BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-151F10
Chromosome12 (Build37)
Map Location 20,283,803 - 20,462,359
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC668614, LOC100042751, LOC100043371, EG668455
Upstream geneEG546524, EG668584, EG544848, EG627871, LOC100042698, LOC629055, EG668588, LOC100042706, EG668594, EG668600, LOC100042727, LOC673301, EG668605
Downstream geneLOC100042755, LOC100043377, LOC625810, 1700030C10Rik, 3110053B16Rik, LOC668698, LOC546752, EG629257, Ddef2, Itgb1bp1, Cpsf3, Iah1, Adam17, Ywhaq, LOC100043407
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-151F10.bB6Ng01-151F10.g
ACCDH947181DH947182
length1,1701,133
definitionDH947181|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-151F10, 5' end.DH947182|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-151F10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(20,283,803 - 20,284,971)(20,461,227 - 20,462,359)
sequence
gaattcaacaaaggtgccaagagtgacccatccattgtctggttgctgca
gtgtgatcccagcagtgctagccagttctgaggggaatggacttttacac
agttgtgagaaacacaggcttgacctgccatcttcagctttgcttgcaaa
agtggatttctccgtgatttctcctgctctctcaggacctgggtccagac
agcatatcacattcacctgatctggctggatgcagctccctcctctgtct
gatccaatagatgtccctccccatccagtccaggctggttccttccaagg
tttcaagtgttctgggctgtagggctccttccctgcccacagagggcctg
gagacccttaaggacaccatacaggacatttcagtatcttaccgagacca
gctgatttattctatgatcccaggtgactttgtgaggatgaagaagatgg
agagcagacaggcaagcccttcctgtgcatggctccacctcccttgttca
ttttctctgagcaaagctgcttgcatgtatataccgtggtatccttactt
ttaatatataagttttgtataaagtgagaaggttcagcccctgtatttaa
agcctctgactgcctttaaagcatggtcccctgtggcctgtgattctccc
cacccccaagtctggctgtgctgtggtatttaagtattcatttgcctaat
tacacaggagatacatgcatgcccaaggctgtggacatcggccctccgtc
ctgcaaaacacacgtcctgtgtgctctgtccttcctttccattggcctgg
catattaaaataatctaataaaccaaggtctgtgagtttcctgtgttgcc
gcaagcaccctgttcatgggttcactctccagtgagtgtgggaatgaagc
aggtagtggtagacattgggaaagtcccttgaatgtttgggacagccgag
atttagtcagataggagtccatgccagcctttccccactcagtgggatcc
acacacagcaaggccattggccctccttattctgttggctagaagtggtt
tttagataattgacagaaacagtcctctcaggccaacaggcatgggccct
ggcctaattgtcatcccgcccgttcaggatcacttattctatatggggaa
taacgggaggatggaatgtg
gaattcaaggaaggctagcctgggctacagagcaagttctaggatagcca
ggactacacagagaaaccctgtctttctctcatagacatacacacaaaca
cacacacatacacacacacacacacacagagacagacagacagacagaca
gacagagacagagagacagagagagagagacacagagagagaaaaagaca
gagagacagagagatatctacaaatggacaaagattatacactagggcat
gtggccattgctgccatctgtgagaactggtcacatgggtttgtgagtgg
aggcctcctgtggaagaacttactggaaaggtaaagttgactgaagtggg
gaattggctggatggacaggtatcttgtaggaccttttgtcgtgttttcc
tttgtaattttatttgtttatttgttttctgagacagggtctcatgtagc
tcatgctggcttcaaacttactatgtagctgaggacgacctgtaccctta
ccttcctgcttcccctgtctagcagtcacagctattagccacaaagcctg
gctcatttgcagggtttgtttgtttgtttgtttgttttgttttattttag
agacaggatttctctgtatagccctggctgtcctggaactcactttgtag
accaagctggcctcgaactcagaaacctacctgactctgcctcccaagtg
ctgggattaaaggtcatttacagttttaagatgtcgaaatgtgtccatat
gttcttttccttttttctctttcaaagctttaagaatatttacttatata
gtatgttacaactgtttttcttgttatataatacattgagaggttgcctg
gtacctgctgaggcctgaatagtatgtcggatccctggaactggagttac
acatgttgtgagccccatgtggatgttggtgaacaggactgaactgggat
cctctgcaagaacagcagagtccttctctgcaggatcccatttctcctta
gatttttattttctacttcaagagagcatccaccaatcataggttcccag
cttcaatttcttggactgatggcatgctagaacctccgagtgtatgaaac
aatgttgtgctaagcctggctgtggaggggctt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_20283803_20284971
seq2: B6Ng01-151F10.b_46_1215

seq1  GAATTCAACAAAGGTGCCAAGAGTGACCCATCCATTGTCTGGTTGCTGCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAACAAAGGTGCCAAGAGTGACCCATCCATTGTCTGGTTGCTGCA  50

seq1  GTGTGATCCCAGCAGTGCTAGCCAGTTCTGAGGGGAATGGACTTTTACAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGATCCCAGCAGTGCTAGCCAGTTCTGAGGGGAATGGACTTTTACAC  100

seq1  AGTTGTGAGAAACACAGGCTTGACCTGCCATCTTCAGCTTTGCTTGCAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGTGAGAAACACAGGCTTGACCTGCCATCTTCAGCTTTGCTTGCAAA  150

seq1  AGTGGATTTCTCCGTGATTTCTCCTGCTCTCTCAGGACCTGGGTCCAGAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGATTTCTCCGTGATTTCTCCTGCTCTCTCAGGACCTGGGTCCAGAC  200

seq1  AGCATATCACATTCACCTGATCTGGCTGGATGCAGCTCCCTCCTCTGTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATATCACATTCACCTGATCTGGCTGGATGCAGCTCCCTCCTCTGTCT  250

seq1  GATCCAATAGATGTCCCTCCCCATCCAGTCCAGGCTGGTTCCTTCCAAGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCCAATAGATGTCCCTCCCCATCCAGTCCAGGCTGGTTCCTTCCAAGG  300

seq1  TTTCAAGTGTTCTGGGCTGTAGGGCTCCTTCCCTGCCCACAGAGGGCCTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAAGTGTTCTGGGCTGTAGGGCTCCTTCCCTGCCCACAGAGGGCCTG  350

seq1  GAGACCCTTAAGGACACCATACAGGACATTTCAGTATCTTACCGAGACCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACCCTTAAGGACACCATACAGGACATTTCAGTATCTTACCGAGACCA  400

seq1  GCTGATTTATTCTATGATCCCAGGTGACTTTGTGAGGATGAAGAAGATGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGATTTATTCTATGATCCCAGGTGACTTTGTGAGGATGAAGAAGATGG  450

seq1  AGAGCAGACAGGCAAGCCCTTCCTGTGCATGGCTCCACCTCCCTTGTTCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCAGACAGGCAAGCCCTTCCTGTGCATGGCTCCACCTCCCTTGTTCA  500

seq1  TTTTCTCTGAGCAAAGCTGCTTGCATGTATATACCGTGGTATCCTTACTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTCTGAGCAAAGCTGCTTGCATGTATATACCGTGGTATCCTTACTT  550

seq1  TTAATATATAAGTTTTGTATAAAGTGAGAAGGTTCAGCCCCTGTATTTAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATATATAAGTTTTGTATAAAGTGAGAAGGTTCAGCCCCTGTATTTAA  600

seq1  AGCCTCTGACTGCCTTTAAAGCATGGTCCCCTGTGGCCTGTGATTCTCCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTCTGACTGCCTTTAAAGCATGGTCCCCTGTGGCCTGTGATTCTCCC  650

seq1  CACCCCCAAGTCTGGCTGTGCTGTGGTATTTAAGTATTCATTTGCCTAAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCCCAAGTCTGGCTGTGCTGTGGTATTTAAGTATTCATTTGCCTAAT  700

seq1  TACACAGGAGATACATGCATGCCCAAGGCTGTGGACATCGGCCCTCCGTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACAGGAGATACATGCATGCCCAAGGCTGTGGACATCGGCCCTCCGTC  750

seq1  CTGC-AAACACACGTCCTGTGTGCTCTGTCCTTCCTTTCCATTGGCCTGG  799
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCAAAACACACGTCCTGTGTGCTCTGTCCTTCCTTTCCATTGGCCTGG  800

seq1  CATATTAAAATAATCTAATAAACCAAGGTCTGTGAGTTTCCTGTGTTGCC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATTAAAATAATCTAATAAACCAAGGTCTGTGAGTTTCCTGTGTTGCC  850

seq1  GCAAGCACCCTGTTCAT-GGTTCACTCTCCAGTGAGTGTGGGAATGAAGC  898
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGCACCCTGTTCATGGGTTCACTCTCCAGTGAGTGTGGGAATGAAGC  900

seq1  AGGTAAGTGGTAGACATTGGGAAAGT-CCTTGAATGTATGGAACAGCCGA  947
      |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||
seq2  AGGT-AGTGGTAGACATTGGGAAAGTCCCTTGAATGTTTGGGACAGCCGA  949

seq1  GAATTTAGTCAGATAGGAGTCCATGCCAGCCTTTCCCCACTCAGTGGGAT  997
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  G-ATTTAGTCAGATAGGAGTCCATGCCAGCCTTTCCCCACTCAGTGGGAT  998

seq1  CCACACACAGCAAGGCCATTGGCCCTCC-TATTCTGTTGGCTAGAAGTTG  1046
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
seq2  CCACACACAGCAAGGCCATTGGCCCTCCTTATTCTGTTGGCTAGAAGTGG  1048

seq1  -TTTTAGATATTGGACAGAAACAGTCC-CTCAGGGCCAAACAGGGCATGT  1094
       ||||||||| | |||||||||||||| ||||||  | |||| |||||| 
seq2  TTTTTAGATAATTGACAGAAACAGTCCTCTCAGG--CCAACA-GGCATGG  1095

seq1  GCCCTGG-CTAA-TGTCATCCAGCACGTTCAGGATCACTTATTCAAATAA  1142
      ||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |   |
seq2  GCCCTGGCCTAATTGTCATCCCGCCCGTTCAGGATCACTTATTCTA--TA  1143

seq1  TGGGGAATAAGGGGATGGATGG-ATGTG  1169
      |||||||||| |||| |||||| |||||
seq2  TGGGGAATAACGGGA-GGATGGAATGTG  1170

seq1: chr12_20461227_20462359
seq2: B6Ng01-151F10.g_68_1200 (reverse)

seq1  AAGCCCCTCC-CAGACAGGGCTTAGC-CAACATTGTTCTATCAACTCGGA  48
      |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||  |||||||
seq2  AAGCCCCTCCACAGCCA-GGCTTAGCACAACATTGTTTCATACACTCGGA  49

seq1  GGTTCTTAGACATGCCATCAGT-CAAGAGATTGAGGCTGGGACACTATGA  97
      ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||
seq2  GGTTC-TAG-CATGCCATCAGTCCAAGAAATTGAAGCTGGGAACCTATGA  97

seq1  TTGGTGGATGCTTCTTCTTTGAGTAGAAAAT-AAAATCTAAGGAG-AATG  145
      ||||||||||||   ||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||
seq2  TTGGTGGATGCT--CTCTTGAAGTAGAAAATAAAAATCTAAGGAGAAATG  145

seq1  GGATCCTGCAGAG-AGGGCTCTTGCTGTTCTTGCAGAGGATCCCAGTTCA  194
      ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATCCTGCAGAGAAGGACTC-TGCTGTTCTTGCAGAGGATCCCAGTTCA  194

seq1  GTCCTGTTC-CCTACATCCACATGGTGGCTCACAACATGTGTAACTCCAG  243
      ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTGTTCACCAACATCCACATGG-GGCTCACAACATGTGTAACTCCAG  243

seq1  TTCCAGGGATCCGACATACTATTCAGGCCTCAGCAGGTACCAGGCAACCT  293
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGGGATCCGACATACTATTCAGGCCTCAGCAGGTACCAGGCAACCT  293

seq1  CTCAATGTATTATATAACAAGAAAAACAGTTGTAACATACTATATAAGTA  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAATGTATTATATAACAAGAAAAACAGTTGTAACATACTATATAAGTA  343

seq1  AATATTCTTAAAGCTTTGAAAGAGAAAAAAGGAAAAGAACATATGGACAC  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATTCTTAAAGCTTTGAAAGAGAAAAAAGGAAAAGAACATATGGACAC  393

seq1  ATTTCGACATCTTAAAACTGTAAATGACCTTTAATCCCAGCACTTGGGAG  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCGACATCTTAAAACTGTAAATGACCTTTAATCCCAGCACTTGGGAG  443

seq1  GCAGAGTCAGGTAGGTTTCTGAGTTCGAGGCCAGCTTGGTCTACAAAGTG  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAGTCAGGTAGGTTTCTGAGTTCGAGGCCAGCTTGGTCTACAAAGTG  493

seq1  AGTTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGAGAAATCCTGTCTCTAAAATAAA  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGAGAAATCCTGTCTCTAAAATAAA  543

seq1  ACAAAACAAACAAACAAACAAACAAACCCTGCAAATGAGCCAGGCTTTGT  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAACAAACAAACAAACAAACAAACCCTGCAAATGAGCCAGGCTTTGT  593

seq1  GGCTAATAGCTGTGACTGCTAGACAGGGGAAGCAGGAAGGTAAGGGTACA  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTAATAGCTGTGACTGCTAGACAGGGGAAGCAGGAAGGTAAGGGTACA  643

seq1  GGTCGTCCTCAGCTACATAGTAAGTTTGAAGCCAGCATGAGCTACATGAG  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCGTCCTCAGCTACATAGTAAGTTTGAAGCCAGCATGAGCTACATGAG  693

seq1  ACCCTGTCTCAGAAAACAAATAAACAAATAAAATTACAAAGGAAAACACG  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTGTCTCAGAAAACAAATAAACAAATAAAATTACAAAGGAAAACACG  743

seq1  ACAAAAGGTCCTACAAGATACCTGTCCATCCAGCCAATTCCCCACTTCAG  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAAGGTCCTACAAGATACCTGTCCATCCAGCCAATTCCCCACTTCAG  793

seq1  TCAACTTTACCTTTCCAGTAAGTTCTTCCACAGGAGGCCTCCACTCACAA  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACTTTACCTTTCCAGTAAGTTCTTCCACAGGAGGCCTCCACTCACAA  843

seq1  ACCCATGTGACCAGTTCTCACAGATGGCAGCAATGGCCACATGCCCTAGT  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCATGTGACCAGTTCTCACAGATGGCAGCAATGGCCACATGCCCTAGT  893

seq1  GTATAATCTTTGTCCATTTGTAGATATCTCTCTGTCTCTCTGTCTTTTTC  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATAATCTTTGTCCATTTGTAGATATCTCTCTGTCTCTCTGTCTTTTTC  943

seq1  TCTCTCTGTGTCTCTCTCTCTCTGTCTCTCTGTCTCTGTCTGTCTGTCTG  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCTGTGTCTCTCTCTCTCTGTCTCTCTGTCTCTGTCTGTCTGTCTG  993

seq1  TCTGTCTGTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTTTGTGTG  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTCTGTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTTTGTGTG  1043

seq1  TATGTCTATGAGAGAAAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGTCCTGGCTATCCT  1093
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTCTATGAGAGAAAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGTCCTGGCTATCCT  1093

seq1  AGAACTTGCTCTGTAGCCCAGGCTAGCCTTCCTTGAATTC  1133
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACTTGCTCTGTAGCCCAGGCTAGCCTTCCTTGAATTC  1133