BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-131O23
Chromosome12 (Build37)
Map Location 44,800,781 - 44,887,839
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100039059
Downstream geneENSMUSG00000066507, LOC100039081, LOC664854, Dnajb9, LOC100039062, Pnpla8, Nrcam, EG620025
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-131O23.bB6Ng01-131O23.g
ACCDH932868DH932869
length1,1361,095
definitionDH932868|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-131O23, 5' end.DH932869|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-131O23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(44,800,781 - 44,801,876)(44,886,754 - 44,887,839)
sequence
gaattctcacctgaggaataccgaatggcagagaagcacctgaaaaaatg
ttcaacatccttaatcatcagggaaatgcaactcaaaacaaccctgagat
tccacctcacaccaatcagaatggctaagatcaaaaattcaggtgacagc
agatgctggcgaggatgtggagaaagaggaacactccttcattgttggtg
ggatagcaagcttatacagccactctggaaatcagtttggcagttcctca
gaaaattggacataatactaccagaggatccagcaatacctctcctgggc
atatatccagaagatgttctaaccagtaagaaggacacatgctccactat
gttcatagcagccttatttataatagccagaagctggaaagaacccagat
gcccctcaacagaggaatggatacagaaaatgtacgtttacacaatggag
tactactcagctattaaaaggaatgaatttatgaaattcctaggcaaatg
gatggacctggagagcagcatcctgagtgaggtaacacattcacaaagga
actcacacaatatgtactcactgataagtagatattagctcaaaaacatt
tcttaagcctatgttttaaactctatctcagaatttgtaagtttattttt
catggttttaaaagaaatctataaaatatgtaacaaaaatttggcttaaa
tcataaatatatatatatatatatatatatacatatatatatataatgat
tcaacttttattataatatattgtatatgtaacttagattcaacacttta
aaaaacacatttaccaaaaacaatagatattttaaacactaaccacatgt
ccagcagacatttttgctaaggttaaaagttgcatgccatgtgactttac
taccatgtcaaaataaacacatggcatacactaagatggcacctataaat
ttctagtcctgtgaacccttggttatcatgtatacttttaaactagaaat
agagctggtctcttatatatttgatggtatgatttttatgatgaataata
aatctatgattaaagtaactcaggttacaaaagctacctaagattctgtc
tactacttaatcttggccactggtccaaatcaggct
gaattctctgcttcagacatggcagccttctgtttccacatttccccctt
tcctttgtacatttctctcctttggcaatgaaggcgatgcttgcattgtg
cttagaaagagagtgatgattgtggggatcctctcaccagcccagcaata
gtcatggttttggctccaactaatagaagataatccacaggctatcaagt
taccaagacaggttttcaggttgacatctttcttgattcttttgatgtca
gatttctagatcattaaagttactagaggtaagtaatttgtagataaaag
agaatgtaagacaaatatactcaaaaggtgggttggttaaatctgtgttg
tattggtatatccaacagcttcccatcactgtaaacagaatccgagaaaa
ggtttccttgatgagtccatgattggtgagctgtgtggctttggtcaagt
ggaaaagcaggacaccatgatctgagcacataagagagccaaattgttca
cttcatggtcacaaaggagaagaagaaggaaaggcctgggtctcacaacc
ccctccagtgtcttaactcaaacaagaagctttcagctcttctaaaaccc
ttacattggaactggagagctggctcagcagttaagagaactgactattc
ttcaagagatctaaagttaattgcattccaactgcctatataaggaagct
caaaactacctgtaactctaggtccagatgatttaacactccctcttgac
cttctaagtacacacacttacatgcacatatgcacatatgcacacacaat
taaaaaacagaataaattattaacaacatcttaatgtgggtctggggctg
cacattaaaattactcagtgagtactaaaactgttgatgtctggccccat
ttcaactcagctgaatcgttgatctccagaaaggaggctggatctttggg
aatcattagttttagaagctcctccgctggttctaataccgcaatgagga
ctgagaatcatcattcataattgttctctcataattaagcattccttttt
tgagaaacacgcctttaagtttcattttttttcaggaacagcacc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_44800781_44801876
seq2: B6Ng01-131O23.b_117_1183

seq1  AGGGAAATGCAACTCAAAACAACCCTGAGATTCCACCTCACACCAATCAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAAATGCAACTCAAAACAACCCTGAGATTCCACCTCACACCAATCAG  50

seq1  AATGGCTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGCGAGGATGTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGCTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGCGAGGATGTG  100

seq1  GAGAAAGAGGAACACTCCTTCATTGTTGGTGGGATAGCAAGCTTATACAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAAGAGGAACACTCCTTCATTGTTGGTGGGATAGCAAGCTTATACAG  150

seq1  CCACTCTGGAAATCAGTTTGGCAGTTCCTCAGAAAATTGGACATAATACT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTCTGGAAATCAGTTTGGCAGTTCCTCAGAAAATTGGACATAATACT  200

seq1  ACCAGAGGATCCAGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGATGTTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGAGGATCCAGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGATGTTC  250

seq1  TAACCAGTAAGAAGGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACCAGTAAGAAGGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTT  300

seq1  ATAATAGCCAGAAGCTGGAAAGAACCCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATAGCCAGAAGCTGGAAAGAACCCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATG  350

seq1  GATACAGAAAATGTACGTTTACACAATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATACAGAAAATGTACGTTTACACAATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAA  400

seq1  GGAATGAATTTATGAAATTCCTAGGCAAATGGATGGACCTGGAGAGCAGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATGAATTTATGAAATTCCTAGGCAAATGGATGGACCTGGAGAGCAGC  450

seq1  ATCCTGAGTGAGGTAACACATTCACAAAGGAACTCACACAATATGTACTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTGAGTGAGGTAACACATTCACAAAGGAACTCACACAATATGTACTC  500

seq1  ACTGATAAGTAGATATTAGCTCAAAAACATTTCTTAAGCCTATGTTTTAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGATAAGTAGATATTAGCTCAAAAACATTTCTTAAGCCTATGTTTTAA  550

seq1  ACTCTATCTCAGAATTTGTAAGTTTATTTTTCATGGTTTTAAAAGAAATC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTATCTCAGAATTTGTAAGTTTATTTTTCATGGTTTTAAAAGAAATC  600

seq1  TATAAAATATGTAACAAAAATTTGGCTTAAATCATAAATATATATATATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAAATATGTAACAAAAATTTGGCTTAAATCATAAATATATATATATA  650

seq1  TATATATATATACATATATATATATAATGATTCAACTTTTATTATAATAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATATATATACATATATATATATAATGATTCAACTTTTATTATAATAT  700

seq1  ATTGTATATGTAACTTAGATTCAACACTTTAAAAAACACATTTACCAAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTATATGTAACTTAGATTCAACACTTTAAAAAACACATTTACCAAAA  750

seq1  ACAATAGATATTTTAAACACTAACCACATGTCCAGCAGACATTTTTGCTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATAGATATTTTAAACACTAACCACATGTCCAGCAGACATTTTTGCTA  800

seq1  AGGTTAAAAGTTGCATGCCATGTGACTTTACTACCATGTCAAAATAAACA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTAAAAGTTGCATGCCATGTGACTTTACTACCATGTCAAAATAAACA  850

seq1  CATGGCATACACTAAGATGGCACCTATAAAATTTCTTAGTCCTGTTGAAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||
seq2  CATGGCATACACTAAGATGGCACCTAT-AAATTTC-TAGTCCTG-TGAAC  897

seq1  CCTTGGTTTATCATTGTATACTTTTAAACTAAGGAAATAAGAGCTGGTCT  950
      |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||
seq2  CCTTGG-TTATCA-TGTATACTTTTAAACTA--GAAAT-AGAGCTGGTCT  942

seq1  CTTATTATTATTTTGGATTGTTATGGATTTTTTATGATG-ATAATAAATT  999
      ||||    ||| || || || ||||   ||||||||||| ||||||||| 
seq2  CTTA----TATATTTGA-TGGTATG--ATTTTTATGATGAATAATAAAT-  984

seq1  CCTATGATTATAAAGTTATACTCAAGTTTACAAAAGCTAACCTAGAGATT  1049
       |||||||  ||||||   |||| || ||||||||||| ||||| |||||
seq2  -CTATGAT--TAAAGT--AACTC-AGGTTACAAAAGCT-ACCTA-AGATT  1026

seq1  CTTGTCTAACTACTTATATCTTTGCCAACTGTGTTCAAAATCAGGCT  1096
      | ||||| |||||||| ||||| ||||    || || ||||||||||
seq2  C-TGTCT-ACTACTTA-ATCTTGGCCA---CTGGTCCAAATCAGGCT  1067

seq1: chr12_44886754_44887839
seq2: B6Ng01-131O23.g_69_1163 (reverse)

seq1  GGTGCTGTTCTTGAAAAAAAAATGGAACTTAAAG--CTGGTTCTTCAAAA  48
      |||||||||| || |||||||||| |||||||||   || ||||  ||||
seq2  GGTGCTGTTCCTG-AAAAAAAATGAAACTTAAAGGCGTGTTTCTCAAAAA  49

seq1  A-GAATGCTTAATTAT--GAGAACAATTATGAATGATGATTCTCAAGTCT  95
      | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||   ||
seq2  AGGAATGCTTAATTATGAGAGAACAATTATGAATGATGATTCTCAGTCCT  99

seq1  CATTGC-GTATTAGAACCAGCGGA-GAGCTTCTAAAACTAATGATTCCC-  142
      |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| 
seq2  CATTGCGGTATTAGAACCAGCGGAGGAGCTTCTAAAACTAATGATTCCCA  149

seq1  AAGATCCAGCCTCC-TTCTGGAGATC-ACGATTCAGCTGAGTTGAAATGG  190
      |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATCCAGCCTCCTTTCTGGAGATCAACGATTCAGCTGAGTTGAAATGG  199

seq1  GGCCAGACATCAACAGTTTTAGTACTCACTGAGTAATTTTAATGTGCAGC  240
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCAGACATCAACAGTTTTAGTACTCACTGAGTAATTTTAATGTGCAGC  249

seq1  CCCAGACCCACATTAAGATGTTGTTAATAATTTATTCTGTTTTTTAATTG  290
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGACCCACATTAAGATGTTGTTAATAATTTATTCTGTTTTTTAATTG  299

seq1  TGTGTGCATATGTGCATATGTGCATGTAAGTGTGTGTACTTAGAAGGTCA  340
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGCATATGTGCATATGTGCATGTAAGTGTGTGTACTTAGAAGGTCA  349

seq1  AGAGGGAGTGTTAAATCATCTGGACCTAGAGTTACAGGTAGTTTTGAGCT  390
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGGAGTGTTAAATCATCTGGACCTAGAGTTACAGGTAGTTTTGAGCT  399

seq1  TCCTTATATAGGCAGTTGGAATGCAATTAACTTTAGATCTCTTGAAGAAT  440
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTATATAGGCAGTTGGAATGCAATTAACTTTAGATCTCTTGAAGAAT  449

seq1  AGTCAGTTCTCTTAACTGCTGAGCCAGCTCTCCAGTTCCAATGTAAGGGT  490
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCAGTTCTCTTAACTGCTGAGCCAGCTCTCCAGTTCCAATGTAAGGGT  499

seq1  TTTAGAAGAGCTGAAAGCTTCTTGTTTGAGTTAAGACACTGGAGGGGGTT  540
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGAAGAGCTGAAAGCTTCTTGTTTGAGTTAAGACACTGGAGGGGGTT  549

seq1  GTGAGACCCAGGCCTTTCCTTCTTCTTCTCCTTTGTGACCATGAAGTGAA  590
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGACCCAGGCCTTTCCTTCTTCTTCTCCTTTGTGACCATGAAGTGAA  599

seq1  CAATTTGGCTCTCTTATGTGCTCAGATCATGGTGTCCTGCTTTTCCACTT  640
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTTGGCTCTCTTATGTGCTCAGATCATGGTGTCCTGCTTTTCCACTT  649

seq1  GACCAAAGCCACACAGCTCACCAATCATGGACTCATCAAGGAAACCTTTT  690
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCAAAGCCACACAGCTCACCAATCATGGACTCATCAAGGAAACCTTTT  699

seq1  CTCGGATTCTGTTTACAGTGATGGGAAGCTGTTGGATATACCAATACAAC  740
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCGGATTCTGTTTACAGTGATGGGAAGCTGTTGGATATACCAATACAAC  749

seq1  ACAGATTTAACCAACCCACCTTTTGAGTATATTTGTCTTACATTCTCTTT  790
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGATTTAACCAACCCACCTTTTGAGTATATTTGTCTTACATTCTCTTT  799

seq1  TATCTACAAATTACTTACCTCTAGTAACTTTAATGATCTAGAAATCTGAC  840
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTACAAATTACTTACCTCTAGTAACTTTAATGATCTAGAAATCTGAC  849

seq1  ATCAAAAGAATCAAGAAAGATGTCAACCTGAAAACCTGTCTTGGTAACTT  890
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAAAGAATCAAGAAAGATGTCAACCTGAAAACCTGTCTTGGTAACTT  899

seq1  GATAGCCTGTGGATTATCTTCTATTAGTTGGAGCCAAAACCATGACTATT  940
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGCCTGTGGATTATCTTCTATTAGTTGGAGCCAAAACCATGACTATT  949

seq1  GCTGGGCTGGTGAGAGGATCCCCACAATCATCACTCTCTTTCTAAGCACA  990
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGGCTGGTGAGAGGATCCCCACAATCATCACTCTCTTTCTAAGCACA  999

seq1  ATGCAAGCATCGCCTTCATTGCCAAAGGAGAGAAATGTACAAAGGAAAGG  1040
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAAGCATCGCCTTCATTGCCAAAGGAGAGAAATGTACAAAGGAAAGG  1049

seq1  GGGAAATGTGGAAACAGAAGGCTGCCATGTCTGAAGCAGAGAATTC  1086
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAAATGTGGAAACAGAAGGCTGCCATGTCTGAAGCAGAGAATTC  1095