BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-157L23
Chromosome12 (Build37)
Map Location 25,585,743 - 25,735,353
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMboat2, EG629397, C330002I19Rik
Upstream geneLOC546534, 9030624G23Rik, EG668710, LOC100042945, EG668711, EG668714, LOC629364, Taf1b, Grhl1, EG629383, Klf11, Cys1, Rrm2, LOC668719
Downstream geneId2, LOC100042973, LOC100042974, LOC668726
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-157L23.bB6Ng01-157L23.g
ACCDH951897DH951898
length1,0981,081
definitionDH951897|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-157L23, 5' end.DH951898|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-157L23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(25,734,237 - 25,735,353)(25,585,743 - 25,586,836)
sequence
gaattcctggactgccaggtgggggagggtaaataaatatttcacttatg
tccgactgactcttttactggtgtcaggagacaatagactatcccatagt
ttaaaaatacctgggaagcacagtgaatgttaatttgtaatgtgaaaaaa
tagttgcactaccacagaaatacatacacatgcatgtgcacatgtgtgtt
tgtgtgcatgttgcatgcacatgcatgtatgtgcatgcatatatgtgcat
gtgtgttaagagtgtgcatgcacctaggtgtttcagatgggaatggagac
tcagacagcaggaacggtgactttatgagtcagggactctacctagctct
acaaaggcaacacaggtatatcgaagtttgggaacagatgacctggaaca
agctgcaccaaatacacttatttatagtttgtttttatttaaccataaac
tgtgccacattgtacacgattcagggttgagctgctgttaaaataataac
aacaggggctggtgagatggctcagtgggtaagagcacccgactgctctt
ccaaaggtccagagttcaaatcccagcaaccacatggtggttcacaacca
tctgtaacgagatctgacgccctcttctggaatgtctgaagacagctaca
gtgtacttacatgtaataaataaataaatctttaaaaaaaaaaaatgaac
tggtgcttcactttaaaaaaaaaaaaaaaataataacaacagaagaccag
tctttcacactttggtcttcataactttgcacatggctcttttttctgtc
tagtaagtcagccagtgttttcactatgcactttcagctatgtgaatttt
aaaaccatgctgatttcctctccacatgccgtggacttccacattaaatg
tacattcaatgactttactttatttacatagtttgtgagccatcacctca
aagaaactgttcccattagttactccattcttcacactcatcctagtcca
gcacccgtgtttgaagtgttctattgcagcactttctacgtgtgaccttc
cttgtcgactctcacggtgttgtttaggtcattcattcatcttgtcac
gaattcactcagtcttaatgtaaaatacattatgaagaaagaaccatgca
ctgtcctatccagttaaataggtaaggaaaaggtatatcagaaaaatctc
aaatgcgggaaaccaggcctgtggtgtaattctagcactggggaaactgg
ggcaggagggtggttagtttgaggctagtaaatttgagaccatcttggct
atatagtaagaccctgtctcaccaaatacatccatccatacgtgcccgcg
cgcgttcatacacacatacacacacacagcaacagagattaaatgaaaat
atcatagtaccaaatggcaaaagaagtccataaggaggaatagagaagac
ctgggacatagctaaattagtgggcaaatgtcagtgacatcagacatgat
aaatctcacccagtgagattggtgaggcttcaactgtattctattcaatt
caatagaatacaattaattatatttctatatacgataatgttccaaaatg
aaagcataaaaatggtttcatgcacatagaatctaaaagaataaataaaa
atagttaataaatttaacactcacttgcaaactactagcaaactcccttt
agagcactggttctcaaccttcctaaagctgtgaccctttaatacagttc
ctcttgttgtgttgacccgaatcataaattactttgttgctgattcataa
ttataatttcctactgttatgacttgtagtataaatatctgtgttttctg
atggccttttggagatctcaactcataggttgagtaccactcctttacaa
agagtaaagattaaatacagtcttccatatttgtgagttgggagactctg
tgttgttaaaactgtatattgtgaagttggcagctggctattcttctcag
tgatccagtgatgtgtaggttagtacagtcctcagtgcagtactaacaaa
gactctgtcagagtttcttgggtatgtgcaaaataagactcagcctaact
tatttgaaaagacatcagaccaggatctgcacatcgcagttctcacttac
tctgatgtagatcaggacacttgtgattgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_25734237_25735353
seq2: B6Ng01-157L23.b_46_1143 (reverse)

seq1  GTGACAAGATGAATGAATGAGCCTTAAAACAACACACCGTGAGAGTCGGA  50
      |||||||||||||||||||| |||  |||||  |||||||||||||| ||
seq2  GTGACAAGATGAATGAATGA-CCT--AAACA--ACACCGTGAGAGTC-GA  44

seq1  CAGGGAGGGTCACACACCGTAGAAAGTGCCTGCAATAG-ACACTTCAAAC  99
      || ||| |||||||   ||||||||||| ||||||||| |||||||||||
seq2  CAAGGAAGGTCACA---CGTAGAAAGTG-CTGCAATAGAACACTTCAAAC  90

seq1  ACGGGGTTGCCTGGGACTAGGGTG-GTGTTGAAGGAATTGGAGTAACTAA  148
      |||||  |||   |||||||| || ||| |||||  | ||||||||||||
seq2  ACGGG--TGC--TGGACTAGGATGAGTG-TGAAG--AATGGAGTAACTAA  133

seq1  TGGGAACAGTTTCTTTTGAGGGTGATGGCTCACAAACTATGTAAATAAAG  198
      ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAACAGTTTC-TTTGA-GGTGATGGCTCACAAACTATGTAAATAAAG  181

seq1  TTAAAGTCATTGAATTGTACATTTAATGTGGAAGTTCCACGGCATGTGGA  248
       ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  -TAAAGTCATTGAA-TGTACATTTAATGTGGAAG-TCCACGGCATGTGGA  228

seq1  GAGGAAATCAGCATGGTTTTAAAATTCACATAGCTGAGAGTGCATAGTGA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  GAGGAAATCAGCATGGTTTTAAAATTCACATAGCTGAAAGTGCATAGTGA  278

seq1  AAACACTGGCTGACTTACTAGACAGAAAAAAGAGCCATGTGCAAAGTTAT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACACTGGCTGACTTACTAGACAGAAAAAAGAGCCATGTGCAAAGTTAT  328

seq1  GAAGACCAAAGTGTGAAAGACTGGTCTTCTGTTGTTATTA-TTTTTTTTT  397
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  GAAGACCAAAGTGTGAAAGACTGGTCTTCTGTTGTTATTATTTTTTTTTT  378

seq1  TTTTTTAAAGTGAAGCACCAGTTCATTTTTTTTTTTTAAAGATTTATTTA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTAAAGTGAAGCACCAGTTCATTTTTTTTTTTTAAAGATTTATTTA  428

seq1  TTTATTACATGTAAGTACACTGTAGCTGTCTTCAGACATTCCAGAAGAGG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTACATGTAAGTACACTGTAGCTGTCTTCAGACATTCCAGAAGAGG  478

seq1  GCGTCAGATCTCGTTACAGATGGTTGTGAACCACCATGTGGTTGCTGGGA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGTCAGATCTCGTTACAGATGGTTGTGAACCACCATGTGGTTGCTGGGA  528

seq1  TTTGAACTCTGGACCTTTGGAAGAGCAGTCGGGTGCTCTTACCCACTGAG  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAACTCTGGACCTTTGGAAGAGCAGTCGGGTGCTCTTACCCACTGAG  578

seq1  CCATCTCACCAGCCCCTGTTGTTATTATTTTAACAGCAGCTCAACCCTGA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCTCACCAGCCCCTGTTGTTATTATTTTAACAGCAGCTCAACCCTGA  628

seq1  ATCGTGTACAATGTGGCACAGTTTATGGTTAAATAAAAACAAACTATAAA  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCGTGTACAATGTGGCACAGTTTATGGTTAAATAAAAACAAACTATAAA  678

seq1  TAAGTGTATTTGGTGCAGCTTGTTCCAGGTCATCTGTTCCCAAACTTCGA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTGTATTTGGTGCAGCTTGTTCCAGGTCATCTGTTCCCAAACTTCGA  728

seq1  TATACCTGTGTTGCCTTTGTAGAGCTAGGTAGAGTCCCTGACTCATAAAG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACCTGTGTTGCCTTTGTAGAGCTAGGTAGAGTCCCTGACTCATAAAG  778

seq1  TCACCGTTCCTGCTGTCTGAGTCTCCATTCCCATCTGAAACACCTAGGTG  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCGTTCCTGCTGTCTGAGTCTCCATTCCCATCTGAAACACCTAGGTG  828

seq1  CATGCACACTCTTAACACACATGCACATATATGCATGCACATACATGCAT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCACACTCTTAACACACATGCACATATATGCATGCACATACATGCAT  878

seq1  GTGCATGCAACATGCACACAAACACACATGTGCACATGCATGTGTATGTA  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCATGCAACATGCACACAAACACACATGTGCACATGCATGTGTATGTA  928

seq1  TTTCTGTGGTAGTGCAACTATTTTTTCACATTACAAATTAACATTCACTG  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTGTGGTAGTGCAACTATTTTTTCACATTACAAATTAACATTCACTG  978

seq1  TGCTTCCCAGGTATTTTTAAACTATGGGATAGTCTATTGTCTCCTGACAC  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTCCCAGGTATTTTTAAACTATGGGATAGTCTATTGTCTCCTGACAC  1028

seq1  CAGTAAAAGAGTCAGTCGGACATAAGTGAAATATTTATTTACCCTCCCCC  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTAAAAGAGTCAGTCGGACATAAGTGAAATATTTATTTACCCTCCCCC  1078

seq1  ACCTGGCAGTCCAGGAATTC  1117
      ||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGGCAGTCCAGGAATTC  1098

seq1: chr12_25585743_25586836
seq2: B6Ng01-157L23.g_67_1147

seq1  GAATTCACTCAGTCTTAATGTAAAATACATTATGAAGAAAGAACCATGCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTCAGTCTTAATGTAAAATACATTATGAAGAAAGAACCATGCA  50

seq1  CTGTCCTATCCAGTTAAATAGGTAAGGAAAAGGTATATCAGAAAAATCTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCCTATCCAGTTAAATAGGTAAGGAAAAGGTATATCAGAAAAATCTC  100

seq1  AAATGCGGGAAACCAGGCCTGTGGTGTAATTCTAGCACTGGGGAAACTGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGCGGGAAACCAGGCCTGTGGTGTAATTCTAGCACTGGGGAAACTGG  150

seq1  GGCAGGAGGGTGGTTAGTTTGAGGCTAGTAAATTTGAGACCATCTTGGCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGGAGGGTGGTTAGTTTGAGGCTAGTAAATTTGAGACCATCTTGGCT  200

seq1  ATATAGTAAGACCCTGTCTCACCAAATACATCCATCCATACGTGCCCGCG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAGTAAGACCCTGTCTCACCAAATACATCCATCCATACGTGCCCGCG  250

seq1  CGCGTTCATACACACATACACACACACAGCAACAGAGATTAAATGAAAAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCGTTCATACACACATACACACACACAGCAACAGAGATTAAATGAAAAT  300

seq1  ATCATAGTACCAAATGGCAAAAGAAGTCCATAAGGAGGAATAGAGAAGAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATAGTACCAAATGGCAAAAGAAGTCCATAAGGAGGAATAGAGAAGAC  350

seq1  CTGGGACATAGCTAAATTAGTGGGCAAATGTCAGTGACATCAGACATGAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGACATAGCTAAATTAGTGGGCAAATGTCAGTGACATCAGACATGAT  400

seq1  AAATCTCACCCAGTGAGATTGGTGAGGCTTCAACTGTATTCTATTCAATT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCTCACCCAGTGAGATTGGTGAGGCTTCAACTGTATTCTATTCAATT  450

seq1  CAATAGAATACAATTAATTATATTTCTATATACGATAATGTTCCAAAATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATAGAATACAATTAATTATATTTCTATATACGATAATGTTCCAAAATG  500

seq1  AAAGCATAAAAATGGTTTCATGCACATAGAATCTAAAAGAATAAATAAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCATAAAAATGGTTTCATGCACATAGAATCTAAAAGAATAAATAAAA  550

seq1  ATAGTTAATAAATTTAACACTCACTTGCAAACTACTAGCAAACTCCCTTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTTAATAAATTTAACACTCACTTGCAAACTACTAGCAAACTCCCTTT  600

seq1  AGAGCACTGGTTCTCAACCTTCCTAAAGCTGTGACCCTTTAATACAGTTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCACTGGTTCTCAACCTTCCTAAAGCTGTGACCCTTTAATACAGTTC  650

seq1  CTCTTGTTGTGTTGACCCGAATCATAAATTACTTTGTTGCTGATTCATAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTGTTGTGTTGACCCGAATCATAAATTACTTTGTTGCTGATTCATAA  700

seq1  TTATAATTTCCTACTGTTATGACTTGTAGTATAAATATCTGTGTTTTCTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAATTTCCTACTGTTATGACTTGTAGTATAAATATCTGTGTTTTCTG  750

seq1  ATGGCCTTTTGGAGATCTCAACTCATAGGTTGAGTACCACTCCTTTACAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCCTTTTGGAGATCTCAACTCATAGGTTGAGTACCACTCCTTTACAA  800

seq1  AGAGTAAAGATTAAATACAGTCTTCCATATTTGTGAGTTGGGAGACTCTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTAAAGATTAAATACAGTCTTCCATATTTGTGAGTTGGGAGACTCTG  850

seq1  TGTTGTTAAAACTGTATATTGTGAAGTTGGCAGCTGGCTATTCTTCTCAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGTTAAAACTGTATATTGTGAAGTTGGCAGCTGGCTATTCTTCTCAG  900

seq1  TTGATCCAGTGATGTGTAGGTTTAGTACAGTCCTCAGTGCAGTTACTAAC  950
       ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  -TGATCCAGTGATGTGTAGG-TTAGTACAGTCCTCAGTGCAG-TACTAAC  947

seq1  AAAGACTCTTGTCAAGAGTTTC-TGGGTATGTGGCAAAATAAGGACCCAG  999
      |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||
seq2  AAAGACTC-TGTC-AGAGTTTCTTGGGTATGT-GCAAAATAA-GACTCAG  993

seq1  CCTAAC-TATTTGAAAAAGGACACCAGACCAAGGATCTGCACATCGCAGT  1048
      |||||| ||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||| 
seq2  CCTAACTTATTTGAAAA--GACATCAGACC-AGGATCTGCACATCGCAG-  1039

seq1  TTCTCCACTTACTCTGATGTAGGAATCAGGACACTTGTGGTTTGTG  1094
      |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||
seq2  TTCT-CACTTACTCTGATGTAG--ATCAGGACACTTGT-GATTGTG  1081