BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-121G13
Chromosome12 (Build37)
Map Location 81,355,857 - 81,496,733
singlet/doubletdoublet
Overlap geneActn1, Wdr22
Upstream geneZfyve26, Rad51l1, LOC100041968, LOC435309, LOC100041674, LOC666754, Zfp36l1
Downstream geneExdl2, 2310002D06Rik, Galntl1, LOC100041715, Erh, Slc39a9, 3830431G21Rik, Gm1568, 4933426M11Rik, Sfrs5, Slc10a1, Smoc1, Slc8a3, LOC100042143, LOC100042148, EG214321
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-121G13.bB6Ng01-121G13.g
ACCDH925100DH925101
length1,1311,145
definitionDH925100|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-121G13, 5' end.DH925101|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-121G13, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(81,355,857 - 81,356,995)(81,495,562 - 81,496,733)
sequence
gaattcaccttgtagatccatgatggcacagctagtcaatgaggaagcca
acatttggaaccccagcacacccagtgcacactcatctgcagaggctgga
accagaatgcaggcctaggattgggtctttatctagaacaaacagaatct
atggctccaagcagcagtctcagtggtcctgtccctgtgtgctcagcatc
agaaattcaggaaagaacagggcagcctgggttctgggccccaaaggcac
tgtcacaggcatggcagtcaagaggacagactatgaggagtctgaggatg
gaagagccaagtctttctaatttcactttcaacaggtaccaccctggttt
gggatgtctaatccttcccaggtaagcccattcatgggaattgtaggtaa
gcgcccatgagactgcccagttgcccagaaaccagtgtgcatgaggtagc
ctatcttgctgagacctagcctatttgagtcctattcacagacatttaat
ttacctgccaacagctagtggatactcggcaaatattgattaagtgtctt
attatgaaaggccccagggctgacacctgtggggatacacagtcacccag
aacttccaagaccagagagaagaggagaatataattaattcaacagcaga
agcaccatcctacatctcaagttgagactgcatcagctagggggctggaa
agatggttctgtggttagctctggctgttctcccaaaggacccaggttca
cttcccagcacccacatggcagctcacaattgtctgtatctccagttcca
ggggattggataccctcacacagacatacaggcaaaacaccaatgcacat
aaaaaacaaacaaacaaacaaacaaacaaacaagcatcgctggcttttac
aagaatggagtttgagcagaagcttaaaggacctggcccaaggtcacagt
gaaagagatagatccaggatgtgactccaagtcaatattctctttagcct
gccttacacctggctcgtaccctcagggtgtgcaagatcttcgagaaggg
taaccacacagagagaccgcttggtcatcattgaaagactgtcttaggag
aagatgacttcaggcctgaatctgaagtcag
gaattctctccctctaccatatgggtctcggatcaaattatgtccagttt
ataggctgtgggaggatccgaggggtctaaagggctgctgggcacctaga
ggtataactccttacgatcatgaggaggccttcccactgagtacctgtcc
ttctggcacagtttatggatactgagctattgagcagcttcttttgcctt
ctcctaaaccacactgctccagttcagcttgaagcctgtgggtgtgccgc
acagtcatgctgtcccactgctgccctgaaataaaccatgagagggctgg
ttggcaggataaaatgttaacggtgggaaggacttgagttagcatctgct
ctgaccccccagagggaactgtaagggaagacactgacagtgtgcgttct
tccagtgcaatctgaagtcttaagacaccaatgtggagacagggtgttat
agtccaggatgaccttaaactcatggtcttcctgcctctgtctcattaca
ggcctatgttaccacatgtgacttggctctaagtttttgccttaaaaata
tccatttaaaacattatcttattttatgtgtaggaatgttttgcttatgt
atatgcacaactttgaaaagtctaaagaccttttttcatgataacatcta
aaactgagccatgggctcttctttaaacttcttaatgtattcagggtccc
agcatttcttaaaggcttaattttaatcttaagcccttagatggcttgcc
tggcccaataaacttaaaggttggaaagtttagcttttggagtttaggtg
gtgatgacagggccgtaggaggagaacttgcatataattgactaaagaga
gaacttcacacccacagtatatttttatatattcagacaagatgtcattg
atttcatttagatagtttctgtgtattctcgtagccatctctttgtcagt
gcgacatcccacgtatgcatgctcggacgctgcagtagcttgacagtctt
tagactgagtctctactttgtagagaatgggaggaagccattgttccctt
tctgctttgtcatctgatccttcattgcctgtttacgtgctactcaccac
gatccttccctttcaacttttggtttctgtcaggactgttagttt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_81355857_81356995
seq2: B6Ng01-121G13.b_50_1180

seq1  GAATTCACCTTGTAGATCCATGATGGCACAGCTAGTCAATGAGGAAGCCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACCTTGTAGATCCATGATGGCACAGCTAGTCAATGAGGAAGCCA  50

seq1  ACATTTGGAACCCCAGCACACCCAGTGCACACTCATCTGCAGAGGCTGGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTTGGAACCCCAGCACACCCAGTGCACACTCATCTGCAGAGGCTGGA  100

seq1  ACCAGAATGCAGGCCTAGGATTGGGTCTTTATCTAGAACAAACAGAATCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGAATGCAGGCCTAGGATTGGGTCTTTATCTAGAACAAACAGAATCT  150

seq1  ATGGCTCCAAGCAGCAGTCTCAGTGGTCCTGTCCCTGTGTGCTCAGCATC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCTCCAAGCAGCAGTCTCAGTGGTCCTGTCCCTGTGTGCTCAGCATC  200

seq1  AGAAATTCAGGAAAGAACAGGGCAGCCTGGGTTCTGGGCCCCAAAGGCAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAATTCAGGAAAGAACAGGGCAGCCTGGGTTCTGGGCCCCAAAGGCAC  250

seq1  TGTCACAGGCATGGCAGTCAAGAGGACAGACTATGAGGAGTCTGAGGATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCACAGGCATGGCAGTCAAGAGGACAGACTATGAGGAGTCTGAGGATG  300

seq1  GAAGAGCCAAGTCTTTCTAATTTCACTTTCAACAGGTACCACCCTGGTTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAGCCAAGTCTTTCTAATTTCACTTTCAACAGGTACCACCCTGGTTT  350

seq1  GGGATGTCTAATCCTTCCCAGGTAAGCCCATTCATGGGAATTGTAGGTAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATGTCTAATCCTTCCCAGGTAAGCCCATTCATGGGAATTGTAGGTAA  400

seq1  GCGCCCATGAGACTGCCCAGTTGCCCAGAAACCAGTGTGCATGAGGTAGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGCCCATGAGACTGCCCAGTTGCCCAGAAACCAGTGTGCATGAGGTAGC  450

seq1  CTATCTTGCTGAGACCTAGCCTATTTGAGTCCTATTCACAGACATTTAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCTTGCTGAGACCTAGCCTATTTGAGTCCTATTCACAGACATTTAAT  500

seq1  TTACCTGCCAACAGCTAGTGGATACTCGGCAAATATTGATTAAGTGTCTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACCTGCCAACAGCTAGTGGATACTCGGCAAATATTGATTAAGTGTCTT  550

seq1  ATTATGAAAGGCCCCAGGGCTGACACCTGTGGGGATACACAGTCACCCAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATGAAAGGCCCCAGGGCTGACACCTGTGGGGATACACAGTCACCCAG  600

seq1  AACTTCCAAGACCAGAGAGAAGAGGAGAATATAATTAATTCAACAGCAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTCCAAGACCAGAGAGAAGAGGAGAATATAATTAATTCAACAGCAGA  650

seq1  AGCACCATCCTACATCTCAAGTTGAGACTGCATCAGCTAGGGGGCTGGAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACCATCCTACATCTCAAGTTGAGACTGCATCAGCTAGGGGGCTGGAA  700

seq1  AGATGGTTCTGTGGTTAGCTCTGGCTGTTCTCCCAAAGGACCCAGGTTCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGGTTCTGTGGTTAGCTCTGGCTGTTCTCCCAAAGGACCCAGGTTCA  750

seq1  CTTCCCAGCACCCACATGGCAGCTCACAATTGTCTGTATCTCCAGTTCCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCCAGCACCCACATGGCAGCTCACAATTGTCTGTATCTCCAGTTCCA  800

seq1  GGGGATTGGATACCCTCACACAGACATACAGGCAAAACACCAATGCACAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGATTGGATACCCTCACACAGACATACAGGCAAAACACCAATGCACAT  850

seq1  AAAAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAGCATCGCTGGCTTTTAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAGCATCGCTGGCTTTTAC  900

seq1  AAGAATGGAGTTTGAGCAGAAGCTTAAAGGACCTGGCCCAAGGTCACAGT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAATGGAGTTTGAGCAGAAGCTTAAAGGACCTGGCCCAAGGTCACAGT  950

seq1  GAAAGAGGATAGATCCAGGATGTGACTCCAAGTCAATATTCTCTTTAGCC  1000
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGA-GATAGATCCAGGATGTGACTCCAAGTCAATATTCTCTTTAGCC  999

seq1  TGCCTTACACCTGGGCTCGTACACTCAAGGGTGTGGCAAGATC-TCGAGA  1049
      |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||
seq2  TGCCTTACACCT-GGCTCGTACCCTC-AGGGTGT-GCAAGATCTTCGAGA  1046

seq1  GAGGGAA-CACACAGAGAGACGCCTTTGGTCATCATGAAAAGAACTGTCT  1098
        || || ||||||||||||| |  |||||||||||  |||| |||||||
seq2  AGGGTAACCACACAGAGAGAC-CGCTTGGTCATCATTGAAAG-ACTGTCT  1094

seq1  TAGGAAAGAAAGATGACTTCAGGCCTGATCCTGAAAGTCAG  1139
      |||||    |||||||||||||||||||  ||| |||||||
seq2  TAGGA---GAAGATGACTTCAGGCCTGAATCTG-AAGTCAG  1131

seq1: chr12_81495562_81496733
seq2: B6Ng01-121G13.g_68_1212 (reverse)

seq1  AAACTAACAGCTCCTGACAGAAACCAAAAAGATGGAAAGGGGAGGAGATG  50
      |||||||||| ||||||||||||||||||   | ||||||| ||  ||| 
seq2  AAACTAACAG-TCCTGACAGAAACCAAAA--GTTGAAAGGGAAG--GATC  45

seq1  GTGGGTGAGTAGACAGCTAAAACAGGCAATGAAGGAATCAGATGGGCAGA  100
      || ||||||||| || |  |||||||||||||||| ||||||| | || |
seq2  GT-GGTGAGTAG-CA-CGTAAACAGGCAATGAAGG-ATCAGAT-GACAAA  90

seq1  GCAGGAAAGGGGGACAATTGCTTTCTCTCCATTCTCTACACAGTAGAGGA  150
      ||||  || ||| ||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||  
seq2  GCAG--AAAGGGAACAATGGCTTCCTC-CCATTCTCTACAAAGTAGAG--  135

seq1  CCTCAGTTCTAAAGACTGTTCCAAGGCTACTGCAGGCGTCCGAGCATGGC  200
       ||||| ||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||| ||
seq2  ACTCAG-TCTAAAGACTGT--CAA-GCTACTGCA-GCGTCCGAGCAT-GC  179

seq1  ATACGTGGGATGTCGGCACTGACAAAGAAGGATGGCTACGAGAATACACC  250
      |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |
seq2  ATACGTGGGATGTC-GCACTGACAAAGA--GATGGCTACGAGAATACA-C  225

seq1  AGAAACTATCTAAATGAAATCAATGACATCTTGTCTGAATATAT-AAAAT  299
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  AGAAACTATCTAAATGAAATCAATGACATCTTGTCTGAATATATAAAAAT  275

seq1  ATACTTGTGGGTGTGAAGTTCTCTCTTTTAGTCAATTATATGCAAGTTTC  349
      |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
seq2  ATAC-TGTGGGTGTGAAGTTCTCTC-TTTAGTCAATTATATGCAAG-TTC  322

seq1  TCCTCCCTACGGCCCTGTCATCACCACCTAAACTCCAAAAGCTAAACTTT  399
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCT-CCTACGGCCCTGTCATCACCACCTAAACTCCAAAAGCTAAACTTT  371

seq1  CCAACC-TTAAGTTTATTGGGCCAGGCAAGCCATCTAAGGGCTTAAGATT  448
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACCTTTAAGTTTATTGGGCCAGGCAAGCCATCTAAGGGCTTAAGATT  421

seq1  AAAATTAAGCCTTTAAGAAATGCTGGGACCCTGAATACATTAAGAAGTTT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATTAAGCCTTTAAGAAATGCTGGGACCCTGAATACATTAAGAAGTTT  471

seq1  AAAGAAGAGCCCATGGCTCAGTTTTAGATGTTATCATGAAAAAAGGTCTT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAAGAGCCCATGGCTCAGTTTTAGATGTTATCATGAAAAAAGGTCTT  521

seq1  TAGACTTTTCAAAGTTGTGCATATACATAAGCAAAACATTCCTACACATA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGACTTTTCAAAGTTGTGCATATACATAAGCAAAACATTCCTACACATA  571

seq1  AAATAAGATAATGTTTTAAATGGATATTTTTAAGGCAAAAACTTAGAGCC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAAGATAATGTTTTAAATGGATATTTTTAAGGCAAAAACTTAGAGCC  621

seq1  AAGTCACATGTGGTAACATAGGCCTGTAATGAGACAGAGGCAGGAAGACC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCACATGTGGTAACATAGGCCTGTAATGAGACAGAGGCAGGAAGACC  671

seq1  ATGAGTTTAAGGTCATCCTGGACTATAACACCCTGTCTCCACATTGGTGT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGTTTAAGGTCATCCTGGACTATAACACCCTGTCTCCACATTGGTGT  721

seq1  CTTAAGACTTCAGATTGCACTGGAAGAACGCACACTGTCAGTGTCTTCCC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAAGACTTCAGATTGCACTGGAAGAACGCACACTGTCAGTGTCTTCCC  771

seq1  TTACAGTTCCCTCTGGGGGGTCAGAGCAGATGCTAACTCAAGTCCTTCCC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAGTTCCCTCTGGGGGGTCAGAGCAGATGCTAACTCAAGTCCTTCCC  821

seq1  ACCGTTAACATTTTATCCTGCCAACCAGCCCTCTCATGGTTTATTTCAGG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCGTTAACATTTTATCCTGCCAACCAGCCCTCTCATGGTTTATTTCAGG  871

seq1  GCAGCAGTGGGACAGCATGACTGTGCGGCACACCCACAGGCTTCAAGCTG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCAGTGGGACAGCATGACTGTGCGGCACACCCACAGGCTTCAAGCTG  921

seq1  AACTGGAGCAGTGTGGTTTAGGAGAAGGCAAAAGAAGCTGCTCAATAGCT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGGAGCAGTGTGGTTTAGGAGAAGGCAAAAGAAGCTGCTCAATAGCT  971

seq1  CAGTATCCATAAACTGTGCCAGAAGGACAGGTACTCAGTGGGAAGGCCTC  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTATCCATAAACTGTGCCAGAAGGACAGGTACTCAGTGGGAAGGCCTC  1021

seq1  CTCATGATCGTAAGGAGTTATACCTCTAGGTGCCCAGCAGCCCTTTAGAC  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATGATCGTAAGGAGTTATACCTCTAGGTGCCCAGCAGCCCTTTAGAC  1071

seq1  CCCTCGGATCCTCCCACAGCCTATAAACTGGACATAATTTGATCCGAGAC  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCGGATCCTCCCACAGCCTATAAACTGGACATAATTTGATCCGAGAC  1121

seq1  CCATATGGTAGAGGGAGAGAATTC  1172
      ||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATATGGTAGAGGGAGAGAATTC  1145