTAGCTGAATTTGAGTATACACAGATACAAGTTTCAGAAG  700

seq1  CACATACCAAAAATGAAGACAAAAATGGAACTACTTATAAAACAGCATTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATACCAAAAATGAAGACAAAAATGGAACTACTTATAAAACAGCATTT  750

seq1  ATGTTTCAGACACTGTAAATAGTAACTTTGCTAAATTCTTATAGTTTAAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTTCAGACACTGTAAATAGTAACTTTGCTAAATTCTTATAGTTTAAA  800

seq1  CTGTGGGTACTAAGAATGCGGTGCTGAGGG-TTAGAGACATTCCATGGGG  849
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  CTGTGGGTACTAAGAATGCGGTGCTGAGGGTTTAGAGACATTCCATGGGG  850

seq1  TCACACAGCACAGTGCACATGTGTAGGTTTGGGCAGCAGGCCTCTTAGGA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACACAGCACAGTGCACATGTGTAGGTTTGGGCAGCAGGCCTCTTAGGA  900

seq1  GGCCATT--GGTTTTATCTCCCATATCACACGGCTGTTGGAGTGTTTCAT  947
      |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCATTTGGTTTTTATCTCCCATATCACACGGCTGTTGGAGTGTTTCAT  950

seq1  CCCTGCCTGCTGTGAAGATTCTAGAGGAACCGCATCCTTCTCTTGAGGAC  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  CCCTGCCTGCTGTGAAGATTCTAGAGGAACCGCAT-CTTCTCTTGAGGAC  999

seq1  TTGGGCGTAGCCCAGAGGTAAACAGGATGACCAGAGCTGGTTTTGCTTGC  1047
      |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||
seq2  TTGGGCGTAGCCCAGA-GTAAACA-GATGACCAGAGCTG--TTTGCTTGC  1045

seq1  TTGAAGCTTAGA-CACGTGGTGAGTGTTAACACCGAAATCCCAACCAGTG  1096
      ||| |||||||| ||||||||||||||||||||   |||||| || | ||
seq2  TTG-AGCTTAGACCACGTGGTGAGTGTTAACAC--GAATCCC-ACAATTG  1091

seq1  CTAACCCTTGCCCATGGCACCCTGCAGCCTCCATAGCTTCCCACCCTCAG  1146
      ||||||||   |||| ||| ||||||| || ||||||||||   ||||||
seq2  CTAACCCT--GCCAT-GCA-CCTGCAG-CTTCATAGCTTCC--ACCTCAG  1134

seq1  AAAGTGTGTACATGCAGCCGATGGCTCACCTTGGGCTCAATAGGAAACCT  1196
      ||   |||||||||||| |||| ||||||||||       || |||    
seq2  AA--GGTGTACATGCAG-CGAT-GCTCACCTTG------CTATGAA---C  1171

seq1  TTTCTATAAACCATTGGGTGCCTATTCCAGGGGCAGTGAA-AGTCT  1241
      |||||   |||||||||||||  ||||||||   |||||| |||||
seq2  TTTCT---AACCATTGGGTGC--ATTCCAGGCCGAGTGAAGAGTCT  1212

seq1: chr12_32212682_32213822
seq2: B6Ng01-118L08.g_68_1191 (reverse)

seq1  TCGCTGTCTGGCCCTCCTGATACCAAACTAAAGTTTCATTTAAACTTGAC  50
      |||||||||||  |||||||   | ||||||||||||| |||||| ||||
seq2  TCGCTGTCTGG-GCTCCTGA---CCAACTAAAGTTTCA-TTAAAC-TGAC  44

seq1  CCTTAGGATCACACCTATTTAAAGTACTCTGAAGCATTCTACAGGGGTTT  100
      ||||| |||||||||   ||||||   |||| ||||||||  | ||||| 
seq2  CCTTAAGATCACACCCTATTAAAGATTTCTG-AGCATTCTCAAAGGGTT-  92

seq1  ATTCGATTGTTTAATGTTTGCCTTCCTCTCTGGTAGAGAAACCATGGCTG  150
        |||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  -ATCGAT--GTTAATGTTTG-CTTCCTCTCTGGTAGAGAAACCATGGCTG  138

seq1  CCTCATCACATGCGTCTTCTGTTAGGTGGAGCAACTGGCACACATTGAAG  200
       ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||
seq2  -CTCATCACATGCGTC-TCTGTTA-GTGGAGCAACT-GCACACA-TGAAG  183

seq1  CATCCAAGAAAGGAACTTGAAATCCTGCAGCTGCTGCTGTGAGTGCTTCT  250
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCAAGAAAGGAAC-TGAAATCCTGCAGCTGCTGCTGTGAGTGCTTCT  232

seq1  GTCCGGCATGTTGCTCAGCTCTTGCCCTGACTTCCTGGGTCTAACCTGAG  300
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  GTCCGGCATG-TGCTCAGCTCTTGCCCTGACTTCTTGGGTCTAACCTGAG  281

seq1  GCC-GGCCCCTGCTGCAGAACAATGTCTGCTCTTTTAGTCCTGTCCCGTT  349
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  GCCGGGCCCCTGCTGCAGAACAATGTCTGCTCTTTAAGTCCTGTCCCGTT  331

seq1  GCTGTGTCTATAACAAGT-AAAATAGAATACTCAATGCAGACTTTGCCAC  398
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTGTCTATAACAAGTAAAAATAGAATACTCAATGCAGACTTTGCCAC  381

seq1  TTTCCTTTTTGTCACGGTCCATTTATGTTCTTAGAAAAATAAAACATACT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCTTTTTGTCACGGTCCATTTATGTTCTTAGAAAAATAAAACATACT  431

seq1  AAGTGTTAGCATCTAAGAGGTATCTATGTGCCAGATACTCCCCTTTACTC  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGTTAGCATCTAAGAGGTATCTATGTGCCAGATACTCCCCTTTACTC  481

seq1  CCTCTATGCATTGCTTATTTGATCTTCATGATACCTGGGTAGTAAATACT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTATGCATTGCTTATTTGATCTTCATGATACCTGGGTAGTAAATACT  531

seq1  ATCATTATGCCGATATTAGAAAAGAAGAAGCCAAAAAAAAGGCGGATTGA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATTATGCCGATATTAGAAAAGAAGAAGCCAAAAAAAAGGCGGATTGA  581

seq1  GAAACGTGTTCTTGGTGCTGGAGGCAGAATTCACCTCACAGAGCCTGACT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACGTGTTCTTGGTGCTGGAGGCAGAATTCACCTCACAGAGCCTGACT  631

seq1  GCAGAGCTTATGCTCAGTTGCCAAAAAGGAGGAGGAGGAGGAGCAAGAGG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAGCTTATGCTCAGTTGCCAAAAAGGAGGAGGAGGAGGAGCAAGAGG  681

seq1  AGGAGGAAGAGGAAGAGGGAAGAAAATTCACAAATTACAGAGCCCCTTCA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGGAAGAGGAAGAGGGAAGAAAATTCACAAATTACAGAGCCCCTTCA  731

seq1  CCAGGCTGTGTGACCCATTCCATCACTTCACTGCACAAATAAACAGAGCC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGCTGTGTGACCCATTCCATCACTTCACTGCACAAATAAACAGAGCC  781

seq1  TCACCATTCGCAATGACCTCACTCCTACCACATCCAGGAAGGATACAGCT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCATTCGCAATGACCTCACTCCTACCACATCCAGGAAGGATACAGCT  831

seq1  CCGCAATCCAGCACCAGGCTGTGGATTGGCACCTTTGGGACATTCACTTT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGCAATCCAGCACCAGGCTGTGGATTGGCACCTTTGGGACATTCACTTT  881

seq1  CACCGGGAGTTCGGAGTTCCAGTCCACTTGAATCTCAATTTCTTTGGTTG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCGGGAGTTCGGAGTTCCAGTCCACTTGAATCTCAATTTCTTTGGTTG  931

seq1  GGATATTAAGTTCCTCTGGCTCTTCCACATCTTCATCAGGCTCGAAGGCA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATATTAAGTTCCTCTGGCTCTTCCACATCTTCATCAGGCTCGAAGGCA  981

seq1  TTATTTGATGAGCCAATATCACTTATGATCCCGTTCTAACGAAGAAAACA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTGATGAGCCAATATCACTTATGATCCCGTTCTAACGAAGAAAACA  1031

seq1  CCTCGGACTTACTTGTCAATAATAATACCAAAAGCCTTTCAGCAGTTTAC  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCGGACTTACTTGTCAATAATAATACCAAAAGCCTTTCAGCAGTTTAC  1081

seq1  CCCAAATGCTTAAAAGCCTTGCACAGACTCTTGTTTGGAATTC  1141
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAAATGCTTAAAAGCCTTGCACAGACTCTTGTTTGGAATTC  1124