BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-156C02
Chromosome12 (Build37)
Map Location 16,268,181 - 16,442,144
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC217409, Trib2, LOC100043268, EG432636, LOC100043273
Downstream geneLpin1, Ntsr2, Greb1, E2f6, Rock2, Pqlc3, 2410004P03Rik, EG668514, Kcnf1, LOC100043299, Pdia6, Atp6v1c2, Nol10
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-156C02.bB6Ng01-156C02.g
ACCDH950717DH950718
length1,076980
definitionDH950717|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-156C02, 5' end.DH950718|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-156C02, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(16,441,062 - 16,442,144)(16,268,181 - 16,269,159)
sequence
gaattctatatcttcatctactagcagagtactgacttccaggcagctag
ggtaaggatcttaaacccatgcccataatgacacacctaccccaacaagg
ccatgcctcctaatagtgccacttcctgggccaagcatatacaaaccatc
acatgcacataaatgtatgaagattaaacacacataaaataaataaatga
agatgtagagtggaaacagagttctcagagttccccttagggtggactct
gttctctccatactctactccacattggcagcaatgggtggagacaagat
ggccttgaggtagaaagccatctgccactgtgccctgactctcttggcag
caacttcagcacctcagttcttcctctcttcctccattctgcctcatgag
cccacctggctgagagcccatctgacaaatattcaaacactgcagcctct
tgggtaccatccaagcatagctccaggtggcctggacagtttgacggttg
gctttggtgtggcagtttaaaggacaataacaaaattggaagcaaggttt
atcaggcacagcaaataaaaatgcttgtgcccaaatgtatctgtaatttg
aatttcaggtaaagaatgcatgcattgttagtacatgcatgcactggata
attcacatgggacatacttattgttgtttactggaattcagaattgactg
tgtaccctgtattttaccaggcatatgcctagattcccctggccaggttt
ggttggacatagagacctttgctaaagagctttaataaagatgctgcaga
ctccagccaggcatggagctctcccaacatcaggactttgatgctttctt
cattcataaaacttgccaagaggccacagtgatggggaggacagctggac
ctcattcatcacactgctgctaatgaggctggcacccagtgcattgtggt
tccagcacattaatgatcatattagacctattgaagattgtgacgctgcc
agtgggaggagctcctcaacccattgttctgtcatgtagatgggaggtgc
cctccagacagcttatgggaggggct
gaattctttcaattcatttgcctttgagttagttctgaagtgctggctgc
tgtccaacaagtatctacagttcctatgaattcataaggatccagggctt
cagcacaaagtccagctgagcagtcagtggtcaccttagtaacatcagtg
tcctggctgtgtttatgtacaattatcatggtgtcagatacaccagccag
agaaccgtactgatgataaaagacaaaactggccttttgctggtagaaat
gagtggcactcttgcccgagtagagccagctgtctagggcagttcacgct
caccatgtgatagacactaacatttggggaccatcctccttcaacgacct
ggtgtctcatttttccctcctgtcttgattccaagtttttcttcccaact
atgctttatctacctggttactgcctagattccatgtacttcttttgcct
tatatgttatcagtccccatttctctactgatgagtctcctttctaccct
tcatctttcccatccatccagacccatccttttccaagctcagatgccac
agggccaagagcctgcccaaagcacaatttgatatagggtctcacaatga
gtacctaaccttctgcttttatgtttgaaaaatttcattaattgtgggga
ggggcagggtatatgttatgagtaccaaaagaggcagatccctagtgtaa
caatgtattctggcctgcccaatgagggtgcttatagaagaacttgggtc
ctgtgcagaagtagcaccacgcactcttatttactgttttcttggtttta
tccttgttttttattggtctatttgttctctaaaaagagagagagaagga
agttgtggagttaggtgggcaaggaggttgaaagatcctaagaggaaaca
agagagctgaattcatgatcagaatagatagtaggaaatattatttgtgt
gtgttgtgtgtttgtaagagagagggggac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_16441062_16442144
seq2: B6Ng01-156C02.b_42_1117 (reverse)

seq1  AGCCCCTTCCCCATAAGCTGTTCTGGAGGGCACCCTTCCCATCTACATGA  50
      |||||||  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||
seq2  AGCCCCT--CCCATAAGCTG-TCTGGAGGGCACC--TCCCATCTACATGA  45

seq1  CAGAACAATGGGTTGAGAGCCTCCTCCCACTGGCAGCGTCACCAATCTTC  100
      |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  CAGAACAATGGGTTGAGGAGCTCCTCCCACTGGCAGCGTCA-CAATCTTC  94

seq1  ATTAGGTCTATAATGATCATTAATGTGCTGGAACCACAATGCACTGGGTG  150
      | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGGTCTAATATGATCATTAATGTGCTGGAACCACAATGCACTGGGTG  144

seq1  CCAGCCTCATTAGCAGCAGTGTGATGAATGAGGTCCAGCTGTCCTCCCCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCCTCATTAGCAGCAGTGTGATGAATGAGGTCCAGCTGTCCTCCCCA  194

seq1  TCACTGTGGCCTCTTGGCAAGTTTTATGAATGAAAGAAAGCATCAAAGTC  250
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TCACTGTGGCCTCTTGGCAAGTTTTATGAATG-AAGAAAGCATCAAAGTC  243

seq1  CTGATGTTGGGAGAGCTCCATGCCTGGCTGGAGTCTGCAGCATCTTTATT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATGTTGGGAGAGCTCCATGCCTGGCTGGAGTCTGCAGCATCTTTATT  293

seq1  AAAGCTCTTTAGCAAAGGTCTCTATGTCCAACCAAACCTGGCCAGGGGAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCTCTTTAGCAAAGGTCTCTATGTCCAACCAAACCTGGCCAGGGGAA  343

seq1  TCTAGGCATATGCCTGGTAAAATACAGGGTACACAGTCAATTCTGAATTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGGCATATGCCTGGTAAAATACAGGGTACACAGTCAATTCTGAATTC  393

seq1  CAGTAAACAACAATAAGTATGTCCCATGTGAATTATCCAGTGCATGCATG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTAAACAACAATAAGTATGTCCCATGTGAATTATCCAGTGCATGCATG  443

seq1  TACTAACAATGCATGCATTCTTTACCTGAAATTCAAATTACAGATACATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTAACAATGCATGCATTCTTTACCTGAAATTCAAATTACAGATACATT  493

seq1  TGGGCACAAGCATTTTTATTTGCTGTGCCTGATAAACCTTGCTTCCAATT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCACAAGCATTTTTATTTGCTGTGCCTGATAAACCTTGCTTCCAATT  543

seq1  TTGTTATTGTCCTTTAAACTGCCACACCAAAGCCAACCGTCAAACTGTCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTATTGTCCTTTAAACTGCCACACCAAAGCCAACCGTCAAACTGTCC  593

seq1  AGGCCACCTGGAGCTATGCTTGGATGGTACCCAAGAGGCTGCAGTGTTTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCACCTGGAGCTATGCTTGGATGGTACCCAAGAGGCTGCAGTGTTTG  643

seq1  AATATTTGTCAGATGGGCTCTCAGCCAGGTGGGCTCATGAGGCAGAATGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATTTGTCAGATGGGCTCTCAGCCAGGTGGGCTCATGAGGCAGAATGG  693

seq1  AGGAAGAGAGGAAGAACTGAGGTGCTGAAGTTGCTGCCAAGAGAGTCAGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGAGAGGAAGAACTGAGGTGCTGAAGTTGCTGCCAAGAGAGTCAGG  743

seq1  GCACAGTGGCAGATGGCTTTCTACCTCAAGGCCATCTTGTCTCCACCCAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACAGTGGCAGATGGCTTTCTACCTCAAGGCCATCTTGTCTCCACCCAT  793

seq1  TGCTGCCAATGTGGAGTAGAGTATGGAGAGAACAGAGTCCACCCTAAGGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGCCAATGTGGAGTAGAGTATGGAGAGAACAGAGTCCACCCTAAGGG  843

seq1  GAACTCTGAGAACTCTGTTTCCACTCTACATCTTCATTTATTTATTTTAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTCTGAGAACTCTGTTTCCACTCTACATCTTCATTTATTTATTTTAT  893

seq1  GTGTGTTTAATCTTCATACATTTATGTGCATGTGATGGTTTGTATATGCT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTTTAATCTTCATACATTTATGTGCATGTGATGGTTTGTATATGCT  943

seq1  TGGCCCAGGAAGTGGCACTATTAGGAGGCATGGCCTTGTTGGGGTAGGTG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCCAGGAAGTGGCACTATTAGGAGGCATGGCCTTGTTGGGGTAGGTG  993

seq1  TGTCATTATGGGCATGGGTTTAAGATCCTTACCCTAGCTGCCTGGAAGTC  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCATTATGGGCATGGGTTTAAGATCCTTACCCTAGCTGCCTGGAAGTC  1043

seq1  AGTACTCTGCTAGTAGATGAAGATATAGAATTC  1083
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACTCTGCTAGTAGATGAAGATATAGAATTC  1076

seq1: chr12_16268181_16269159
seq2: B6Ng01-156C02.g_66_1044

seq1  GAATTCTTTCAATTCATTTGCCTTTGAGTTAGTTCTGAAGTGCTGGCTGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTCAATTCATTTGCCTTTGAGTTAGTTCTGAAGTGCTGGCTGC  50

seq1  TGTCCAACAAGTATCTACAGTTCCTATGAATTCATAAGGATCCAGGGCTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCAACAAGTATCTACAGTTCCTATGAATTCATAAGGATCCAGGGCTT  100

seq1  CAGCACAAAGTCCAGCTGAGCAGTCAGTGGTCACCTTAGTAACATCAGTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCACAAAGTCCAGCTGAGCAGTCAGTGGTCACCTTAGTAACATCAGTG  150

seq1  TCCTGGCTGTGTTTATGTACAATTATCATGGTGTCAGATACACCAGCCAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGGCTGTGTTTATGTACAATTATCATGGTGTCAGATACACCAGCCAG  200

seq1  AGAACCGTACTGATGATAAAAGACAAAACTGGCCTTTTGCTGGTAGAAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACCGTACTGATGATAAAAGACAAAACTGGCCTTTTGCTGGTAGAAAT  250

seq1  GAGTGGCACTCTTGCCCGAGTAGAGCCAGCTGTCTAGGGCAGTTCACGCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGGCACTCTTGCCCGAGTAGAGCCAGCTGTCTAGGGCAGTTCACGCT  300

seq1  CACCATGTGATAGACACTAACATTTGGGGACCATCCTCCTTCAACGACCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCATGTGATAGACACTAACATTTGGGGACCATCCTCCTTCAACGACCT  350

seq1  GGTGTCTCATTTTTCCCTCCTGTCTTGATTCCAAGTTTTTCTTCCCAACT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTCTCATTTTTCCCTCCTGTCTTGATTCCAAGTTTTTCTTCCCAACT  400

seq1  ATGCTTTATCTACCTGGTTACTGCCTAGATTCCATGTACTTCTTTTGCCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTTTATCTACCTGGTTACTGCCTAGATTCCATGTACTTCTTTTGCCT  450

seq1  TATATGTTATCAGTCCCCATTTCTCTACTGATGAGTCTCCTTTCTACCCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATGTTATCAGTCCCCATTTCTCTACTGATGAGTCTCCTTTCTACCCT  500

seq1  TCATCTTTCCCATCCATCCAGACCCATCCTTTTCCAAGCTCAGATGCCAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCTTTCCCATCCATCCAGACCCATCCTTTTCCAAGCTCAGATGCCAC  550

seq1  AGGGCCAAGAGCCTGCCCAAAGCACAATTTGATATAGGGTCTCACAATGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCCAAGAGCCTGCCCAAAGCACAATTTGATATAGGGTCTCACAATGA  600

seq1  GTACCTAACCTTCTGCTTTTATGTTTGAAAAATTTCATTAATTGTGGGGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACCTAACCTTCTGCTTTTATGTTTGAAAAATTTCATTAATTGTGGGGA  650

seq1  GGGGCAGGGTATATGTTATGAGTACCAAAAGAGGCAGATCCCTAGTGTAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGCAGGGTATATGTTATGAGTACCAAAAGAGGCAGATCCCTAGTGTAA  700

seq1  CAATGTATTCTGGCCTGCCCAATGAGGGTGCTTATAGAAGAACTTGGGTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGTATTCTGGCCTGCCCAATGAGGGTGCTTATAGAAGAACTTGGGTC  750

seq1  CTGTGCAGAAGTAGCACCACGCACTCTTATTTACTGTTTTCTTGGTTTTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGCAGAAGTAGCACCACGCACTCTTATTTACTGTTTTCTTGGTTTTA  800

seq1  TCCTTGTTTTTTATTGGTCTATTTGTTCTCTAAAAAGAGAGAGAGAAGGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTGTTTTTTATTGGTCTATTTGTTCTCTAAAAAGAGAGAGAGAAGGA  850

seq1  AGTTGTGGAGTTAGGTGGGCAAGGAGGTTGAAAAGAT-CTAAGAGGAAAC  899
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||
seq2  AGTTGTGGAGTTAGGTGGGCAAGGAGGTTG-AAAGATCCTAAGAGGAAAC  899

seq1  AAGAGAGCTGAAATCATGATCAGAATAGATAGTAGGAAAATATTATTTGT  949
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  AAGAGAGCTGAATTCATGATCAGAATAGATAGTAGG-AAATATTATTTGT  948

seq1  GTGTG-TGTGTGTTTGTAAGAGAGAGGGGGA  979
      ||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTTGTGTGTTTGTAAGAGAGAGGGGGA  979