BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-186J12
Chromosome12 (Build37)
Map Location 120,014,229 - 120,164,076
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC620665, Sp8, Abcb5
Upstream geneCdca7l, Dnahc11, Sp4, LOC100042993, LOC668611, EG668615
Downstream geneItgb8, EG627557, LOC100043011, 4732474O15Rik, LOC668632, LOC668633
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-186J12.bB6Ng01-186J12.g
ACCGA011391GA011392
length7131,047
definitionB6Ng01-186J12.b B6Ng01-186J12.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(120,014,229 - 120,014,940)(120,163,038 - 120,164,076)
sequence
gaattcactatcagaaccacctacagggtaaaaagaaagaactgataact
ggatattgtcctctggtctcatttcattgtggtatgcacatgccacaccc
tccttcccctaacacatgaactcatccctactgtcttaatctttttgggt
gtggtggtagtggtttgtgtgcatatggtgtgcatgtatgtgtgtgcata
catactttggggatgtgttatcattgttttcactacagaatgctactatc
tgagtagcttacaaagagcagagaattctttcttataattctggagttgg
agaagccccaggtgagtaccaggtacaggccctcactgaggagtttcaca
aggtatatggttgagaattctagagactagatactcaattttttttttgt
ctttttaaaaggccgctaatctcatcctaggggctccatctactctcatg
accaaatacattcctaattatcttcaaaagttctcacctccaactaccac
tgggacacatgtactaccatgcctgatttaatgtggtgctggaatcaaac
ctaggcttgacatatgctaggcaagcattctgtcaactgagctatactct
tggttcctatattatattcttataaaaaagaagactgaatatagtaaaaa
aaaaattgatatgtggtggttttataaattcttttcttgttatgattgag
ctttttcaaatac
gaattccatgactgctatgtatatgtgtagaaagtgatggatagactccc
aaatatttttgtatttataaaatcaaaatgtgaatatagatgaaacagct
ttaaaaacagcaatgctagcacacactcacaacatcttgttcaagacaac
aaccaatacagtagtagaggaacatcagtggacagggataacagcagggc
aaacactcaaaacgagaccatgtatcagttaagttttagcaaggctaata
aaattaatcagatgaaagccaaaaaattaagcaaatagcactggaacaag
atgtccaatgagctgtggttttttgcattacaccacaaataaaaattaat
ttgacatataccttaaagcaaaatattagcttgtatttcaaaaattaaag
tgtagatcacttagagagctgaggcagtagaatcaccatttggaggccag
cccacactgcataacaagtatggaaccagtctgaactagttggtaaaaca
gtctcaaaataataattaatagatttaataccttagcagaaagaagacaa
tcatgatgttgaggtaagcaaagaactcttaggaagctatgtgctgctct
ctaaagtggtaacacagaggctactgagataattcagcagttaatggcat
ttgctgcttgtagtggctattcctggttatcaacttaactatatttggaa
tgaactgcaatccagaattggaaggctcaccagtcacccttatctggagg
cttggagatagaagtttctgatctggatcttggtatggagatcttgaggc
atagtgactatggattccagaagattaaatctctgagttcaaggtcatcc
gggattaaaggtgaacacacctttaatctgggctacacctttcatctggg
attaagggtgtggtggaacacacctttaatctgggctacacctttcatct
gggattaagggtgtggtgaaccacaccttaaatctgggctactcttctgc
tggaaacaatatagacatggaagaagcatctgctcttgctctttcgc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_120014229_120014940
seq2: B6Ng01-186J12.b_43_755

seq1  GAATTCACTATCAGAACCACCTACAGGGTAAAAAGAAAGAACTGATAACT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTATCAGAACCACCTACAGGGTAAAAAGAAAGAACTGATAACT  50

seq1  GGATATTGTCCTCTGGTCTCATTTCATTGTGGTATGCACATGCCACACCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATATTGTCCTCTGGTCTCATTTCATTGTGGTATGCACATGCCACACCC  100

seq1  TCCTTCCCCTAACACATGAACTCATCCCTACTGTCTTAATCTTTTTGGGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTCCCCTAACACATGAACTCATCCCTACTGTCTTAATCTTTTTGGGT  150

seq1  GTGGTGGTAGTGGTTTGTGTGCATATGGTGTGCATGTATGTGTGTGCATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTGGTAGTGGTTTGTGTGCATATGGTGTGCATGTATGTGTGTGCATA  200

seq1  CATACTTTGGGGATGTGTTATCATTGTTTTCACTACAGAATGCTACTATC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACTTTGGGGATGTGTTATCATTGTTTTCACTACAGAATGCTACTATC  250

seq1  TGAGTAGCTTACAAAGAGCAGAGAATTCTTTCTTATAATTCTGGAGTTGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTAGCTTACAAAGAGCAGAGAATTCTTTCTTATAATTCTGGAGTTGG  300

seq1  AGAAGCCCCAGGTGAGTACCAGGTACAGGCCCTCACTGAGGAGTTTCACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGCCCCAGGTGAGTACCAGGTACAGGCCCTCACTGAGGAGTTTCACA  350

seq1  AGGTATATGGTTGAGAATTCTAGAGACTAGATACTCAATTTTTTTTTTGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTATATGGTTGAGAATTCTAGAGACTAGATACTCAATTTTTTTTTTGT  400

seq1  CTTTTTAAAAGGCCGCTAATCTCATCCTAGGGGCTCCATCTACTCTCATG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTTAAAAGGCCGCTAATCTCATCCTAGGGGCTCCATCTACTCTCATG  450

seq1  ACCAAATACATTCCTAATTATCTTCAAAAGTTCTCACCTCCAACTACCAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAAATACATTCCTAATTATCTTCAAAAGTTCTCACCTCCAACTACCAC  500

seq1  TGGGACACATGTACTACCATGCCTGATTTAATGTGGTGCTGGAATCAAAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGACACATGTACTACCATGCCTGATTTAATGTGGTGCTGGAATCAAAC  550

seq1  CTAGGCTTGACATATGCTAGGCAAGCATTCTGTCAACTGAGCTATACTCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGGCTTGACATATGCTAGGCAAGCATTCTGTCAACTGAGCTATACTCT  600

seq1  TGGTTCCTATATTATATTCTTATAAAAAAGAAGACTGAATATAGTAAAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTCCTATATTATATTCTTATAAAAAAGAAGACTGAATATAGTAAAAA  650

seq1  AAAAATTGATATGTGGTGGTTTTATAAATTCTTTTCTTGTTATGATTGAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATTGATATGTGGTGGTTTTATAAATTCTTTTCTTGTTATGATTGAG  700

seq1  C-TTTTCAAATAC  712
      | |||||||||||
seq2  CTTTTTCAAATAC  713

seq1: chr12_120163038_120164076
seq2: B6Ng01-186J12.g_81_1112 (reverse)

seq1  GCGAAGGAGCAAGAGCAAGACTCCCTTCTTCCAATGTCCTTATATTGTCT  50
      ||||| |||||||||| |||    |||||||| |||||  |||||||| |
seq2  GCGAAAGAGCAAGAGC-AGA--TGCTTCTTCC-ATGTC--TATATTGTTT  44

seq1  CCAGCAGAAGGTGTAGCCCAGATTAAAGGTGTGTTCCACCACACCCTTAA  100
      ||||||||| | |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||
seq2  CCAGCAGAA-GAGTAGCCCAGATTTAAGGTGTGGTTCACCACACCCTTAA  93

seq1  TCCCAGATGAAAGGTGTAGCCCAGATTAAAGGTGTGTTCCACCACACCCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAGATGAAAGGTGTAGCCCAGATTAAAGGTGTGTTCCACCACACCCT  143

seq1  TAATCCCAGATGAAAGGTGTAGCCCAGATTAAAGGTGTGTTCACCTTTAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATCCCAGATGAAAGGTGTAGCCCAGATTAAAGGTGTGTTCACCTTTAA  193

seq1  TCCCGGATGACCTTGAACTCAGAGATTTAATCTTCTGGAATCCATAGTCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCGGATGACCTTGAACTCAGAGATTTAATCTTCTGGAATCCATAGTCA  243

seq1  CTATGCCTCAAGATCTCCATACCAAGATCCAGATCAGAAACTTCTATCTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGCCTCAAGATCTCCATACCAAGATCCAGATCAGAAACTTCTATCTC  293

seq1  CAAGCCTCCAGATAAGGGTGACTGGTGAGCCTTCCAATTCTGGATTGCAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCCTCCAGATAAGGGTGACTGGTGAGCCTTCCAATTCTGGATTGCAG  343

seq1  TTCATTCCAAATATAGTTAAGTTGATAACCAGGAATAGCCACTACAAGCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATTCCAAATATAGTTAAGTTGATAACCAGGAATAGCCACTACAAGCA  393

seq1  GCAAATGCCATTAACTGCTGAATTATCTCAGTAGCCTCTGTGTTACCACT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAATGCCATTAACTGCTGAATTATCTCAGTAGCCTCTGTGTTACCACT  443

seq1  TTAGAGAGCAGCACATAGCTTCCTAAGAGTTCTTTGCTTACCTCAACATC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAGAGCAGCACATAGCTTCCTAAGAGTTCTTTGCTTACCTCAACATC  493

seq1  ATGATTGTCTTCTTTCTGCTAAGGTATTAAATCTATTAATTATTATTTTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATTGTCTTCTTTCTGCTAAGGTATTAAATCTATTAATTATTATTTTG  543

seq1  AGACTGTTTTACCAACTAGTTCAGACTGGTTCCATACTTGTTATGCAGTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTGTTTTACCAACTAGTTCAGACTGGTTCCATACTTGTTATGCAGTG  593

seq1  TGGGCTGGCCTCCAAATGGTGATTCTACTGCCTCAGCTCTCTAAGTGATC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCTGGCCTCCAAATGGTGATTCTACTGCCTCAGCTCTCTAAGTGATC  643

seq1  TACACTTTAATTTTTGAAATACAAGCTAATATTTTGCTTTAAGGTATATG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACTTTAATTTTTGAAATACAAGCTAATATTTTGCTTTAAGGTATATG  693

seq1  TCAAATTAATTTTTATTTGTGGTGTAATGCAAAAAACCACAGCTCATTGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAATTAATTTTTATTTGTGGTGTAATGCAAAAAACCACAGCTCATTGG  743

seq1  ACATCTTGTTCCAGTGCTATTTGCTTAATTTTTTGGCTTTCATCTGATTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCTTGTTCCAGTGCTATTTGCTTAATTTTTTGGCTTTCATCTGATTA  793

seq1  ATTTTATTAGCCTTGCTAAAACTTAACTGATACATGGTCTCGTTTTGAGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTATTAGCCTTGCTAAAACTTAACTGATACATGGTCTCGTTTTGAGT  843

seq1  GTTTGCCCTGCTGTTATCCCTGTCCACTGATGTTCCTCTACTACTGTATT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGCCCTGCTGTTATCCCTGTCCACTGATGTTCCTCTACTACTGTATT  893

seq1  GGTTGTTGTCTTGAACAAGATGTTGTGAGTGTGTGCTAGCATTGCTGTTT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGTTGTCTTGAACAAGATGTTGTGAGTGTGTGCTAGCATTGCTGTTT  943

seq1  TTAAAGCTGTTTCATCTATATTCACATTTTGATTTTATAAATACAAAAAT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAGCTGTTTCATCTATATTCACATTTTGATTTTATAAATACAAAAAT  993

seq1  ATTTGGGAGTCTATCCATCACTTTCTACACATATACATA  1039
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGGGAGTCTATCCATCACTTTCTACACATATACATA  1032