BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-152A08
Chromosome12 (Build37)
Map Location 31,969,076 - 32,081,063
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLamb1-1, Dld
Upstream geneSntg2, Tmem18, LOC100043055, Acp1, Sh3yl1, LOC629656, 9030611O19Rik, LOC668781, LOC100043065, LOC100043514, EG629667, LOC100043068
Downstream geneLOC668786, Slc26a3, Cbll1, Slc26a4, LOC100043531, Bcap29, Dus4l, LOC100043081, Gpr22, Hbp1, Prkar2b, Pik3cg, 2010109K11Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-152A08.bB6Ng01-152A08.g
ACCDH947699DH947700
length1,2021,051
definitionDH947699|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-152A08, 5' end.DH947700|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-152A08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(31,969,076 - 31,970,277)(32,080,014 - 32,081,063)
sequence
gaattccagacagacttgactttgcagcgtagcaaaacctttgtgacctg
acaccaagccattctcagatgctgggtgtcttgtgtgggctgggagactg
tctgctcttcaattcagcatgacggctggccaagaaaggattttgaactc
cacctaagtgcactcctgtcaaggcaggtgcaggagaggagggacctgtc
tgtcctgttcccgaattccaggcagtagaaatgagggttaaggtggaggg
cttatgtatgtgcgcgcttgcttggtagaagtgacgtactgcaagggtct
tcagcacaacttgccacaaaaggacatgcagtagtgtaccttaggtctta
aagaaaaattaatttgtgtctttctcatagttccatatctttacttgaag
gaaaacagatggtagatggttttaaaaaatggttttacttatggttaaga
aaaattaagagctgggattaaaggggagaaaaagcagaaacctttcaagg
aaaatgatggcttggcgcagaggagcgcgcacattcgttagagcctgttc
tcgcagagcagtgcgtgctgagtgctccactaagacctacaggtttctag
tacagtagctttcagaggttattcttaaatattactacactttgaaatcc
ctttattctgtgtgtatgtgtgtcctcacacatgtgcgactgagtttgta
tggaggtcagagcataacctgaaagagtcagcttctcctagccacatagg
aatcgaatgtgggtattcagggcagtagtttttgttgtggtagttgttgt
aattcttaaataattacttgtaaattatttattttagattataatttatc
tcacttcactctttgcctccttctaaaaccttctcgctctcttaaatatg
tagcctctttttttcattaattgtagttacatttgtgaatgtgtgtatat
gtatacatacacgtgtgtgtgtgtgtatctatctatgtatgtatattccc
aagtgcctgagtacagcctgctcagtctgtaccactgtaaccttgcctgt
gtgttttcaggactgatcatttggcaattggataaccaagtaggtgtgtc
cttcctggggacacccagttctcctgttggtagcgttccttgattgccgt
gccggtccttcaaagggaatccttaaagtgttaatttggtccatcgattc
tt
gaattcatttccaagaggcttaatcgccctaccccaacacaacctcacca
caggcacccttgctgcccagagctgataagaatcacccacacttactgca
gtgctattatctgtcataggctgttctgaccatcagcaatgtggcaaaag
gcctggtgggcagaggcagaggtgtccactgaagtatgtcattgggttgg
tggggtgcccatcctaggcctgtgcttatcaatctggtacctccagacat
cagctcctcttgaattagggaactgggacagttttacagtgaatgctgtg
gtggtttgttctgtgggcagggatagtgggaaatgtaggagactggagtt
gagttagaaggagaagctggtctaagtgaattatttagttctttcttcct
aacctccgtgaaggcagagatgtactttctcctttgtcctttctcccttg
cgccacaggcagcagtattcgtggctgtggctgctccaggacctgactag
tgttgctttcactacacgggatctattctcatggtttcttggaaccaaag
agccagagaacttaacatggctgaaaacttccttgctgtttctaaagact
ccatcagaccaccagctctgcattcaccagcagggcaccataccttcaca
aggcttcgtgacatctaccaaaacatcttatatggcactctcttctccta
tgggtttggattctaaaaggatatctacttttaaaagtttgtctcttggg
actggagagatgactcagaggttaagagcactgactgctcttccagaggt
cctgagttcaattcccagaaaccacatggtggctcacaaccacctataac
gggatccggtgccctattctggtgtgtcttgaagatagcaacagtgtact
catatacatacatacatacatacatacatacatacatacatacatacatc
tttttttaagaaaagttttgtctttgtagtgtagcacaatgctcatataa
ctgtgaaagaagaatctagctaagaagtttagttttgttggaacaaagac
a
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_31969076_31970277
seq2: B6Ng01-152A08.b_43_1244

seq1  GAATTCCAGACAGACTTGACTTTGCAGCGTAGCAAAACCTTTGTGACCTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGACAGACTTGACTTTGCAGCGTAGCAAAACCTTTGTGACCTG  50

seq1  ACACCAAGCCATTCTCAGATGCTGGGTGTCTTGTGTGGGCTGGGAGACTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCAAGCCATTCTCAGATGCTGGGTGTCTTGTGTGGGCTGGGAGACTG  100

seq1  TCTGCTCTTCAATTCAGCATGACGGCTGGCCAAGAAAGGATTTTGAACTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCTCTTCAATTCAGCATGACGGCTGGCCAAGAAAGGATTTTGAACTC  150

seq1  CACCTAAGTGCACTCCTGTCAAGGCAGGTGCAGGAGAGGAGGGACCTGTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTAAGTGCACTCCTGTCAAGGCAGGTGCAGGAGAGGAGGGACCTGTC  200

seq1  TGTCCTGTTCCCGAATTCCAGGCAGTAGAAATGAGGGTTAAGGTGGAGGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCTGTTCCCGAATTCCAGGCAGTAGAAATGAGGGTTAAGGTGGAGGG  250

seq1  CTTATGTATGTGCGCGCTTGCTTGGTAGAAGTGACGTACTGCAAGGGTCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATGTATGTGCGCGCTTGCTTGGTAGAAGTGACGTACTGCAAGGGTCT  300

seq1  TCAGCACAACTTGCCACAAAAGGACATGCAGTAGTGTACCTTAGGTCTTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCACAACTTGCCACAAAAGGACATGCAGTAGTGTACCTTAGGTCTTA  350

seq1  AAGAAAAATTAATTTGTGTCTTTCTCATAGTTCCATATCTTTACTTGAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAAAATTAATTTGTGTCTTTCTCATAGTTCCATATCTTTACTTGAAG  400

seq1  GAAAACAGATGGTAGATGGTTTTAAAAAATGGTTTTACTTATGGTTAAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAACAGATGGTAGATGGTTTTAAAAAATGGTTTTACTTATGGTTAAGA  450

seq1  AAAATTAAGAGCTGGGATTAAAGGGGAGAAAAAGCAGAAACCTTTCAAGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATTAAGAGCTGGGATTAAAGGGGAGAAAAAGCAGAAACCTTTCAAGG  500

seq1  AAAATGATGGCTTGGCGCAGAGGAGCGCGCACATTCGTTAGAGCCTGTTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATGATGGCTTGGCGCAGAGGAGCGCGCACATTCGTTAGAGCCTGTTC  550

seq1  TCGCAGAGCAGTGCGTGCTGAGTGCTCCACTAAGACCTACAGGTTTCTAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGCAGAGCAGTGCGTGCTGAGTGCTCCACTAAGACCTACAGGTTTCTAG  600

seq1  TACAGTAGCTTTCAGAGGTTATTCTTAAATATTACTACACTTTGAAATCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGTAGCTTTCAGAGGTTATTCTTAAATATTACTACACTTTGAAATCC  650

seq1  CTTTATTCTGTGTGTATGTGTGTCCTCACACATGTGCGACTGAGTTTGTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTATTCTGTGTGTATGTGTGTCCTCACACATGTGCGACTGAGTTTGTA  700

seq1  TGGAGGTCAGAGCATAACCTGAAAGAGTCAGCTTCTCCTAGCCACATAGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGGTCAGAGCATAACCTGAAAGAGTCAGCTTCTCCTAGCCACATAGG  750

seq1  AATCGAATGTGGGTATTCAGGGCAGTAGTTTTTGTTGTGGTAGTTGTTGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCGAATGTGGGTATTCAGGGCAGTAGTTTTTGTTGTGGTAGTTGTTGT  800

seq1  AATTCTTAAATAATTACTTGTAAATTATTTATTTTAGATTATAATTTATC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCTTAAATAATTACTTGTAAATTATTTATTTTAGATTATAATTTATC  850

seq1  TCACTTCACTCTTTGCCTCCTTCTAAAACCTTCTCGCTCTCTTAAATATG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTTCACTCTTTGCCTCCTTCTAAAACCTTCTCGCTCTCTTAAATATG  900

seq1  TAGCCTCTTTTTTTCATTAATTGTAGTTACATTTGTGAATGTGTGTATAT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCCTCTTTTTTTCATTAATTGTAGTTACATTTGTGAATGTGTGTATAT  950

seq1  GTATACATACACGTGTGTGTGTGTGTATCTATCTATGTATGTATATTCCC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATACATACACGTGTGTGTGTGTGTATCTATCTATGTATGTATATTCCC  1000

seq1  AAGTGCCTGAGTACAGCCTGCTCAGTCTGTA-CACTGTTAACTTGCCTGT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||
seq2  AAGTGCCTGAGTACAGCCTGCTCAGTCTGTACCACTGTAACCTTGCCTGT  1050

seq1  GTGTTTTCAGGACTGATCATTTGGC-ATTGGATAACC-AGTTAGTGTGTC  1097
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||
seq2  GTGTTTTCAGGACTGATCATTTGGCAATTGGATAACCAAGTAGGTGTGTC  1100

seq1  CTTCCCTGGGGAACACCAGTTTCTCCTGTTGTCAGCGTTCCTTAGTTGCC  1147
      ||| ||||||| |||||   |||||||||||  ||||||||||  |||||
seq2  CTT-CCTGGGG-ACACCCAGTTCTCCTGTTGGTAGCGTTCCTTGATTGCC  1148

seq1  -TG-CAGTCCTTTAAAAAGGGAATTCTTAAGTTGTTAATTTTGCTCATTC  1195
       || | ||||||   ||||||||| |||||  |||||| |||| ||  ||
seq2  GTGCCGGTCCTT--CAAAGGGAATCCTTAAAGTGTTAA-TTTGGTCCATC  1195

seq1  GATTCTT  1202
      |||||||
seq2  GATTCTT  1202

seq1: chr12_32080014_32081063
seq2: B6Ng01-152A08.g_69_1119 (reverse)

seq1  TGTCTTTGTTCCAACACAACTAAAC-TCTTAGCTAGGATTCTATCTTCAC  49
      |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||   |||||
seq2  TGTCTTTGTTCCAACAAAACTAAACTTCTTAGCTA-GATTCTTCTTTCAC  49

seq1  AGTTATATGAGCATTGTGCTACACTACAGAGACAAAACTTTTCTTTAAAA  99
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||
seq2  AGTTATATGAGCATTGTGCTACACTACAAAGACAAAACTTTTCTTAAAAA  99

seq1  AAGATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATA  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATA  149

seq1  TGAGTACACTGTTGCTATCTTC-AGACACACCAGAATAGGGCACCGGATC  198
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTACACTGTTGCTATCTTCAAGACACACCAGAATAGGGCACCGGATC  199

seq1  CCGTTATAGGTGGTTGTGAGCCACCATGTGGTTTCTGGGAATTGAACTCA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGTTATAGGTGGTTGTGAGCCACCATGTGGTTTCTGGGAATTGAACTCA  249

seq1  GGACCTCTGGAAGAGCAGTCAGTGCTCTTAACCTCTGAGTCATCTCTCCA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACCTCTGGAAGAGCAGTCAGTGCTCTTAACCTCTGAGTCATCTCTCCA  299

seq1  GTCCCAAGAGACAAACTTTTAAAAGTAGATATCCTTTTAGAATCCAAACC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCAAGAGACAAACTTTTAAAAGTAGATATCCTTTTAGAATCCAAACC  349

seq1  CATAGGAGAAGAGAGTGCCATATAAGATGTTTTGGTAGATGTCACGAAGC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGGAGAAGAGAGTGCCATATAAGATGTTTTGGTAGATGTCACGAAGC  399

seq1  CTTGTGAAGGTATGGTGCCCTGCTGGTGAATGCAGAGCTGGTGGTCTGAT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTGAAGGTATGGTGCCCTGCTGGTGAATGCAGAGCTGGTGGTCTGAT  449

seq1  GGAGTCTTTAGAAACAGCAAGGAAGTTTTCAGCCATGTTAAGTTCTCTGG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTCTTTAGAAACAGCAAGGAAGTTTTCAGCCATGTTAAGTTCTCTGG  499

seq1  CTCTTTGGTTCCAAGAAACCATGAGAATAGATCCCGTGTAGTGAAAGCAA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTTGGTTCCAAGAAACCATGAGAATAGATCCCGTGTAGTGAAAGCAA  549

seq1  CACTAGTCAGGTCCTGGAGCAGCCACAGCCACGAATACTGCTGCCTGTGG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTAGTCAGGTCCTGGAGCAGCCACAGCCACGAATACTGCTGCCTGTGG  599

seq1  CGCAAGGGAGAAAGGACAAAGGAGAAAGTACATCTCTGCCTTCACGGAGG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCAAGGGAGAAAGGACAAAGGAGAAAGTACATCTCTGCCTTCACGGAGG  649

seq1  TTAGGAAGAAAGAACTAAATAATTCACTTAGACCAGCTTCTCCTTCTAAC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGAAGAAAGAACTAAATAATTCACTTAGACCAGCTTCTCCTTCTAAC  699

seq1  TCAACTCCAGTCTCCTACATTTCCCACTATCCCTGCCCACAGAACAAACC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACTCCAGTCTCCTACATTTCCCACTATCCCTGCCCACAGAACAAACC  749

seq1  ACCACAGCATTCACTGTAAAACTGTCCCAGTTCCCTAATTCAAGAGGAGC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCACAGCATTCACTGTAAAACTGTCCCAGTTCCCTAATTCAAGAGGAGC  799

seq1  TGATGTCTGGAGGTACCAGATTGATAAGCACAGGCCTAGGATGGGCACCC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGTCTGGAGGTACCAGATTGATAAGCACAGGCCTAGGATGGGCACCC  849

seq1  CACCAACCCAATGACATACTTCAGTGGACACCTCTGCCTCTGCCCACCAG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCAACCCAATGACATACTTCAGTGGACACCTCTGCCTCTGCCCACCAG  899

seq1  GCCTTTTGCCACATTGCTGATGGTCAGAACAGCCTATGACAGATAATAGC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTTTGCCACATTGCTGATGGTCAGAACAGCCTATGACAGATAATAGC  949

seq1  ACTGCAGTAAGTGTGGGTGATTCTTATCAGCTCTGGGCAGCAAGGGTGCC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCAGTAAGTGTGGGTGATTCTTATCAGCTCTGGGCAGCAAGGGTGCC  999

seq1  TGTGGTGAGGTTGTGTTGGGGTAGGGCGATTAAGCCTCTTGGAAATGAAT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGTGAGGTTGTGTTGGGGTAGGGCGATTAAGCCTCTTGGAAATGAAT  1049

seq1  TC  1050
      ||
seq2  TC  1051