BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-136B19
Chromosome12 (Build37)
Map Location 26,455,258 - 26,568,772
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC668726
Upstream geneLOC668719, Mboat2, EG629397, C330002I19Rik, Id2, LOC100042973, LOC100042974
Downstream geneRnf144, Rsad2, Tyki, LOC668731, 1700020D12Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-136B19.bB6Ng01-136B19.g
ACCDH935974DH935975
length5311,157
definitionDH935974|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-136B19, 5' end.DH935975|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-136B19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(26,455,258 - 26,455,788)(26,567,599 - 26,568,772)
sequence
tctggattttcattactcaatatgccaaaggctcagaaaagccaggtgtc
acgcacatgacagcaatagcatggccattctacctggacactgtggactt
ttgtggccctagggccttcaaacccactctcatcagtgtcccctgataga
tccagccttgtttagcttctttagcacccctgcgtgctctcactgagttg
ttgagggcacactgtggaggcctgactttccttggccacaggactgaggg
gaatagatcagaagatgtggggcccatgttggttgcattagcttctcacg
ctgagtctgttgaccacagtgttcctcactctgggcaaagtcatcaaaat
gtgaaatgtgtcaccgattcactgatgtctgtactaacagagtcttactc
ccattcttacccccaagcaactccagatgtctgggaagcaagtcccaggc
ataggctgagtggagaacagtgtgtatatgtatgtgcatgcgcatgtttg
ggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gaattccataatttcaaggctacagtgtcccaagtggaaatctgaaagcc
acacctgattgtgctcccgaagatctgagccctcaggtgcctctttaagg
ggggagacagccaatccttgagcagggtccctttcttctcacagatgggc
aagactttcttggtcctaattttttctgcagtaagccaggtggtaggccc
gttgagattgcagcaggcagtcatgccagcttgctgcttctctagatgag
gatttttgttgaatggacaccttctttgaaatcaatagtgatttgaacac
ctcctacctaaaatctacacaaagcaaatatgtcaggaccctgaaacatc
agtgaattacctaaattcagaactgataatgaattccaaacagcagaagt
gagataatgcccattaaaggtttgctgcagggtgtgggtggatgaaaaaa
aaaaaaaaacacagtggcccaacaaggagagaggtgtgatgccagtcaca
gattgcggatggcgaaaaggtaacgttataaaaaacgactaagattgggt
agaagctctggagaatgtccaccccctgtcatccaaaaggcaaaggcaaa
catggtttctgtactgctaaatcaatgcaggagagagctgtagagaaggt
ttagttgataaaccttctgtataatcctgagcagcacctgagttcagagt
tctagcatccacataaaagccaagtgagcatggtaccctgtctgtaacct
cagagctcaagaggcagagacagggtaccccaaagcaagtagtctagctc
aactagacaaatctgcaagcgctgggtccagagagagacccagcctatgt
agataaactggagagggatcaagaaacatacccgatgtcaacctctgaca
ttcacaggacacctgcaaacatgcacttacatatgtctgaacacacatac
caaatacacatccatgtgcaataaatagttaattaactaatgcaggaaaa
tgtttgaagatttctaacagctgggtgtataaaatcaactcaattcagat
gaacaatgttctatgttttcaaggtatcgctgcttcagacaatcgacaaa
aacagaagaagaaagatggaagatctaatttagcttttttccttacaaga
atcaagt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_26455258_26455788
seq2: B6Ng01-136B19.b_57_587

seq1  TCTGGATTTTCATTACTCAATATGCCAAAGGCTCAGAAAAGCCAGGTGTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGATTTTCATTACTCAATATGCCAAAGGCTCAGAAAAGCCAGGTGTC  50

seq1  ACGCACATGACAGCAATAGCATGGCCATTCTACCTGGACACTGTGGACTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGCACATGACAGCAATAGCATGGCCATTCTACCTGGACACTGTGGACTT  100

seq1  TTGTGGCCCTAGGGCCTTCAAACCCACTCTCATCAGTGTCCCCTGATAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGGCCCTAGGGCCTTCAAACCCACTCTCATCAGTGTCCCCTGATAGA  150

seq1  TCCAGCCTTGTTTAGCTTCTTTAGCACCCCTGCGTGCTCTCACTGAGTTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGCCTTGTTTAGCTTCTTTAGCACCCCTGCGTGCTCTCACTGAGTTG  200

seq1  TTGAGGGCACACTGTGGAGGCCTGACTTTCCTTGGCCACAGGACTGAGGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGGGCACACTGTGGAGGCCTGACTTTCCTTGGCCACAGGACTGAGGG  250

seq1  GAATAGATCAGAAGATGTGGGGCCCATGTTGGTTGCATTAGCTTCTCACG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAGATCAGAAGATGTGGGGCCCATGTTGGTTGCATTAGCTTCTCACG  300

seq1  CTGAGTCTGTTGACCACAGTGTTCCTCACTCTGGGCAAAGTCATCAAAAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGTCTGTTGACCACAGTGTTCCTCACTCTGGGCAAAGTCATCAAAAT  350

seq1  GTGAAATGTGTCACCGATTCACTGATGTCTGTACTAACAGAGTCTTACTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAAATGTGTCACCGATTCACTGATGTCTGTACTAACAGAGTCTTACTC  400

seq1  CCATTCTTACCCCCAAGCAACTCCAGATGTCTGGGAAGCAAGTCCCAGGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTCTTACCCCCAAGCAACTCCAGATGTCTGGGAAGCAAGTCCCAGGC  450

seq1  ATAGGCTGAGTGGAGAACAGTGTGTATATGTATGTGCATGCGCATGTTTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGCTGAGTGGAGAACAGTGTGTATATGTATGTGCATGCGCATGTTTG  500

seq1  GGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  531
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  531

seq1: chr12_26567599_26568772
seq2: B6Ng01-136B19.g_67_1223 (reverse)

seq1  ACTTGAAATCCTTGTAAGGAAAAAAAGCTAAATTAGATCCTATCACATTC  50
      |||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||| |    |  ||
seq2  ACTTG--ATTCTTGTAAGG-AAAAAAGCTAAATTAGATCTT----CCATC  43

seq1  TTTCTTCTTTCCTCTATTTTGTTAGAATTTGTCTG-AGCAGCGATA-CTT  98
      ||||||||    ||| ||||  | ||  ||||||| |||||||||| |||
seq2  TTTCTTCT----TCTGTTTTTGTCGA--TTGTCTGAAGCAGCGATACCTT  87

seq1  GAAAACATTTAGAACATGGTTCATCTGAAATTGAGTTGATTTTTATACAC  148
      |||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||
seq2  GAAAACA--TAGAACATTGTTCATCTG-AATTGAGTTGA-TTTTATACAC  133

seq1  ACAGCTGTTAGAAATCTTCAAACATTTTCCTGCATTAGTTAATTAACTTA  198
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  CCAGCTGTTAGAAATCTTCAAACATTTTCCTGCATTAGTTAATTAAC-TA  182

seq1  TTTATTGCACATGGATGTGTATTTGGTATGTGTGTTCAGACATATGTAAG  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTGCACATGGATGTGTATTTGGTATGTGTGTTCAGACATATGTAAG  232

seq1  TGCATGTTTGCAGGTGTCCTTGTGAATGTCAGAGGTTGACATCGGGTATG  298
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATGTTTGCAGGTGTCC-TGTGAATGTCAGAGGTTGACATCGGGTATG  281

seq1  TTTCTTGATCCCTCTCCAGTTTATCTACATAGGCTGGGTCTCTCTCTGGA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTGATCCCTCTCCAGTTTATCTACATAGGCTGGGTCTCTCTCTGGA  331

seq1  CCCAGCGCTTGCAGATTTGTCTAGTTGAGCTAGACTACTTGCTTTGGGGT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGCGCTTGCAGATTTGTCTAGTTGAGCTAGACTACTTGCTTTGGGGT  381

seq1  ACCCTGTCTCTGCCTCTTGAGCTCTGAGGTTACAGACAGGGTACCATGCT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTGTCTCTGCCTCTTGAGCTCTGAGGTTACAGACAGGGTACCATGCT  431

seq1  CACTTGGCTTTTATGTGGATGCTAGAACTCTGAACTCAGGTGCTGCTCAG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTGGCTTTTATGTGGATGCTAGAACTCTGAACTCAGGTGCTGCTCAG  481

seq1  GATTATACAGAAGGTTTATCAACTAAACCTTCTCTACAGCTCTCTCCTGC  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTATACAGAAGGTTTATCAACTAAACCTTCTCTACAGCTCTCTCCTGC  531

seq1  ATTGATTTAGCAGTACAGAAACCATGTTTGCCTTTGCCTTTTGGATGACA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGATTTAGCAGTACAGAAACCATGTTTGCCTTTGCCTTTTGGATGACA  581

seq1  GGGGGTGGACATTCTCCAGAGCTTCTACCCAATCTTAGTCGTTTTTTATA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGTGGACATTCTCCAGAGCTTCTACCCAATCTTAGTCGTTTTTTATA  631

seq1  ACGTTACCTTTTCGCCATCCGCAATCTGTGACTGGCATCACACCTCTCTC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTTACCTTTTCGCCATCCGCAATCTGTGACTGGCATCACACCTCTCTC  681

seq1  CTTGTTGGGCCACTGTGTTTTTTTTTTTTTTTCATCCACCCACACCCTGC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTTGGGCCACTGTGTTTTTTTTTTTTTTTCATCCACCCACACCCTGC  731

seq1  AGCAAACCTTTAATGGGCATTATCTCACTTCTGCTGTTTGGAATTCATTA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAACCTTTAATGGGCATTATCTCACTTCTGCTGTTTGGAATTCATTA  781

seq1  TCAGTTCTGAATTTAGGTAATTCACTGATGTTTCAGGGTCCTGACATATT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTTCTGAATTTAGGTAATTCACTGATGTTTCAGGGTCCTGACATATT  831

seq1  TGCTTTGTGTAGATTTTAGGTAGGAGGTGTTCAAATCACTATTGATTTCA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTTGTGTAGATTTTAGGTAGGAGGTGTTCAAATCACTATTGATTTCA  881

seq1  AAGAAGGTGTCCATTCAACAAAAATCCTCATCTAGAGAAGCAGCAAGCTG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAGGTGTCCATTCAACAAAAATCCTCATCTAGAGAAGCAGCAAGCTG  931

seq1  GCATGACTGCCTGCTGCAATCTCAACGGGCCTACCACCTGGCTTACTGCA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGACTGCCTGCTGCAATCTCAACGGGCCTACCACCTGGCTTACTGCA  981

seq1  GAAAAAATTAGGACCAAGAAAGTCTTGCCCATCTGTGAGAAGAAAGGGAC  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAAATTAGGACCAAGAAAGTCTTGCCCATCTGTGAGAAGAAAGGGAC  1031

seq1  CCTGCTCAAGGATTGGCTGTCTCCCCCCTTAAAGAGGCACCTGAGGGCTC  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCTCAAGGATTGGCTGTCTCCCCCCTTAAAGAGGCACCTGAGGGCTC  1081

seq1  AGATCTTCGGGAGCACAATCAGGTGTGGCTTTCAGATTTCCACTTGGGAC  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCTTCGGGAGCACAATCAGGTGTGGCTTTCAGATTTCCACTTGGGAC  1131

seq1  ACTGTAGCCTTGAAATTATGGAATTC  1174
      ||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTAGCCTTGAAATTATGGAATTC  1157