BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-155P07
Chromosome12 (Build37)
Map Location 31,502,073 - 31,609,556
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100043055, Acp1, Sh3yl1
Upstream geneMyt1l, Pxdn, Tpo, Sntg2, Tmem18
Downstream geneLOC629656, 9030611O19Rik, LOC668781, LOC100043065, LOC100043514, EG629667, LOC100043068, Lamb1-1, Dld, LOC668786, Slc26a3, Cbll1, Slc26a4, LOC100043531, Bcap29, Dus4l, LOC100043081, Gpr22
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-155P07.bB6Ng01-155P07.g
ACCDH950590DH950591
length1,1611,149
definitionDH950590|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-155P07, 5' end.DH950591|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-155P07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(31,608,384 - 31,609,556)(31,502,073 - 31,503,238)
sequence
gaattctttacttattactatgaaaattcagtgatttgctatttcaaagg
ttattttaaaactcataatctgtttgaactaccattttatactgaaattc
tcatttatgtataaaactaacgtattcatatttcagagttcatgacataa
aatgagattttaagtgaatgtgcccactaaaggaacaacctcaccacaat
gtgaatttgcttacataatagcttatttttcacacttatgtttcagcctt
tcaaagacatcactggaaggcagtttaagcccaggcgtggtagtacacac
ctttaattctagtacttagaaggtagaagcaagaggatatttgagagttc
caggctagcctggtatacatagtgaattccaagctaacctgggttagtgg
agccctgtatccaaaccaaaccaaaccaaaccaaaccaaaccaaaccaaa
ccaaaccaaccaaccaaaaaaccccacacatatacacaaaaggtttataa
attcctctacacagtgtgaaatttctaattctacaatgataaaagagtcc
tgtaaaccattgtaaatcatgtccccagagcatagcaaggacaggacaca
cataactttcggaaccttcctgtgtgggaggtagaggacaagggtacctt
cctgtgcaccagaaattgaggacacctctcctttgaaggtttgcttttat
ttttattttatgtatatgtgtgagtgcatgcatgttatgcatgtggatca
catatctgaagaggtcagaagagtgctggcacccctaacactggagttag
atgggggtaaggggccatgtggctcctgagcacgaacctaggtcctctgt
aaaagcagtcagtgttcttagctgctgagtcagctctctagtcaaacacc
ttacttttgtgttttaagttgctgcacatatgttgtaatagattgaaaat
ataacatatacatcaagcatatttattactttatatttattatttaggtg
ccacatgtggtaccatgtcctatacatgccattctggtatcatgcttcta
tggtactaatgcctcaattgagacatttaccagtaacagcatgttttgaa
agtgaggcattcttccatgccataaaacctaggtgaatctaataatcggc
accgtctcctc
gaattcctatgttaagtaactccataaaaacatggtgtttttagtctgtc
tattgaaactttgttttgcaactgtaattcatcttgtacattgttcttca
tgtccatttgtaagtaatgtatgaagcaaaacaatacaaaagaaatcagt
ctgagattccaactgctggtcaatccaaaaaagatgaaatctcggaggag
aagcttcccacatattctgaattacacgcattgtgaaaaatattatttcc
tatggatcaacttctaaatgccttgcagaagggaccctcatgttaaaatt
taagatttctaggatactttggtgtgtggtgtaaagaaggaagcaagatt
tcctcgaaatcgataccttatttcaggttgacttgtttggaagccatgcc
atgaggcctgagaagactctagtagccacatatggaacaataacgtagtc
cttatactgatgaatacgtcaacagtgctcatcatcactcagaattaata
tacgcatatgttgatgaaaaaatttatacgtgcgtcatcacaaggtagta
tgactagaacttcacttaattcatttgcacagaaacaagtctttagtcta
cttatctttgtacctgtactgtttgtttatttgttttattctccagagaa
cacccttccatttgtaaaacaagtctgggtggctatggagcaatcttcct
ctatttggtatttttagactggattatgtctttatgactatttattcatg
gatgacaaccaggtcttcatcacagttaacagagatccctcaaatgtaat
acactaggaccacccattgcattcaggaatctacagccacatggtacagg
ggggacattgtcatagatggaccaacactgccttgagttatttaaatgtc
tataataatttagctaccaaccctacatatgattttggagcagtcattaa
aaattggaaatgatttttcttgattgatagacagaaatacacattaacaa
aacaatatctactgcttttgaaatgcaaaaatggacaatcggctgaaaca
acatactaatgtaagtgaaaacatcctagagattttaacctgttatcaga
tgagatatgctagttcagcagccactacgagcatgttcagctagaactt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_31608384_31609556
seq2: B6Ng01-155P07.b_49_1209 (reverse)

seq1  GAGGAGACGGTTGCGGATTATTTAGGAATCA-CTAGTGTTTTATTGGCAT  49
      |||||||||| ||| |||||||   || ||| |||| |||||| ||||||
seq2  GAGGAGACGG-TGCCGATTATT--AGATTCACCTAG-GTTTTA-TGGCAT  45

seq1  GTGAAGAATG-CTCACTTTCAAAAACATGCTGTTA-TGGGTAATGTCTTC  97
      | |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||  
seq2  G-GAAGAATGCCTCACTTTC-AAAACATGCTGTTACTGGTAAATGTCT--  91

seq1  AAATTGAGGCATTAGTAACATTAGAAGCATTGATACCAGAATGGCATGTA  147
       |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  CAATTGAGGCATTAGTACCA-TAGAAGCA-TGATACCAGAATGGCATGTA  139

seq1  TAGGACATGGTACCAACATGTGGCACTAAAATAAATAAATAATAAAGTAA  197
      |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||| |||||||||
seq2  TAGGACATGGTACC-ACATGTGGCACCTAAAT-AATAAAT-ATAAAGTAA  186

seq1  TAAATATGCTTGATTGTATATGTTATAATTTTCAATCTATTACAACATAT  247
      ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATATGCTTGA-TGTATATGTTAT-ATTTTCAATCTATTACAACATAT  234

seq1  GTGCAGCAACTTAAAACAC-AAAGTAAGGTGTTTGACTAGAGAGCTGACT  296
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCAGCAACTTAAAACACAAAAGTAAGGTGTTTGACTAGAGAGCTGACT  284

seq1  CAGCAGCTAAGAACACTGACTGCTTTTACAGAGGACCTAGGTTCGTGCTC  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAGCTAAGAACACTGACTGCTTTTACAGAGGACCTAGGTTCGTGCTC  334

seq1  AGGAGCCACATGGCCCCTTACCCCCATCTAACTCCAGTGTTAGGGGTGCC  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGCCACATGGCCCCTTACCCCCATCTAACTCCAGTGTTAGGGGTGCC  384

seq1  AGCACTCTTCTGACCTCTTCAGATATGTGATCCACATGCATAACATGCAT  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACTCTTCTGACCTCTTCAGATATGTGATCCACATGCATAACATGCAT  434

seq1  GCACTCACACATATACATAAAATAAAAATAAAAGCAAACCTTCAAAGGAG  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTCACACATATACATAAAATAAAAATAAAAGCAAACCTTCAAAGGAG  484

seq1  AGGTGTCCTCAATTTCTGGTGCACAGGAAGGTACCCTTGTCCTCTACCTC  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGTCCTCAATTTCTGGTGCACAGGAAGGTACCCTTGTCCTCTACCTC  534

seq1  CCACACAGGAAGGTTCCGAAAGTTATGTGTGTCCTGTCCTTGCTATGCTC  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACACAGGAAGGTTCCGAAAGTTATGTGTGTCCTGTCCTTGCTATGCTC  584

seq1  TGGGGACATGATTTACAATGGTTTACAGGACTCTTTTATCATTGTAGAAT  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGACATGATTTACAATGGTTTACAGGACTCTTTTATCATTGTAGAAT  634

seq1  TAGAAATTTCACACTGTGTAGAGGAATTTATAAACCTTTTGTGTATATGT  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAATTTCACACTGTGTAGAGGAATTTATAAACCTTTTGTGTATATGT  684

seq1  GTGGGGTTTTTTGGTTGGTTGGTTTGGTTTGGTTTGGTTTGGTTTGGTTT  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGGTTTTTTGGTTGGTTGGTTTGGTTTGGTTTGGTTTGGTTTGGTTT  734

seq1  GGTTTGGTTTGGTTTGGATACAGGGCTCCACTAACCCAGGTTAGCTTGGA  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTGGTTTGGTTTGGATACAGGGCTCCACTAACCCAGGTTAGCTTGGA  784

seq1  ATTCACTATGTATACCAGGCTAGCCTGGAACTCTCAAATATCCTCTTGCT  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCACTATGTATACCAGGCTAGCCTGGAACTCTCAAATATCCTCTTGCT  834

seq1  TCTACCTTCTAAGTACTAGAATTAAAGGTGTGTACTACCACGCCTGGGCT  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTACCTTCTAAGTACTAGAATTAAAGGTGTGTACTACCACGCCTGGGCT  884

seq1  TAAACTGCCTTCCAGTGATGTCTTTGAAAGGCTGAAACATAAGTGTGAAA  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACTGCCTTCCAGTGATGTCTTTGAAAGGCTGAAACATAAGTGTGAAA  934

seq1  AATAAGCTATTATGTAAGCAAATTCACATTGTGGTGAGGTTGTTCCTTTA  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAGCTATTATGTAAGCAAATTCACATTGTGGTGAGGTTGTTCCTTTA  984

seq1  GTGGGCACATTCACTTAAAATCTCATTTTATGTCATGAACTCTGAAATAT  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGCACATTCACTTAAAATCTCATTTTATGTCATGAACTCTGAAATAT  1034

seq1  GAATACGTTAGTTTTATACATAAATGAGAATTTCAGTATAAAATGGTAGT  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATACGTTAGTTTTATACATAAATGAGAATTTCAGTATAAAATGGTAGT  1084

seq1  TCAAACAGATTATGAGTTTTAAAATAACCTTTGAAATAGCAAATCACTGA  1146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAACAGATTATGAGTTTTAAAATAACCTTTGAAATAGCAAATCACTGA  1134

seq1  ATTTTCATAGTAATAAGTAAAGAATTC  1173
      |||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTCATAGTAATAAGTAAAGAATTC  1161

seq1: chr12_31502073_31503238
seq2: B6Ng01-155P07.g_68_1216

seq1  GAATTCCTATGTTAAGTAACTCCATAAAAACATGGTGTTTTTAGTCTGTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTATGTTAAGTAACTCCATAAAAACATGGTGTTTTTAGTCTGTC  50

seq1  TATTGAAACTTTGTTTTGCAACTGTAATTCATCTTGTACATTGTTCTTCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGAAACTTTGTTTTGCAACTGTAATTCATCTTGTACATTGTTCTTCA  100

seq1  TGTCCATTTGTAAGTAATGTATGAAGCAAAACAATACAAAAGAAATCAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCATTTGTAAGTAATGTATGAAGCAAAACAATACAAAAGAAATCAGT  150

seq1  CTGAGATTCCAACTGCTGGTCAATCCAAAAAAGATGAAATCTCGGAGGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGATTCCAACTGCTGGTCAATCCAAAAAAGATGAAATCTCGGAGGAG  200

seq1  AAGCTTCCCACATATTCTGAATTACACGCATTGTGAAAAATATTATTTCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTTCCCACATATTCTGAATTACACGCATTGTGAAAAATATTATTTCC  250

seq1  TATGGATCAACTTCTAAATGCCTTGCAGAAGGGACCCTCATGTTAAAATT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGATCAACTTCTAAATGCCTTGCAGAAGGGACCCTCATGTTAAAATT  300

seq1  TAAGATTTCTAGGATACTTTGGTGTGTGGTGTAAAGAAGGAAGCAAGATT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGATTTCTAGGATACTTTGGTGTGTGGTGTAAAGAAGGAAGCAAGATT  350

seq1  TCCTCGAAATCGATACCTTATTTCAGGTTGACTTGTTTGGAAGCCATGCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCGAAATCGATACCTTATTTCAGGTTGACTTGTTTGGAAGCCATGCC  400

seq1  ATGAGGCCTGAGAAGACTCTAGTAGCCACATATGGAACAATAACGTAGTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGGCCTGAGAAGACTCTAGTAGCCACATATGGAACAATAACGTAGTC  450

seq1  CTTATACTGATGAATACGTCAACAGTGCTCATCATCACTCAGAATTAATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATACTGATGAATACGTCAACAGTGCTCATCATCACTCAGAATTAATA  500

seq1  TACGCATATGTTGATGAAAAAATTTATACGTGCGTCATCACAAGGTAGTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACGCATATGTTGATGAAAAAATTTATACGTGCGTCATCACAAGGTAGTA  550

seq1  TGACTAGAACTTCACTTAATTCATTTGCACAGAAACAAGTCTTTAGTCTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTAGAACTTCACTTAATTCATTTGCACAGAAACAAGTCTTTAGTCTA  600

seq1  CTTATCTTTGTACCTGTACTGTTTGTTTATTTGTTTTATTCTCCAGAGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATCTTTGTACCTGTACTGTTTGTTTATTTGTTTTATTCTCCAGAGAA  650

seq1  CACCCTTCCATTTGTAAAACAAGTCTGGGTGGCTATGGAGCAATCTTCCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCTTCCATTTGTAAAACAAGTCTGGGTGGCTATGGAGCAATCTTCCT  700

seq1  CTATTTGGTATTTTTAGACTGGATTATGTCTTTATGACTATTTATTCATG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTTGGTATTTTTAGACTGGATTATGTCTTTATGACTATTTATTCATG  750

seq1  GATGACAACCAGGTCTTCATCACAGTTAACAGAGATCCCTCAAAATGTAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  GATGACAACCAGGTCTTCATCACAGTTAACAGAGATCCCTC-AAATGTAA  799

seq1  TACACTAGGACCACCCATTGCATTCAGGAATCTACAGCCACATGGTACAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACTAGGACCACCCATTGCATTCAGGAATCTACAGCCACATGGTACAG  849

seq1  GGGGGACATTGTCATAGATGGACCAACACTGCCTTGAGTTATTTAAATGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGACATTGTCATAGATGGACCAACACTGCCTTGAGTTATTTAAATGT  899

seq1  CTATAATAATTTAGCTACCAACCTTACATATGATTTTGGAGCAGTCATTA  950
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATAATAATTTAGCTACCAACCCTACATATGATTTTGGAGCAGTCATTA  949

seq1  AAAATTGGAAATGATTTT--CTGATTGATAGACAGAAATAACAACATTAA  998
      ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||   ||||| |
seq2  AAAATTGGAAATGATTTTTCTTGATTGATAGACAGAAATA--CACATT-A  996

seq1  ACAAAACAATATCTACTGCTTTTGAAATGCAAAAATGGAC-ATCGGCTGA  1047
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  ACAAAACAATATCTACTGCTTTTGAAATGCAAAAATGGACAATCGGCTGA  1046

seq1  AAC-ACATACTAAATGTTAAGTGAAAAACAATCCCTAGAGATTTATACAC  1096
      ||| ||||||| |||| |||||| ||||||   ||||||||||| ||  |
seq2  AACAACATACT-AATG-TAAGTG-AAAACA--TCCTAGAGATTT-TAACC  1090

seq1  TGTTATTCAGGAATGAGATATGCTAAGTATCAGCAGGCCACCTACAGAAG  1146
      ||||| ||||  |||||||||||| ||| |||||| |||| ||||   ||
seq2  TGTTA-TCAG--ATGAGATATGCT-AGT-TCAGCA-GCCA-CTAC--GAG  1131

seq1  CATGTATCAGCTAAGAACTT  1166
      ||||| |||||| |||||||
seq2  CATGT-TCAGCT-AGAACTT  1149