BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-176M06
Chromosome12 (Build37)
Map Location 23,291,615 - 23,450,861
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG668669, EG668670, LOC668680
Upstream geneEG668496, LOC668653, EG432637, LOC668656, EG629133, EG668660, EG668662, LOC668664, 2410018L13Rik, LOC77114
Downstream geneLOC100042895, LOC100043435, EG628081, LOC100042903, LOC100043440, EG668518, LOC100043445, LOC668697, LOC100042923, LOC677338, EG668701
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-176M06.bB6Ng01-176M06.g
ACCGA004215GA004216
length992961
definitionB6Ng01-176M06.b B6Ng01-176M06.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(23,449,870 - 23,450,861)(23,291,615 - 23,292,579)
sequence
gaattcctatctgtctgcttctgtcaatgagtgctagagttaaaggcatg
caccactacttgcctgcttgttctctttcttttaatataatttttttgga
gacagggtctagtgtagcccaggctagccctgaattgctatatagtctta
gatgaccttgaagtccaagataatcctgcccccaccctctggttctggag
ttacagatgtgtggcaccaggctagctcagttgatggttatttctgatca
agatgctgtggacaattgagttggttgtttctacaggggagaacatgttt
agataagtaaatgtgtgctttgaaaggcaatattaagctgccatatgtct
gtgttggacaaggaactttaaatatctcctagtcctgtagataagtaatt
aaaatatgtacatagaacgttaacagcctgggaaagaggtgaagaagaca
ggggaggtagcaggtaatactgagtgcatgtctcatcttccttaacagga
cctagcacctaatgcttagaattcataagcctctgagcagttcagagtag
tttcctttgggacttgggtagaggagactcacccacactagttcttctac
acatttcaaaaataacagagctattgcaggtgtgatactgtgaaagaaag
aaaccaaaattgaggtagggaagtgaacgagcattaatgtccagtggcca
atcactgcaggatctcacacttgggccttgtgggagactgcagtggggtg
tgctggccaatgaagcacagtcctgaatttccaagggggctgtttcagct
ggtaacattcacatcgacatttaccgaaaattgatgcaattctagatctc
cctggcagaacaatatctcataggcataatagagagtggggactcccata
agttcccagatgtctcttctagggttaaaacagcatggcatgtgctggta
acttctaccagtatttgtatggagggggacagggaggtcttg
gaattcagttctctcctcctaccacatgagttctcaagcttaaactccag
tcatcaggcttggtggcttgtgcctttacccaaggagtcatttcaatggc
tctgctgcctttttttttaaacagtcattgaggctctggggagctcagaa
tgtgcgctcctggaatgtggcttgggagtcaggatggttttgcagtgact
agtaccatgacatgggatctatggttcagatggcaggctgaggttgcagt
aacactctagtctccctcccatagatctcactgggtggctggttgttgtt
ccactcagaagaggagggtacctctctcactgtagtcttctgcctccctg
gctggactcaggcttctggtaccttatagctggcttctccagagaggtcc
aaggtagccctgcaggataggtctgtggacctgaggaggactgtgggatg
gcaacacattatctctcactcccagtatcagtgagtaacgtgatcaccgg
atgccacaggatgctaactgctgtgaataggatccctgtgtggtggcatc
agctacagagtccttggtactgcccagcgctgtccaagaaataggatgac
attcatatataatatgagattttcccacaaccacatggaaaagaggaaag
agaaacggggtgaacaatgtccacagcctgttggatttaacccattgtat
tccaagcgggcccaataactgtgtattttaccctaaaggacttacttagt
ttgggactagtggttcttcaaacttctaatgctgtgaccctttaataaca
gtcctccatgtcatggtcaccccaaccaaattattattttttttgctact
catactgtaagttttgttatcgttaatcgtaatatagatatgtgctttcg
atgtttccgccacccctatgaggagtcttgcaattccaaggagtggaccc
acccattgaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_23449870_23450861
seq2: B6Ng01-176M06.b_45_1036 (reverse)

seq1  CAAGACCTCCCTGTCCCCCTCCATAC-AATACTGGTAGAAGTTACCAGCA  49
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGACCTCCCTGTCCCCCTCCATACAAATACTGGTAGAAGTTACCAGCA  50

seq1  CATGCCATGCTGTTTTAACCCTAGAAGAGACATCTGGGAACCTTATGGGA  99
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  CATGCCATGCTGTTTTAACCCTAGAAGAGACATCTGGGAA-CTTATGGGA  99

seq1  GTCCCCACTCTCTATTATGCCTATGAGATATTGTTCTGCCAGGGAGATCT  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCCACTCTCTATTATGCCTATGAGATATTGTTCTGCCAGGGAGATCT  149

seq1  AGAATTGCATCAATTTTCGGTAAATGTCGATGTGAATGTTACCAGCTGAA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATTGCATCAATTTTCGGTAAATGTCGATGTGAATGTTACCAGCTGAA  199

seq1  ACAGCCCCCTTGGAAATTCAGGACTGTGCTTCATTGGCCAGCACACCCCA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCCCCCTTGGAAATTCAGGACTGTGCTTCATTGGCCAGCACACCCCA  249

seq1  CTGCAGTCTCCCACAAGGCCCAAGTGTGAGATCCTGCAGTGATTGGCCAC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCAGTCTCCCACAAGGCCCAAGTGTGAGATCCTGCAGTGATTGGCCAC  299

seq1  TGGACATTAATGCTCGTTCACTTCCCTACCTCAATTTTGGTTTCTTTCTT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACATTAATGCTCGTTCACTTCCCTACCTCAATTTTGGTTTCTTTCTT  349

seq1  TCACAGTATCACACCTGCAATAGCTCTGTTATTTTTGAAATGTGTAGAAG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACAGTATCACACCTGCAATAGCTCTGTTATTTTTGAAATGTGTAGAAG  399

seq1  AACTAGTGTGGGTGAGTCTCCTCTACCCAAGTCCCAAAGGAAACTACTCT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTAGTGTGGGTGAGTCTCCTCTACCCAAGTCCCAAAGGAAACTACTCT  449

seq1  GAACTGCTCAGAGGCTTATGAATTCTAAGCATTAGGTGCTAGGTCCTGTT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTGCTCAGAGGCTTATGAATTCTAAGCATTAGGTGCTAGGTCCTGTT  499

seq1  AAGGAAGATGAGACATGCACTCAGTATTACCTGCTACCTCCCCTGTCTTC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAAGATGAGACATGCACTCAGTATTACCTGCTACCTCCCCTGTCTTC  549

seq1  TTCACCTCTTTCCCAGGCTGTTAACGTTCTATGTACATATTTTAATTACT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACCTCTTTCCCAGGCTGTTAACGTTCTATGTACATATTTTAATTACT  599

seq1  TATCTACAGGACTAGGAGATATTTAAAGTTCCTTGTCCAACACAGACATA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTACAGGACTAGGAGATATTTAAAGTTCCTTGTCCAACACAGACATA  649

seq1  TGGCAGCTTAATATTGCCTTTCAAAGCACACATTTACTTATCTAAACATG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAGCTTAATATTGCCTTTCAAAGCACACATTTACTTATCTAAACATG  699

seq1  TTCTCCCCTGTAGAAACAACCAACTCAATTGTCCACAGCATCTTGATCAG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCCCCTGTAGAAACAACCAACTCAATTGTCCACAGCATCTTGATCAG  749

seq1  AAATAACCATCAACTGAGCTAGCCTGGTGCCACACATCTGTAACTCCAGA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAACCATCAACTGAGCTAGCCTGGTGCCACACATCTGTAACTCCAGA  799

seq1  ACCAGAGGGTGGGGGCAGGATTATCTTGGACTTCAAGGTCATCTAAGACT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGAGGGTGGGGGCAGGATTATCTTGGACTTCAAGGTCATCTAAGACT  849

seq1  ATATAGCAATTCAGGGCTAGCCTGGGCTACACTAGACCCTGTCTCCAAAA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAGCAATTCAGGGCTAGCCTGGGCTACACTAGACCCTGTCTCCAAAA  899

seq1  AAATTATATTAAAAGAAAGAGAACAAGCAGGCAAGTAGTGGTGCATGCCT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTATATTAAAAGAAAGAGAACAAGCAGGCAAGTAGTGGTGCATGCCT  949

seq1  TTAACTCTAGCACTCATTGACAGAAGCAGACAGATAGGAATTC  992
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACTCTAGCACTCATTGACAGAAGCAGACAGATAGGAATTC  992

seq1: chr12_23291615_23292579
seq2: B6Ng01-176M06.g_65_1025

seq1  GAATTCAGTTCTCTCCTCCTACCACATGAGTTCTCAAGCTTAAACTCCAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTTCTCTCCTCCTACCACATGAGTTCTCAAGCTTAAACTCCAG  50

seq1  TCATCAGGCTTGGTGGCTTGTGCCTTTACCCAAGGAGTCATTTCAATGGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCAGGCTTGGTGGCTTGTGCCTTTACCCAAGGAGTCATTTCAATGGC  100

seq1  TCTGCTGCCTTTTTTTTTAAACAGTCATTGAGGCTCTGGGGAGCTCAGAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCTGCCTTTTTTTTTAAACAGTCATTGAGGCTCTGGGGAGCTCAGAA  150

seq1  TGTGCGCTCCTGGAATGTGGCTTGGGAGTCAGGATGGTTTTGCAGTGACT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCGCTCCTGGAATGTGGCTTGGGAGTCAGGATGGTTTTGCAGTGACT  200

seq1  AGTACCATGACATGGGATCTATGGTTCAGATGGCAGGCTGAGGTTGCAGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACCATGACATGGGATCTATGGTTCAGATGGCAGGCTGAGGTTGCAGT  250

seq1  AACACTCTAGTCTCCCTCCCATAGATCTCACTGGGTGGCTGGTTGTTGTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACTCTAGTCTCCCTCCCATAGATCTCACTGGGTGGCTGGTTGTTGTT  300

seq1  CCACTCAGAAGAGGAGGGTACCTCTCTCACTGTAGTCTTCTGCCTCCCTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTCAGAAGAGGAGGGTACCTCTCTCACTGTAGTCTTCTGCCTCCCTG  350

seq1  GCTGGACTCAGGCTTCTGGTACCTTATAGCTGGCTTCTCCAGAGAGGTCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGACTCAGGCTTCTGGTACCTTATAGCTGGCTTCTCCAGAGAGGTCC  400

seq1  AAGGTAGCCCTGCAGGATAGGTCTGTGGACCTGAGGAGGACTGTGGGATG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTAGCCCTGCAGGATAGGTCTGTGGACCTGAGGAGGACTGTGGGATG  450

seq1  GCAACACATTATCTCTCACTCCCAGTATCAGTGAGTAACGTGATCACCGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAACACATTATCTCTCACTCCCAGTATCAGTGAGTAACGTGATCACCGG  500

seq1  ATGCCACAGGATGCTAACTGCTGTGAATAGGATCCCTGTGTGGTGGCATC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCACAGGATGCTAACTGCTGTGAATAGGATCCCTGTGTGGTGGCATC  550

seq1  AGCTACAGAGTCCTTGGTACTGCCCAGCGCTGTCCAAGAAATAGGATGAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTACAGAGTCCTTGGTACTGCCCAGCGCTGTCCAAGAAATAGGATGAC  600

seq1  ATTCATATATAATATGAGATTTTCCCACAACCACATGG-AAAGAGGAAAG  649
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  ATTCATATATAATATGAGATTTTCCCACAACCACATGGAAAAGAGGAAAG  650

seq1  AGAAACGGGGTGAACAATGTCCACAGCCTGTTGGATTTAACCCATTGTAT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAACGGGGTGAACAATGTCCACAGCCTGTTGGATTTAACCCATTGTAT  700

seq1  TCCAAGCGGGCCCAATAACTGTGTATTTTACCCT-AAGGACTTACTTAGT  748
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  TCCAAGCGGGCCCAATAACTGTGTATTTTACCCTAAAGGACTTACTTAGT  750

seq1  TT-GGACTAGTGGTTC-TCAAACTTCTAATGCTGTGACCCTTTAAT-ACA  795
      || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TTGGGACTAGTGGTTCTTCAAACTTCTAATGCTGTGACCCTTTAATAACA  800

seq1  GTTCCTCATGTCATGGTCACCCCAACCAAAATATTA-TTTTTTTGCTACT  844
      || |  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| 
seq2  GTCCTCCATGTCATGGTCACCCCAACCAAATTATTATTTTTTTTGCTAC-  849

seq1  TCATAACTGTAAGTTTTGTTATCGTTTTAATCGTAATATAGATATGTGCT  894
      |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAT-ACTGTAAGTTTTGTTATCG--TTAATCGTAATATAGATATGTGCT  896

seq1  TTCTGATAGTTTTCGGCAACCCCTATGAAGAGTCCTGCAATTCCCAAGGA  944
      ||| |||   |||| || |||||||||| ||||| ||||||| |||||||
seq2  TTC-GAT--GTTTCCGCCACCCCTATGAGGAGTCTTGCAATT-CCAAGGA  942

seq1  GTTGGGACCCACCCATTGAGA  965
      ||  |||||||||||||||||
seq2  GT--GGACCCACCCATTGAGA  961